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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
27/02/2009 |
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Data da última atualização: |
25/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; TASSELL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; SCHROEDER, S.; VANRADEN, P.; WIGGANS, G. |
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Afiliação: |
Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva Embrapa Gado de Leite / USDA USA; Curtis Van Tassell USDA USA; Tad S. Sonstegard USDA USA; Lakshmi Matukumalli George Mason University USA; Steven Schroeder USDA USA; Paul VanRaden USDA USA; George Wiggans USDA USA. |
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Título: |
Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos. |
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Palavras-Chave: |
Bovinos; Seleção genômica; SNP. |
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Thesagro: |
Marcador Genético. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/596763/1/Predicao-do-valor-genetico-total-de-touros-da-raca-Holandesa.pdf
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Marc: |
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520 $aA seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 1. |  | PIRES, J. L.; GRAMACHO, K. P.; MELO, G. P.; YAMADA, M. M. Cocoa breeding program. In: COMMON FUND FOR COMMODITIES. Project: The use of molecular biology techniques in search for varieties resistant to wotches' broom disease of cocoa. Amsterdam: CFC, 2010. p. 122-130. (CFC Technical Paper, 55).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 2. | | YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; SANTOS, R. F. dos; PIRES, J. L. Relação entre incompatibilidade, cor de frutos, incidência de vassoura-de-bruxa e a produção de frutos em cacaueiro. Agrotrópica, v. 26, n. 3, p. 207-210, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 5. | | YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; LOPES, U. V.; FLORES, A. B.; PIRES, J. L. Genetic divergence in cocoa progenies for backcrossing program to witches’ broom disease resistance. Revista Ceres, Viçosa, v. 57, n. 1, p. 73-78, ja./fev., 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 13. | | REHEM, B. C.; ALMEIDA, A. A. F.; CORRÊA, R. X.; GESTEIRA, A. da S.; YAMADA, M. M.; VELLE, R. R. Genetic mapping of Theobroma cacao (Malvaceae) seedlings of the Parinari series, carriers of the lethal gene Luteus-Pa. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 3, p. 1775-1784, 2010. Disponível em: Acesso em: 26 out. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 14. | | YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; CLEMENT, D. P. L.; LOPES, U. V.; PIRES, J. L.; MELO, G. R. P. Relationship between molecular markers and incompatibility in Theobroma cacao L. Agrotropica, v. 22, n. 2, p. 71-74, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 15. | | YAMADA, M. M.; FLORES, A. B.; FALEIRO, F. G.; MELO, G. R. P.; MACEDO, M. M.; LOPES, U. V.; XAVIER, R. C.; SANTOS, R. F. dos. Identificação e variabilidade genética de acessos de cacaueiros autocompatíveis selecionados para resistência à vassoura-de-bruxa em fazendas produtoras. Agrotrópica, Itabuna, v. 17, p. 17-22, 2005. Publicado em dezembro de 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 16. | | ANDRADE, I. S.; LEAL, J. B.; FARIA, J. C.; GAIOTTO, F. A.; AHNERT, D.; YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; CRUZ, C. D.; CORRÊA, R. X. Diversidade genética de clones de cacaueiros por marcadores microssatélites visando identificar novas fontes de resistência à vassoura-de-bruxa. Magistra, Cruz das Almas, v. 18, p. 78, 2006. Número especial. Resumos do 2º Workshop de Recursos Genéticos Vegetais no Estado da Bahia, Ilhéus, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 17. | | ANDRADE, I. S.; LEAL, J. B.; FARIA, J. C.; GAIOTTO, F. A.; AHNERT, D.; YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; CRUZ, C. D.; CORRÊA, R. X. Diversidade genética de clones de cacaueiros por marcadores microssatélites visando identificar novas fontes de resistência à vassoura-de-bruxa. Magistra, Cruz das Almas, v.18, número especial, p. 78, outubro 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 18. | | REHEM, B. C.; ALMEIDA, A. A. F.; FIGUEIREDO, G. S. F.; GESTEIRA, A. da S.; SANTOS, S. C.; CORRÊA, R. X.; YAMADA, M. M.; VALL, R. R. Differential expression of the lethal gene Luteus-Pain cacao of the Parinari series. Genetics and Molecular Research, v.15, n.1. [2016].| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | YAMADA, M. M.; FALEIRO, F. G.; FLORES, A. B.; LOPES, U. V.; PIRES, J. L.; CORRÊA, R. X.; SANTOS, R. F. dos. Microsatellite diversity and heterozygosity of parents of a cocoa breeding population. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 9, p. 17-22, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 20. | | FALEIRO, F. G.; PEREIRA, M. G.; CLEMENT, D.; LOPES, U. V.; YAMADA, M. M.; ARAÚJO, I. S.; PIRES, J. L.; PEREIRA, J. L. Mapping genes of resistance in cocoa. In: COMMON FUND FOR COMMODITIES. Project: The use of molecular biology techniques in search for varieties resistant to wotches' broom disease of cocoa. Amsterdam: CFC, 2010. Cap. 2. p. 34-52. (CFC Technical Paper, 55).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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