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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
25/10/2022 |
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Data da última atualização: |
25/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SILVA, C. G. N. da. |
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Afiliação: |
CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO DA SILVA, UFLA. |
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Título: |
Desenvolvimento e validação de método para o monitoramento de rizóbios elite inoculados no feijoeiro utilizando pcr e qPCR. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
2022. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese. (Doutorado em Microbiologia Agrícola, área de concentração Biotecnologia de Microrganismos Aplicada à Agropecuária e ao Meio Ambiente) - Universidade Federal de Lavras, 2022. Orientação de Ederson da Conceição Jesus. Coorientação de: Eustáquio Souza Dias Márcia Soares Vidal. |
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Conteúdo: |
O feijoeiro é uma planta capaz de realizar simbiose com rizóbios de modo que a Fixação Biológica de Nitrogênio é uma alternativa sustentável na utilização de adubos nitrogenados para a cultura. No entanto, o sucesso da simbiose depende de diversos fatores bióticos e abióticos, dentre eles, a competitividade de estirpes selecionadas frente à microbiota natural existente no solo. Uma forma de acessar essa competitividade é pela avaliação da ocupação nodular e persistência da bactéria no solo. Porém, os métodos atualmente existentes são muito laboriosos e/ou não apresentam especificidade suficiente para diferenciar as estirpes inoculadas de rizóbios nativos do solo. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e suas variantes se apresentam como uma alternativa conveniente e de alta especificidade para o monitoramento e a quantificação de microrganismos associados a plantas e/ou no solo. Nesse contexto, o objetivo do presente trabalho foi desenhar e validar primers estirpe-específicos para detectar e quantificar as bactérias Rhizobium tropici estirpe CIAT 899 e CPAC H12 e R. freirei estirpe PRF 81, utilizando as técnicas de PCR e PCR em Tempo Real (qPCR). Para tal, os primers foram desenhados a partir de regiões codantes do genoma e selecionados in silico de modo a conter sequências de DNA exclusivas do genoma de cada estirpe. O processo de validação desses primers envolveu teste de especificidade exclusiva para as estirpes alvo em relação a outras geneticamente próximas e distante a elas, ensaios de PCR envolvendo diversos extratos de DNA e avaliação da ocupação nodular em experimentos de casa de vegetação. Cada par de primer foi avaliado principalmente quanto a sua eficiência de amplificação e curva de dissociação e, posteriormente, quanto a quantificação das estirpes alvo a partir das amostras de DNA isoladas de raízes e solo rizosférico do feijoeiro. Por fim, os pares de primers foram testados quanto a sua aplicabilidade para avaliar a taxa de ocupação nodular e quantificar a população de rizóbios elite em solo rizosférico e raízes do feijoeiro em condição de campo. Essas informações permitiram discorrer sobre os dados de nodulação e fitotécnicos inerentes à interação rizóbio-planta, bem como a aptidão das estirpes CIAT 899, CPAC H12 e PRF 81 para nodular o feijoeiro. MenosO feijoeiro é uma planta capaz de realizar simbiose com rizóbios de modo que a Fixação Biológica de Nitrogênio é uma alternativa sustentável na utilização de adubos nitrogenados para a cultura. No entanto, o sucesso da simbiose depende de diversos fatores bióticos e abióticos, dentre eles, a competitividade de estirpes selecionadas frente à microbiota natural existente no solo. Uma forma de acessar essa competitividade é pela avaliação da ocupação nodular e persistência da bactéria no solo. Porém, os métodos atualmente existentes são muito laboriosos e/ou não apresentam especificidade suficiente para diferenciar as estirpes inoculadas de rizóbios nativos do solo. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e suas variantes se apresentam como uma alternativa conveniente e de alta especificidade para o monitoramento e a quantificação de microrganismos associados a plantas e/ou no solo. Nesse contexto, o objetivo do presente trabalho foi desenhar e validar primers estirpe-específicos para detectar e quantificar as bactérias Rhizobium tropici estirpe CIAT 899 e CPAC H12 e R. freirei estirpe PRF 81, utilizando as técnicas de PCR e PCR em Tempo Real (qPCR). Para tal, os primers foram desenhados a partir de regiões codantes do genoma e selecionados in silico de modo a conter sequências de DNA exclusivas do genoma de cada estirpe. O processo de validação desses primers envolveu teste de especificidade exclusiva para as estirpes alvo em relação a outras geneticamente próximas e distante a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adubação nitrogenada; Fixação biológica de nitrogênio; Rizóbios elite. |
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Thesagro: |
Phaseolus Vulgaris. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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520 $aO feijoeiro é uma planta capaz de realizar simbiose com rizóbios de modo que a Fixação Biológica de Nitrogênio é uma alternativa sustentável na utilização de adubos nitrogenados para a cultura. No entanto, o sucesso da simbiose depende de diversos fatores bióticos e abióticos, dentre eles, a competitividade de estirpes selecionadas frente à microbiota natural existente no solo. Uma forma de acessar essa competitividade é pela avaliação da ocupação nodular e persistência da bactéria no solo. Porém, os métodos atualmente existentes são muito laboriosos e/ou não apresentam especificidade suficiente para diferenciar as estirpes inoculadas de rizóbios nativos do solo. A Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e suas variantes se apresentam como uma alternativa conveniente e de alta especificidade para o monitoramento e a quantificação de microrganismos associados a plantas e/ou no solo. Nesse contexto, o objetivo do presente trabalho foi desenhar e validar primers estirpe-específicos para detectar e quantificar as bactérias Rhizobium tropici estirpe CIAT 899 e CPAC H12 e R. freirei estirpe PRF 81, utilizando as técnicas de PCR e PCR em Tempo Real (qPCR). Para tal, os primers foram desenhados a partir de regiões codantes do genoma e selecionados in silico de modo a conter sequências de DNA exclusivas do genoma de cada estirpe. O processo de validação desses primers envolveu teste de especificidade exclusiva para as estirpes alvo em relação a outras geneticamente próximas e distante a elas, ensaios de PCR envolvendo diversos extratos de DNA e avaliação da ocupação nodular em experimentos de casa de vegetação. Cada par de primer foi avaliado principalmente quanto a sua eficiência de amplificação e curva de dissociação e, posteriormente, quanto a quantificação das estirpes alvo a partir das amostras de DNA isoladas de raízes e solo rizosférico do feijoeiro. Por fim, os pares de primers foram testados quanto a sua aplicabilidade para avaliar a taxa de ocupação nodular e quantificar a população de rizóbios elite em solo rizosférico e raízes do feijoeiro em condição de campo. Essas informações permitiram discorrer sobre os dados de nodulação e fitotécnicos inerentes à interação rizóbio-planta, bem como a aptidão das estirpes CIAT 899, CPAC H12 e PRF 81 para nodular o feijoeiro.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
26/02/2015 |
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Data da última atualização: |
17/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; SANTOS, V. W. de S.; ALVES, F. S. F.; PINHEIRO, R. R. |
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Afiliação: |
FRANCISCO SELMO FERNANDES ALVES, CNPC; RAYMUNDO RIZALDO PINHEIRO, CNPC. |
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Título: |
Avaliação da sensibilidade de testes de imunodiagnósticos para detecção de anticorpos contra o vírus da artrite encefalite caprina. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 3., 2014, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2014. p. 42. |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
Artrite Encefalite Caprina; CAE; Caprine arthritis encephalit virus; Sorologia. |
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Thesagro: |
Anticorpo; Antígeno; Caprino; Doença animal. |
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Thesaurus NAL: |
Animal diseases; Antibody formation; Goats; Immune response; Immunization; Serology. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/118778/1/cnpc-2014-Avaliacao-da-sensibilidade.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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