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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
10/01/2018 |
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Data da última atualização: |
05/04/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LIMA, B. P. de; ALVES-FREITAS, D. M. T.; MELO, F. L. de; CARVALHO, R. de C. P.; FARIA, J. C. de; RIBEIRO, S. G. |
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Afiliação: |
BRUNA PINHEIRO DE LIMA, UNB; DIONE MENDES TEIXEIRA ALVES-FREITAS; FERNANDO LUCAS DE MELO, UNB; RITA DE CASSIA PEREIRA CARVALHO, UNB; JOSIAS CORREA DE FARIA, CNPAF; SIMONE DA GRACA RIBEIRO, Cenargen. |
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Título: |
Characterization of a new whitefly-transmitted (Bemisia tabaci Meam 1) cytorhabdovirus infecting common bean. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. |
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Páginas: |
p. 52. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
CONAFE |
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Conteúdo: |
Common bean (Phaseolus vulgaris) is an important crop in Latin America and Africa. The bean yield may be affected by the incidence of different viruses. As part of a virus survey in beans, we have used high-throughput sequencing approach to identify viruses with RNA genome in bean plants collected in Goiás (GO) state. Bioinformatic analysis of the de novoassembled contigs identified a putative cytorhabdovirus (family Rhabdoviridae) with low similarities with Northern cereal mosaic virus (NCMV). This new cytorhabdovirus was denominated Bean associated cytorhabdovirus (BaC). Cytorhabdoviruses have enveloped particles, negative ssRNA of 11-14 kb genome and are usually transmitted by aphids or leafhoppers. |
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Thesagro: |
Bemisia tabaci; Feijão; Mosca branca; Phaseolus vulgaris. |
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Thesaurus Nal: |
Cytorhabdovirus. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166028/1/CNPAF-2017-conafep52.pdf
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Marc: |
LEADER 01601nam a2200253 a 4500
001 2084949
005 2023-04-05
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Data corrente: |
20/08/2014 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SILVA, A. M. O. da. |
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Afiliação: |
ANA MARA OLIVEIRA DA SILVA, Coorientadora: Dra. NELCIMAR REIS SOUSA, CPAA. |
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Título: |
Diversidade e estrutura genética da coleção regional de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
2014. |
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Páginas: |
47 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus. Orientador: Dr. Charles Roland Clement; Coorientadora: Dra. Nelcimar Reis Sousa. |
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Conteúdo: |
A mandioca (Manihot esculenta Crantz) desempenha importante papel social como fonte de alimentação nas regiões tropicais mundiais. O germoplasma conservado constitui a base para aproveitamento tecnológico da espécie no desenvolvimento de novas cultivares. Para que seja eficientemente utilizado necessita de diferentes métodos de caracterização genética. Os marcadores com base em elementos transponíveis são indicados para análises genéticas devido as suas qualidades de reprodutibilidade e polimorfismo abundante. Foram utilizados 430 acessos de mandioca que compõem o germoplasma da Embrapa, coletados na bacia amazônica. As sequências de retrotransposons foram localizadas no banco de dados do Phytozome, os primers IRAP desenhados com o programa Primer3, a estruturação dentro do germoplasma foi detectada através do software STRUCTURE v 2.2 e a diversidade genética foi avaliada utilizando o software Popgen v1.32. Para os dados de IRAP o software STRUCTURE sugeriu a existência de dois agrupamentos genéticos (K=2) um com 93 e outro com 127 variedades do total de 430 plantas, considerando apenas a fidelidade acima de 80%. A AMOVA para K = 2 revelou mais variação dentro do grupo (89%) que entre os grupos (11%). Os seis pares de primers IRAP foram informativos para avaliar a diversidade genética, com médias de 96% de polimorfismo, 0.4 de heterozigosidade e com índice de Shannon de 0.57, porém, não detectaram estruturação dentro do germoplasma de mandioca comparada com a estruturação assistida por outros marcadores. MenosA mandioca (Manihot esculenta Crantz) desempenha importante papel social como fonte de alimentação nas regiões tropicais mundiais. O germoplasma conservado constitui a base para aproveitamento tecnológico da espécie no desenvolvimento de novas cultivares. Para que seja eficientemente utilizado necessita de diferentes métodos de caracterização genética. Os marcadores com base em elementos transponíveis são indicados para análises genéticas devido as suas qualidades de reprodutibilidade e polimorfismo abundante. Foram utilizados 430 acessos de mandioca que compõem o germoplasma da Embrapa, coletados na bacia amazônica. As sequências de retrotransposons foram localizadas no banco de dados do Phytozome, os primers IRAP desenhados com o programa Primer3, a estruturação dentro do germoplasma foi detectada através do software STRUCTURE v 2.2 e a diversidade genética foi avaliada utilizando o software Popgen v1.32. Para os dados de IRAP o software STRUCTURE sugeriu a existência de dois agrupamentos genéticos (K=2) um com 93 e outro com 127 variedades do total de 430 plantas, considerando apenas a fidelidade acima de 80%. A AMOVA para K = 2 revelou mais variação dentro do grupo (89%) que entre os grupos (11%). Os seis pares de primers IRAP foram informativos para avaliar a diversidade genética, com médias de 96% de polimorfismo, 0.4 de heterozigosidade e com índice de Shannon de 0.57, porém, não detectaram estruturação dentro do germoplasma de mandioca comparada com a estruturação as... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Genetic Diversity; Germoplasma vegetal; IRAP; Retrotransposon. |
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Thesagro: |
Mandioca; Manihot Esculenta; Polimorfismo. |
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Thesaurus NAL: |
polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/106826/1/ANA-MARA-PPGBIOTEC-DISSERTACAO-2014.pdf
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Marc: |
LEADER 02378nam a2200241 a 4500
001 1992989
005 2021-12-22
008 2014 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aSILVA, A. M. O. da
245 $aDiversidade e estrutura genética da coleção regional de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental.
260 $a2014.$c2014
300 $a47 f.
500 $aDissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus. Orientador: Dr. Charles Roland Clement; Coorientadora: Dra. Nelcimar Reis Sousa.
520 $aA mandioca (Manihot esculenta Crantz) desempenha importante papel social como fonte de alimentação nas regiões tropicais mundiais. O germoplasma conservado constitui a base para aproveitamento tecnológico da espécie no desenvolvimento de novas cultivares. Para que seja eficientemente utilizado necessita de diferentes métodos de caracterização genética. Os marcadores com base em elementos transponíveis são indicados para análises genéticas devido as suas qualidades de reprodutibilidade e polimorfismo abundante. Foram utilizados 430 acessos de mandioca que compõem o germoplasma da Embrapa, coletados na bacia amazônica. As sequências de retrotransposons foram localizadas no banco de dados do Phytozome, os primers IRAP desenhados com o programa Primer3, a estruturação dentro do germoplasma foi detectada através do software STRUCTURE v 2.2 e a diversidade genética foi avaliada utilizando o software Popgen v1.32. Para os dados de IRAP o software STRUCTURE sugeriu a existência de dois agrupamentos genéticos (K=2) um com 93 e outro com 127 variedades do total de 430 plantas, considerando apenas a fidelidade acima de 80%. A AMOVA para K = 2 revelou mais variação dentro do grupo (89%) que entre os grupos (11%). Os seis pares de primers IRAP foram informativos para avaliar a diversidade genética, com médias de 96% de polimorfismo, 0.4 de heterozigosidade e com índice de Shannon de 0.57, porém, não detectaram estruturação dentro do germoplasma de mandioca comparada com a estruturação assistida por outros marcadores.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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