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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
26/12/2019 |
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Data da última atualização: |
13/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BLECHA, I. M. Z.; SOUSA, I. I.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F. |
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Afiliação: |
Isabella Maiumi Zaidan Blecha, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; Isadora Inácio Sousa, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; ANNA BEATRIZ ROBOTTOM FERREIRA, CTAA; GELSON LUIS DIAS FEIJO, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC. |
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Título: |
Alternative methodologies for genotyping polymorphisms in the CAST and CAPN1 genes in beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 48, e20180218, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform in any basic molecular biology laboratory. If the association of these markers with traits of economic interest in beef cattle is confirmed in new studies, these methodologies may contribute to the selection of animals with superior genetics, i.e., with the potential to produce better-quality meat, either by marker-assisted selection or by the inclusion of these polymorphisms in high-density marker panels. MenosThe objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform i... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Marker-assisted selection; Meat tenderness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207815/1/Alternative-methodologies-for-genotyping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
05/10/2010 |
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Data da última atualização: |
27/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, D. M. da; CARNEIRO, A. V.; MOSCARDI, F.; BUENO, A. de F.; FORTES, A. P.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; MARTINELLI, S. |
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Afiliação: |
DÉBORA MELLO DA SILVA, UEL; ADAIR VICENTE CARNEIRO, CNPSO; FLÁVIO MOSCARI, UEL; ADENEY DE FREITAS BUENO, CNPSO; ANA PAULA FORTES, CNPSo; CLARA BEATRIZ HOFFMANN CAMPO, CNPSO; SAMUEL MARTINELLI, Monsanto do Brasil. |
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Título: |
Aspectos bioecológicos de Spodoptera frugiperda em diferentes culturas hospedeiras. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. [Anais...]. Natal: Emparn: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. Poster 1590. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Espécies do gênero Spodoptera têm sido encontradas em diferentes níveis de intensidade atacando à cultura da soja no Brasil. A complexidade da paisagem agrícola brasileira na qual é possível se encontrar justaposição de áreas e sucessões de culturas de importância econômica pode contribuir para o aumento de pragas com hábitos alimentares polífagos. Neste estudo avaliou-se a duração dos instares, sobrevivência, peso de pupas e razão sexual de Spodoptera frugiperda alimentadas com soja BRS 284, algodão FMT 701, trigo BRS Pardela, milho DKB 390, aveia Embrapa 139 e dieta artificial em condições controladas (25 ± 1ºC , UR de 80 ± 10% e fotofase de 14 h). A sobrevivência (%) e a razão sexual das lagartas não foram afetadas pelo alimento oferecido. Entretanto, a duração dos instares (dias) foi significativamente afetada, sendo mais curta nos tratamentos com gramíneas onde se destacou o trigo, como o alimento em que houve o tempo de desenvolvimento mais curto entre todos os tratamentos avaliados. O algodão e soja foram os alimentos que mais prolongaram o ciclo de desenvolvimento das lagartas, sendo que o algodão foi também onde se originaram as pupas de menor peso, mostrando-se como um alimento desfavorável ao desenvolvimento da S. frugiperda. Em geral, os resultados mostram que as gramíneas são os melhores alimentos para o desenvolvimento da S. frugiperda semelhantes ao padrão de dieta artificial. Além do milho, o trigo e aveia têm um grande potencial para o desenvolvimento dessa lagarta. Entre os alimentos testados, algodão foi o alimento mais desfavorável para praga seguido pela soja. Essas informações são de grande importância para a melhor compreensão da dinâmica populacional dessa praga nessas diferentes culturas e futuramente traçar estratégias de manejo integrado de pragas e manejo de resistência da S. frugiperda a inseticidas ou a plantas geneticamente modificadas contendo Bt (Bacillus thuringiensis). MenosEspécies do gênero Spodoptera têm sido encontradas em diferentes níveis de intensidade atacando à cultura da soja no Brasil. A complexidade da paisagem agrícola brasileira na qual é possível se encontrar justaposição de áreas e sucessões de culturas de importância econômica pode contribuir para o aumento de pragas com hábitos alimentares polífagos. Neste estudo avaliou-se a duração dos instares, sobrevivência, peso de pupas e razão sexual de Spodoptera frugiperda alimentadas com soja BRS 284, algodão FMT 701, trigo BRS Pardela, milho DKB 390, aveia Embrapa 139 e dieta artificial em condições controladas (25 ± 1ºC , UR de 80 ± 10% e fotofase de 14 h). A sobrevivência (%) e a razão sexual das lagartas não foram afetadas pelo alimento oferecido. Entretanto, a duração dos instares (dias) foi significativamente afetada, sendo mais curta nos tratamentos com gramíneas onde se destacou o trigo, como o alimento em que houve o tempo de desenvolvimento mais curto entre todos os tratamentos avaliados. O algodão e soja foram os alimentos que mais prolongaram o ciclo de desenvolvimento das lagartas, sendo que o algodão foi também onde se originaram as pupas de menor peso, mostrando-se como um alimento desfavorável ao desenvolvimento da S. frugiperda. Em geral, os resultados mostram que as gramíneas são os melhores alimentos para o desenvolvimento da S. frugiperda semelhantes ao padrão de dieta artificial. Além do milho, o trigo e aveia têm um grande potencial para o desenvolvimento dessa... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Praga de planta; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
Plant pests; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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Marc: |
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245 $aAspectos bioecológicos de Spodoptera frugiperda em diferentes culturas hospedeiras.
260 $c2010
520 $aEspécies do gênero Spodoptera têm sido encontradas em diferentes níveis de intensidade atacando à cultura da soja no Brasil. A complexidade da paisagem agrícola brasileira na qual é possível se encontrar justaposição de áreas e sucessões de culturas de importância econômica pode contribuir para o aumento de pragas com hábitos alimentares polífagos. Neste estudo avaliou-se a duração dos instares, sobrevivência, peso de pupas e razão sexual de Spodoptera frugiperda alimentadas com soja BRS 284, algodão FMT 701, trigo BRS Pardela, milho DKB 390, aveia Embrapa 139 e dieta artificial em condições controladas (25 ± 1ºC , UR de 80 ± 10% e fotofase de 14 h). A sobrevivência (%) e a razão sexual das lagartas não foram afetadas pelo alimento oferecido. Entretanto, a duração dos instares (dias) foi significativamente afetada, sendo mais curta nos tratamentos com gramíneas onde se destacou o trigo, como o alimento em que houve o tempo de desenvolvimento mais curto entre todos os tratamentos avaliados. O algodão e soja foram os alimentos que mais prolongaram o ciclo de desenvolvimento das lagartas, sendo que o algodão foi também onde se originaram as pupas de menor peso, mostrando-se como um alimento desfavorável ao desenvolvimento da S. frugiperda. Em geral, os resultados mostram que as gramíneas são os melhores alimentos para o desenvolvimento da S. frugiperda semelhantes ao padrão de dieta artificial. Além do milho, o trigo e aveia têm um grande potencial para o desenvolvimento dessa lagarta. Entre os alimentos testados, algodão foi o alimento mais desfavorável para praga seguido pela soja. Essas informações são de grande importância para a melhor compreensão da dinâmica populacional dessa praga nessas diferentes culturas e futuramente traçar estratégias de manejo integrado de pragas e manejo de resistência da S. frugiperda a inseticidas ou a plantas geneticamente modificadas contendo Bt (Bacillus thuringiensis).
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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