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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
31/01/2012 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, M. R.; GUIMARÃES, M. D. C.; VEIGA, V. M. de O.; MOREIRA, A. dos S.; COSTA, R. R. da; ABI-ZAID, K. C. F.; ROCHA, A. da S.; SUFFYS, P. N. |
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Afiliação: |
MARCIO ROBERTO SILVA, CNPGL; MARK DREW CROSLAND GUIMARÃES, UFMG; VANIA MARIA DE OLIVEIRA VEIGA, CNPGL; ALINE DOS SANTOS MOREIRA, Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática; RONALDO RODRIGUES DA COSTA, UFJF; FHEMIG; KELLY CRISTINA FERREIRA ABI-ZAID, FHEMIG; ADALGIZA DA SILVA ROCHA, FIOCRUZ; PHILIP NOEL SUFFYS, FIOCRUZ. |
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Título: |
Identification of Mycobacterium tuberculosis complex based on amplification and sequencing of the oxyR pseudogene from stored Ziehl-Neelsen-stained sputum smears in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 106, n. 1, p. 9-15, 2011. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S0074-02762011000100002 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A cross-sectional analysis of stored Ziehl-Neelsen (ZN)-stained sputum smear slides (SSS) obtained from two public tuberculosis referral laboratories located in Juiz de Fora, Minas Gerais, was carried out to distinguish Mycobacterium bovis from other members of the Mycobacterium tuberculosis complex (MTC). A two-step approach was used to distinguish M. bovis from other members of MTC: (i) oxyR pseudogene amplification to detect MTC and, subsequently, (ii) allele-specific sequencing based on the polymorphism at position 285 of this gene. The oxyR pseudogene was successfully amplified in 100 of 177 (56.5%) SSS available from 99 individuals. No molecular profile of M. bovis was found. Multivariate analysis indicated that acid-fast bacilli (AFB) results and the source laboratory were associated (p < 0.05) with oxyR pseudogene amplification. SSS that were AFB++ SSS showed more oxyR pseudogene amplification than those with AFB0, possibly due to the amount of DNA. One of the two source laboratories presented a greater chance of oxyR pseudogene amplification, suggesting that differences in sputum conservation between laboratories could have influenced the preservation of DNA. This study provides evidence that stored ZN-SSS can be used for the molecular detection of MTC. |
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Palavras-Chave: |
Molecular sequence data; OxyR pseudogene; Sputum smear. |
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Thesagro: |
Mycobacterium Bovis. |
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Thesaurus Nal: |
Mycobacterium tuberculosis; polymerase chain reaction. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/53227/1/Artigo-meta-2011-MInstOC-Marcio-2.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
06/12/2022 |
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Data da última atualização: |
15/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
DART, R. de O.; PINTO, D. M.; MOTA, C.; AMORIM, A.; SIMÕES, M.; DRUCKER, D. P.; CRISCUOLO, C.; CUSTODIO, D. de O.; BORBA, R.; GOVEIA, S. S.; GRIGOLIN, G.; CAMBOIM, S.; LANDAU, E. C.; GARRASTAZU, M. C.; SILVA, M. F. da; BERTIN, P. R. B. |
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Afiliação: |
RICARDO DE OLIVEIRA DART, CNPS; DANIELA MACIEL PINTO, CNPM; CARLOS MOTA, SERVIÇO GEOLÓGICO DO BRASIL; ALEXANDRE AMORIM, AGÊNCIA NACIONAL DE ÁGUAS E SANEAMENTO BÁSICO; MARGARETH GONCALVES SIMOES, CNPS; DEBORA PIGNATARI DRUCKER, CNPTIA; CRISTINA CRISCUOLO, CNPM; DAVI DE OLIVEIRA CUSTODIO, CNPM; ROGÉRIO BORBA, IBGE; SIDNEY SCHABERLE GOVEIA, GEOSABER / QGIS BR; GIULIANO GRIGOLIN, SISTEMA INTEGRADO DE BASES GEOESPACIAIS DO ESTADO DO ESPÍRITO SANTO; SILVANA CAMBOIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; ELENA CHARLOTTE LANDAU, CNPMS; MARILICE CORDEIRO GARRASTAZU, CNPF; MAURIELLE FELIX DA SILVA, MINISTÉRIO PÚBLICO DO PARANÁ; PATRICIA ROCHA BELLO BERTIN, DEPI. |
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Título: |
GeoNode-BR: comunidade brasileira para a colaboração entre usuários do software GeoNode. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE INFRAESTRUTURA DE DADOS ESPACIAIS, 3., 2022. Geoinformação aberta para o desenvolvimento sustentável: anais. Rio de Janeiro: IBGE, 2022. p. 185-187. Evento online. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O GeoNode é uma solução web para o gerenciamento de recursos espaciais [1], e para a implantação de Infraestruturas de Dados Espaciais (IDEs). É uma solução livre e de código aberto, que oferece suporte aos padrões do Open Geoespatial Consortium (OGC) [2], além de ser extensível e interoperável com outras plataformas. O GeoNode possui uma estrutura de metadados baseada na ISO 19115 [3], essa aplicação Free Open Source Software (FOSS) GIS web tem sido uma ótima alternativa para implantar IDE e, por essa razão, tem sido muito adotada por empresas e instituições que possuem grande acervo de dados espaciais no Brasil e no mundo. Desta forma, visando trocar experiências sobre a aplicação FOSS GeoNode, profissionais de gestão de geoinformação da Embrapa, CPRM, ANA, IBGE e Geobases criaram um Grupo de Trabalho (GT) com reuniões periódicas a partir de 2020. Destas reuniões surgiu o interesse em criar uma comunidade brasileira de usuários GeoNode, e organizar um primeiro evento para disseminar, compartilhar e difundir conhecimentos sobre essa aplicação FOSS GIS, além de identificar outras iniciativas, em curso no país, que também estejam utilizando o GeoNode. |
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Palavras-Chave: |
Dados espaciais; Geoinformação. |
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Thesaurus NAL: |
Spatial data. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149252/1/GeoNode-BR-2022.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1149322/1/GeoNode-BR-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 02260nam a2200325 a 4500
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100 1 $aDART, R. de O.
245 $aGeoNode-BR$bcomunidade brasileira para a colaboração entre usuários do software GeoNode.$h[electronic resource]
260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE INFRAESTRUTURA DE DADOS ESPACIAIS, 3., 2022. Geoinformação aberta para o desenvolvimento sustentável: anais. Rio de Janeiro: IBGE, 2022. p. 185-187. Evento online.$c2022
520 $aO GeoNode é uma solução web para o gerenciamento de recursos espaciais [1], e para a implantação de Infraestruturas de Dados Espaciais (IDEs). É uma solução livre e de código aberto, que oferece suporte aos padrões do Open Geoespatial Consortium (OGC) [2], além de ser extensível e interoperável com outras plataformas. O GeoNode possui uma estrutura de metadados baseada na ISO 19115 [3], essa aplicação Free Open Source Software (FOSS) GIS web tem sido uma ótima alternativa para implantar IDE e, por essa razão, tem sido muito adotada por empresas e instituições que possuem grande acervo de dados espaciais no Brasil e no mundo. Desta forma, visando trocar experiências sobre a aplicação FOSS GeoNode, profissionais de gestão de geoinformação da Embrapa, CPRM, ANA, IBGE e Geobases criaram um Grupo de Trabalho (GT) com reuniões periódicas a partir de 2020. Destas reuniões surgiu o interesse em criar uma comunidade brasileira de usuários GeoNode, e organizar um primeiro evento para disseminar, compartilhar e difundir conhecimentos sobre essa aplicação FOSS GIS, além de identificar outras iniciativas, em curso no país, que também estejam utilizando o GeoNode.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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