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| Registros recuperados : 7 | |
| 3. |  | SILVA, M. I. V.; CHITARRA, C. S.; OLIVEIRO FILHO, J. X. de; MORES, N.; ITO, A. T. H.; ROCHA, I. S. M.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V. Identificação de transcritos diferencialmente expressos por Pasteurella multocida em condições de privação de ferro. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 10, p. 965-970, out. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | SILVA, M. I. V.; CHITARRA, C. S.; REIS, I. H. V.; OLIVEIRA FILHO, J. X.; MORES, N.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V. Identification of differentially expressed transcripts by Pasteurella multocida iron-starved conditions by RNA-seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | CHITARRA, C. S.; OLIVEIRA FILHO, J. X. de; MORES, N.; SILVA, M. I. V. da; CÂNDIDO, S. L.; CEZARINO, P. G.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V. Identification of Pasteurella multocida transcribed genes in porcine lungs through RNAseq. Microbial Pathogenisis, v. 122, p. 180-183, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | CHITARRA, C. S.; FRANÇA, G. N. C.; CANDIDO, S. L.; SILVA, M. I. V.; OLIVEIRA FILHO, J. X.; MORES, N.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V. Identification of transcribed genes by Pasteurella multocida in porcine lungs through the selective capture of transcribed sequences (SCOTS). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | HAJI, F. N. P.; FREIRE, L. C. L.; ROA, F. G.; SILVA, C. N. da S.; SOUZA JUNIOR, M. M.; SILVA, M. I. V. da. Manejo integrado de Scrobipalpuloides absoluta (Povolny) (Lepidoptera: Gelechidae) no Submedio Sao Francisco. Anais da Sociedade Entomológica do Brasil, v. 24, n. 3, p. 587-591, dez. 1995.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
30/12/2016 |
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Data da última atualização: |
29/12/2017 |
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Autoria: |
SILVA, M. I. V.; CHITARRA, C. S.; OLIVEIRO FILHO, J. X. de; MORES, N.; ITO, A. T. H.; ROCHA, I. S. M.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V. |
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Afiliação: |
MAYARA I. V. SILVA, UFMT; MAYARA I. V. SILVA, UFMT; JOÃO X. DE OLIVEIRA FILHO, CNPGL; NELSON MORES, CNPSA; ALESSANDRA TAMMY HAYAKAWA ITO, UFMT; ICARO SERGIO MAGALHÃES ROCHA, UFMT; LUCIANO NAKAZATO, UFMT; VALÉRIA DUTRA, UFMT. |
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Título: |
Identificação de transcritos diferencialmente expressos por Pasteurella multocida em condições de privação de ferro. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 10, p. 965-970, out. 2016. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Ferro (Fe) é um elemento essencial e a capacidade de adquiri-lo in vivo têm sido descrita em diversos agentes patogênicos através de fatores de virulência. Análises de transcritos durante a privação de Fe tem sido descritos através da técnica de microarray?, entretanto a técnica de RNA-seq recentemente tem demonstrado resultados superiores. Neste trabalho, o isolado de Pasteurella multocida (Pm 16759) altamente patogênico em suínos foi cultivado em duas condições com diferentes concentrações de Fe (controle e privação) com o objetivo de analisar transcritos diferencialmente expressos. O RNA total das duas condições foi extraído e sequenciado através da plataforma de nova geração Ion Torrent. Os dados foram analisados no Software Ion Reporter? e processados no programa Rockhopper. Foram obtidas 1.341.615 leituras com tamanho médio de 81pb, com 96% de alinhamento com o genoma de Pasteurella multocida subsp. multocida 3480 e 98,8% de acurácia. No mapeamento das leituras das duas condições, observou-se 2,652 transcritos e destes, 177 (6,7%) foram diferencialmente expressos, sendo 93 na condição controle (Fe+) e 84 na condição de privação (Fe-). Na condição de privação de Fe, o perfil de transcritos foram associados a função de transporte celular (fbp ABC, permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteína periplasmática de alta afinidade com Fe2+), reguladores transcricionais e proteínas hipotéticas. O perfil na condição controle (Fe+) apresentou transcritos diferencialmente expressos associados ao RNAs anti-sense (asRNA) e genes do metabolismo energético (fructose-1,6-bisfosfatase). O estudo comprovou que a restrição de Fe aumenta a expressão de genes envolvidos no transporte celular, reguladores transcricionais, proteínas hipotéticas e desconhecidas e permitiu ainda a identificação de novos genes como a permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteina periplasmática de alta afinidade com Fe2+, que configuram uma possível via alternativa de absorção de Fe. MenosFerro (Fe) é um elemento essencial e a capacidade de adquiri-lo in vivo têm sido descrita em diversos agentes patogênicos através de fatores de virulência. Análises de transcritos durante a privação de Fe tem sido descritos através da técnica de microarray?, entretanto a técnica de RNA-seq recentemente tem demonstrado resultados superiores. Neste trabalho, o isolado de Pasteurella multocida (Pm 16759) altamente patogênico em suínos foi cultivado em duas condições com diferentes concentrações de Fe (controle e privação) com o objetivo de analisar transcritos diferencialmente expressos. O RNA total das duas condições foi extraído e sequenciado através da plataforma de nova geração Ion Torrent. Os dados foram analisados no Software Ion Reporter? e processados no programa Rockhopper. Foram obtidas 1.341.615 leituras com tamanho médio de 81pb, com 96% de alinhamento com o genoma de Pasteurella multocida subsp. multocida 3480 e 98,8% de acurácia. No mapeamento das leituras das duas condições, observou-se 2,652 transcritos e destes, 177 (6,7%) foram diferencialmente expressos, sendo 93 na condição controle (Fe+) e 84 na condição de privação (Fe-). Na condição de privação de Fe, o perfil de transcritos foram associados a função de transporte celular (fbp ABC, permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteína periplasmática de alta afinidade com Fe2+), reguladores transcricionais e proteínas hipotéticas. O perfil na condição controle (Fe+) apresentou transcritos diferencialmente ex... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expresão genica; Fe deprivation; Gene experession; New generation sequencing; Privação de Fe; RNA-seq; Sequenciamento de nova geração. |
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Thesagro: |
Pasteurella Multocida. |
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Thesaurus NAL: |
Pasteurellosis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152574/1/Identificacao-de-transcritos.pdf
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Marc: |
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520 $aFerro (Fe) é um elemento essencial e a capacidade de adquiri-lo in vivo têm sido descrita em diversos agentes patogênicos através de fatores de virulência. Análises de transcritos durante a privação de Fe tem sido descritos através da técnica de microarray?, entretanto a técnica de RNA-seq recentemente tem demonstrado resultados superiores. Neste trabalho, o isolado de Pasteurella multocida (Pm 16759) altamente patogênico em suínos foi cultivado em duas condições com diferentes concentrações de Fe (controle e privação) com o objetivo de analisar transcritos diferencialmente expressos. O RNA total das duas condições foi extraído e sequenciado através da plataforma de nova geração Ion Torrent. Os dados foram analisados no Software Ion Reporter? e processados no programa Rockhopper. Foram obtidas 1.341.615 leituras com tamanho médio de 81pb, com 96% de alinhamento com o genoma de Pasteurella multocida subsp. multocida 3480 e 98,8% de acurácia. No mapeamento das leituras das duas condições, observou-se 2,652 transcritos e destes, 177 (6,7%) foram diferencialmente expressos, sendo 93 na condição controle (Fe+) e 84 na condição de privação (Fe-). Na condição de privação de Fe, o perfil de transcritos foram associados a função de transporte celular (fbp ABC, permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteína periplasmática de alta afinidade com Fe2+), reguladores transcricionais e proteínas hipotéticas. O perfil na condição controle (Fe+) apresentou transcritos diferencialmente expressos associados ao RNAs anti-sense (asRNA) e genes do metabolismo energético (fructose-1,6-bisfosfatase). O estudo comprovou que a restrição de Fe aumenta a expressão de genes envolvidos no transporte celular, reguladores transcricionais, proteínas hipotéticas e desconhecidas e permitiu ainda a identificação de novos genes como a permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteina periplasmática de alta afinidade com Fe2+, que configuram uma possível via alternativa de absorção de Fe.
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