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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
24/10/2012 |
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Data da última atualização: |
20/02/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RESENDE JUNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P.; RESENDE, M. D. V. de; GARRICK, D. J.; FERNANDO, R. L.; DAVIS, J. M.; JOKELA, E. J.; MARTIN, T. A.; PETER, G. F.; KIRST, M. |
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Afiliação: |
M. F. R. RESENDE JUNIOR, UNIVERSITY OF FLORIDA; P. MUÑOZ, UNIVERSITY OF FLORIDA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; D. J. GARRICK, IOWA STATE UNIVERSITY; R. L. FERNANDO, IOWA STATE UNIVERSITY; J. M. DAVIS, UNIVERSITY OF FLORIDA; E. J. JOKELA, UNIVERSITY OF FLORIDA; T. A. MARTIN, UNIVERSITY OF FLORIDA; G. F. PETER, UNIVERSITY OF FLORIDA; M. KIRST, UNIVERSITY OF FLORIDA. |
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Título: |
Accuracy of genomic selection methods in a standard data set of loblolly pine (Pinus taeda L.) |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics, v. 190, p. 1503-1510, April 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection can increase genetic gain per generation through early selection. Genomic selection is expected to be particularly valuable for traits that are costly to phenotype and expressed late in the life cycle of long-lived species. Alternative approaches to genomic selection prediction models may perform differently for traits with distinct genetic properties. Here the performance of four different original methods of genomic selection that differ with respect to assumptions regarding distribution of marker effects, including (i) ridge regression–best linear unbiased prediction (RR–BLUP), (ii) Bayes A, (iii) Bayes Cp, and (iv) Bayesian LASSO are presented. In addition, a modified RR–BLUP (RR–BLUP B) that utilizes a selected subset of markers was evaluated. The accuracy of these methods was compared across 17 traits with distinct heritabilities and genetic architectures, including growth, development, and disease-resistance properties, measured in a Pinus taeda (loblolly pine) training population of 951 individuals genotyped with 4853 SNPs. The predictive ability of the methods was evaluated using a 10-fold, cross-validation approach, and differed only marginally for most method/trait combinations. Interestingly, for fusiform rust disease-resistance traits, Bayes Cp, Bayes A, and RR–BLUB B had higher predictive ability than RR–BLUP and Bayesian LASSO. Fusiform rust is controlled by few genes of large effect. A limitation of RR–BLUP is the assumption of equal contribution of all markers to the observed variation. However, RR-BLUP B performed equally well as the Bayesian approaches.The genotypic and phenotypic data used in this study are publically available for comparative analysis of genomic selection prediction models. MenosGenomic selection can increase genetic gain per generation through early selection. Genomic selection is expected to be particularly valuable for traits that are costly to phenotype and expressed late in the life cycle of long-lived species. Alternative approaches to genomic selection prediction models may perform differently for traits with distinct genetic properties. Here the performance of four different original methods of genomic selection that differ with respect to assumptions regarding distribution of marker effects, including (i) ridge regression–best linear unbiased prediction (RR–BLUP), (ii) Bayes A, (iii) Bayes Cp, and (iv) Bayesian LASSO are presented. In addition, a modified RR–BLUP (RR–BLUP B) that utilizes a selected subset of markers was evaluated. The accuracy of these methods was compared across 17 traits with distinct heritabilities and genetic architectures, including growth, development, and disease-resistance properties, measured in a Pinus taeda (loblolly pine) training population of 951 individuals genotyped with 4853 SNPs. The predictive ability of the methods was evaluated using a 10-fold, cross-validation approach, and differed only marginally for most method/trait combinations. Interestingly, for fusiform rust disease-resistance traits, Bayes Cp, Bayes A, and RR–BLUB B had higher predictive ability than RR–BLUP and Bayesian LASSO. Fusiform rust is controlled by few genes of large effect. A limitation of RR–BLUP is the assumption of equal contrib... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Precisão. |
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Thesagro: |
Pinus Taeda; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
12/09/2001 |
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Data da última atualização: |
10/12/2018 |
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Autoria: |
MARTINS, L.; SILVA, W. R. da. |
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Afiliação: |
Leila Martins, Coordenadoria de Assistência Técnica Integral - CATI/Departamento de Sementes, Mudas e Matrizes; Walter Rodrigues da Silva, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/Departamento de Produção Vegetal. |
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Título: |
Comportamento da dormência em sementes de braquiária submetidas a tratamentos térmicos e químicos. |
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Ano de publicação: |
2001 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 7, p. 997-1003, jul. 2001 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Dormancy performance of Brachiaria brizantha seeds submitted to thermal and chemical treatments. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos de tratamentos térmicos e químicos sobre a dormência em sementes de Brachiaria brizantha cv. Marandu. Sementes com taxas de dormência superiores a 25% e pureza física acima de 98% foram submetidas a temperaturas de 40, 55, 70 e 85°C durante 5, 10 e 15 horas, à imersão em H2SO4 (98%, 36N) por 15 minutos, e a substrato de germinação umedecido com KNO3 (0,2%). No início e ao final do armazenamento de nove meses, conduzido em ambiente não-controlado de laboratório, as sementes foram avaliadas por meio dos testes de germinação, de viabilidade (tetrazólio), de danificações nas glumelas (lema e pálea), de primeira contagem de germinação, de comprimento da parte aérea das plântulas, de emergência das plântulas e do índice de velocidade de emergência. Foi verificado que tratamentos térmicos específicos reduzem a taxa de dormência das sementes; aquecimentos a 70°C por 10 e 15 horas, além de reduzirem a taxa de dormência, apresentam efeitos imediatos positivos no desempenho das sementes, sem gerar deterioração fisiológica latente. As aplicações de 85°C e de H2SO4, apesar de proporcionarem redução na dormência e efeitos imediatos positivos no desempenho das sementes, promovem deterioração fisiológica latente. |
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Palavras-Chave: |
Armazenagem de sementes; Longevidade das sementes; Seeds longevity; Storage of seeds; Sulphuric acid. |
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Thesagro: |
Ácido Sulfúrico; Nitrato de Potássio. |
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Thesaurus NAL: |
potassium nitrate. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/AI-SEDE/19157/1/pab0997.pdf
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Marc: |
LEADER 02166naa a2200241 a 4500
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100 1 $aMARTINS, L.
245 $aComportamento da dormência em sementes de braquiária submetidas a tratamentos térmicos e químicos.
260 $c2001
500 $aTítulo em inglês: Dormancy performance of Brachiaria brizantha seeds submitted to thermal and chemical treatments.
520 $aO objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos de tratamentos térmicos e químicos sobre a dormência em sementes de Brachiaria brizantha cv. Marandu. Sementes com taxas de dormência superiores a 25% e pureza física acima de 98% foram submetidas a temperaturas de 40, 55, 70 e 85°C durante 5, 10 e 15 horas, à imersão em H2SO4 (98%, 36N) por 15 minutos, e a substrato de germinação umedecido com KNO3 (0,2%). No início e ao final do armazenamento de nove meses, conduzido em ambiente não-controlado de laboratório, as sementes foram avaliadas por meio dos testes de germinação, de viabilidade (tetrazólio), de danificações nas glumelas (lema e pálea), de primeira contagem de germinação, de comprimento da parte aérea das plântulas, de emergência das plântulas e do índice de velocidade de emergência. Foi verificado que tratamentos térmicos específicos reduzem a taxa de dormência das sementes; aquecimentos a 70°C por 10 e 15 horas, além de reduzirem a taxa de dormência, apresentam efeitos imediatos positivos no desempenho das sementes, sem gerar deterioração fisiológica latente. As aplicações de 85°C e de H2SO4, apesar de proporcionarem redução na dormência e efeitos imediatos positivos no desempenho das sementes, promovem deterioração fisiológica latente.
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650 $aÁcido Sulfúrico
650 $aNitrato de Potássio
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653 $aLongevidade das sementes
653 $aSeeds longevity
653 $aStorage of seeds
653 $aSulphuric acid
700 1 $aSILVA, W. R. da
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 36, n. 7, p. 997-1003, jul. 2001
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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