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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
18/06/2012 |
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Data da última atualização: |
03/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GUIMARÃES-DIAS, F.; NEVES-BORGES, A. C.; VIANA, A. A. B.; MESQUITA, R. O.; ROMANO, E.; GROSSI-DE-SÁ, M. de F.; NEPOMUCENO, A. L.; LOUREIRO, M. E.; ALVES-FERREIRA, M. |
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Afiliação: |
FÁBIA GUIMARÃES DIAS, UFRJ; ANNA CRISTINA NEVES-BORGES, UNIRIO; ANTONIO AMERICO BARBOSA VIANA, CENARGEN; ROSILENE OLIVEIRA MESQUITA, UFV; EDUARDO ROMANO DE CAMPOS PINTO, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, SRI; MARCELO EHLERS LOUREIRO, UFV; MÁRCIO ALVES-FERREIRA, UFRJ. |
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Título: |
Expression analysis in response to drought stress in soybean: shedding light on the regulation of metabolic pathway genes. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 222-232, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Metabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plants. MenosMetabolomics analysis of wild type Arabidopsis thaliana plants, under control and drought stress conditions revealed several metabolic pathways that are induced under water deficit. The metabolic response to drought stress is also associated with ABA dependent and independent pathways, allowing a better understanding of the molecular mechanisms in this model plant. Through combining an in silico approach and gene expression analysis by quantitative real-time PCR, the present work aims at identifying genes of soybean metabolic pathways potentially associated with water deficit. Digital expression patterns of Arabidopsis genes, which were selected based on the basis of literature reports, were evaluated under drought stress condition by Genevestigator. Genes that showed strong induction under drought stress were selected and used as bait to identify orthologs in the soybean genome. This allowed us to select 354 genes of putative soybean orthologs of 79 Arabidopsis genes belonging to 38 distinct metabolic pathways. The expression pattern of the selected genes was verified in the subtractive libraries available in the GENOSOJA project. Subsequently, 13 genes from different metabolic pathways were selected for validation by qPCR experiments. The expression of six genes was validated in plants undergoing drought stress in both pot-based and hydroponic cultivation systems. The results suggest that the metabolic response to drought stress is conserved in Arabidopsis and soybean plan... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; QPCR. |
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Thesagro: |
Gene; Genoma; Resistência a seca; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Biochemical pathways; Bioinformatics; Drought tolerance; Genes; Genome; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61069/1/gmb.expression.anal.v35n1s.222-232.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 563. | | LANGE, C. C.; BRITO, M. A. V. P. e; BRITO, J. R. F.; ARCURI, E. F.; SOUZA, G. N. de; SILVA, M. A. DE; MARQUES, S. L. S.; DOMINGUES, R. Identificação de estafilococos isolados de leite de búfalas com mastite por PCR e pelo Sequenciamento do 16S rDNA. In: CONGRESSO NACIONAL DE LATICÍNIOS, 26., 2009, Juiz de Fora. Anais... Belo Horizonte: EPAMIG, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 564. | | RAPHAELLI, C. DE O.; GUERRA, D.; PEREIRA, E. DOS S.; VINHOLES, J. DA R.; CAMARGO, T. M.; SCHWARZ, S. F.; SILVA, M. A. S. DA; VIZZOTTO, M.; ZAVAREZE, E. DA R.; NORA, L. Fruits, seeds and leaves of guabijuzeiro (Myrcianthes pungens (O. Berg) D. Legrand): characteristics, uses and health benefts. Journal of Food Science and Technology, 2023. 18 p. Published: 01 September 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 566. | | HOFFMEISTER, C. R. D.; FANDARUFF, C.; COSTA, M. A.; CABRAL, L. M.; PITTA, L. R.; BILATTO, S. E. R.; PRADO, L. D.; CORREA, D. S.; TASSO, L.; SILVA, M. A. S.; ROCHA, H. V. A. Efavirenz dissolution enhancement III: Colloid milling, pharmacokinetics and electronic tongue evaluation. In:European Journal of Pharmaceutical Sciences, v. 99, p. 310-317, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 568. | | MELLO, G. L.; GENRO, T. C. M.; ROSSETTO, J.; FARIA, B. M. de; SILVA, M. A. P. da; SISTI, R. N.; SANTOS, A. de S.; CORREA, J. U. P. Comportamento ingestivo de novilhos Hereford mantidos em pastagem nativa. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 4., 2014, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2014. p. 17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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