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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
30/03/2012 |
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Data da última atualização: |
30/03/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SAWAZAKI, H. E.; SÁ, L. A. N. de; ALCÂNTARA, M. Q.; POLEZ, V. L. P.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. |
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Afiliação: |
HAIKO ENOK SAWAZAKI, IAC; LUIZ ALEXANDRE NOGUEIRA DE SA, CNPMA; MAILA Q. ALCÂNTARA, CNPq. |
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Título: |
Otimização da diagnose molecular de vírus, bactéria e fungo em cana-de-açúcar. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Biológico, São Paulo, v. 73, n. 2, p. 282-287, 2011. Anais da 24ª Reunião Anual do Instituto Biológico, São Paulo, nov. 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
RESUMO: Visando à otimização da diagnose molecular de plântulas de cana-de-açúcar, tentou-se desenvolver iniciadores específicos para escaldadura e ferrugem alaranjada, assim como a comparação da PCR comum e a PCR em Tempo Real (PCR/TR) de maior resolução, importante para doenças com grande período de latência, como as causadas por: 1- Bactérias, (a) raquitismo-da-soqueira (Leifsonina xyli subsp. Xyli) e (b) escaldadura (Xanthomonas aibilineans); 2- Vírus, (a) amarelinho (Sugarcane Yellow Leaf Vírus); (b) mosaico (Sugarcane Mosaic Vírus) e (c) fijivirus (Fiji disease vírus); 3- fungo, (a) carvão (Sporisorium scitamineum) e (b) ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii). As plântulas foram obtidas do quarentenário do IAC. Os iniciadores da literatura para cana-de-açúcar detectaram especificamente o raquitismo, amarelinho, mosaico e fijivirus, enquanto os desenvolvidos para PCR/TR para as mesmas doenças, incluindo a escaldadura e ferrugem alaranjada, possibilitaram a detecção com maior diluição das amostras. Os iniciadores da ferrugem alaranjada, além de não detectarem a ferrugem marrom, também diferenciaram a ferrugem branca do milho. Os da escaldadura não foram específicos somente para o gênero Erwinia, enquanto que os da literatura não diferenciaram também outras espécies dos gêneros Kanthomonas, Pseudomonas, Enwinia, Stenotrophomona e Pantoea. A otimização das diluições para PCR/TR a partir de cDNA foi de apenas lOX. Porém, para extratos de DNA de planta, foi maior, de lOOX a lOOOX,indicando a maior sensibilidade do método. Dos 28 pares de iniciadores testados, os melhores para o agente causal de cada doença e curvas de diluições (com eficiência de PCR de 1,05 a 1,28) são apresentados. MenosRESUMO: Visando à otimização da diagnose molecular de plântulas de cana-de-açúcar, tentou-se desenvolver iniciadores específicos para escaldadura e ferrugem alaranjada, assim como a comparação da PCR comum e a PCR em Tempo Real (PCR/TR) de maior resolução, importante para doenças com grande período de latência, como as causadas por: 1- Bactérias, (a) raquitismo-da-soqueira (Leifsonina xyli subsp. Xyli) e (b) escaldadura (Xanthomonas aibilineans); 2- Vírus, (a) amarelinho (Sugarcane Yellow Leaf Vírus); (b) mosaico (Sugarcane Mosaic Vírus) e (c) fijivirus (Fiji disease vírus); 3- fungo, (a) carvão (Sporisorium scitamineum) e (b) ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii). As plântulas foram obtidas do quarentenário do IAC. Os iniciadores da literatura para cana-de-açúcar detectaram especificamente o raquitismo, amarelinho, mosaico e fijivirus, enquanto os desenvolvidos para PCR/TR para as mesmas doenças, incluindo a escaldadura e ferrugem alaranjada, possibilitaram a detecção com maior diluição das amostras. Os iniciadores da ferrugem alaranjada, além de não detectarem a ferrugem marrom, também diferenciaram a ferrugem branca do milho. Os da escaldadura não foram específicos somente para o gênero Erwinia, enquanto que os da literatura não diferenciaram também outras espécies dos gêneros Kanthomonas, Pseudomonas, Enwinia, Stenotrophomona e Pantoea. A otimização das diluições para PCR/TR a partir de cDNA foi de apenas lOX. Porém, para extratos de DNA de planta, foi maior, de lOOX a ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análises moleculares; Cana-de-açúcar; Raquitismo-da-soqueira. |
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Thesagro: |
Amarelinho; Bactéria; Carvão; Escaldadura; Ferrugem Alaranjada; Mosaico; Vírus. |
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Thesaurus Nal: |
Fijivirus; Plant diseases and disorders; Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56756/1/2011AA106.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 608 | |
| 8. |  | VIANA, J. H. M. Mineralogia das frações areia e silte dos solos da IX RCC. In: SILVA, L. M. da; ANJOS, L. H. C. dos; LUMBRERAS, J. F.; PEREIRA, M. G.; WADT, P. G. S. (Ed.). Pesquisas coligadas da IX Reunião Brasileira de Classificação e Correlação de Solos: solos de formações sedimentares em sistemas amazônicos: potencialidades e demandas de pesquisa. Brasília, DF: Embrapa, 2019.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 11. | | DONAGEMMA, G. K.; VIANA, J. H. M. Argila dispersa em água e grau de floculação. In: TEIXEIRA, P. C.; DONAGEMMA, G. K.; FONTANA, A.; TEIXEIRA, W. G. (Ed.). Manual de métodos de análise de solo. 3. ed. rev. e ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2017. pt. 1, cap. 11, p. 117-124.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
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| 12. | | VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K. Análise granulométrica e fracionamento de areias como subsídio para a interpretação de perfis de solos da RCC de Rondônia. In: LUMBRERAS, J. F.; SILVA, L. M. da; ANJOS, L. H. C. dos; OLIVEIRA, V. A. de; WADT, P. G. S.; PEREIRA, M. G.; DELARMELINDA-HONORÉ, E. A.; BURITY, K. T. L. (Ed.). Guia de campo da XII Reunião Brasileira de Classificação e Correlação de Solos: RCC de Rondônia. Brasília, DF: Embrapa, 2019. E-book. cap. 11.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K. Granulometria dos solos da RCC de Roraima: subsídios a sua gênese, classificação e manejo. In: BATISTA, K. D.; LUMBRERAS, J. F.; COELHO, M. R.; OLIVEIRA, V. A. de; VALE JÚNIOR, J. F. do (Ed.). Guia de campo da XI Reunião Brasileira de Classificação e Correlação de Solos: RCC de Roraima. Brasília, DF: Embrapa, 2018. cap. 5.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
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| 17. | | VIANA, J. H. M.; DONAGEMMA, G. K. Limite de pegajosidade. In: TEIXEIRA, P. C.; DONAGEMMA, G. K.; FONTANA, A.; TEIXEIRA, W. G. (Ed.). Manual de métodos de análise de solo. 3. ed. rev. e ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2017. pt. 1, cap. 15, p. 149-151.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
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