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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/11/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOARES, I. C.; PACHECO, R. S.; SILVA, C. G. N. da; SANTOS, R. S.; BALDANI, J. I.; URQUIAGA, S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
ISIS CAPELLA SOARES, UFRRJ; RAFAEL SANCHES PACHECO, UFRRJ; CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO DA SILVA, UFLA; RAFAEL SALAZAR SANTOS, UFRRJ; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; SEGUNDO SACRAMENTO U CABALLERO, CNPAB; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Real-time PCR method to quantify Sp245 strain of Azospirillum baldaniorum on Brachiaria grasses under field conditions. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant and Soil, 06 September 2021 |
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ISSN: |
0032-079X |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11104-021-05137-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial quantification by qPCR is considered the gold standard for microbial molecular diagnosis. However, a fundamental pre-requisite in this methodology is the designing of specific primers for the bacterium of interest. With the increase in bacterial genome sequencing data in the recent years, it has become possible to design specific primers that can be used to quantify different strains of the same bacterial species. Methods: To develop a real-time PCR (qPCR) protocol for the specific quantification of Azospirillum baldaniorum Sp245 strain (old Azospirillum brasilense), the Sp245 genome sequence was fragmented into small contigs with 500 base pairs each, and analyzed for similarity against the NCBI non-redundant database. A. baldaniorum-specific contigs were used to design the primers. The best pair of primers was used to quantify these bacteria after inoculation in different cultivars of Brachiaria, grown under field conditions. Results: Our results showed that the primer pair Sp245p10 was highly specific for the Sp245 strain in the Brachiaria root and shoot field under different conditions. The qPCR assay using these primers showed differences among cultivars in the number of bacteria detected in plants after inoculation. Additionally, the number of bacteria observed in the roots was higher than that in the shoots. Conclusion: The qPCR methodology using a Sp245 strain-specific primer may be used to monitor A. baldaniorum inoculated into other plants and may find potential application in field experiments. MenosBacterial quantification by qPCR is considered the gold standard for microbial molecular diagnosis. However, a fundamental pre-requisite in this methodology is the designing of specific primers for the bacterium of interest. With the increase in bacterial genome sequencing data in the recent years, it has become possible to design specific primers that can be used to quantify different strains of the same bacterial species. Methods: To develop a real-time PCR (qPCR) protocol for the specific quantification of Azospirillum baldaniorum Sp245 strain (old Azospirillum brasilense), the Sp245 genome sequence was fragmented into small contigs with 500 base pairs each, and analyzed for similarity against the NCBI non-redundant database. A. baldaniorum-specific contigs were used to design the primers. The best pair of primers was used to quantify these bacteria after inoculation in different cultivars of Brachiaria, grown under field conditions. Results: Our results showed that the primer pair Sp245p10 was highly specific for the Sp245 strain in the Brachiaria root and shoot field under different conditions. The qPCR assay using these primers showed differences among cultivars in the number of bacteria detected in plants after inoculation. Additionally, the number of bacteria observed in the roots was higher than that in the shoots. Conclusion: The qPCR methodology using a Sp245 strain-specific primer may be used to monitor A. baldaniorum inoculated into other plants and may find pot... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Azospirillum baldanioru; Plant growth promoting bacteria; Quantification; Signal grass. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
15/12/2009 |
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Data da última atualização: |
08/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - A |
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Autoria: |
LEMOS, W. P.; SERRÃO, J. E.; RAMALHO, F. S.; ZANUNCIO, J. C. C.; LACERDO, M. C. |
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Afiliação: |
WALKYMARIO DE PAULO LEMOS, CPATU; J. E. SERRÃO, UFV; FRANCISCO DE SOUZA RAMALHO, CNPA; J. C. COLA ZANUNCIO, UFV; M. C. LACERDO, UFV. |
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Título: |
Effect of diet on male reproductive tract of Podisus nigrispinus (Dallas) (Heteroptera: pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Biology, v. 65, n. 1, p. 91-96, 2005. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Estudou-se a morfologia e a histologia do órgão reprodutivo de machos do predador Podisus nigrispinus (Dallas), alimentados com diferentes dietas (lagartas de Alabama argillacea (Hübner), larvas de Tenebrio molitor L., larvas de Musca domestica L. e dieta artificial). O órgão reprodutivo dos machos, independentemente da dieta fornecida, apresentou testículos com coloração vermelha intensa, compactos e de aspecto circular ou ligeiramente ovóide. Os canais deferentes apresentaram coloração semelhante a dos testículos e forma de filamentos longos, os quais se conectam a um duto ejaculatório de coloração creme-amarelada. As características morfológicas do órgão reprodutivo dos machos foram similares em todas as dietas, exceto quando alimentados com dieta artificial. Os estudos histológicos demonstraram que, independentemente da dieta, os testículos de P. nigrispinus são compostos por quatro a seis folículos. Os testículos com seis folículos geralmente têm quatro folículos desenvolvidos e dois atrofiados. Este trabalho apresenta e discute as diferenças morfológicas e histológicas dos testículos de P. nigrispinus alimentados com as diferentes dietas. |
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Palavras-Chave: |
Morfologia. |
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Thesagro: |
Controle Biológico. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/18059/1/a12v65n1.pdf
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Marc: |
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260 $c2005
520 $aEstudou-se a morfologia e a histologia do órgão reprodutivo de machos do predador Podisus nigrispinus (Dallas), alimentados com diferentes dietas (lagartas de Alabama argillacea (Hübner), larvas de Tenebrio molitor L., larvas de Musca domestica L. e dieta artificial). O órgão reprodutivo dos machos, independentemente da dieta fornecida, apresentou testículos com coloração vermelha intensa, compactos e de aspecto circular ou ligeiramente ovóide. Os canais deferentes apresentaram coloração semelhante a dos testículos e forma de filamentos longos, os quais se conectam a um duto ejaculatório de coloração creme-amarelada. As características morfológicas do órgão reprodutivo dos machos foram similares em todas as dietas, exceto quando alimentados com dieta artificial. Os estudos histológicos demonstraram que, independentemente da dieta, os testículos de P. nigrispinus são compostos por quatro a seis folículos. Os testículos com seis folículos geralmente têm quatro folículos desenvolvidos e dois atrofiados. Este trabalho apresenta e discute as diferenças morfológicas e histológicas dos testículos de P. nigrispinus alimentados com as diferentes dietas.
650 $aControle Biológico
653 $aMorfologia
700 1 $aSERRÃO, J. E.
700 1 $aRAMALHO, F. S.
700 1 $aZANUNCIO, J. C. C.
700 1 $aLACERDO, M. C.
773 $tBrazilian Journal of Biology$gv. 65, n. 1, p. 91-96, 2005.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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