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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
04/10/2011 |
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Data da última atualização: |
05/02/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PROSDOCIMI, P; BITTENCOURT, D.; SILVA, F. R. da; KIRST, M.; MOTA, P. C.; RECH, E. L. |
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Afiliação: |
FRANCISCO PROSDOCIMI, UFRJ, UCB; DANIELA MATIAS DE C BITTENCOURT, CPAA; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; MATIAS KIRST, University of Florida; PAULO C. MOTA, UnB; ELIBIO LEOPOLDO RECH FILHO, CENARGEN. |
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Título: |
Spinning gland transcriptomics from two main Clades of Spiders (Order: Araneae) - insights on their molecular, anatomical and behavioral evolution. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, San Francisco, v. 6, n. 6, p. 1-15, June 2011. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0021634 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Characterized by distinctive evolutionary adaptations, spiders provide a comprehensive system for evolutionary and developmental studies of anatomical organs, including silk and venom production. Here we performed cDNA sequencing using massively parallel sequencers (454 GS-FLX Titanium) to generate ~80,000 reads from the spinning gland of Actinopus spp. (infraorder: Mygalomorphae) and Gasteracantha cancriformis (infraorder: Araneomorphae, Orbiculariae clade). Actinopus spp. retains primitive characteristics on web usage and presents a single undifferentiated spinning gland while the orbiculariae spiders have seven differentiated spinning glands and complex patterns of web usage. MIRA, Celera Assembler and CAP3 software were used to cluster NGS reads for each spider. CAP3 unigenes passed through a pipeline for automatic annotation, classification by biological function, and comparative transcriptomics. Genes related to spider silks were manually curated and analyzed. Although a single spidroin gene family was found in Actinopus spp., a vast repertoire of specialized spider silk proteins was encountered in orbiculariae. Astacin-like metalloproteases (meprin subfamily) were shown to be some of the most sampled unigenes and duplicated gene families in G. cancriformis since its evolutionary split from mygalomorphs. Our results confirm that the evolution of the molecular repertoire of silk proteins was accompanied by the (i) anatomical differentiation of spinning glands and (ii) behavioral complexification in the web usage. Finally, a phylogenetic tree was constructed to cluster most of the known spidroins in gene clades. This is the first large-scale, multi-organism transcriptome for spider spinning glands and a first step into a broad understanding of spider web systems biology and evolution. MenosCharacterized by distinctive evolutionary adaptations, spiders provide a comprehensive system for evolutionary and developmental studies of anatomical organs, including silk and venom production. Here we performed cDNA sequencing using massively parallel sequencers (454 GS-FLX Titanium) to generate ~80,000 reads from the spinning gland of Actinopus spp. (infraorder: Mygalomorphae) and Gasteracantha cancriformis (infraorder: Araneomorphae, Orbiculariae clade). Actinopus spp. retains primitive characteristics on web usage and presents a single undifferentiated spinning gland while the orbiculariae spiders have seven differentiated spinning glands and complex patterns of web usage. MIRA, Celera Assembler and CAP3 software were used to cluster NGS reads for each spider. CAP3 unigenes passed through a pipeline for automatic annotation, classification by biological function, and comparative transcriptomics. Genes related to spider silks were manually curated and analyzed. Although a single spidroin gene family was found in Actinopus spp., a vast repertoire of specialized spider silk proteins was encountered in orbiculariae. Astacin-like metalloproteases (meprin subfamily) were shown to be some of the most sampled unigenes and duplicated gene families in G. cancriformis since its evolutionary split from mygalomorphs. Our results confirm that the evolution of the molecular repertoire of silk proteins was accompanied by the (i) anatomical differentiation of spinning glands and (ii) b... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Aranhas; Molecular anatomical; Sequencia de DNA; Sequenciamento. |
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Thesaurus Nal: |
Araneae; Sequence analysis; Transcriptomics. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56400/1/journal.pone.0021634.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/42811/1/spinningjournal.pone.0021634.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
14/02/2019 |
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Data da última atualização: |
15/03/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEDROZA NETO, J. L.; ALVES, R. M.; SANTOS, T. G. dos; FERNANDES, J. R. Q. |
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Afiliação: |
Jack Loureiro Pedroza Neto, GRADUANDO UFRA; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; Thalita Gomes dos Santos, GRADUANDA UFRA; JOSE RAIMUNDO QUADROS FERNANDES, CPATU. |
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Título: |
Caracterização floral de acessos procedentes do bag de cupuaçuzeiro (coleção clones elites ii), no município de Tomé-Açu, Pará. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. |
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Páginas: |
p. 213-218. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O cupuaçuzeiro é uma frutífera em processo de domesticação, necessitando conhecer e ampliar a variabilidade existente dentro das coleções, para permitir a identificação de acessos que sejam do interesse do programa de melhoramento genético da espécie. O objetivo desde trabalho foi o de realizar a caracterização floral dos acessos existentes na coleção Clones Elites II, que compõe o BAG de cupuaçuzeiro da Embrapa Amazônia Oriental. O delineamento experimental utilizado foi em blocos inteiramente casualizados, com dezessete tratamentos/clones e dez repetições. Foram coletadas 15 flores e 15 botões por acesso, utilizando-se 16 descritores para a caracterização. Os dados obtidos, de maneira quantitativa, foram transformados para dados qualitativos a partir da média e desvio padrão, utilizando limite inferior e superior para categorizar (pequeno, grande, médio, longo, curto, grosso e fino) cada descritor. Foi possível detectar considerável variabilidade entre os acessos, para a maioria dos descritores. |
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Thesagro: |
Clone; Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/192849/1/AnaisPIBIC2018-214-219.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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