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| Registros recuperados : 63 | |
| 43. |  | SANTOS, M. V. C. dos; NASCIMENTO, P. T.; SIMEONE, M. L. F.; LIMA, P. F.; SIMEÃO, R. M.; AUAD, A. M.; OLIVEIRA, I. R. de; MENDES, S. M. Performance of fall armyworm preimaginal development on cultivars of tropical grass forages. Insects, v. 13, 1139, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 44. | | NONATO, T. B.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; CAMPOS, G. F.; SANTANA, S. T.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SIMEÃO, R. M. Seleção de híbridos de panicum maximum Jacq. candidatos a lançamento. In: WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL: CONTRIBUIÇÕES, AVANÇOS E PERSPECTIVAS PARA O CERRADO BRASILEIRO, 2., 2016. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 45. | | SANTANA, S. T.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; NONATO, T. B.; CAMPOS, G. F.; VALLE, C. B. do; BARRIOS, S. C. L.; SIMEÃO, R. M. Seleção no melhoramento de Panicum maximum Jacq. visando ao aumento da produção na seca. In: WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL: CONTRIBUIÇÕES, AVANÇOS E PERSPECTIVAS PARA O CERRADO BRASILEIRO, 2., 2016. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 47. | | SILVEIRA, E. S.; SANTOS, M. F.; CARROMEU, C.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SIMEÃO, R. M. Utilização de drone com diferentes Ground Sample Distance para obtenção de dados fenotípicos de forrageiras. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. 30-31| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 48. | | SILVEIRA, M. C. T. da; SANTOS, F. C. dos; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; ALMEIDA, R. G. de; ALVES, F. V.; VILELA, L.; BARBOSA, T. A.; PINTO, C. F.; FEIJO, G. L. D.; SIMEÃO, R. M. Beef production with low carbon emission in Tropical pastures: a case study for the validation of guidelines. In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FORESTRY SYSTEMS, 2., 2021. Proceedings reference... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 128-133. WCCLF. Evento online.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 49. | | SILVEIRA, M. C. T. da; SANTOS, F. C. dos; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; ALMEIDA, R. G. de; ALVES, F. V.; VILELA, L.; BARBOSA, T. A.; PINTO, C. F.; FEIJO, G. L. D.; SIMEÃO, R. M. Beef production with low carbon emission in tropical pastures: a case study for the validation of guidelines. In: CONGRESSO MUNDIAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA-FLORESTA, 2., 2021. Anais... Brasília, DF: Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento: Embrapa, 2021. Evento online. 169| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 50. | | MARTINS, F. B.; MORAES, A. C. L.; AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; BARRIOS, S. C. L.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. A semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses. Frontiers in Plant Science, v.12, article 737919, 2021. 19 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 51. | | MARTINS, F. B.; AONO, A. H.; MORAES, A. da C. L.; FERREIRA, R. C. U.; VILELA, M. de M.; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; RODRIGUES-MOTTA, M.; SIMEÃO, R. M.; SOUZA, A. P. de. Genome-wide family prediction unveils molecular mechanisms underlying the regulation of agronomic traits in Urochloa ruziziensis. Frontiers in Plant Science, v. 14, 2023. Na publicação: Marco Pessoa-Filho.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte. |
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| 53. | | JANK, L.; ANDRADE, C. M. S. de; BARBOSA, R. A.; MACEDO, M. C. M.; VALERIO, J. R.; VERZIGNASSI, J. R.; ZIMMER, A. H.; FERNANDES, C. D.; SANTOS, M. F.; SIMEÃO, R. M. O capim-BRS Quênia (Panicum maximum Jacq.) na diversificação e intensificação das pastagens. Brasília, DF: Embrapa, 2017. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 138).| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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| 54. | | SILVEIRA, M. C. T. da; SIMEÃO, R. M.; LEANDRO, T. T.; RIBEIRO, A. C. G.; GONTIJO NETO, M. M.; SOUSA, S. M. de; PARRELLA, R. A. da C.; TARDIN, F. D. Caracterização da produção de forragem de cultivares tropicais anuais em resposta a diferentes estratégias de manejo e aprimoramento de uso. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2024. 26 p. (Embrapa Pecuária Sul. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 57)| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 55. | | JANK, L.; ANDRADE, C. M. S. de; MACIEL, G. A.; BARBOSA, R. A.; BRAGA, G. J.; MACEDO, M. C. M.; VALÉRIO, J. R.; VERZIGNASSI, J. R.; ZIMMER, A. H.; FERNANDES, C. D.; SANTOS, M. F.; SIMEÃO, R. M. BRS Quênia and BRS Tamani: new Panicum maximum Jacq. hybrid cultivars in Brazil. In: INTERNATIONAL GRASSLAND CONGRESS, 24., INTERNATIONAL RANGELAND CONGRESS, 11., 2020, Kenya. Sustainable use of grassland and rangeland resources for improved livelihoods. Proceedings... Kenya: Kenya Agricultural and Livestock Research Organization, 2021. p. 218-222.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 56. | | JANK, L.; ANDRADE, C. M. S. de; MACIEL, G. A.; BARBOSA, R. A.; BRAGA, G. J.; MACEDO, M. C. M.; VALÉRIO, J. R.; VERZIGNASSI, J. R.; ZIMMER, A. H.; FERNANDES, C. D.; SANTOS, M. F.; SIMEÃO, R. M. BRS Quênia and BRS Tamani: new Panicum maximum Jacq. hybrid cultivars in Brazil. In: INTERNATIONAL GRASSLAND CONGRESS, 24., INTERNATIONAL RANGELAND CONGRESS, 11., 2020, Kenya. Sustainable use of grassland and rangeland resources for improved livelihoods. Proceedings... Kenya: Kenya Agricultural and Livestock Research Organization, 2021. p. 218-222.| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Gado de Corte. |
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| 57. | | SIMEÃO, R. M.; SILVA, D. D. da; SANTOS, F. C. dos; VILELA, L.; SILVEIRA, M. C. T. da; RESENDE, A. C.; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; BARBOSA, T. A.; PINTO, C. F. Forrageiras para pastejo, para cobertura e suas combinações para plantio direto do sorgo nos solos arenosos no Oeste da Bahia. Campo Grande, MS : Embrapa Gado de Corte, 2021. (Embrapa Gado de Corte / Comunicado Técnico, 160).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 58. | | SIMEÃO, R. M.; RAPOSO, A.; VILELA, M. de M.; MARTINS, F. B.; RESENDE, M. D. V. de; BARRIOS, S. C. L.; MEIRELES, K. G. X.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; SANTOS, M. F.; SOUSA, A. P. de. Melhoramento genético de Brachiaria ruziziensis Germain & Evrard (sin. Urochloa ruziziensis) autotetraploide: resultados do segundo ciclo de seleção intrapopulacional e estratégias para aumentar a eficiência da seleção. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2022. (Embrapa Gado de Corte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 50).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 59. | | LEANDRO, T. T.; RIBEIRO, A. C. G.; SIMEÃO, R. M.; SANTOS, F. C. dos; ALMEIDA, R. G. de; VILELA, L.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; SILVEIRA, M. C. T. DA. Produção de forragem e cobertura do solo do capim Piatã em área de ILPF no oeste da Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 32., 2023. Resumos... Natal, 2023. Zootec2023.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 60. | | OLIVEIRA, G. S. de; MARCATO JUNIOR, J.; POLIDORO, C.; OSCO, L. P.; SIQUEIRA, H.; RODRIGUES, L.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C.; SIMEÃO, R. M.; CARROMEU, C.; SILVEIRA, E.; JORGE, L. A. de C.; GONÇALVES, W.; SANTOS, M. F.; MATSUBARA, E. Convolutional Neural Networks to Estimate Dry Matter Yield in a Guineagrass Breeding Program Using UAV Remote Sensing. Sensors, v. 21, n. 3971, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Instrumentação. |
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| Registros recuperados : 63 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
07/12/2021 |
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Data da última atualização: |
20/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MARTINS, F. B.; MORAES, A. C. L.; AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; BARRIOS, S. C. L.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. |
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Afiliação: |
FELIPE BITENCOURT MARTINS, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; ALINE COSTA LIMA MORAES, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; ALEXANDRE HILD AONO, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ROSANGELA MARIA SIMEAO, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE; ANETE PEREIRA DE SOUZA, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; UNICAMP. |
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Título: |
A semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v.12, article 737919, 2021. |
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Páginas: |
19 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2021.737919 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Artificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made available through the polyCID Shiny app and can be easily coupled with traditional genetic approaches, such as linkage map construction, thereby increasing the efficiency of breeding programs. MenosArtificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made ava... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele dosage; Apomictic clones; Clustering analysis; GBS; Half sibling; Self fertilization; Shiny. |
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Thesaurus NAL: |
Principal component analysis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/228605/1/SemiAutomatedSNP.pdf
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Marc: |
LEADER 02794naa a2200373 a 4500
001 2138071
005 2021-12-20
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fpls.2021.737919$2DOI
100 1 $aMARTINS, F. B.
245 $aA semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses.$h[electronic resource]
260 $c2021
300 $a19 p.
520 $aArtificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made available through the polyCID Shiny app and can be easily coupled with traditional genetic approaches, such as linkage map construction, thereby increasing the efficiency of breeding programs.
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700 1 $aSOUZA, A. P. DE
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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