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Registros recuperados : 93 | |
42. | | BRITO, G. G. de; CAIXETA, E. T.; GALLINA, A. P.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; DIOLA, V.; LOUREIRO, M. E. Inheritance of coffee leaf rust resistance and identification of AFLP markers linked to the resistance gene. Euphytica, Wageningen, v. 173, n. 2, p. 255-264, May 2010. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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43. | | BRITO, G. G. D.; CAIXETA, E. T.; DIOLA, V.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; LOUREIRO, M. E. Inheritance of coffee leaf rust resistance and identification of AFLP markers linked to the resistance gene. In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para a produção de alimentos e bioenergia - resumos. Fortaleza: SBFV; UFC / EMBRAPA AGROINDÚSTIA TROPICAL, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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44. | | MISSIO, R. F.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; CRUZ, C. D.; SAKIYAMA, N. S. Polymorphic information content of SSR markers for Coffea spp. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Londrina, v. 10, n. 1, p. 89-94, Mar. 2010. Notes. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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45. | | OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; RUFINO, R. J. N.; ZAMBOLIM, L. Partial map of Coffea arabica L. and recovery of the recurrent parent in backcross progenies. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Londrina, v. 7, n. 2, p. 196-203, Mar. 2007. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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46. | | ANDRADE, F. T.; CAIXETA, E. T.; MACIEL, B. H.; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, E. M.; SAKIYAMA, N. S. Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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47. | | MACIEL, B. H.; CAIXETA, E. T.; ANDRADE, F. T.; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, E. M.; SAKIYAMA, N. S. Obtenção de marcador molecular potencialmente envolvido com a resistência do cafeeiro à ferrugem. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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48. | | QUEIROZ, T. F. N.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; MISSIO, R. F.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Mapa parcial de ligação gênica em Coffea arabica L. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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49. | | MAIA, T. A.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; MIZUBUTI, E. S. G.; SANTANA, M. F.; ZAMBOLIM, L. Estrutura genética da população de Hemileia vastatrix com base no marcador AFLP. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Anais...Brasília, DF: Embrapa Café, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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50. | | FERRÃO, L. F. V.; SOUZA, F. de F.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Estudo comparativo do nível de polimorfismo e informatividade acessado pelos marcadores RAPD, AFLP e SSR, no estabelecimento de relações genéticas em Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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51. | | CAPUCHO, A. S.; ZAMBOLIM, L.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; FRANCHINI, E. de A.; PEREIRA, A. A. Avaliação da resistência de cultivares de café à raça II de Hemileia vastatrix Berk. et Br. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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52. | | CAIXETA, E. T.; RUFINO, R. J. N.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L. Caracterização da resistência genética do híbrido de Timor UFV 427-15 à ferrugem do cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Resumos... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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53. | | FERREIRA, A. B.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; FRANCHINI, E. de A.; COSTA, H.; ZAMBOLIM, L. Diversidade genética por AFLP de Colletotrichum gloeosporioides E C. kahawae isolados de cafeeiros. In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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54. | | MISSIO, R. F.; CAIXETA, E. T.; RIBEIRO, A. P.; MOURA, E. F.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Diversidade genética de cafeeiro por meio de marcadores EST-SSR. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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55. | | ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; HUFNAGEL, B.; THIEBAUT, F.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem. Pesquisa Agropecuária Brasileira. Brasília, v. 46, n.8, p. 890-898, ago. 2011. Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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56. | | SAKATE-KRAUSE, R.; MELLO, R. N.; PAVAN, M. A.; ZAMBOLIM, E. M.; CARVALHO, M. G.; GALL LE, O.; ZERBINI, M. Molecular characterization of two Brazilian isolates of Lettuce mosaic virus with distinct biological propertis. Fitopatologia Brasileira, Brasilia, v.26, n.2, p.153-157, jun. 2001. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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57. | | FERNANDES, J. J.; FONTES, E. P. B.; BROMMOSCHENKEL, S. H. CARVALHO, M. G.; ZAMBOLIM, E. M.; ZERBINI, F. M. Molecular cloning and charactezation of TGV-ub, Begomovirus isolated from tomatões at "Triâgulo Mineiro", Brazil. Virus Reviews & Research, Florianópolis, v. 5, n. 2, p. 193, 2000. Suplemento 1. Resumo. Trabalho apresentado no 11º National Meeting of Virology,São Lourenço, 2000. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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58. | | FERNANDES, J. J.; FONTES, E. P. B.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; CARVALHO, M. G.; ZAMBOLIM, E. M.; ZERBINI, F. M. Molecular clonning and sequencing of Tomato rugose mosaic virus (TRMV), a geminivirus isolated form tomatoes at triangulo mineiro Brazil. Fitopatologia Brasileira, Brasilia, v.25, p.440, ago. 2000. Suplemento. Resumo. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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59. | | CALEGARIO, R. F.; AMBROZEVICIUS, L. P.; SILVEIRA, S. F.; RODRIGUES, I. L.; ZAMBOLIM, E. M.; ZERBINI, F. M. Survey of tomato geminivirus in Rio de Janeiro State Brazil. Fitopatologia Brasileira, Brasilia, v.25, p.438, ago. 2000. Suplemento. Resumo. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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60. | | ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; HUFNAGEL, B.; THIEBAUT, F.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. In silico identification of coffee genome expressed sequences potentially associated with resistance to diseases. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 33, n.4, p. 795-806. 2010. 795-806 Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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Registros recuperados : 93 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
14/03/2016 |
Data da última atualização: |
22/03/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; PENA, G.; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; FERRAO, M. A. G.; SAKIYAMA, N. S. |
Afiliação: |
LUÍS FELIPE V. FERRÃO, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; GUILHERME PENA, UFV; EUNICE M. ZAMBOLIM, UFV; COMES D. CRUZ, UFV; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UFV; MARIA AMELIA GAVA FERRAO, SAPC; NEY S. SAKIYAMA, UFV. |
Título: |
New EST-SSR markers of Coffea arabica: transferability and application to studies of molecular characterization and genetic mapping. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, v. 35, n. 1, p. 2-5, jan. 2015. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Microsatellite markers (SSR) have broad utility in genetic studies due to a high rate of polymor-phisms, a codominant nature and multiallelism. EST?SSRs are markers derived from the expressed sequences of a genome and represent transcribed genes. Despite the importance of the genus Coffea , only a small number of EST?SSR markers are currently available. Thus, this study was designed to mine and develop a new set of EST?SSR markers from the Brazilian Coffee Genome Project. We investigated 130,792 expressed sequence tags (ESTs), from which 24,031 DNA sequences with microsatellites were identified. After stability and amplification testing, 101 new EST?SSR markers were developed and analyzed in different coffee species. The average rate of transferability was 88 %, showing that these markers are useful in genetic studies across the genus Coffea. Polymorphism levels and the degree of diversity were consistent with the evolutionary history of the species. All coffee genotypes were discriminated, even the C. arabica genotypes that have known narrow genetic basis. It was also possible to locate 14 EST? SSRs into different linkage groups of the C. arabica genetic map, which demonstrate that these markers can be useful in QTL mapping studies and in molecular-assisted selection. |
Palavras-Chave: |
Brazilian Coffee Genome Project; Microsatellites. |
Thesagro: |
Coffea Arábica. |
Thesaurus NAL: |
Coffea; Genetic markers. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141110/1/New-EST-SSR-markers.pdf
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Marc: |
LEADER 02100naa a2200265 a 4500 001 2040767 005 2016-03-22 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFERRÃO, L. F. V. 245 $aNew EST-SSR markers of Coffea arabica$btransferability and application to studies of molecular characterization and genetic mapping.$h[electronic resource] 260 $c2015 520 $aMicrosatellite markers (SSR) have broad utility in genetic studies due to a high rate of polymor-phisms, a codominant nature and multiallelism. EST?SSRs are markers derived from the expressed sequences of a genome and represent transcribed genes. Despite the importance of the genus Coffea , only a small number of EST?SSR markers are currently available. Thus, this study was designed to mine and develop a new set of EST?SSR markers from the Brazilian Coffee Genome Project. We investigated 130,792 expressed sequence tags (ESTs), from which 24,031 DNA sequences with microsatellites were identified. After stability and amplification testing, 101 new EST?SSR markers were developed and analyzed in different coffee species. The average rate of transferability was 88 %, showing that these markers are useful in genetic studies across the genus Coffea. Polymorphism levels and the degree of diversity were consistent with the evolutionary history of the species. All coffee genotypes were discriminated, even the C. arabica genotypes that have known narrow genetic basis. It was also possible to locate 14 EST? SSRs into different linkage groups of the C. arabica genetic map, which demonstrate that these markers can be useful in QTL mapping studies and in molecular-assisted selection. 650 $aCoffea 650 $aGenetic markers 650 $aCoffea Arábica 653 $aBrazilian Coffee Genome Project 653 $aMicrosatellites 700 1 $aCAIXETA, E. T. 700 1 $aPENA, G. 700 1 $aZAMBOLIM, E. M. 700 1 $aCRUZ, C. D. 700 1 $aZAMBOLIM, L. 700 1 $aFERRAO, M. A. G. 700 1 $aSAKIYAMA, N. S. 773 $tMolecular Breeding$gv. 35, n. 1, p. 2-5, jan. 2015.
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