Consulta: (autoria:"YAMAGISHI, M.")
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Data/hora: 06/06/2024 05:28:24

YAMAGISHI, M. E. B. bayesDNA. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. HinvClusterFilter. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. HinvTissueIdentification. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. Mathematical grammar of Biology. Switzerland: Springer, 2017. 82 p. il. (Springer briefs in Mathematics).
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. NGS_KmerFreq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. FLCDNA2GENOME. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. FLCDNA2MRNA. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008.
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NARCISO, M.; YAMAGISHI, M. A fast algorithm to "de novo" genome wide tandem repeats discovery. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. X-MEETING 2011.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/49983/1/denovo.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão.

YAMAGISHI, M. E. B. Is our immune system a powerful vaccine factory? Genetics and Molecular Biology, v. 44, n. 1, p.1-2. 2021. Supplement 1, article e20200468. Letter to the Editor.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225750/1/AP-Immune-system-2021.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. GCSPR. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B. Projeções ortogonais sobre conjuntos convexos para restauração de imagens comprimidas pelo JPEG. Revista Ciência e Tecnologia, Americana, v. 7, n. 10, p. 55-68, jun. 2004.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A bioinformatics approach to detect interchromosomal trans-splicing in bovine full length cDNA databanks. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 18., 2010, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. Não paginado. P869. PAG-XVIII.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/91866/1/869.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. Identification of repetitive sequences within gene loci. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P0983.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/65420/1/geneLoci.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster P1003.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94599/1/P1003.odt
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. MappingTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; SHIMABUKURO, A. I. Nucleotide frequencies in human genome and Fibonacci numbers. Bulletin of Mathematical Biology, v. 70, n. 3, p. 643-653, Apr. 2008.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159709/1/AP-Nucleotide-Yamagishi-2008.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VELLOZO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. A new BLAST-based Gbrowse plugin. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75464/1/blast.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detecting evidences of inter-chromosomal trans-spliced genes using a bioinformatic approach. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-meeting 2008.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of human interchromosomal trans-splicing in sequence databanks. Briefings in Bioinformatics, London, v. 2, n. 2, p. 198-209, 2010.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148693/1/AP-Brief-Bioinform-2010-Herai-198-209.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VELLOZO, A. F.; YAMAGISHI, M. E. B. FIOMA. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FastaSequenceTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ROMANIUC, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. JM-CNV. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FusionFinder. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HONGO, J. A.; YAMAGISHI, M. E. B. gene_name_to_refseq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. RepGraph. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B. SUFFIX - Extrator de seqüências periódicas de bases ATCG: V. 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2008.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/17608/1/39.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B. Uma nova proposta de busca por tandem repeats. In: CONGRESSO NACIONAL DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS, 1.; SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS, 4., 2011, Recife. Biodiversidade e floresta: desafios e perspectivas: anais. Recife: Universidade Católica de Pernambuco, 2011. p. 760-767.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/55663/1/Narciso.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B. Uma nova proposta para se obter Tandem Repeats em sequências genômicas. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. 12 p. (Embrapa Arroz e Feijão. Comunicado técnico, 217).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114254/1/comt217.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão.

HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A Web-based tool for identification and visualization of repetitive sequences within gene loci. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; VELLOZO, A. F. Blast.pm. Versão 0.01. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

MOURA, M. F.; HIGA, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Um modelo orientado a objetos para o cálculo da estimativa da área acessível a solvente. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. 25 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 46).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10655/1/doc46.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. flanSnps. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

DE PIERRO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Fast scaled gradient decomposition methods for maximum likelihood transmission tomography. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IEEE EMBS, 25., 2003, Cancun. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2003. p. 829-832.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

LEITE, V.; SILVA, R.; YAMAGISHI, M.; CHAHINE, J. Role of hydrophobicity in protein evolution. In: ANNUAL SYMPOSIUM OF THE PROTEIN SOCIETY, 24., 2010, California. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2010.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32531/1/michel.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINALIA, T.; BEZERRA, G. B. P.; NESHICH, G. 2D maps of protein interface surfaces. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 1. X-meeting 2005. Presented posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. 2D maps of protein surface. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster B-63.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173864/1/B-63-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PEREIRA, S. V. C. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Acessando o potencial bioativo de Streptomyces sp. MAD39, isolada de sedimentos do Rio Madeira baseado em análises in silico do genoma. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 106. CDMICRO 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158010/1/RA-Acessando-Potencial-CDMICRO-2023.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

SILVA, J. M. da; CARDOSO, F. F.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Accuracy of low- to medium-density genotype imputation in a Hereford and Braford cattle population from Brazil. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster K11.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.

GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B. An approach based on gene co-expression in searching for genes involved in bovine tick-resistance. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 7 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 48).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10041/1/comtec48.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Algoritmos de bioinformática para detecção de nullomers no transcriptoma humano. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL, 2.,2009, Petrópolis. Resumos... Petrópolis: Laboratório nacional de computação científica, 2009. p. 35-36. IIEAMC/LNCC 2009.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MARTINS, N. F. Bioinformática como instrumento de apoio aos programas de melhoramento genético. In: FIGUEIREDO, M. do V. B.; BURITY, H. A.; OLIVEIRA, J. de P.; SANTOS, C. E. de R. e S.; STAMFORD, N. P. (Ed.). Biotecnologia aplicada à agricultura: textos de apoio e protocolos experimentais. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Recife: Instituto Agronômico de Pernambuco, 2010. p. 313-332.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCAO, P. R. ConvolutionTR: comprehensive study of SNPs within tandem repeats. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/67281/1/PL-2012.039.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Arroz e Feijão.

DITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; GIACHETTO, P.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalho apresentado no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6-10, 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GIACHETTO, P. F.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Identificando redes gênicas a partir de dados de expressão de microarranjos. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado. Pôster 92.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26215/1/redesgenicas.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

LACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; FACO, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Identificação de polimorfimos de base única (SNPs) em genes relacionados à taxa de ovulação em ovinos. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 708. 1 CD-ROM.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112368/1/ResumoCBRG-708.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.

LACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; FACÓ, O.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Identificação de polimorfimos de base única (SNPs) em genes relacionados à taxa de ovulação em ovinos. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Não paginado. Resumo 708.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117759/1/ResumoCBRG-708.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

GIACHETTO, P. F.; SANTOS, E. H. dos; KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of cattle-tick interaction-related genes by means of transcript co-expression analysis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 211.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IBELLE, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of genes involved in cattle-tick response mechanism by differentiall co-expression. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 305.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36794/1/305.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Identification of genes involved in cattle-tick response mechanism by differentiall co-expression. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 305.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 59).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10198/1/comtec59.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ARBEX, W.; CARVALHO, L. A. V. de; SILVA, M. V. B. da; YAMAGISHI, M. E. B. Modelagem difusa para suporte à decisão na descoberta de SNPs em sequências de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 7., 2009, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: UFV, 2009. Não paginado. SBIAgro 2009.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/16775/1/T092.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; FERNANDES, M. A. C.; YAMAGISHI, M. E. B. Plataforma de bancos de dados e ferramentas para visualização de dados moleculares no contexto genômico. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: UECE, 2009. Não paginado.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VIEIRA, F. D.; AGOSTINHO, G. C.; REGITANO, L. C. A.; YAMAGISHI, M. E. B. Database modeling and web interface system: on-line genomic association studies. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159372/1/PL-Indirect-xmeeting-2007.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BOARETO, M.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N.; LEITE, V. B. P. Predicting enzyme class from protein structure using super paramagnetic cluster. In: INTERNATIONAL WORKSHOP ON BAYESIAN INFERENCE AND MAXIMUM ENTROPY METHODS IN SCIENCE AND ENGINEERING, 28., 2008, São Sebastião, SP. Proceedings... São Paulo: USP, 2008. Não paginado. MaxEnt 2008.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BOARETO, M.; LEITE, V. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N. Predição de classes de enzimas usando método de agrupamento super-paramagnético. In: ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DE MATÉRIA CONDENSADA, 31., 2008, Águas de Lindóia. São Paulo: SBF, 2008. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/158867/1/PL-Predicao-2008.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BOARETO, M.; YAMAGISHI, M. E. B.; CATICHA, N.; LEITE, V. B. P. Relationship between global structural parameters and Enzyme Commission hierarchy: implications for function prediction. Computational Biology and Chemistry, Oxford, v. 40, p. 15-19, 2012.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 42. X-meeting 2015.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137626/1/Xmeeting-reconstructing-Castro.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

LOBO, I.; NASCIMENTO, A.; YAMAGISHI, M.; GUIGUEN, Y.; SILVA, G. F.; ALMEIDA, F. L. The tambaqui (Colossoma macropomum) transcriptome at sex differentiation stage. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 90.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/186956/1/ISRPF-PROGRAM-2018-90.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

CARDOSO, F. F.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; HIGA, R. H. Statistical tools to uncover genetic architecture of tick resistance using highdensity oligonucleotide gene expression microarrays. In: SÃO PAULO ADVANCED SCHOOL OF SCIENCE, 1., 2011, São Carlos, SP. Advances in the knowledge of parasite resistance of ruminant hosts and parasites: proceedings. São São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2011. p. 34-38.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/50555/1/artigo-fernando-sao-carlos.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.

VENÂNCIO, F. C.; MEYER, J. F. C. A.; YAMAGISHI, M. E. B. Visualização das superfícies de interação em complexos protéicos através de transformações conformacionais. In: CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL, 27., 2004, Porto Alegre. Anais... Porto Alegre: PUC-RS, 2004. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/174571/1/Visualizacao-CNMAC-2004.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SANTOS, S. F.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Análise metataxonômica de bactérias degradadoras de combustível diesel obtidas do rio Juruá. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 102. CDMICRO 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158008/1/RA-Analise-Metataxonomica-CDMICRO-2023.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

CIRÍACO, A. L. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Análise in silico do potencial metabólico de Streptomyces APUR 36.1 isolada de sedimentos do Rio Purus. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 36.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

CIRÍACO, A. L. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Análise in silico do potencial metabólico de Streptomyces sp. APUR 36.1 isolada de sedimentos do Rio Purus. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 36.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/232789/1/PC-Analise-insilico-SIMBIOTEC-2022.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

COSTA, G. V. da; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Caracterização do cluster gênico biossintético para produção do sideróforo petrobactina por Bacillus cereus SOL 105 isolado de sedimentos do Rio Solimões. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 24.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

COSTA, G. V. da; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Caracterização do cluster gênico biossintético para produção do sideróforo petrobactina por Bacillus cereus SOL 105 isolado de sedimentos do Rio Solimões. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 24.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/232787/1/PC-Caracterizacao-cluster-genico-SIMBIOTEC-2022.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72857/1/Isabel-PAG-Comparative.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas.

DITA, M. A.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M.; GIACHETTO, P.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: INTERNATIONAL PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [S.l.]: ISHS, 2011. p. 58.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CAMPOS, C. C. B.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. da; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Diversidade de clusters gênicos biossintéticos em Streptomyces sp. Mad39, isolado com potencial para biocontrole de patógenos de cadeias agrícolas regionais. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 7.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

CAMPOS, C. C. B.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. da; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Diversidade de clusters gênicos biossintéticos em Streptomyces sp. MAD39, isolado com potencial para biocontrole de patógenos de cadeias agrícolas regionais. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 7.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/232786/1/PC-Diversidade-cluster-genicos-SIMBIOTEC-2022.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CASTRO, G. dos S.; SOUSA, T.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; GARRETT, R.; SOMAN, L.; KOOLEN, H. Identification of new peptaibols in the strain of Trichoderma amazonicum MMSRG 38A isolated from açaí fruit. In: BRAZILIAN CONFERENCE ON NATURAL PRODUCT (BCNP), 9.; MEETING ON MICROMOLECULAR EVOLUTION, SYSTEMATICS AND ECOLOGY (RESEM), 35., 2023, Salvador. Proceedings [...]. Campinas: Galoá, 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159786/1/RA-Identification-new-peptaibols-BCNP-2023.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Identification of folding essential residues by looking at an extensive DB of the structure descriptors in Diamond STING. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 13., 2005, Detroit. Program... Detroit: ISCB, 2005. p. 71. Na publicação: Paula Kuser; Michel Yamagishi; Adauto Mancini; Roberto Higa; Goran Neshich. ISMB 2005. Poster A-47.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SOUZA, R. P. e; QUEIROZ, C. A.; LOPES, E. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Identificação de cluster gênicos biossintéticos nas linhagens de Streptomyces MPUR-28.3 e MPUR-51.7. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 141. CDMICRO 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158057/1/RA-Identificacao-Cluster-CDMICRO-2023.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

SOUZA, R. P.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; LOPES, E. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Identificação de clusters gênicos biossintéticos relacionados a produção de antibióticos em pool bacteriano isolado de sedimentos de rios amazônicos. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 8.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SOUZA, R. P.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; LOPES, E. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Identificação de clusters gênicos biossintéticos relacionados a produção de antibióticos em pool bacteriano isolado de sedimentos de rios amazônicos. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 8.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

CHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

HERAI, R.; DITA, M.; WAALWIJK, C.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, G.; FALCAO, P.; GIACHETTO, P.; YAMAGISHI, M. Building a transcriptome molecular marker platform for diagnosis of fungal plant pathogens. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75435/1/building.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

COSTA, J. L. C.; OLIVEIRA, E. J. de; OLIVEIRA, G. A. F.; SILVA, A. dos S.; YAMAGISHI, M. E. B. Minissatélites: novas ferramentas moleculares para o mamoeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 915
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/37107/1/ID27130pdf915.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

ARBEX, W. A.; CARVALHO, L. A. V. de; SILVA, M. V. G. B.; YAMAGISHI, M. E. B. Modelagem difusa para suporte à decisão na descoberta de SNPs em sequências de cDNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 7., 2009, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: UFV, 2009. Não paginado. SBIAgro 2009. 1 CD-ROM.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/16775/1/T092.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; YAMAGISHI, M. E. B.; CARVALHO, L. A. V. DE. Modelagem difusa para suporte à decisão na descoberta de SNPs em sequências de cDNA. Engormix, 4 mar. 2013.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/955228/1/Modelagem-difusa-para-suporte-a-decisao.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

PAIVA, S. R.; LACERDA, T. S.; YAMAGISHI, M.; FARIA, D. A.; MCMANUS, C.; CAETANO, A.; BLACKBURN, H. Desenvolvimento e validação de um painel de baixa densidade de marcadores snp relacionado a prolificade em ovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/158997/1/Anais-CBRG-2016-pg-58.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

VIEIRA, F. D.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. Databases & data integration text mining & information extraction. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

VIEIRA, F. D.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. Databases & data integration text mining & information extraction. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ANGELO, P. C. da S.; YAMAGISHI, M. E. B.; CRUZ, J. C. da; SILVA, G. F. da; GASPAROTTO, L. Differential expression and structural polymorphism in rubber tree genes related to South American leaf blight resistance. Physiological and Molecular Plant Pathology, v. 110, 101477, Apr. 2020.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/213349/1/Differential-expression-and-structural.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Café.

YAMAGISHI, M. E. B.; MARTINS, N. F.; NESHICH, G.; CAI, W.; SHAO, X.; BEAUTRAIT, A.; MAIGRET, B. A fast surface-matching procedure for protein-ligand docking. Journal of Molecular Modeling, v. 12, n. 6, p. 965-972, Sept. 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/178055/1/ID-27692-1.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P1170.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137048/1/Java-Silva-PAG.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ARBEX, W. A.; ARBEX, W. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, M. V. G. B.; CARVALHO, L. A. V. DE. Inferência difusa como suporte à descoberta de possíveis SNPs em sequências de cDNA. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL DO LNCC, 2., 2009, Petrópolis. Anais... Petropolis: Laboratório Nacional de Computação Científica, 2009. p. 19-20
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/663961/1/Inferencia-difusa-como-suporte.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

ARBEX, W.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, M. V. G. B. da; CARVALHO, L. A. V. de. Inferência difusa suporte à descoberta de possíveis SNPs em seqüências de cDNA. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL DO LABORATÓRIO NACIONAL DE COMPUTAÇÃO CIENTÍFICA, 2., 2009, Petropólis. Resumos... Petrópolis: LNCC, 2009. p. 19-20.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A. Transcriptional networks reconstruction: identification of genes involved on cattle response to tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus infestation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 154. Na publicação: Regitano, L.C.A. X-meeting 2010.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23811/1/p154-out.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.

IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019. p. 491.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Abstracts. [S.l.]: Word Aquaculture society, 2019.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208846/1/CNPASA-2019-Aqua2.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

LOBO, I.; NASCIMENTO, A.; YAMAGISHI, M. E. B.; GUIGUEN, Y.; SILVA, G. F.; O'SULLIVAN, F. L. A. The tambaqui (Colossoma macropomum) transcriptome at sex differentiation stage. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 90. Na publicação: Yamagishi, M., Almeida, F. L. ISRPF 2018.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PEREIRA, F. C. de P.; VAZ, G. J.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F. Utilização da ferramenta Liferay na construção do portal do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa - LMB. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 80-82.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56895/1/Liferay.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BAIA, F. L.; CANIATO, F. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; QUEIROZ, C. A. de; SILVA, G. F. da. Análise comparativa de genes efetores com base no genoma completo de Pseudopestalotiopsis theae e Pseudopestalotiopsis gilvanii. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 15.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BAIA, F. L.; CANIATO, F. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; QUEIROZ, C. A. de; SILVA, G. F. da. Análise comparativa de genes efetores com base no genoma completo de Pseudopestalotiopsis theae e Pseudopestalotiopsis gilvanii. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 15.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

GALVÃO, S. F. A.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIANA, M. J. A.; SOUSA, S. M. de. Análise genômica de bactérias promotoras de crescimento de plantas visando a identificação de genes e desenvolvimento de marcadores estirpe-específicos. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento híbrido.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GALVÃO, S. F. A.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIANA, M. J. A.; SOUSA, S. M. de. Análise genômica de bactérias promotoras de crescimento de plantas visando a identificação de genes e desenvolvimento de marcadores estirpe-específicos. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1148494/1/Analise-genomica-de-bacterias-promotoras-de-crescimento-de-plantas.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 77). Na publicação: Goran Neshich.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11392/1/ct77.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NARCISO, M. G.; NESHICH, G.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer usando o software Sting. In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. p. 166-175. COMPSULMT 2006.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F. Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 11 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32433/1/ct101-10-4.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTAS, I. R. S.; BENITO, N. P. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Análises Fitossanitárias. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

QUEIROS, L. R.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; IDE, F. H.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; COSTA, I. R. S.; BENITO, N. P. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Processo Análise Quarentenária de Germoplasma Vegetal (planejamento, acompanhamento e finalização). Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SANTOS, A. D. dos; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; IDE, F. H.; QUEIROS, L. R.; VACARI, I.; COSTA, I. R. S.; FERREIRA, F. R. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Processo Intercâmbio de Germoplasma Vegetal. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTA, I. R. S.; BENITO, N. P. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Serviços de apoio à Análise Fitossanitária. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F.; CRUZ, S.; SANTOS, A.; YAMAGISHI, M.; VACARI, I.; BURLE, M.; SIAS, I.; RICARDO, F.; BENITO, N.; GONZAGA, V.; JOSÉ, S.; PÁDUA, J. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos. Versão 0.49. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2013. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F.; CRUZ, S.; SANTOS, A.; YAMAGISHI, M.; VACARI, I.; BURLE, M.; SIAS, I.; RICARDO, F.; BENITO, N.; GONZAGA, V.; JOSÉ, S.; PÁDUA, J. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos. Versão 0.51. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SANTOS, A. D. dos; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; IDE, F. H.; QUEIROS, L. R.; VACARI, I.; COSTA, I. R. S.; FERREIRA, F. R. Alelo - Solicitação e gerenciamento de Requerimentos de Intercâmbio de Germoplasma Vegetal (Público). Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J. G.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G.; NARCISO, M. G. Comparisson of the amino acids co-evolution and the correlated structure descriptors. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-51. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira, Marcelo Narciso.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173863/1/I-51-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

DITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; SOUZA JUNIOR, M. T.; GIACHETTO, P. F.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalhos apresentados no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6–10, 2011.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/39883/1/PHYTO-2011-101-6-Manoel.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.

RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FERREIRA, G. T.; SOUZA, M.; GIACHETTO, P.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. Cubense APS-IPPC Joinh Meeting. August, 2011. Honolulu. Abstracts of presentations.
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G. B.; SOUZA, M.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analyses and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense. Acta Horticulturae, n. 986, p. 165-168, 2013. 4p. Trabalho apresentado no ISHS - ProMusa Symposium on Bananas and Plantains: Towards Sustainable Global Production and Improved Uses.
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: ISHS / PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador, BH. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: program and abstracts. Leuven: ISHS, 2011. p. 58
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46315/1/Manoel-Fusarium-58.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.

RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M.; GIACHETT, P.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; KEMA, D G. H. J. Comparative transcriptome analysis and genome assembly of fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: PROMUSA SYMPOSIUM, 2011, Salvador. Bananas and plantains: toward sustainable global production and improved uses: abstracts. [Montepellier.]: [Bioversity International, 2011. p.46.
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

KUSER, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. BlueStar STING - a multiplatform environment for protein structure analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-22. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173853/1/I-22-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; OLIVEIRA, H. N.; YAMAGISHI, M. E. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/37889/1/PROCI-2010.00060.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

HIGA, R. H.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MOURA, M. F.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Grau de conservação de aminoácidos de proteínas: comparação entre entropia relativa e pressão evolucionária. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 61).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10613/1/comtec61.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GIACHETTO, P. F.; SILVA, J. M. da; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Genomic variant hotspots in nelore cattle revealed by missing genotypes. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P0289.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137045/1/genomic-Giachetto-PAG.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Genomic Variants Revealed by Invariably Missing Genotypes in Nelore Cattle. PLoS ONE, v. 10, n. 8, p. 1-18, 2015
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/134042/1/journal.pone.0136035.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SANTOS, E. H. dos; GIACHETTO, P. F.; IBELLI, A. M. G.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A.; YAMAGISHI, M. E. B. Implementação de um pipeline de análises aplicado a experimentos de expressão em larga escala, para a identificação de redes de co-expressão gênica. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: UECE, 2009. Não paginado.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HERAI, R. H.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCHINI, K. G.; PEREIRA, G. G. A. CNBi: the new Brazilian National Consortium for Bioinformatics. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 110. X-meeting 2010.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23822/1/p110.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCAO, P. R. K. Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. 50 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 17).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11660/1/bp17.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Building multiple sequence alignments with a flavour of HSSP alignments. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 28. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Regina Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

JARDINE, J. G.; NESHICH, G.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MARANGONI, S.; MARTINS, D.; WINCK, F. V.; NOVELLO, J. C. Molecular modeling of the protein twitching motility of Xylella fastidiosa. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 99. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira. X-meeting 2005. Presented Posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, J. C. I. da; NEVES, K. de O. G.; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da. Mineração genômica de Penicillium labradorum INPA-AP10: prospecção de produtos naturais em linhagem isolada de sedimentos do rio Amazonas. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 70.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 64). Na publicação: Michel Eduardo Beleza Yamaghishi.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10648/1/comtec64.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

MAZONI, I.; KUSER, P.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. MSSP: simultaneous comparison of the same structure descriptor for different protein structures. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-50. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173862/1/I-50-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 1017.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94602/1/P1017.odt
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75327/1/LMB.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L. Estrogen receptors are sex-differentially expressed in tambaqui (Colossoma macropomum) during sex differentiation. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 40. ISRPF 2018.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L. Estrogen receptors are sex-differentially expressed in tambaqui (Colossoma macropomum) during sex differentiation. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. p. 40.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179109/1/CNPASA-2018-pl1.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F.; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L. Estrogen receptors are sex-differentially expressed in tambaqui (Colossoma macropomum) during sex differentiation. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. p. 40.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179109/1/CNPASA-2018-pl1.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

SILVA, N. M. L.; IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; PAIVA, S. R.; ROCHA, J. L.; TEIXEIRA, A. K.; FARIAS, F. G.; GUERRELHAS, A. C.; CAETANO, A. R. Development and validation of a low-density SNP panel for parentage control and evaluation of genetic diversity of pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei). In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2019. PE0274. PAG 2019.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, N. M. L.; IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; PAIVA, S. R.; ROCHA, J. L.; TEIXEIRA, A. K.; FARIAS, F. G.; GUERRELHAS, A. C.; CAETANO, A. R. Development and validation of a low-density SNP panel for parentage control and evaluation of genetic diversity of pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei). In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Plant and animal genome abstracts. Livingston, NJ: Scherago, 2019. PE0274.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SILVA, N. M. L.; IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; ROCHA, J. L.; TEIXEIRA, A. K.; FARIAS, F. G.; GUERRELHAS, A. C.; CAETANO, A. R. Development and validation of a low-density SNP panel for paternity and kinship analysis and evaluation of genetic variability and structure of commercial Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) populations from Brazil. Aquaculture, v. 560, 738540, Nov. 2022.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

HERAI, R. H.; GIACHETTO, P. F.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. Detecção de erros de montagens em regiões gênicas. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., Brasília, DF, 2010. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26589/1/Motagem.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P553.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CALDAS, L. F. G. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Potenciais metabólitos secundários em Streptomyces cavourensis SOL153 isolada de sedimentos do Rio Solimões. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 38.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

CALDAS, L. F. G. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Potenciais metabólitos secundários em Streptomyces cavourensis SOL153 isolada de sedimentos do Rio Solimões. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 38.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/232793/1/PC-Potenciais-metabolitos-SIMBIOTEC-2022.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Plant and animal genome abstracts. Livingston, NJ: Scherago, 2019. PO0249
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/206503/1/genome-sequencing-and-de-novo-assembly-of-the-southe-american.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2019. Na publicação: Adhemar Zerlotini. PAG 2019. PO0249.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208152/1/Genome-Sequencing-PAG.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019. p. 182.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Abstracts. [S.l.]: Word Aquaculture Society, 2019.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208842/1/CNPASA-2019-Aqua.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Genome-wide copy number variation (CNV) detection in Nelore cattle reveals highly frequent variants in genome regions harboring QTLs affecting production traits. BMC Genomics, London, v. 17, p. 1-14, 2016.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144667/1/AP-Genome-Silva-et-al.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H.; PAIVA, S. R. Genetic origin of Brazilian local adapted sheep (Ovis aries) breeds by complete mitochodrial genome data analysis. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0620.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H.; PAIVA, S. R. Genetic origin of Brazilian local adapted sheep (Ovis aries) breeds by complete mitochondrial genome data analysis. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster P620.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94597/1/P0620.odt
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L. Is aromatase necessary for ovarian differentiation in tambaqui (Colossoma macropomum)? In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 99.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179107/1/CNPASA-2018-pl4.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F.; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L. Is aromatase necessary for ovarian differentiation in tambaqui (Colossoma macropomum)? In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. p. 99.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179107/1/CNPASA-2018-pl4.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A. Is aromatase necessary for ovarian differentiation in tambaqui (Colossoma macropomum)? In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 99. Na publicação: Silva, G. F., Almeida, F. L. ISRPF 2018.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A. Is aromatase necessary for ovarian differentiation in tambaqui (Colossoma macropomum)? In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON REPRODUCTIVE PHYSIOLOGY OF FISH, 11., 2018, Manaus. New fromtiers in reproductive diversity in a changing environment: program and abstracts. [S.l.: s.n.], 2018. p. 99. ISRPF 2018.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/212199/1/CNPASA-2018-poster14.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

FARIA, L. C. B.; ROCHA, A. S. L.; KLEINSCHMIDT, J. H.; SILVA-FILHO, M. C.; BIM, E.; HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.; PALAZZO JÚNIOR, R. Is a genome a codeword of an error-correcting code? PLoS ONE, San Francisco, v. 7, n. 5, e105396, May 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/60323/1/journal.pone.0036644.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P.; SILVA, F. R. da; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos. Laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., Brasília, DF, 2010. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26587/1/Bioinformatica.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Looking for the "missing" Nelore genotypes. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barras dos Coqueiros.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117421/1/LookingSBZ2014.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. Looking for the "missing" Nelore genotypes. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barras dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas. Barra dos Coqueiros: Sociedade brasileira de Zootecnia, 2014. 1 p.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117421/1/LookingSBZ2014.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IBELLI, A. M. G.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. Genes e vias metabólicas envolvidos nos mecanismos de resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 74.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26212/1/Resumo-SBG-2010.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Projeções de superfície 3D no plano para análise de interfaces proteicas através do Sting. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 78). Na publicação: Goran Neshich.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11393/1/ct78.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NEVES, K. de O. G.; SILVA, J. C. I. da; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H.; SILVA, G. F. da. Prospecção de produtos naturais de interesse biotecnológico com base na análise genômica de Streptomyces sp. MAD 27. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 78. CDMICRO 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158014/1/RA-Prospeccao-Produtos-CDMICRO-2023.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

FALCÃO, P. R. K.; MAZONI, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. Protein ligand contacts analyzed in an integrated environment with the other sequence and structure related parameters. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-49.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173861/1/I-49-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in three South American freshwater characiformes species by deep sequencing of Reduced Representation Libraries (RRL). In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Plant and animal genome abstracts. Livingston, NJ: Scherago, 2019. PE0268. PAG 2019.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in three South American freshwater characiformes species by deep sequencing of Reduced Representation Libraries (RRL). In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Plant and animal genome abstracts. Livingston, NJ: Scherago, 2019. PE0268
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208102/1/CNPASA-2019-conference.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da. RNA-seq analysis of Eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY; STRUCTURAL BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS CONFERENCE MEETING, 8., 2012, Long Beach, California. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2012. Não paginado. 1 Poster. ISMB 2012. Poster G19. Também publicado em: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado....
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da. RNA-seq analysis of Eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY; STRUCTURAL BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS CONFERENCE MEETING, 8., 2012, Long Beach, California. Abstracts. 1 Pôster. Poster G19.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72860/1/Isabel-ISMB-RNA-Seq.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas.

GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. A.; ZERTOLINI, A.; SILVA, F. R. da. RNA-Seq Analysis of Eucalyptus Genotypes that Differ in Carbon Allocation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book. [S.l.: s.n.], 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72853/1/Isabel-XMEETING-RNA-Seq.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

VILLELA, L. C. V.; ALVES, A.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Sequenciamento, montagem de novo e anotação do mitogenoma de Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmman & Eigenmman). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 104.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155993/1/CNPASA-2016-p104.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

VILLELA, L. C. V.; ALVES, A.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Sequenciamento, montagem de novo e anotação do mitogenoma de Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmman & Eigenmman). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 104.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155993/1/CNPASA-2016-p104.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

GIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H.; NICIURA, S. C. M.; DODE, M. A. N.; REGITANO, L. C. de A.; YAMAGISHI, M. E. B. Transcritos quiméricos em bovinos. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília. Anais... Brasília: Embrapa, 2010. Não paginado. Pôster 77.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26216/1/transcritos.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

GIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H.; NICIURA, S. C. M.; DODE, M. A. N.; REGITANO, L. C. A.; YAMAGISHI, M. E. B. Transcritos quiméricos em bovinos. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Não paginado. Pôster 77.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26216/1/transcritos.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.

NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.; FALCAO, P.; HENRIQUE, E.; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. Transformação de imagens 3D para 2D para análise de proteínas usando o software Sting. In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. p. 176-184. COMPSULMT 2006.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, N. M. L.; IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; ROCHA, J. L.; FARIAS, F. A.; GUERRELHAS, A. C.; CAETANO, A. R. Validation of a low-density SNP panel for genetic structure and diversity analysis of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei). In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66.; SIMPÓSIO DE CITOGENÉTICA E GENÉTICAS DE PEIXES, 19.; REUNIÃO DE GENÉTICA DE MICRORGANISMOS, 32.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE GENÉTICA PARA CONSERVAÇÃO, 2., 2021. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2021. p. 281. Evento online.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157780/1/E-Book-Genetica2021-abril2022-1.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

BELLI, A. M. G; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. A. Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: WORKSHOP EM GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Ceará. Resumos... Ceará: UECE, 2009. Não paginado. WSRGA 2009.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. de S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38076/1/PROCI-2009.00368.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. Analysing protein-protein interface using JPIV. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-14. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173850/1/I-14-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTAS, I. R. S.; JOSÉ, S. C. B. R.; PÁDUA, J. G. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Processo de Atendimento de Solicitação de Germoplasma Semente da coleção Colbase. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTA, I. R. S.; JOSE, S. C. B. R.; PÁDUA, J. G. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Processo de Incorporação de Germoplasma Semente à coleção Colbase. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTAS, I. R. S.; JOSÉ, S. C. B. R.; PÁDUA, J. G. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Processo de Monitoração da viabilidade das sementes armazenadas na coleção Colbase. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IDE, F. H.; VISOLI, M. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VACARI, I.; SANTOS, A. D. dos; QUEIROS, L. R.; COSTAS, I. R. S.; JOSÉ, S. C. B. R.; PÁDUA, J. G. Alelo - Gestor Integrado de Recursos Genéticos - Serviços de apoio à Gestão da Conservação de Longo Prazo à -20o C. Versão 0.32. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; MONTAGNER, A. J.; TOGAWA, R. C.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; PAPPAS JUNIOR, G.; MIURA, R. T.; HORITA, L. G.; NESHICH, G. ConSSeq: a web-based application for analysis of amino acid conservation based on HSSP database and within context of structure. Bioinformatics, v. 20, n. 12, p. 1983-1985, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ANGELO, P. C. da S.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, A. G.; PONCE, T. P.; ARIYOSHI, C.; SHIGUEOKA, L. H.; ARANTES, T.; GASPARINI, A. K.; SERA, G. H.; PEREIRA, L. F. P.; CAIXETA, E. T. Could genes allocated to SH3 loci contribute to other resistance factors? In: ASIC CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 29., 2023, Hanoi, Vietnam. Books of abstracts... Montpellier: ASIC, 2023. p. 167. ASIC 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159091/1/Book-of-Abstracts-Asic2023-SH3.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café.

YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2005. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 67).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/10852/1/comtec67.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; CARDOSO, F. F.; HIGA, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; RIBEIRO, A. R. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Identification of new genes in cattle of different genetic groups activated in response to tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: REUNIÓN DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 22., 2011, Montevideo, Uruguay. Memorias... Montevideo: Asociación Uruguaya de Producción Animal, 2011. 1 CD-ROM.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/45417/1/PROCI2011.00133.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.

IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; CARDOSO, F. F.; HIGA, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; RIBEIRO, A. R. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Identification of new genes in cattle of different genetic groups activated in response to tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 221, 2011
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/45417/1/PROCI2011.00133.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.

VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. G.; GROSSI, D. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010. P4020.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26888/1/PROCILCAR2010.00060.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

VERONESI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; GROSSI, D. A.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010. P4020.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26956/1/genomic.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. Genetica, v. 145, n. 1, p. 51-66, Feb. 2017.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180992/1/Villela2017-Article-CompleteMitochondrialGenomeFro.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152102/1/metabolites-13-00221-v2.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 127-137, 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160118/1/AP-Building-Higaetal-GMR-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F. Elaeis oleifera genome draft: genomics of american oil palm. In: X-MEETING, 2012, Campinas, SP. [Anais?]. Brasilia, DF: CAPES: CNPq, 2012.
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.

LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. de C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F. Elaeis oleifera genome draft - genomics of american oil palm. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75450/1/elaeis.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114451/1/ResumoCBRG-367.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 367. 1 CD-ROM.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112129/1/ResumoCBRG-367.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A. G.; HORITA, L. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Defining 3D residue environment in protein structures using SCORPION and FORMIGA. Bioinformatics, v. 20, n. 12, p. 1989-1991, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 47. X-meeting 2016.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 47. X-meeting 2016.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/158030/1/PL-Xmeeting-Zerlotini.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PAIM, T. P.; PAIVA, S. R.; TOLEDO, N. M. de; YAMAGISHI, M. E. B.; CARNEIRO, P. L. S.; FACO, O.; ARAUJO, A. M. de; AZEVEDO, H. C.; CAETANO, A. R.; BRAGA, R. M.; McMANUS, C. Origin and population structure of Brazilian hair sheep breeds. Animal Genetics, v. 52, n. 4, p. 492-504, Aug. 2021. Na publicação: M. B. Yamaghishi.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos.

IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, M. C. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. R. B; ALENCAR, M. M.; GIGLIOTI, R.; REGITANO, L. C. A. Expressão gênica diferencial em bovinos nelore, angus x nelore e senepol x nelore infestados com carrapato rhipicephalus (boophilus) microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 16., Campo Grande. Anais... Campo Grande: CBPV, 2010. Não paginado.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46600/1/Ibelli-et-al-2010-CBPV.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul.

BERG, A. S.; DITA, M.; NAN, T.; SHEA, T.; ZHOU, S.; JONKERS, W.; ZHENG, Q.; YOUNG, S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HERAI, R.; SOUZA, M.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. H. J.; KLISTLER, H.; MA, L. Genome sequencing of Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4 strain II5. Phytopathology, v. 102, n. 7, 2012. Supplement 4. Abstracts of presentations of the APS Annual meeting, Providence, RI, 2012.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. An integrated database of structural parameters for protein analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster B-44. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira, Paula R. Kuser-Falcão, Edgard H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173858/1/B-44-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CRUZ, S. A. B. da; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. JMOL and STING integration: a STING for multiple patforms. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 86. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira, Paula R. Kuser, Edgard H. Santos. X-meeting 2005. Presented Posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, G. F. da; FERNANDES, J. dos S.; MACHADO, A. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; KING, R.; URBAN, M.; Hanada, R. E.; PERREIRA, J. O.; PFENNING, L. H.; O'DONNELL, K.; HAMMOND-KOSACK, K. Fungos da Amazônia: genoma completo e edição de genoma via CRISPR-CAS9. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 9., 2019, Manaus. Anais... Manaus: Inpa, 2019. p. 569.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SILVA, G. F. da; FERNANDES, J. dos S.; MACHADO, A. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; KING, R.; URBAN, M.; Hanada, R. E.; PERREIRA, J. O.; PFENNING, L. H.; O'DONNELL, K.; HAMMOND-KOSACK, K. Fungos da Amazônia: genoma completo e edição de genoma via CRISPR-CAS9. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 9., 2019, Manaus. Anais... Manaus: Inpa, 2019. p. 569.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207828/1/anais-cbmy-2019p569.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-13.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173813/1/I-13-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structure using Bayesian classification. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 193-202, 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159942/1/AP-Predicting-Borro-GMR-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155285/1/PAG-p0484.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155285/1/PAG-p0484.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/140249/1/PAG-p0484.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/140249/1/PAG-p0484.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 6 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 76).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11391/1/ct76.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

LOBO, I. K. C.; NASCIMENTO, A. R. do; YAMAGISHI, M. E. B.; GUIGUEN, Y.; SILVA, G. F. da; SEVERAC, D.; AMARAL, A. da C.; REIS, V. R.; O'SULLIVAN, F. L. A. Transcriptome of tambaqui Colossoma macropomum during gonad differentiation: different molecular signals leading to sex identity. Genomics, v. 112, n. 3, p. 2478-2488, May 2020.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

PAPINE, J. M.; VIEIRA, M. S.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos. Structural analysis of proplasmepsin from the human malarial pathogen plasmodium vivax In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-34. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgar H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173855/1/I-34-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 18 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 14).
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPTIA/11314/1/bp14.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

OLIVEIRA, S. R. de M.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.; RODRIGUES, D. N.; SOUZA, K. R. R.; MORITA, D. U.; ALMEIDA, G. V.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. STING database quality assessment. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster B-33. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173854/1/B-33-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

OLIVEIRA, S. R. de M.; PAVANELLI, D. S.; ALMEIDA, G. V.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER, P. R.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B. da; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. STING_DB: a relational database of structural parameters for protein analysis. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 132. Na publicação: Paula R. Kuser, Edgard H. Santos. X-meeting 2005. Presented Posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; TOGAWA, R. C.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. C. F.; OKIMOTO, I. K. S.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Sting Millennium Suite: integrated software for extensive analyses of 3d structures of proteins and their complexes. BMC Bioinformatics, v. 5, p. 1-9, 2004. Na publicação: Paula R Kuser.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23949/1/sting.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

HIGA, R. H.; TOGAWA, R. C.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. C. F.; OKIMOTO, I. K. S.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Sting millennium suite: integrated software for extensive analyses of 3d structures of proteins and their complexes. BMC Bioinformatics, v. 5, n. 107, 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23949/1/sting.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Sting_RDB: a relational database of structural parameters for protein analysis with support for data warehousing and data mining. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 911-922, 2007.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159698/1/AP-Sting-GMR-2007.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NESHICH, G.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; FILETO, R.; PINTO, I. P.; PALANDRANI, J. F.; KRAUCHENCO, J. N.; BAUDET, C.; MONTAGNER, A. J.; HIGA, R. H. STING Report: convenient web-based application for graphic and tabular presentations of protein sequence, structure and function descriptors from the STING database. Nucleic Acids Research, v. 33, p. D269-D274, 2005. Na publicação: Paula R. Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

GOUVEIA, G. V.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518-524, oct. 2012.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

VENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518?524, 2011.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

VENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518-524, nov. 2012.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; CRUZ, S. A. B. da; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; HIGA, R. H. What makes the active site amino acids so different from the others: defining the structural descriptors specific for activity. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 149. Na publicação: Paula Kuser, Michel Yamagishi, Stanley Oliveira, Edgard Santos, Fabio Vieira, Sergio Cruz, Adauto Mancini, Roberto Higa. X-meeting 2005. Presented Posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NESHIC, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A. TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. The Diamond STING Server. Nucleic Acids Research, v. 33, n. 2, p. W29-W35, July 2005. Supplement.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/178422/1/ID-25540.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

NESHICH, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B. P.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. The Diamond Sting server. Nucleic Acids Research, v. 33, W29-W35, 2005.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/80301/1/Diamond-S.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SOUSA, T. F.; ARAÚJO JÚNIOR, M. B. de; PERES, E. G.; SOUZA, M. P.; SILVA, F. M. A. da; MEDEIROS, L. S. de; SOUZA, A. D. L. de; SOUZA, A. Q. L. de S.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F.; QUEIROZ, M. V. de. Discovery of dual PKS involved in sclerotiorin biosynthesis in Penicillium meliponae using genome mining and gene knockout. Archives of Microbiology, v. 205, n. 2, 75, Feb. 2023.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117783/1/de-novo-Cintra.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117783/1/de-novo-Cintra.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 2, p. 333-341, 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159948/1/AP-PDB-Metrics-Fileto-GMR-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 64., 2013, Nantes. Abstracts... Session 25, Poster 34
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95460/1/digitalizar0024.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 64., 2013, Nantes. Abstracts... Session 25, Poster 34
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95460/1/digitalizar0024.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

QUEIROZ, C. A. DE; MATOS, K. DA S.; LOBO, I. K. C.; SOUSA, S. B. DE; MUNIZ, C. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZOCOLO, G. J.; HANADA, R. E.; GASPAROTTO, L.; SOUSA, N. R.; ANDRADE, E. V. DE; CORDEIRO, I. B.; MELO, A. A. M.; SILVA, G. F. da. Morpho-anatomical and molecular characterization of the oversprouting symptoms caused by Fusarium decemcellulare in Guarana plants (Paullinia cupana var. Sorbilis). Tropical Plant Biology, 2020. in Press
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Amazônia Ocidental.

PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; ANDRADE. L. G.; GUEDES, E.; MCMANUS, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; CARNEIRO, P. L.; AZEVEDO, H. C.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H. de; LOBO, R. N. B.; ARAUJO, A. M. de; MARTINS, V. M. V.; CAETANO, A. R. Development of a low density SNP panel for parentage and traceability testing in brazilian sheep breeds for optimization of breeding and conservation programs. In: Conference International Plant & Animal Genomes, 19., 2011, San Diego.
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

GOUVEIA, J. J. de S.; PAIVA, S. R.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; KIJAS, J. W.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; SOUZA, C. J. H. de; YAMAGISHI, M. E. B.; CARNEIRO, P. L. S.; LOBO, R. N. B.; OLIVEIRA, S. M. P. de; SILVA, M. V. G. B. Genome-wide search for signatures of selection in three major Brazilian locally adapted sheep breeds. Livestock Science, n. 197, p. 36-45, 2017.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155207/1/Genome-wide.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R. S.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetic variants with potencial loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, n. 4, p. 81, 2017. Edição dos abstracts do  of Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetic variants with potential loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, p. 81, 2017. Suplemento 4, Resumo 165. Edição de Abstracts do ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show, Baltimore, 2017. Na publicação: A. Zerlotini, M. V. G. B. da Silva.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R. S.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Genetiv variants with potencial loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. Journal of Animal Science, v. 95, n. suppl. 4, p. 81, 2017. Abstract of Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

YAMAGISHI, M. E. B.; BEZERRA, G. B. P.; QUINALIA, T.; KUSER, P. R.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; CRUZ, S. A. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; NESHICH, G.; RAY, N.; MAIGRET, B. An interative protein interface surface Java Viewer. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 17. X-meeting 2005. Presented posters.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NESHICH, G.; ROCCHIA, W.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER, P. R.; FILETO, R.; BAUDET, C.; PINTO, I. P.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. F.; KRAUCHENCO, J. N.; TORRES, R. C.; SOUZA, S.; TOGAWA, R. C.; HIGA, R. H. Java Protein Dossier: a novel web-based data visualization tool for comprehensive analysis of protein structure. Nucleic Acids Research, v. 32, W595-W601, 2004.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

NESHICH, G.; YAMAGISHI, M. E. B.; ROCCHIA, W.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; FILETO, R.; BAUDET, C.; PINTO, I. P.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. F.; KRAUCHENCO, J. N.; TORRES, R. C.; BEZERRA, G. B. P.; SOUZA, S.; TOGAWA, R. C.; HIGA, R. H. Protein structure analysis and visualization using Java Protein Dossier. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON CHEMOMETRICS AND BIOINFORMATICS IN ASIA, 2004, Shanghai. Proceedings... Shanghai: [s.n.], 2004. 1 p. CCBA 2004. Na publicação: Paula R. Kuser.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Sequencing and de novo genome assembley of a Nelore (Bos indicus) bull. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0522.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Sequencing and de novo genome assembly of a nelore (Bos indicus) bull. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 0522.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94595/1/P0522.odt
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. Plos One, v. 12, n. 3, p. 1-15, 2017. Artigo e0173954. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/171980/1/AP-Single-nucleotide-Stafuzza-etal.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and indels identified from whole-genome resequencing of Gyr, Girolando, and Holstein cattle breeds. Journal of Animal Science, v. 95, n. 4, p. 80-81, 2017. Edição dos abstracts do Breeding and Genetics Symposium, Baltimore, 2017.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1073801/1/Single-nucleotide.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. Single nucleotide variants and indels identified from whole-genome resequencing of Gyr, Girolando, and Holstein cattle breeds. Journal of Animal Science, v. 95, p. 80-81, 2017. Suplemento 4, Resumo 164. Edição de Abstracts do ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show, Baltimore, 2017. Na publicação: A. Zerlotini, M. V. G. B. da Silva.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

JARDINE, J. G.; NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MARANGONI, S.; MARTINS, D.; WINCK, F. V.; NOVELLO, J. C.; PAPINE, J. M.; VIEIRA, M. S. Structural analysis of the protein twitching motility. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-35. Na publicação: Paula R. Kuser-Falcão, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173857/1/I-35-ISMB-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

SOUSA, T. F.; REÇA, B. N. P. V.; CASTRO, G. S.; SILVA, I. J. S. da; CANIATO, F. F.; JÚNIOR, M. B. de A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H. F.; BATAGLION, G. A.; HANADA, R. E.; SILVA, G. F. da. Trichoderma agriamazonicum sp. nov. (Hypocreaceae), a new ally in the control of phytopathogens. Microbiological Research, v. 275, 127469, Oct. 2023.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.

NESHICH, G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; BORRO, L. C.; MORITA, D. U.; SOUZA, K. R. R.; ALMEIDA, G. V.; RODRIGUES, D. N.; JARDINE, J. G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H.; MELO, R. C.; SANTORO, M. M. The Star STING server: a multiplatform environment for protein structure analysis. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 4, p. 717-722, 2006.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159950/1/AP-StarSting-Neshich-GMR-2006.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

PAIM, T. do P.; McMANUS, C.; VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.; FACÓ, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAÚJO, A. M. de; MORAES, J. C. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; CARNEIRO, P. L. S.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validation of a customized subset of SNPs for sheep breed assignment in Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 54, p. 1-5, 2019. Article number: e00506. Título em português: Validação de um subconjunto de SNPs específicos para certificação racial de ovinos no Brasil.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/197140/1/Validation-of-a-customized-subset-of-SNPs.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais.

PAIVA, S. R.; VIEIRA, F. D.; YAMAGISHI, M. E. B.; LACERDA, T. S.; VASCONCELOS, C.; TANNO, P.; HIGA, R. H.; McMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; AZEVEDO, H. C.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H.; ARAUJO, A. M.; MARTINS, V. M. V.; CAETANO, A. Validation of a low density SNP panel for breed certification testing in Brazilian sheep (Ovis aries) breeds as a tool for flock genetic management. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. p. 1. Pôster.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/52904/1/Abstract-PAG-2012.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

PAIVA, S. R.; VIEIRA, F. D.; YAMAGISHI, M. E. B.; LACERDA, T. S.; VASCONCELOS, C.; TANNO, P.; HIGA, R. H.; McMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; AZEVEDO, H. C.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H.; ARAUJO, A. M.; MARTINS, V. M. V.; CAETANO, A. Validation of a low density SNP panel for breed certification testing in Brazilian sheep (Ovis aries) breeds as a tool for flock genetic management. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. p. 1. Pôster.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/52904/1/Abstract-PAG-2012.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos.

PAIVA, S. R.; VIEIRA, F. D.; YAMAGISHI, M. E. B.; LACERDA, T. S.; VASCONCELOS, C.; TANNO, P.; HIGA, R. H.; MCMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; AZEVEDO, H. C.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H. de; ARAUJO, A. M. de; MARTINS, V. M. V.; CAETANO, A. R. Validation of a Low Density SNP Panel for Breed Certification Testing in Brazilian Sheep (Ovis aries) Breeds as a Tool for Flock Genetic Management. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster. P581.
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.

NESHICH, G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; PAPPAS JUNIOR, G.; TORRES, W. V.; CAMPOS, T. F. e; FERREIRA, L. L.; LUNA, F. M.; OLIVEIRA, A. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; HORITA, L. G.; SOUZA, D. F. de; DOMINIQUINI, F.; ÁLVARO, A.; LIMA, C. S.; OGAWA, F. O.; GOMES, G. B.; PALANDRANI, J. F.; SANTOS, G. F. dos; FREITAS, E. M. de; MATTIUZ, A. R.; COSTA, I. C.; ALMEIDA, C. L. de; SOUZA, S.; BAUDET, C.; HIGA, R. H. STING Millennium: a web-based suite of programs for comprehensive and simultaneous analysis of protein structure and sequence. Nucleic Acids Research, London, v. 31, n. 13, p. 3386-3392, July 2003. Na publicação: Paula R. Kuser.
URL: https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23940/1/sting578.pdf
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.