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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
25/03/2024 |
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Data da última atualização: |
25/03/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, W. A.; GASPAR, E. B.; DOMINGUES, R.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
WANESSA ARAUJO CARVALHO, CNPGL; EMANUELLE BALDO GASPAR, CNPGL; ROBERT DOMINGUES, CNPGL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Genetic factors underlying host resistance to Rhipicephalus microplus tick infestation in Braford cattle: a systems biology perspective. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, 2024. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-024-10030-x |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
First online. |
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Conteúdo: |
Approximately 80% of the world's cattle are raised in regions with a high risk of tick-borne diseases, resulting in significant economic losses due to parasitism by Rhipicephalus(Boophilus)microplus. However, the lack of a systemic biology approach hampers a comprehensive understanding of tick-host interactions that mediate tick resistance phenotypes. Here, we conducted a genome-wide association study (GWAS) of 2933 Braford cattle and found 340 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with tick counts. Gene expression analyses were performed on skin samples obtained from previously tick-exposed heifers with extremely high or low estimated breeding values for R.microplus counts. Evaluations were performed both before and after artificial infestation with ticks. Differentially expressed genes were found within 1-Mb windows centered at significant SNPs from GWAS. A total of 330 genes were related to the breakdown of homeostasis that was induced by larval attachment to bovine skin. Enrichment analysis pointed to a key role of proteolysis and signal transduction via JAK/STAT, NFKB and WNT/beta catenin signaling pathways. Integrative analysis on matrixEQTL revealed two cis-eQTLs and four significant SNPs in the genes peptidylargininedeiminasetypeIV (PADI4) and LOC11449251. The integration of genomic data from QTL maps and transcriptome analyses has identified a set of twelve key genes that show significant associations with tick loads. These genes could be key candidates to improve the accuracy of genomic predictions for tick resistance in Braford cattle. MenosApproximately 80% of the world's cattle are raised in regions with a high risk of tick-borne diseases, resulting in significant economic losses due to parasitism by Rhipicephalus(Boophilus)microplus. However, the lack of a systemic biology approach hampers a comprehensive understanding of tick-host interactions that mediate tick resistance phenotypes. Here, we conducted a genome-wide association study (GWAS) of 2933 Braford cattle and found 340 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with tick counts. Gene expression analyses were performed on skin samples obtained from previously tick-exposed heifers with extremely high or low estimated breeding values for R.microplus counts. Evaluations were performed both before and after artificial infestation with ticks. Differentially expressed genes were found within 1-Mb windows centered at significant SNPs from GWAS. A total of 330 genes were related to the breakdown of homeostasis that was induced by larval attachment to bovine skin. Enrichment analysis pointed to a key role of proteolysis and signal transduction via JAK/STAT, NFKB and WNT/beta catenin signaling pathways. Integrative analysis on matrixEQTL revealed two cis-eQTLs and four significant SNPs in the genes peptidylargininedeiminasetypeIV (PADI4) and LOC11449251. The integration of genomic data from QTL maps and transcriptome analyses has identified a set of twelve key genes that show significant associations with tick loads. These genes could be key candidates ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Bovino; Carrapato; Doença Animal; Parasitismo; Resistência. |
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Thesaurus Nal: |
Amber disease; Parasitism; Ticks. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
11/07/2012 |
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Data da última atualização: |
14/08/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
POLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; PEREIRA, R. M.; STOLF-MOREIRA, R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. |
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Afiliação: |
Bolsista DTI; Universidade Federal da Grande Dourados, MS.; RENATA STOLF MOREIRA, UEL; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO. |
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Título: |
Identificação de genes diferencialmente expressos em soja em resposta à Phakopsora pachyrhizi pela metodologia ACP. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A ferrugem asiática da soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, é uma doença foliar destrutiva em quase todos os países produtores de soja. Ferramentas biotecnológicas podem auxiliar no entendimento dos mecanismos de resposta de defesa a este fungo em nível molecular e consequentemente no controle da doença. Para identificar genes envolvidos em resposta à infecção com FAS, RNA de folhas infectadas e não infectadas de genótipos de soja resistente (PI561356) e suscetível (BRS 184), foram analisadas pela metodologia ACP (Annealing Control Primer). Quarenta ACPs foram utilizados para identificar e sequenciar 59 genes diferencialmente expressos (DEGs) e 44 destes genes mostraram homologia com proteínas conhecidas e foram identificados como envolvidos principalmente em fotossíntese, síntese e degradação de proteínas. A maioria dos DEGs que foi induzida nas plantas resistentes estava envolvida na categoria funcional de defesa, energia, atividade antioxidante e transporte celular. Quatro genes com diferentes padrões de expressão foram selecionados e caracterizados por meio de análises de RT-qPCR para obter um perfil de expressão específico nos genótipos de soja resistente (PI561356), tolerante (BRS 231) e suscetível (BRS 184). Análises de RT-qPCR revelaram que as respostas iniciais são mais intensas nas plantas resistentes. Adicionalmente, foi possível identificar o gene tiazol como candidato para estudos mais detalhados de seu envolvimento com a resistência a FAS. |
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Thesagro: |
Biotecnologia. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61932/1/1-s286.pdf
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Marc: |
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520 $aA ferrugem asiática da soja (FAS), causada pelo fungo Phakopsora pachyrhizi, é uma doença foliar destrutiva em quase todos os países produtores de soja. Ferramentas biotecnológicas podem auxiliar no entendimento dos mecanismos de resposta de defesa a este fungo em nível molecular e consequentemente no controle da doença. Para identificar genes envolvidos em resposta à infecção com FAS, RNA de folhas infectadas e não infectadas de genótipos de soja resistente (PI561356) e suscetível (BRS 184), foram analisadas pela metodologia ACP (Annealing Control Primer). Quarenta ACPs foram utilizados para identificar e sequenciar 59 genes diferencialmente expressos (DEGs) e 44 destes genes mostraram homologia com proteínas conhecidas e foram identificados como envolvidos principalmente em fotossíntese, síntese e degradação de proteínas. A maioria dos DEGs que foi induzida nas plantas resistentes estava envolvida na categoria funcional de defesa, energia, atividade antioxidante e transporte celular. Quatro genes com diferentes padrões de expressão foram selecionados e caracterizados por meio de análises de RT-qPCR para obter um perfil de expressão específico nos genótipos de soja resistente (PI561356), tolerante (BRS 231) e suscetível (BRS 184). Análises de RT-qPCR revelaram que as respostas iniciais são mais intensas nas plantas resistentes. Adicionalmente, foi possível identificar o gene tiazol como candidato para estudos mais detalhados de seu envolvimento com a resistência a FAS.
650 $aBiotecnologia
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700 1 $aSTOLF-MOREIRA, R.
700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
700 1 $aABDELNOOR, R. V.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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