|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
26/09/2017 |
Data da última atualização: |
26/09/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERSEGUINI, J. M. K. C.; OBLESSUC, P. R.; ROSA, J. R. B. F.; GOMES, K. A.; CHIORATO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; GARCIA, A. A. F.; VIANELLO, R. P.; BENCHIMOL-REIS, L. L. |
Afiliação: |
JULIANA MORINI KÜPPER CARDOSO, IAC; PAULA RODRIGUES OBLESSUC, LABORATÓRIO NACIONAL DE BIOCIÊNCIAS, Campinas-SP; JOÃO RICARDO BACHEGA FEIJÓ ROSA, ESALQ; KLEBER ALVES GOMES, IAC; ALISSON FERNANDO CHIORATO, IAC; SERGIO AUGUSTO MORAIS CARBONELL, IAC; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA, ESALQ; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; LUCIANA LASRY BENCHIMOL-REIS, IAC. |
Título: |
Genome-wide association studies of anthracnose and angular leaf spot resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L.). |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 11, n. 3, e0150506, Mar. 2016. |
DOI: |
10.1371/journal.pone.0150506 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per genotype in each replicate. Association mapping analyses were performed for ANT and ALS using a mixed linear model approach implemented in TASSEL. A total of 17 and 11 significant statistically associations involving SSRs were detected for ANT and ALS resistance loci, respectively. Using SNPs, 21 and 17 significant statistically associations were obtained for ANT and angular ALS, respectively, providing more associations with this marker. The SSR-IAC167 and PvM95 markers, both located on chromosome Pv03, and the SNP scaffold00021_89379, were associated with both diseases. The other markers were distributed across the entire common bean genome, with chromosomes Pv03 and Pv08 showing the greatest number of loci associated with ANT resistance. The chromosome Pv04 was the most saturated one, with six markers associated with ALS resistance. The telomeric region of this chromosome showed four markers located between approximately 2.5 Mb and 4.4 Mb. Our results demonstrate the great potential of genome-wide association studies to identify QRLs related to ANT and ALS in common bean. The results indicate a quantitative and complex inheritance pattern for both diseases in common bean. Our findings will contribute to more effective screening of elite germplasm to find resistance alleles for marker-assisted selection in breeding programs. MenosThe common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per genotype in each replicate. Association mapping analyses were performed for ANT and ALS using a mixed linear model approach implemented in TASSEL. A total of 17 and 11 significant statistically associations involving SSRs were detected for ANT and ALS resistance loci, respectively. Using SNPs, 21 and 17 significant statistically associations were obtained for ANT and angular ALS, respectively, providing more associations with this marker. The SSR-IAC167 and PvM95 markers, both located on chromosome Pv03, and the SNP scaffold00021_89379, were associated with both diseases. The other markers were distributed across the entire common bean genome, with chromosomes Pv03 and Pv08 showing the greatest number of loci associated with AN... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Antracnose; Colletotrichum lindemuthianum; Feijão; Genoma; Mancha foliar; Phaseolus vulgaris. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164342/1/CNPAF-2016-plosone.pdf
|
Marc: |
LEADER 03030naa a2200301 a 4500 001 2076304 005 2017-09-26 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/journal.pone.0150506$2DOI 100 1 $aPERSEGUINI, J. M. K. C. 245 $aGenome-wide association studies of anthracnose and angular leaf spot resistance in common bean (Phaseolus vulgaris L.).$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aThe common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the world?s most important legume for human consumption. Anthracnose (ANT; Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (ALS; Pseudocercospora griseola) are complex diseases that cause major yield losses in common bean. Depending on the cultivar and environmental conditions, anthracnose and angular leaf spot infections can reduce crop yield drastically. This study aimed to estimate linkage disequilibrium levels and identify quantitative resistance loci (QRL) controlling resistance to both ANT and ALS diseases of 180 accessions of common bean using genomewide association analysis. A randomized complete block design with four replicates was performed for the ANT and ALS experiments, with four plants per genotype in each replicate. Association mapping analyses were performed for ANT and ALS using a mixed linear model approach implemented in TASSEL. A total of 17 and 11 significant statistically associations involving SSRs were detected for ANT and ALS resistance loci, respectively. Using SNPs, 21 and 17 significant statistically associations were obtained for ANT and angular ALS, respectively, providing more associations with this marker. The SSR-IAC167 and PvM95 markers, both located on chromosome Pv03, and the SNP scaffold00021_89379, were associated with both diseases. The other markers were distributed across the entire common bean genome, with chromosomes Pv03 and Pv08 showing the greatest number of loci associated with ANT resistance. The chromosome Pv04 was the most saturated one, with six markers associated with ALS resistance. The telomeric region of this chromosome showed four markers located between approximately 2.5 Mb and 4.4 Mb. Our results demonstrate the great potential of genome-wide association studies to identify QRLs related to ANT and ALS in common bean. The results indicate a quantitative and complex inheritance pattern for both diseases in common bean. Our findings will contribute to more effective screening of elite germplasm to find resistance alleles for marker-assisted selection in breeding programs. 650 $aAntracnose 650 $aColletotrichum lindemuthianum 650 $aFeijão 650 $aGenoma 650 $aMancha foliar 650 $aPhaseolus vulgaris 700 1 $aOBLESSUC, P. R. 700 1 $aROSA, J. R. B. F. 700 1 $aGOMES, K. A. 700 1 $aCHIORATO, A. F. 700 1 $aCARBONELL, S. A. M. 700 1 $aGARCIA, A. A. F. 700 1 $aVIANELLO, R. P. 700 1 $aBENCHIMOL-REIS, L. L. 773 $tPlos One$gv. 11, n. 3, e0150506, Mar. 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
07/10/2004 |
Data da última atualização: |
17/03/2008 |
Autoria: |
KRZYZANOWSKI, F. C.; FRANÇA NETO, J. de B.; COSTA, N. P. da; HENNING, A. A.; VIEIRA, B. G. T. L. |
Título: |
Influência do tamanho da semente na produtividade da cultura da soja. |
Ano de publicação: |
2004 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA NA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 26., 2004, Ribeirão Preto. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: Fundação Meridional, 2004. |
Páginas: |
p. 318-319. |
Série: |
(Embrapa Soja. Documentos, 234). |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite. |
Conteúdo: |
O objetivo foi avaliar o efeito de diferentes tamanhos da semente de soja na produtividade da cultura. Sementes das cultivares precoces, BRS 212 e Embrapa 48, semiprecoces, BRS 133 e BRS 214 e a de ciclo médio BRS 134 foram semeadas em parcelas, em Londrina, na época ideal nos anos 2002/03 e 2003/04, padronizando-se a mesma população de plantas para todos os tratamentos. Quatro tamanhos de semente foram utilizados por cultivar. O delineamento experimental foi blocos ao acaso em fatorial com quatro repetições. Em relação à produtividade, apenas as cultivares BRS 212, na safra 02/03, e a BRS 133, na safra 03/04, mostraram tendência de redução de produtividade diretamente relacionada ao tamanho da semente. Na BRS 212, a produtividade baixou de 2.681 kg/ha, na peneira 7,0 mm, para 1.535 kg/ha, na peneira 5,5 mm, e na BRS 133, baixou de 2.590 kg/ha, na peneira 7,0 mm, para 1.997 kg/ha, na peneira 5,5 mm. A execução dessa pesquisa terá continuidade, avaliando-se os possíveis efeitos do tamanho da semente em diferentes regiões edafoclimáticas do Brasil. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01867naa a2200205 a 4500 001 1467472 005 2008-03-17 008 2004 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aKRZYZANOWSKI, F. C. 245 $aInfluência do tamanho da semente na produtividade da cultura da soja. 260 $c2004 300 $ap. 318-319. 490 $a(Embrapa Soja. Documentos, 234). 500 $aOrganizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite. 520 $aO objetivo foi avaliar o efeito de diferentes tamanhos da semente de soja na produtividade da cultura. Sementes das cultivares precoces, BRS 212 e Embrapa 48, semiprecoces, BRS 133 e BRS 214 e a de ciclo médio BRS 134 foram semeadas em parcelas, em Londrina, na época ideal nos anos 2002/03 e 2003/04, padronizando-se a mesma população de plantas para todos os tratamentos. Quatro tamanhos de semente foram utilizados por cultivar. O delineamento experimental foi blocos ao acaso em fatorial com quatro repetições. Em relação à produtividade, apenas as cultivares BRS 212, na safra 02/03, e a BRS 133, na safra 03/04, mostraram tendência de redução de produtividade diretamente relacionada ao tamanho da semente. Na BRS 212, a produtividade baixou de 2.681 kg/ha, na peneira 7,0 mm, para 1.535 kg/ha, na peneira 5,5 mm, e na BRS 133, baixou de 2.590 kg/ha, na peneira 7,0 mm, para 1.997 kg/ha, na peneira 5,5 mm. A execução dessa pesquisa terá continuidade, avaliando-se os possíveis efeitos do tamanho da semente em diferentes regiões edafoclimáticas do Brasil. 700 1 $aFRANÇA NETO, J. de B. 700 1 $aCOSTA, N. P. da 700 1 $aHENNING, A. A. 700 1 $aVIEIRA, B. G. T. L. 773 $tIn: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA NA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 26., 2004, Ribeirão Preto. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: Fundação Meridional, 2004.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|