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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
05/09/2005 |
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Data da última atualização: |
18/05/2022 |
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Autoria: |
NESHIC, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A. TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. |
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Título: |
The Diamond STING Server. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
Nucleic Acids Research, v. 33, n. 2, p. W29-W35, July 2005. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Supplement. |
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Conteúdo: |
Diamond STING is a new version of the STING suite of programs for a comprehensive analysis of a relationship between protein sequence, structure, function and stability. We have added a number of new functionalities by both providing more structure parameters to the STING Database and by improving/expanding the interface for enhanced data handling. The integration among the STING components has also been improved. A new key feature is the ability of the STING server to handle local files containing protein structures (either modeled or not yet deposited to the Protein Data Bank) so that they can be used by the principal STING components: JavaProtein Dossier (JPD) and STING Report. The current capabilities of the new STING version and a couple of biologically relevant applications are described here. We have provided an example where Diamond STING identifies the active site amino acids and folding essential amino acids (both previously determined by experiments) by filtering out all but those residues by selecting the numerical values/ranges for a set of corresponding parameters. This is the fundamental step toward a more interesting endeavor?the prediction of such residues. Diamond STING is freely accessible at http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br and http://trantor.bioc.columbia.edu/SMS. |
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Palavras-Chave: |
Diamond STING; JavaProtein Dossier; Protein structures; STING. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/178422/1/ID-25540.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 103 | |
| 6. |  | SILVA, J. L. S. da; TOWSEND, C. R. Integração lavoura-pecuária em solos hidromórficos no bioma Pampa. In: BUNGENSTAB, D. J.; ALMEIDA, R. G. de; LAURA, V. A.; BALBINO, L. C.; FERREIRA, A. D. (Ed.). ILPF: inovação com integração de lavoura, pecuária e floresta. Brasília, DF: Embrapa, 2019. p. 723-730.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | SILVA, J. L. S. da; THEISEN, G.; BORTOLINI, F. Planejamento de uso das áreas em integração lavourapecuária. In: ENCONTRO DE INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA NO SUL DO BRASIL, 3., 2011, [Pato Branco]. [Anais.]. Synergismus scyentifica UTFPR, v. 6, n. 2, [s.p.], 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no litoral Sul do Rio Grande do Sul, no ano agrícola 2010/2011. Pesquisa Agropecuária Gaúcha, Porto Alegre, v. 17, n. 1. p. 37-44, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no Litoral Sul do Rio Grande do Sul no ano agrícola 2010 / 2011. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 56.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 39., 2011, Ijui. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2011. p. 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no Litoral Sul do Rio Grande do Sul no ano agrícola 2010 / 2011. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 56.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 39., 2011, Ijui. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2011. p. 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | BORTOLINI, F.; MITTELMANN, A.; LONGARAY, M. B.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Avaliação agronômica de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos no litoral sul do Rio Grande do Sul, no ano agrícola 2010/2011. Pesquisa Agropecuária Gaucha, v. 17, n. 1, p. 37-44, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 14. | | BORTOLINI, F.; ROSA, T. C.; SANTOS, H. S.; MITTELMANN, A.; SILVA, J. L. S. da. Avaliação de híbridos de sorgo silageiro no Litoral Sul do RS, no ano agrícola 2012/13 In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 58.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 41., 2013, Pelotas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | FONTANELI, R. S.; VARELLA, A. C.; SILVA, J. L. S. da; SANTOS, H. P. dos. Desempenho das forrageiras subtropicais em sistema de integração lavoura-pecuária e de integração pecuária-floresta. In: CORDEIRO, L. A. M.; VILELA, L.; KLUTHCOUSKI, J.; MARCHÂO, R. L. (Ed.). Integração lavoura-pecuária-floresta: o produtor pergunta, a Embrapa responde. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 225-242.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 16. | | BORTOLINI, F.; ROSA, T. C. da; MITTELMANN, A.; SILVA, J. L. S. da; GOMES, J. F. Desempenho de genótipos de sorgo silageiro em solos hidromórficos. In: REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO MILHO, 57.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DO SORGO, 40., 2012, Porto Alegre. Atas e resumos. Porto Alegre: FEPAGRO, 2012. p. 34.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 17. | | AMARAL, F. P. do; AGOUD, L.; SCHAFHAUSER JUNIOR, J.; AZAMBUJA, A.; SILVA, J. L. S. da. Desempenho de novilhas jersey em pastagens anuais de inverno e verão sob sistema de pastejo contínuo. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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