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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
24/12/2014 |
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Data da última atualização: |
22/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
URBITANI, I.; BUZANSKAS, M. E.; CHUD, T. C. S.; MORKRY, F. B; REGITANO, L. C. A.; HIGA, R. H.; MUNARI, D. P. |
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Afiliação: |
ISMAEL URBINATI, FCAV/Unesp; MARCOS ELI BUZANSKAS, FCAV/Unesp; FCAV/Unesp; FABIANA BARICHELLO MORKRY, UFSCar; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; DANÍSIO PRADO MUNARI, FCAV/Unesp. |
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Título: |
Selection signatures in Canchim beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Selection signature (SS) was assessed in this study by means of the integrated haplotype score (iHS) method, which determines the decay of homozygosity in the surroundings of a core single nucleotide polymorphism (SNP) marker. Canchim breed animals were genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip; which has almost 800 thousand SNP markers. Genotype quality control (QC) was applied to exclude SNP with genotype calling score lower than 0.20; SNP with minor allele frequency lower than 0.01; and call rate for SNP and samples which were lower than 0.95 and 0.90, respectively. Only autosomal SNPs with known genome position were used. After the QC, 687,655 SNPs and 396 samples remained for SS analysis. Signals of SS were detected on chromosomes 5, 6, 8, and 14, indicating that these regions are conserved through recent generations. |
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Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114439/1/Selection-Urbinati.pdf
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Marc: |
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520 $aSelection signature (SS) was assessed in this study by means of the integrated haplotype score (iHS) method, which determines the decay of homozygosity in the surroundings of a core single nucleotide polymorphism (SNP) marker. Canchim breed animals were genotyped using the Illumina BovineHD BeadChip; which has almost 800 thousand SNP markers. Genotype quality control (QC) was applied to exclude SNP with genotype calling score lower than 0.20; SNP with minor allele frequency lower than 0.01; and call rate for SNP and samples which were lower than 0.95 and 0.90, respectively. Only autosomal SNPs with known genome position were used. After the QC, 687,655 SNPs and 396 samples remained for SS analysis. Signals of SS were detected on chromosomes 5, 6, 8, and 14, indicating that these regions are conserved through recent generations.
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700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aMUNARI, D. P.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
25/11/2015 |
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Data da última atualização: |
25/11/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
VIEIRA, S. A.; BEN, J. R.; BERTAGNOLLI, P. F.; VELLOSO, J. A. R. de O. |
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Afiliação: |
SIMIÃO ALANO VIEIRA; JOSÉ RENATO BEN, CNPT; PAULO FERNANDO BERTAGNOLLI, CNPT; JOSÉ ALBERTO ROEHE DE OLIVEIRA VELLOSO, CNPT. |
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Título: |
Avaliação de ensaios preliminares de linhagens de soja. |
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Ano de publicação: |
1982 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SOJA: resultados de pesquisa 1981-1982. Passo Fundo: EMBRAPA-CNPT, 1982. |
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Páginas: |
p.11-17. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Trabalho apresentado na X Reunião de Pesquisa de Soja da Região Sul, Porto Alegre, 1982. |
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Thesagro: |
Soja. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/133890/1/ID43401-1981-1982sojaresultados-p11-17.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
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