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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Roraima; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
04/09/2006 |
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Data da última atualização: |
07/08/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BUENO, L. G.; MENDONÇA, J. A.; COELHO, A. S. G.; CORDEIRO, A. C. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIEIRA, A. F.; BRONDANI, C. |
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Afiliação: |
GABRIEL FERESIN PANTALIAO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; JOAO ANTONIO MENDONCA, CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; ANTONIO CARLOS CENTENO CORDEIRO, CPAF-RR; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; ARIADNA FARIA VIEIRA; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Development of SNP markers for grain yield screening of Brazilian rice cultivars. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01643, 2020. |
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ISSN: |
1678-3921 |
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DOI: |
https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2020.v55.01643 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy.
Resumo - O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimada por meio da análise conjunta de nove experimentos de campo, realizados em seis estados brasileiros. Quinze SNPs foram significativamente associados à produtividade de grãos e, dos dez SNPs que foram convertidos em ensaios TaqMan, quatro discriminaram os acessos com maior produtividade. Esses marcadores foram utilizados para identificar acessos de arroz com os alelos favoráveis. Em seguida, os acessos selecionados foram avaliados em experimentos de campo, em ambientes-alvo, para identificar os mais produtivos. Essa triagem reduz o número de acessos avaliados experimentalmente, pois torna possível priorizar aqueles com maior potencial produtivo, o que permite aumentar o número de repetições e, consequentemente, a precisão experimental MenosAbstrct - The objective of this work was to identify and validate single nucleotide polymorphism (SNP) markers related to grain yield in rice (Oryza sativa) core collection. The genome-wide association studies (GWAS) methodology was applied for genotyping of 541 rice accessions by 167,470 SNPs. The grain yield of these accessions was estimated through the joint analysis of nine field experiments carried out in six Brazilian states. Fifteen SNPs were significantly associated with grain yield, and out of the ten SNPs converted to TaqMan assays, four discriminated the most productive accessions. These markers were used for the screening of rice accessions with favorable alleles. The selected accessions were, then, evaluated in field experiments in target environments, in order to select the most productive ones. This screening reduces the number of accessions evaluated experimentally, making it possible to prioritize those with higher productive potential, which allows of the increase of the number of replicates and, consequently, of the experimental accuracy.
Resumo - O objetivo deste trabalho foi identificar e validar marcadores de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) relacionados à produtividade de grãos em coleção nuclear de arroz (Oryza sativa). A metodologia de estudos de associação genômica ampla (GWAS) foi aplicada à genotipagem de 541 genótipos por 167.470 SNPs. A produtividade de grãos desses acessos foi estimad... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GWAS; Seleção assistida por marcadores. |
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Thesagro: |
Arroz; Marcador Molecular; Oryza Sativa; Produtividade; Seleção Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genome-wide association study; Marker-assisted selection; Rice; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/214500/1/Development-snp-markers.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
03/10/2017 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ALBERT, L. P.; WU, J.; PROHASKA, N.; CAMARGO, P. B.; HUXMAN, T. E.; TRIBUZY, E.; IVANOV, V.; OLIVEIRA, R.; GARCIA, S.; SMITH, M. N.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; RESTREPO-COUPE, N.; SILVA, R. da; STARK, S. C.; MARTINS, G.; PENHA, D. V.; SALESKA, S. R. |
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Afiliação: |
Loren P. Albert, University of Arizona; Jin Wu, University of Arizona; Neill Prohaska, University of Arizona; Plinio B. Camargo, CENA/USP; Travis E. Huxman, University of California; Edgard Tribuzy, UFOPA; Valeriy Ivanov, University of Michigan; Rafael Oliveira, Universidade Estadual de Campinas; Sabrina Garcia, National Institute for Amazon Research; Marielle N. Smith, University of Arizona; RAIMUNDO COSME DE OLIVEIRA JUNIOR, CPATU; Natalia Restrepo-Coupe, University of Arizona; Rodrigo da Silva, UFOPA; Scott C. Stark, Michigan State University; Giordane Martins, INPA; Deliane V. Penha, UFOPA; Scott R. Saleska, University of Arizona. |
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Título: |
Age-dependent leaf function and consequences for carbon uptake of leaves, branches, and the canopy during the dry season in an Amazon evergreen forest. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ESA ANNUAL MEETING, 2017, Portland. [Abstracts]. Washington, DC: Ecological Society of America, 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Abstract COS 124-3. |
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Thesagro: |
Absorção; Carbono; Floresta Tropical; Folha. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/164605/1/LOREN-2017-ESA.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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