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| Registros recuperados : 321 | |
| 301. |  | HAMAWAKI, R. L.; SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P.; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F.; SOUZA FILHO, J. S. de; FERNANDES NETO, J. T.; SOARES, A. K. C. Efeito de doses de potássio na produção e nos teores foliares de K+ do algodoeiro no Oeste Baiano, safra 2004/2005. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p.1-5 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 302. | | HAMAWAKI, R. L.; SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F.; SOUZA FILHO, J. S.; FERNANDES NETO, J. T.; SOARES, A. K. C. Efeito de doses de potássio na produção e nos teores foliares de K+ do algodoeiro no oeste baiano, Safra 2004/2005. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 303. | | FERREIRA, G. B.; ALMEIDA, R. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; FARIAS, F. J. de; MIRANDA, C. H. B.; CARVALHO, M. da C. S.; FAVARO, S. P.; SILVA FILHO, P. M. da; SILVA, H. R. da; DENARDIN, J. E.; ROCHA, M. de M.; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; MUTADIUA, C. A. P.; MALEIA, M. P.; NAPITA, I. C.; SIMBA, D. Produção de algodão em função de doses de fósforo e potássio em Nampula, Moçambique, campanha 2013/2014. In: SEMINÁRIO DE DIVULGAÇÃO DE RESULTADOS DA INVESTIGAÇÃO AGRÁRIA NO CORREDOR DE NACALA, 2., 2015, Lichinga, Moçambique. Anais... Lichinga, Moçambique: Instituto de Investigação Agrária de Moçambique, 2015. p. 348-354. Editores técnicos: Fernando João Sualei, Oscar Chichongue, Guilhermino Boina, Simone Palma Favaro, Cesar Heraclides Behling Miranda.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 304. | | FERREIRA, G. B.; ALMEIDA, R. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; FARIAS, F. J. de; MIRANDA, C. H. B.; CARVALHO, M. da C. S.; FAVARO, S. P.; SILVA FILHO, P. M. da; SILVA, H. R. da; DENARDIN, J. E.; ROCHA, M. de M.; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; MUTADIUA, C. A. P.; MALEIA, M. P.; NAPITA, I. C.; SIMBA, D. Produção de algodão em função de doses de fósforo e potássio em Nampula, Moçambique, campanha 2013/2014. In: SEMINÁRIO DE DIVULGAÇÃO DE RESULTADOS DA INVESTIGAÇÃO AGRÁRIA NO CORREDOR DE NACALA, 2., 2015, Lichinga, Moçambique. Anais... Lichinga, Moçambique: Instituto de Investigação Agrária de Moçambique, 2015. p. 348-354. Editores técnicos: Fernando João Sualei, Oscar Chichongue, Guilhermino Boina, Simone Palma Favaro, Cesar Heraclides Behling Miranda.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 305. | | FERREIRA, G. B.; ALMEIDA, R. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; FARIAS, F. J. de; MIRANDA, C. H. B.; CARVALHO, M. da C. S.; FAVARO, S. P.; SILVA FILHO, P. M. da; SILVA, H. R. da; DENARDIN, J. E.; ROCHA, M. de M.; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; MUTADIUA, C. A. P.; MALEIA, M. P.; NAPITA, I. C.; SIMBA, D. Produção de algodão em função de doses de fósforo e potássio em Nampula, Moçambique, campanha 2013/2014. In: SEMINÁRIO DE DIVULGAÇÃO DE RESULTADOS DA INVESTIGAÇÃO AGRÁRIA NO CORREDOR DE NACALA, 2., 2015, Lichinga, Moçambique. Anais... Lichinga, Moçambique: Instituto de Investigação Agrária de Moçambique, 2015. Editado por Fernando João Sualei, Oscar Chichongue, Guilhermino Boina, Simone Palma Favaro, Cesar Heraclides Behling Miranda. p. 348-354.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 306. | | FERREIRA, G. B.; SANTOS, J. B. dos; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; FREIRE, R. M. M.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F.; SANTOS, D. C. dos; NASCIMENTO, P. N. do. Produção do algodoeiro em resposta a dose e modos de aplicação de potássio no cerrado da Bahia, Safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 307. | | FERREIRA, G. B.; SANTOS, J. B. dos; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; FREIRE, R. M. M.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F.; SANTOS, D. C. dos; NASCIMENTO, P. N. do. Produção do algodoeiro em resposta a doses e modos de aplicação de potássio no Cerrado da Bahia, safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 308. | | SANTOS, F. C. dos; FERREIRA, G. B.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SANTOS, J. B. dos; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; LINS, S. A. da S.; SOUSA, R. L. A. de; FREIRE, R. M. M. Produtividade do algodão e qualidade da fibra em resposta a doses e formas de aplicação do Nitrogênio em solo arenoso do Cerrado do Oeste Baiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Cerrados. |
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| 309. | | SANTOS, F. C. dos; FERREIRA, G. B.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; SANTOS, J. B. dos; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; LINS, S. A. da S.; SOUSA, R. L. A. de; FREIRE, R. M. M. Produtividade do algodão e qualidade da fibra em resposta a doses e formas de aplicação do nitrogênio em solo arenoso do cerrado do Oeste Baiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 310. | | SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; HAMAWAKI, R. L.; MONTEIRO, C. M. A.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. da; SANTOS, F. D. S. dos; MINA, V. G. Qualidade da fibra do algodoeiro em função de doses e modos de aplicação de potássio no Oeste da Bahia, safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-4 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 311. | | SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; HAMAWAKI, R. L.; MONTEIRO, C. M. A.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. da; SANTOS, F. D. S. dos; MINA, V. G. Qualidade de Fibra do algodoeiro em função de doses e modos de aplicação de potássio no Oeste da Bahia. Safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 312. | | FERREIRA, G. B.; VASCONCELOS, O. L.; ANDRADE, F. P. de; FREIRE, R. M. M.; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; ALENCAR, A. R. de; FERREIRA, A. F.; PIRES, C. G.; ABREU JÚNIOR, J. de S.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F. Seleção de variedades de algodão para o Sudoeste Baiano em função de sua capacidade de resposta à adubação NPK, safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-7 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 313. | | FERREIRA, G. B.; VASCONCELOS, O. L.; ANDRADE, F. P. de; FREIRE, R. M. M.; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; ALENCAR, A. R. de; FERREIRA, A. F.; PIRES, C. G.; ABREU JÚNIOR, J. de S.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F. Seleção de variedades de algodão para o sudoeste baiano em função de sua capacidade de resposta à adubação NPK, safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 314. | | SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; HAMAWAKI, R. L.; MONTEIRO, C. M. A.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; LINS, S. A. da S.; SOUZA, R. L. A. de. Resposta de doses e modo de aplicação de potássio na produção do algodoeiro no Oeste na Bahia. Safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 315. | | SANTOS, J. B. dos; FERREIRA, G. B.; HAMAWAKI, R. L.; MONTEIRO, C. M. A.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P. de; FREIRE, R. M. M.; VALENÇA, A. R.; SAMPAIO, L. R.; LINS, S. A. da S.; SOUSA, R. L. A. de. Respostas de doses e modo de aplicação de potássio na produção do algodoeiro no Oeste da Bahia, safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-4 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 316. | | FERREIRA, G. B.; SANTOS, J. B. dos; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; FREIRE, R. M. M.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P.; TAVARES, J. A.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F. Resposta do algodoeiro ao parcelamento e a doses de nitrogênio no Cerrado da Bahia, safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 317. | | FERREIRA, G. B.; SANTOS, J. B. dos; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; FREIRE, R. M. M.; ALENCAR, A. R. de; OLIVEIRA, W. P.; TAVARES, J. A.; VALENÇA, A. R.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F. Resposta do algodoeiro ao parcelamento e a doses de nitrogênio no cerradoda Bahia, Safra 2003/2004. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 6., Uberlândia, MG, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 318. | | FERREIRA, G. B.; ALMEIDA, R. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; SILVA, H. R. da; MIRANDA, C. H. B.; CARVALHO, M. da C. S.; SILVA FILHO, P. M. da; DENARDIN, J. E.; ROCHA, M. de M.; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; MUTADIUA, C.; IPO, A. do R.; MALEIA, M. P.; NAPITA, I. C.; SIMBA, D. Response of cotton to increasing rates od phosphorus and potassium in Muriaze, Nampula province, Mozambique. In: Seminário de divulgação de resultados da investigação agrária no corredor de Nacala, 1., 2014, Nampula.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 319. | | FERREIRA, G. B.; ALMEIDA, R. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; SILVA, H. R. da; MIRANDA, C. H. B.; CARVALHO, M. da C. S.; SILVA FILHO, P. M. da; DENARDIN, J. E.; ROCHA, M. de M.; NEUMAIER, N.; CRUZ, I.; MUTADIUA, C.; IPO, A. do R.; MALEIA, M. P.; NAPITA, I. C.; SIMBA, D. Response of cotton to increasing rates of phosphorus and potassium in Muriaze, Nampula Province, Mozambique. In: SEMINÁRIO DE DIVULGAÇÃO DE RESULTADOS DA INVESTIGAÇÃO AGRÁRIAS NO CORREDOR DE NACALA, 1., 2014, Nampula. Nampula: Instituto de Investigação Agrária de Moçambique, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 320. | | FERREIRA, G. B.; VASCONCELOS, O. L.; ANDRADE, F. P. de; FREIRE, R. M. M.; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; ALENCAR, A. R. de; FERREIRA, A, F.; PIRES, C. G.; VALENÇA, A. R.; LINS, S. A. da S.; SOUSA, R. L. A. de; SILVA, L. C. da; SANTOS, F. D. S. dos; MINA, V. G.; SILVA, L. C. P. da; FARIAS, D. R. de; SAMPAIO, L. R.; RIBEIRO, R. R. F. Adequação de adubação, espaçamento e variedade cultivada para melhoria da produtividade do algodoeiro no Sudoeste da Bahia, safra 2005/2006. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-6 1 CD-ROM Solos e nutrição de plantas| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| Registros recuperados : 321 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
19/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
FONSECA, P. A. S.; LEAL, T. P.; SANTOS, F. C.; GOUVEIA, M. H.; ID-LAHOUCINE, S.; ROSSE, I. C.; VENTURA, R. V.; BRUNELI, F. A. T.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TARAZONA-SANTOS, E.; CARVALHO, M. R. S. |
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Afiliação: |
PABLO A. S. FONSECA, UFMG; THIAGO P. LEAL, UFMG; FERNANDA C. SANTOS, UFMG; MATEUS H. GOUVEIA, UFMG; SAMIR ID-LAHOUCINE, University of Guelph, Guelph, Canada; IZINARA C. ROSSE, UFMG; RICARDO V. VENTURA, University of Guelph, Guelph, Canada; Beef Improvement Opportunities, Guelph, Canada; FRANK ANGELO TOMITA BRUNELI, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; EDUARDO TARAZONA?SANTOS, UFMG; MARIA RAQUEL S. CARVALHO, UFMG. |
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Título: |
Reducing cryptic relatedness in genomic data sets via a central node exclusion algorithm. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Ecology Resources, v. 18, n. 3, 2018. |
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DOI: |
10.1111/1755-0998.12746 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Cryptic relatedness is a confounding factor in genetic diversity and genetic association studies. Development of strategies to reduce cryptic relatedness in a sample is a crucial step for downstream genetic analyses. This study uses a node selection algorithm, based on network degrees of centrality, to evaluate its applicability and impact on evaluation of genetic diversity and population stratification. 1,036 Guzerá (Bos indicus) females were genotyped using Illumina Bovine SNP50 v2 BeadChip. Four strategies were compared. The first and second strategies consist on a iterative exclusion of most related individuals based on PLINK kinship coefficient (φij) and VanRaden's φij, respectively. The third and fourth strategies were based on a node selection algorithm. The fourth strategy, Network G matrix, preserved the larger number of individuals with a better diversity and representation from the initial sample. Determining the most probable number of populations was directly affected by the kinship metric. Network G matrix was the better strategy for reducing relatedness due to producing a larger sample, with more distant individuals, a more similar distribution when compared with the full data set in the MDS plots and keeping a better representation of the population structure. Resampling strategies using VanRaden's φij as a relationship metric was better to infer the relationships among individuals. Moreover, the resampling strategies directly impact the genomic inflation values in genomewide association studies. The use of the node selection algorithm also implies better selection of the most central individuals to be removed, providing a more representative sample. MenosAbstract Cryptic relatedness is a confounding factor in genetic diversity and genetic association studies. Development of strategies to reduce cryptic relatedness in a sample is a crucial step for downstream genetic analyses. This study uses a node selection algorithm, based on network degrees of centrality, to evaluate its applicability and impact on evaluation of genetic diversity and population stratification. 1,036 Guzerá (Bos indicus) females were genotyped using Illumina Bovine SNP50 v2 BeadChip. Four strategies were compared. The first and second strategies consist on a iterative exclusion of most related individuals based on PLINK kinship coefficient (φij) and VanRaden's φij, respectively. The third and fourth strategies were based on a node selection algorithm. The fourth strategy, Network G matrix, preserved the larger number of individuals with a better diversity and representation from the initial sample. Determining the most probable number of populations was directly affected by the kinship metric. Network G matrix was the better strategy for reducing relatedness due to producing a larger sample, with more distant individuals, a more similar distribution when compared with the full data set in the MDS plots and keeping a better representation of the population structure. Resampling strategies using VanRaden's φij as a relationship metric was better to infer the relationships among individuals. Moreover, the resampling strategies directly impact t... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bovine; Cryptic relatedness; Genetic diversity; Population genetic structure. |
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Thesaurus NAL: |
Inbreeding. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02671naa a2200325 a 4500
001 2102041
005 2023-01-24
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1111/1755-0998.12746$2DOI
100 1 $aFONSECA, P. A. S.
245 $aReducing cryptic relatedness in genomic data sets via a central node exclusion algorithm.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aAbstract Cryptic relatedness is a confounding factor in genetic diversity and genetic association studies. Development of strategies to reduce cryptic relatedness in a sample is a crucial step for downstream genetic analyses. This study uses a node selection algorithm, based on network degrees of centrality, to evaluate its applicability and impact on evaluation of genetic diversity and population stratification. 1,036 Guzerá (Bos indicus) females were genotyped using Illumina Bovine SNP50 v2 BeadChip. Four strategies were compared. The first and second strategies consist on a iterative exclusion of most related individuals based on PLINK kinship coefficient (φij) and VanRaden's φij, respectively. The third and fourth strategies were based on a node selection algorithm. The fourth strategy, Network G matrix, preserved the larger number of individuals with a better diversity and representation from the initial sample. Determining the most probable number of populations was directly affected by the kinship metric. Network G matrix was the better strategy for reducing relatedness due to producing a larger sample, with more distant individuals, a more similar distribution when compared with the full data set in the MDS plots and keeping a better representation of the population structure. Resampling strategies using VanRaden's φij as a relationship metric was better to infer the relationships among individuals. Moreover, the resampling strategies directly impact the genomic inflation values in genomewide association studies. The use of the node selection algorithm also implies better selection of the most central individuals to be removed, providing a more representative sample.
650 $aInbreeding
653 $aBovine
653 $aCryptic relatedness
653 $aGenetic diversity
653 $aPopulation genetic structure
700 1 $aLEAL, T. P.
700 1 $aSANTOS, F. C.
700 1 $aGOUVEIA, M. H.
700 1 $aID-LAHOUCINE, S.
700 1 $aROSSE, I. C.
700 1 $aVENTURA, R. V.
700 1 $aBRUNELI, F. A. T.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aPEIXOTO, M. G. C. D.
700 1 $aTARAZONA-SANTOS, E.
700 1 $aCARVALHO, M. R. S.
773 $tMolecular Ecology Resources$gv. 18, n. 3, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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