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| Registros recuperados : 248 | |
| 161. |  | CARVALHO, J. O. P. de; SOARES, M. H. M.; MIRANDA, I. L.; ALMEIDA, W. da C.; COSTA, D. H. M. Efeito do fogo na composição florística de uma mata virgem no Tapajós. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 53.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 25., 2002, Recife. Resumos. Recife: SBB: UFRPE: UFPE, 2002. p. 330.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 162. | | CARVALHO, J. O. P. de; NASCIMENTO, S. M. do; CASTRO, T. da C.; BATISTA, R. W. C. Mudanças ocorridas nas populações de espécies arbóreas das famílias Burseraceae, Humiriaceae e Sapotaceae em conseqüência de exploração florestal de impacto reduzido em florestas naturais de terra firme no Estado do Pará. In: CONFERÊNCIA DO SUBPROGRAMA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA - SPC&T FASE II/PPG7, 2008, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: CNPq, 2009. p. 329-333. Disponível também em CD-ROM (CD 00173).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 164. | | SILVA, J. N. M.; CARVALHO, J. O. P. de; LOPES, J. do C. A.; MONTAGNER, L. H. Regeneração natural de Vochysia maxima em floresta secundaria no Planalto do Tapajós, Belterra, Pará. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1984. p. 118-119. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 31).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 165. | | SILVA, J. N. M.; CARVALHO, J. O. P. de; LOPES, J. do C. A.; MONTAGNER, L. H. Regeneração natural de Vochysia maxima em floresta secundária no planalto do Tapajós, Belterra, Pará. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Anais. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1986. v. 2, p. 283-289. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 36). v.2 Flora e floresta.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 167. | | LOPES, J. do C. A.; CARVALHO, J. O. P. de; SILVA, J. N. M.; COSTA, H. B. da. Sociabilidade entre 18 espécies comerciais ocorrentes na Floresta Nacional do Tapajós. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Anais. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1986. v. 2, p. 263-268. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 36). v.2 Flora e floresta.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 168. | | LOPES, J. do C. A.; CARVALHO, J. O. P. de; SILVA, J. N. M.; COSTA, H. B. da. Sociabilidade entre as espécies comerciais correntes na Floresta Nacional do Tapajós. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1984. p. 115-116. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 31).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 169. | | QUADROS, L. C. L.; CARVALHO, J. O. P. de; GOMES, J. M.; TAFFAREL, M.; SILVA, J. C. F. Sobrevivência e crescimento de mudas de regeneração natural de Astronium gracile Engl. em clareiras causadas por exploração florestal na Amazônia brasileira. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 23, n. 3, p. 411-416, jul./set. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 170. | | MACIEL, M. de N. M.; BASTOS, P. C. de O.; CARVALHO, J. O. P. de; WATRIN, O. dos S. Uso de imagens orbitais na estimativa de parâmetros estruturais de uma floresta primária no município de Paragominas, estado do Pará. Revista de Ciências Agrárias, Belém, PA, n. 52, p. 159-178, jul./dez. 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 171. | | CARVALHO, J. O. P. de; FERREIRA, M. do S. G.; OLIVEIRA, L. C. de; VIEIRA, I. C. G.; SOARES, M. H.; MIRANDA, I. L. Espécies mais importantes na estrutura da floresta da área Trombetas no território Quilombola, município de Oriximina, Pará. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DA IUFRO, 2000, Belém, PA. Manejo integrado de florestas úmidas neotropicais por industrias e comunidades: aplicando resultados de pesquisa, envolvendo atores e definindo políticas públicas - resumos. Belém: [s.n.], 2000. p. 99.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 172. | | REIS, P. C. M. dos; REIS, L. P.; RUSCHEL, A. R.; SILVA, J. N. M.; CARVALHO, J. O. P. de; QUEIROZ, W. T. de. Effect of timber harvesting on density and basal area of Lecythidaceae species in the Eastern Amazon. Floresta, v. 44, n. 2, p. 229-238, abr./jun. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas. |
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| 173. | | CARVALHO, J. O. P. de; SILVA, J. N. M.; LOPES, J. do C. A.; MONTAGNER, L. H.; CARVALHO, M. S. P. de. Composição florística de uma mata secundária no planalto de Belterra no Pará. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Anais. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1986. v. 2 p. 197-205. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 36).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 174. | | CARVALHO, J. O. P. de; SILVA, J. N. M.; LOPES, J. do C. A.; MONTAGNER, L. H.; CARVALHO, M. S. P. de. Composição florística e uma mata secundária no planalto do Tapajós em Belterra - PA. In: SIMPÓSIO DO TRÓPICO ÚMIDO, 1., 1984, Belém, PA. Resumos. Belém, PA: EMBRAPA-CPATU, 1984. p. 104. (EMBRAPA-CPATU. Documentos, 31).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 175. | | SILVA, J. N. M.; CARVALHO, J. O. P. de; LOPES, J. do C. A.; OLIVEIRA, R. P. de; OLIVEIRA, L. C. de. Growth and yield studies in the Tapajos region, central brazilian Amazon. Commonwealth Forestry Review, v. 75, n. 4, p. 325-329, Dec. 1996. il.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 176. | | SILVA, J. N. M.; CARVALHO, J. O. P. de; LOPES, J. do C. A.; ALMEIDA, B. F. de; COSTA, D. H. M.; OLIVEIRA, L. C. de. Growth and yield of a tropical rain forest of the brazilian Amazon 13 years after logging. In: IUFRO CONFERENCE, 1993, Copenhagen. Growth and yield estimation from successive forest inventories - proceedings. Lyngby: Danish Forest and Landscape Research Institute, 1993. p. 250-259. Editado por J.K. Vanclay, J.P. Skovsgaard, G.Z. Gertner.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 177. | | SOUZA, D. V.; CARVALHO, J. O. P. de; MENDES, F. da S.; MELO, L. de O.; SILVA, J. N. M.; JARDIM, F. C. da S. Growth of Manilkara huberi and Manilkara paraensis after logging and silvicultural treatments in the municipality of paragominas, Pará, Brazil. Floresta, Curitiba, v. 44, n. 3, p. 485-496, jul./set. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 178. | | AVILA, A. L. de; RUSCHEL, A. R.; CARVALHO, J. O. P. de; SILVA, J. N.; MAZZEI, L.; DORMANN, C. F.; BAUHUS, J. Forest recovery over 30 years following management interventions of different intensities in the brazilian Amazon. In: ANNUAL CONFERENCE OF THE SOCIETY FOR TROPICAL ECOLOGY, 2015, Zürich. Resilience of tropical ecosystems - future challenges and opportunities. Zurich: GTO, 2015. p. 43.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| Registros recuperados : 248 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Acre. Para informações adicionais entre em contato com cpafac.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
25/10/2023 |
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Data da última atualização: |
13/05/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 3 |
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Autoria: |
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; PETERS, L. P.; ASSIS, G. M. L. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de. |
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Afiliação: |
JÔNATAS CHAGAS DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; ANDRÉ LUCAS DOMINGOS DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; LUCIELIO MANOEL DA SILVA, CPATC; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; LEILA PRISCILA PETERS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; GISELLE MARIANO LESSA DE ASSIS, CPAF-AC; CARLA CRISTINA DA SILVA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC. |
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Título: |
Novel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, v. 42, p. 183-192, Mar. 2024. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11105-023-01402-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Forage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first gene-derived SSR for A. pintoi. These new informative microsatellites may be linked to agronomically important genes to be used in genetic studies. MenosForage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Amendoim forrageiro; Anotação funcional; Cacahuetes forrajeros; Fitomejoramiento; Forage peanut; Identificación de especies; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; RNA-Seq; Transcriptoma; Transferencia de genes. |
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Thesagro: |
Arachis Hypogaea; Genoma; Identificação de Estirpe; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal. |
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Thesaurus NAL: |
Arachis pintoi; Gene transfer; Genetic markers; Genome; Microsatellite repeats; Plant breeding; Species identification; Transcriptome. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 03263naa a2200517 a 4500
001 2157490
005 2024-05-13
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11105-023-01402-9$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, J. C. de
245 $aNovel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification.$h[electronic resource]
260 $c2024
520 $aForage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first gene-derived SSR for A. pintoi. These new informative microsatellites may be linked to agronomically important genes to be used in genetic studies.
650 $aArachis pintoi
650 $aGene transfer
650 $aGenetic markers
650 $aGenome
650 $aMicrosatellite repeats
650 $aPlant breeding
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653 $aCacahuetes forrajeros
653 $aFitomejoramiento
653 $aForage peanut
653 $aIdentificación de especies
653 $aMarcadores genéticos
653 $aRepeticiones de microsatélite
653 $aRNA-Seq
653 $aTranscriptoma
653 $aTransferencia de genes
700 1 $aSILVA, A. L. D. da
700 1 $aSILVA, L. M. da
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700 1 $aPETERS, L. P.
700 1 $aASSIS, G. M. L. de
700 1 $aSILVA, C. C. da
700 1 $aSOUZA, A. P. de
700 1 $aCAMPOS, T. de
773 $tPlant Molecular Biology Reporter$gv. 42, p. 183-192, Mar. 2024.
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