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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
28/11/2019 |
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Data da última atualização: |
06/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PÉRTILLE, F.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, USP; USP; USP; CLARISSA BOSCHIERO, USP; ALINE SILVA MELLO CESAR, USP; THAIS FERNANDA GODOY, USP; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; JAMES M. REECY, USP; DORIAN J. GARRICK, USP; LUIZ LEHMANN COUTINHO, USP. |
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Título: |
Unraveling genomic associations with feed efficiency and body weight traits in chickens through an integrative approach. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 20, n. 83, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract Background: Feed efficiency and growth rate have been targets for selection to improve chicken production. The incorporation of genomic tools may help to accelerate selection. We genotyped 529 individuals using a high-density SNP chip (600 K, Affymetrix®) to estimate genomic heritability of performance traits and to identify genomic regions and their positional candidate genes associated with performance traits in a Brazilian F2 Chicken Resource population. Regions exhibiting selection signatures and a SNP dataset from resequencing were integrated with the genomic regions identified using the chip to refine the list of positional candidate genes and identify potential causative mutations. Results: Feed intake (FI), feed conversion ratio (FC), feed efficiency (FE) and weight gain (WG) exhibited low genomic heritability values (i.e. from 0.0002 to 0.13), while body weight at hatch (BW1), 35 days-of-age (BW35), and 41 days-of-age (BW41) exhibited high genomic heritability values (i.e. from 0.60 to 0.73) in this F2 population. Twenty unique 1-Mb genomic windows were associated with BW1, BW35 or BW41, located on GGA1?4, 6?7, 10, 14, 24, 27 and 28. Thirty-eight positional candidate genes were identified within these windows, and three of them overlapped with selection signature regions. Thirteen predicted deleterious and three high impact sequence SNPs in these QTL regions were annotated in 11 positional candidate genes related to osteogenesis, skeletal muscle development, growth, energy metabolism and lipid metabolism, which may be associated with body weight in chickens. Conclusions: The use of a high-density SNP array to identify QTL which were integrated with whole genome sequence signatures of selection allowed the identification of candidate genes and candidate causal variants. One novel QTL was detected providing additional information to understand the genetic architecture of body weight traits. We identified QTL for body weight traits, which were also associated with fatness in the same population. Our findings form a basis for further functional studies to elucidate the role of specific genes in regulating body weight and fat deposition in chickens, generating useful information for poultry breeding programs. MenosAbstract Background: Feed efficiency and growth rate have been targets for selection to improve chicken production. The incorporation of genomic tools may help to accelerate selection. We genotyped 529 individuals using a high-density SNP chip (600 K, Affymetrix®) to estimate genomic heritability of performance traits and to identify genomic regions and their positional candidate genes associated with performance traits in a Brazilian F2 Chicken Resource population. Regions exhibiting selection signatures and a SNP dataset from resequencing were integrated with the genomic regions identified using the chip to refine the list of positional candidate genes and identify potential causative mutations. Results: Feed intake (FI), feed conversion ratio (FC), feed efficiency (FE) and weight gain (WG) exhibited low genomic heritability values (i.e. from 0.0002 to 0.13), while body weight at hatch (BW1), 35 days-of-age (BW35), and 41 days-of-age (BW41) exhibited high genomic heritability values (i.e. from 0.60 to 0.73) in this F2 population. Twenty unique 1-Mb genomic windows were associated with BW1, BW35 or BW41, located on GGA1?4, 6?7, 10, 14, 24, 27 and 28. Thirty-eight positional candidate genes were identified within these windows, and three of them overlapped with selection signature regions. Thirteen predicted deleterious and three high impact sequence SNPs in these QTL regions were annotated in 11 positional candidate genes related to osteogenesis, skeletal muscle development... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Características de desempenho; Genomic heritability; Genotypic data; GWAS; Herdabilidade genômica; Performance traits. |
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Thesagro: |
Frango de Corte; Genoma; Seleção Genótipa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
22/01/2008 |
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Data da última atualização: |
25/01/2008 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Circulação/Nível: |
-- - -- |
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Autoria: |
PEREIRA, B. L. da S.; SOUZA, L. D.; SOUZA, L. da S.; SANTOS, C. V. dos; FIGUEREDO, G. H. S.; SILVEIRA, F. G. F. da. |
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Afiliação: |
Bruno Laécio da Silva Pereira, UFRB; Laercio Duarte Souza, CNPMF; Luciano da Silva Souza, CNPMF; Caroline Valverde dos Santos, UFRB; Grabiel Henrique Santos Figueredo, UFRB; Felipe Gomes F. da Silveira, UFRB. |
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Título: |
Práticas realizadas no Laboratório de Física do Solo da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 2007, Cruz das Almas. [Trabalhos apresentados...]. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2007. p. 26. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Durante o período de estágio no Laboratório de Física do Solo da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, foi efetuada orientação quanto a procedimentos e execução de análise física para estudos das relações solo-água e solo-planta. O objetivo da realização dessas práticas laboratorias foi o de compreender os efeitos do manejo do solo sobre alguns de seus parâmetros físicos, e identificar possíveis necessidades de correção. As análises mais utilizadas na avaliação das propriedades físicas do solo são a granulometria, a estabilidade dos agregados, a densidade do solo e a densidade das partículas. O comportamento da água no solo é avaliado medindo-se sua velocidade de infiltração na superfície, a condutividade hidráulica saturada do solo e os potenciais da água na capacidade de campo e no ponto de murchua permanente. Esses parâmetros determinam a capacidade de armazenamento de água no solo e a sua disponibilidade para as plantas. No sistema solo - planta foi avaliado o desenvolvimento do sistema radicular, em determinado volume de solo , e o poder de penetração das raízes em solos compactados e/ou adensados. |
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Thesagro: |
Água; Solo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 01893naa a2200205 a 4500
001 1655616
005 2008-01-25
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100 1 $aPEREIRA, B. L. da S.
245 $aPráticas realizadas no Laboratório de Física do Solo da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical.
260 $c2007
520 $aDurante o período de estágio no Laboratório de Física do Solo da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, foi efetuada orientação quanto a procedimentos e execução de análise física para estudos das relações solo-água e solo-planta. O objetivo da realização dessas práticas laboratorias foi o de compreender os efeitos do manejo do solo sobre alguns de seus parâmetros físicos, e identificar possíveis necessidades de correção. As análises mais utilizadas na avaliação das propriedades físicas do solo são a granulometria, a estabilidade dos agregados, a densidade do solo e a densidade das partículas. O comportamento da água no solo é avaliado medindo-se sua velocidade de infiltração na superfície, a condutividade hidráulica saturada do solo e os potenciais da água na capacidade de campo e no ponto de murchua permanente. Esses parâmetros determinam a capacidade de armazenamento de água no solo e a sua disponibilidade para as plantas. No sistema solo - planta foi avaliado o desenvolvimento do sistema radicular, em determinado volume de solo , e o poder de penetração das raízes em solos compactados e/ou adensados.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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