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| Registros recuperados : 181 | |
| 141. |  | SANTANA, C. G.; ANDRADE, A. E.; GUIMARÃES, L. M.; PAES, N. S.; FRAGOSO, R. R.; SILVA, F. R. da; OLIVEIRA, J. T. A. de; CARNEIRO, R. M. D. G.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; MEHTA, A. Identificação de genes potencialmente envolvidos na resistência a Meloidogyne incognita em feijão e algodão. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGA, 2., 2007, Brasília. Anais... Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 123-126.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 142. | | SOUTO, B. M.; LEITE, A. P. F.; MADEIRA, L. M.; VINECKY, F.; CARVALHO, D. M.; VIANNA, G. R.; SILVA, F. R. da; ARAGÃO, F. J. L.; DAFFRE, S.; SILVA JÚNIOR, P. I.; ANDRADE, A. C.; RECH, E. Identificação de uma smased-like isolada da glândula da seda de Nephilengys cruentata. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 9., 2004, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. p. 64.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 143. | | RABELLO, A. R.; GUIMARÃES, C. M.; RANGEL, P. H. N.; SILVA, F. R. da; SEIXAS, D.; SOUZA, E. de; BRASILEIRO, A. C. M.; SPEHAR, C. R.; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Identification of drought-responsive genes in roots of upland rice (Oryza sativa L). BMC Genomics, London, v. 9, n. 485, out. 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 144. | | SOUSA, T. R. de; CARVALHO, A. M. de; RAMOS, M. L. G.; OLIVEIRA, A. D. de; FONSECA, A. C. P. da; SILVA, F. R. da C.; RIBEIRO, H. C.; SANTOS, M. V. A. dos; MARCHAO, R. L. Indicadores químicos e atividade enzimática dos efeitos do consórcio café arábica e capim braquiária. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 22., 2023, Natal. A agrometeorologia e a agropecuária: adaptação às mudanças climáticas: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2023. p. 2167-2172.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 145. | | BARROS, L. M. G.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; SANTOS, D. B. M.; ABREU, M. S.; MARRACCINI, P.; SILVA, F. R. da; RODRIGUES, G. C.; EIRA, M. T. S.; ALMEIDA, J. D. de; ANDRADE, A. C.; CARNEIRO, M. Studies of a new lipid transfer protein (LTP) expressed during coffee fruit development. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 27.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 37º Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 146. | | BARROS, L. M. G.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; SANTOS, D. B. M.; ABREU, M. S.; MARRACCINI, P.; SILVA, F. R. da; RODRIGUES, G. C.; EIRA, M. T. S.; ALMEIDA, J. D. de; CARNEIRO, M. Studies of a new lipid transfer protein (LTP) expressed during coffee fruit development. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PABMB, 11., 2008, Águas de Lindóia, SP. Abstracts... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 147. | | BITTENCOURT, D.; SOUTO, B. M.; VERZA, N. C.; VINECKY, F.; DITTMAR, K.; SILVA JUNIOR, P. I.; ANDRADE, A. C.; SILVA, F. R. da; LEWIS, R. V.; RECH, E. L. Spidroins from the Brazilian spider Nephilengys cruentata (Araneae: Nephilidae). Comparative Biochemistry and Physiology, part B, v. 147, p. 597-606, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 148. | | SOUTO, B. M.; BITTENCOURT, D.; DITTMAR, K.; OLIVEIRA, P. E. F.; MADEIRA, L. M.; VERZA, N. C.; ANDRADE, A. C.; SILVA, F. R. da; LEWIS, R. V.; RECH, E. L. Spidroins from the brazilian spider Nephilengys cruentata (Araneae: Tetragnathidae). In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 149. | | CRATIVOL, C.; REGULSKI, M.; BERTALAN, M.; MCCOMBIE, W. R.; SILVA, F. R. da; ZERLOTINI NETO, A.; VICENTINI, R.; FARINELLI, L.; HEMERLY, A. S.; MARTIENSSEN, R. A.; FERREIRA, P. C. G. Sugarcane genome sequencing by methylation filtration provides tools for genomic research in the genus Saccharum. The Plant Journal, Oxford, v. 79, n. 1, p. 162-172, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 150. | | FONSECA, A. C. P. da; CARVALHO, A. M. de; SOUSA, T. R. de; OLIVEIRA, A. D. de; JESUS, D. R. de; DAMASCENO, G. A.; RIBEIRO, H. C.; SILVA, F. R. da C.; BARROS, I. A. de; MARCHAO, R. L. Teores de macronutrientes do consórcio café com capim Braquiária no Cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 22., 2023, Natal. A agrometeorologia e a agropecuária: adaptação às mudanças climáticas: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2023. p. 2173-2177| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 151. | | VARGAS, C.; PÁDUA, V. L. M. de; NOGUEIRA, E. de M.; VINAGRE, F.; MASUDA, H. P.; SILVA, F. R. da; BALDANI, J. I.; FERREIRA, P. C. G.; HEMERLY, A. S. Signaling pathways mediating the association between sugarcane and endophytic diazotropic bacteria: A Genomic approach. Symbiosis, Balaban, v. 35, p. 159-180, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 152. | | SOUSA, E. M. R.; SUZART, C.; COSTA, S. N.; COSTA, M. G. C.; ALMEIDA, A. A. F. de; COELHO FILHO, M. A.; SILVA, F. R. da; SOARES FILHO, W. dos S.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. Transcriptomic analysis related to the flowering of the citrus hybrid Microcitrangemonia. Current Plant Biology, v. 18, p. 1-9, May 2019. Article number: 100097.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 153. | | BRASILEIRO, A. C. M.; SANTOS, C. M. R.; MORGANTE, C. V.; MARTINS, A. C. Q.; ARAUJO, A. C. G. de; SILVA, F. R. da; BERTIOLI, D. J.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARAES, P. M. A transcriptional approach to identify genes related to drought in wild arachis. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [s.l.]: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 127| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 154. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; ARAÚJO, A. C. G.; BERTIOLI, D. J.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M. A transcriptional approach for identifying genes related to drought stress. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 77. Poster.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 155. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; ARAÚJO, A. C. G.; BERTIOLI, D. J.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M. A transcriptional approach for identifying genes related to drought stress. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE PEANUT RESEARCH COMMUNITY ON ADVANCES IN ARACHIS THROUGH GENOMICS AND BIOTECNOLOGY, 5., 2011, Brasília, DF. Book of abstracts... Brasília, DF: Embrapa Genetic Researces and Biotecnology, 2011. p. 77.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 156. | | CARVALHO, D. M.; VINECKY, F.; SOUTO, B. M.; MADEIRA, L. M.; VIANNA, G. R.; ARAGÃO, F. J. L.; DAFFRE, S.; SILVA JÚNIOR, P. L.; ANDRADE, A. C.; SILVA, F. R. da; RECH, E. Transcriptoma da glândula produtora de teias de aranha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 407.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 157. | | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; PROITE, K.; ARAUJO, A. C. G. de; BERTIOLI, S. C. de M. L.; PIC TAYLOR, A.; SILVA, F. R. da; MORGANTE, C. V.; RIBEIRO, S. da G.; BERTIOLI, D. J. A study of gene expression in the nematode resistant wild peanut relative, Arachis stenosperma, in response to challenge with Meloidogyne arenaria. Tropical Plant Biology, v. 3, p. 183-192, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 158. | | OLIVEIRA, A. D. de; RIBEIRO, F. C.; FERREIRA, E. A. B.; SOARES, J. P. G.; SILVA, F. R. da C.; BISPO, O. B.; ZANSAVIO, A. M. de O.; CEOLIN, J. G. R. Variability of Nitrous Oxide and Methane emissions from soils under Eucalyptus forests in the Cerrado (Brazilian savanna). In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FOREST SYSTEMS; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK SYSTEMS, 3., 2015, Brasília, DF. Towards sustainable intensification: proceedings. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 310| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 159. | | PEREIRA, C. M.; CARVALHO, A. C. de; SILVA, F. R. da; MELENDEZ, M. E.; LESSA, R. C.; ANDRADE, V. C. C.; KOWALSKI, L. P.; VETTORE, A. L.; CARVALHO, A. L. In vitro and in silico validation of CA3 and FHL1 downregulation in oral cancer. BMC Cancer, v. 18, p. 1-10, 2018. Article number: 193.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 160. | | VIEIRA, L. A.; CARVALHO, V. da S. A.; PIMENTEL, V. da S.; MOREIRA, E. M.; VIEIRA, A. C.; SILVA, F. R. da S. e; RIBEIRO, J. M. R.; GURGEL, F. de L.; ANDRADE NETO, R. de C.; ARÉVALO, M. R.; ROSSI, C. Q.; VIEIRA, D. D. S. S. Avaliação do desenvolvimento de cultivares de maracujazeiro amarelo (Passiflora edulis) em diferentes substratos. In: SILVA, L. F. da; OLIVEIRA, V. C. de (org.). Ciências agrárias: estudos sistemáticos e pesquisas avançadas 4. Ponta Grossa: Atena, 2023. cap. 3, p. 29-46.| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| Registros recuperados : 181 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
02/01/2014 |
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Data da última atualização: |
22/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
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Afiliação: |
LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN. |
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Título: |
Sequencing and de novo genome assembly of a nelore (Bos indicus) bull. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Notas: |
Pôster 0522. |
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Conteúdo: |
Bos indicus cattle breeds have been extensively used for dairy and beef production in tropical climates and present several natural adaptations to biotic and abiotic stresses found in these regions of the world. As breeder associations stride towards incorporating genomic tools into ongoing genetic evaluations and breeding programs to improve productivity and beef and milk quality traits, a (B. indicus) genome assembly represents an essential tool which will be vital to help identify and understand the underlying genetic variations that distinguish taurine and indicine cattle, which have diverged >250,000 years ago. DNA obtained from semen from a Nelore bull born in 1987, with an estimated cumulative inbreeding coefficient of 29.4%, and that can be traced to animals imported from India, was used to produce 100bp paired-end sequences from short (300 and 700bp) and long insert (3, 5 and 10 kbp) libraries, with an Illumina HiSeq platform. A total of 120Gbp were sequenced, corresponding to 45x raw coverage of the genome. The SOAP de novo assembler was used to build contigs and scaffolding. Several parameters sets were evaluated to obtain the best assembly based on the number of scaffolds, number of bases in scaffolds, N50, and total gap length. The best assembly obtained so far contains 2.7Gbp, 15,103 scaffolds with N50 of 649Kbp, and 756Mbp of gaps. Current results are being used to target additional sequencing of specific libraries to improve scaffold assembly. In addition, different sequencing technologies are also under evaluation for generating additional data to improve sequence assembly quality before comparisons with the reference (B. taurus) sequence are performed. MenosBos indicus cattle breeds have been extensively used for dairy and beef production in tropical climates and present several natural adaptations to biotic and abiotic stresses found in these regions of the world. As breeder associations stride towards incorporating genomic tools into ongoing genetic evaluations and breeding programs to improve productivity and beef and milk quality traits, a (B. indicus) genome assembly represents an essential tool which will be vital to help identify and understand the underlying genetic variations that distinguish taurine and indicine cattle, which have diverged >250,000 years ago. DNA obtained from semen from a Nelore bull born in 1987, with an estimated cumulative inbreeding coefficient of 29.4%, and that can be traced to animals imported from India, was used to produce 100bp paired-end sequences from short (300 and 700bp) and long insert (3, 5 and 10 kbp) libraries, with an Illumina HiSeq platform. A total of 120Gbp were sequenced, corresponding to 45x raw coverage of the genome. The SOAP de novo assembler was used to build contigs and scaffolding. Several parameters sets were evaluated to obtain the best assembly based on the number of scaffolds, number of bases in scaffolds, N50, and total gap length. The best assembly obtained so far contains 2.7Gbp, 15,103 scaffolds with N50 of 649Kbp, and 756Mbp of gaps. Current results are being used to target additional sequencing of specific libraries to improve scaffold assembly. In addition, di... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Sequenciamento de genoma. |
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Thesagro: |
Bos indicus. |
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Thesaurus NAL: |
bioinformatics; genome assembly; Nellore. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94595/1/P0522.odt
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Marc: |
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700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
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Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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