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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com cnpms.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
24/07/2018 |
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Data da última atualização: |
05/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
Kaio Olímpio das Graças Dias, Universidade Federal de Lavras; Salvador Alejandro Gezan, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Alireza Nazarian, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; Luciano da Costa e Silva, JMP Division, SAS Institute Inc., Cary.; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; Carina de Oliveira Anoni, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; José Maria Villela Pádua, Universidade Federal de Lavras; MARCOS DE OLIVEIRA PINTO, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; Carlos Alexandre Gomes Ribeiro, Universidade Federal de Viçosa; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; Antonio Augusto Franco Garcia, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; João Cândido de Souza, Universidade Federal de Lavras; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018. |
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DOI: |
10.1038/s41437-018-0053-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Breeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS and using CV1, the AD model doubled the predictive accuracy in comparison to the A model. Through CV2, GS models benefit from borrowing information of correlated trials, resulting in an increase of 40% and 9% in the predictive accuracy of GY under WS for A and AD models, respectively. These results highlight the importance of multi-environment trial analyses using GS models that incorporate additive and dominance effects for genomic predictions of GY under drought in maize single-cross hybrids. MenosBreeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS a... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Milho; Resistência a Seca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aBreeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS and using CV1, the AD model doubled the predictive accuracy in comparison to the A model. Through CV2, GS models benefit from borrowing information of correlated trials, resulting in an increase of 40% and 9% in the predictive accuracy of GY under WS for A and AD models, respectively. These results highlight the importance of multi-environment trial analyses using GS models that incorporate additive and dominance effects for genomic predictions of GY under drought in maize single-cross hybrids.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
06/03/2018 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
GAMA, L. T.; GINJA, C.; DELGADO, J. V.; CAMACHO, E.; LANDI, V.; VEGA-PLA, J. L.; DUNNER, S.; CAÑON, J.; GARCIA, D.; ZARAGOZA, P.; MARTIN-BURRIEL, I.; RODELLAR, C.; MARTINEZ, R.; MELLUCI, L.; MARQUES, J. R. F.; ALVAREZ, L. A.; MUÑOZ, J. E.; REYNOSA, O. U.; ACOSTA, A.; ZAMBRANO, D.; QUIROZ, J.; ULLOA, R.; VILLALOBOS, A.; MARTINEZ, O. R.; ARMSTRONG, E.; POSTIGLIONI, A.; SPONENBERG, P.; PENEDO, C.; MARTÍNEZ, A. |
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Afiliação: |
L. T. Gama, Universidad Técnica de Lisboa; C. Ginja, Universidad Técnica de Lisboa; J. V. Delgado, Universidad de Córdoba; E. Camacho, Universidad de Córdoba; V. Landi, Universidad de Córdoba; J. L. Vega-Pla, Universidad de Córdoba; S. Dunner, Universidad de Córdoba; J. Cañon, Universidad de Córdoba; D. Garcia, Universidad de Córdoba; P. Zaragoza, Universidad de Córdoba; I. Martin-Burriel, Universidad de Córdoba; C. Rodellar, Universidad de Córdoba; R. Martinez, Facultad de Cs Agrarias Universidad Nacional de Lomas de Zamora; L. Melluci, Facultad de Cs Agrarias Universidad Nacional de Lomas de Zamora; JOSE RIBAMAR FELIPE MARQUES, CPATU; L.A. Alvarez, Universidad Nacional de Colombia sede Palmira; J. E. Muñoz, Universidad Nacional de Colombia sede Palmira; O. Uffo Reynosa, Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (CENSA); A. Acosta, Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (CENSA); D. Zambrano, Universidad Técnica Estatal de Quevedo; J. Quiroz, Instituto Nacional de Investigaciones Forestal, Agrícola y Pecuario; R. Ulloa, Instituto Nacional de Investigaciones Forestal, Agrícola y Pecuario; A. Villalobos, Instituto de Investigación Agropecuaria. Los Santos; O.R Martínez, Universidad Nacional de Asunción; E. Armstrong, Universidad de la República; A. Postiglioni, Universidad de la República; P. Sponenberg, Regional College of Veterinary Medicine; C. Penedo, Regional College of Veterinary Medicine; A. Martínez, Universidad de Córdoba. |
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Título: |
Diversidade e relações genéticas em populações bovinas da Ibero-América - resultados preliminares. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 10., 2009, Palmira. Memorias... Palmira, Colombia: Universidad Nacional de Colombia, 2009. |
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Páginas: |
p. 92-95. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A presumível origem Ibérica das raças bovinas Crioulas está presentemente a ser estudada num trabalho que envolve uma amostragem de mais de 3300 animais de 85 raças, utilizando um painel comum de 22 marcadores microssatélites. Adicionalmente, num número de raças mais reduzido, está a ser estudada a variabilidade genética em marcadores do DNA mitocondrial e do cromossoma Y. Os resultados preliminares obtidos até ao momento indicam uma elevada diversidade genética nas raças bovinas Crioulas, e a proximidade de algumas delas com as raças Ibéricas. Contudo, noutras raças Crioulas observa-se alguma influência de raças britânicas e zebuínas. Este trabalho demonstra os benefícios resultantes das sinergias estabelecidas pelos diferentes grupos, sendo de justiça destacar o papel fundamental desempenhado pela rede CYTED (actual Red COMBIAND) na interligação e criação de vínculos de colaboração entre os vários grupos de investigação |
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Thesagro: |
Bovino; Genética. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173587/1/Diversidade-p92.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 10., 2009, Palmira. Memorias... Palmira, Colombia: Universidad Nacional de Colombia$c2009
300 $ap. 92-95.
520 $aA presumível origem Ibérica das raças bovinas Crioulas está presentemente a ser estudada num trabalho que envolve uma amostragem de mais de 3300 animais de 85 raças, utilizando um painel comum de 22 marcadores microssatélites. Adicionalmente, num número de raças mais reduzido, está a ser estudada a variabilidade genética em marcadores do DNA mitocondrial e do cromossoma Y. Os resultados preliminares obtidos até ao momento indicam uma elevada diversidade genética nas raças bovinas Crioulas, e a proximidade de algumas delas com as raças Ibéricas. Contudo, noutras raças Crioulas observa-se alguma influência de raças britânicas e zebuínas. Este trabalho demonstra os benefícios resultantes das sinergias estabelecidas pelos diferentes grupos, sendo de justiça destacar o papel fundamental desempenhado pela rede CYTED (actual Red COMBIAND) na interligação e criação de vínculos de colaboração entre os vários grupos de investigação
650 $aBovino
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700 1 $aDELGADO, J. V.
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700 1 $aPENEDO, C.
700 1 $aMARTÍNEZ, A.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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