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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
30/12/2019 |
Data da última atualização: |
22/08/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
AVELLAR-COSTA, P.; SANTOS, D. C. DOS; LANGE, C. C.; LAPORT, M. S.; BRITO, M. A. V. P.; ROSSI, C. C.; GIAMBIAGI-DEMARVAL, M. |
Afiliação: |
PEDRO AVELLAR-COSTA; DANIELLE CABRAL DOS SANTOS; CARLA CHRISTINE LANGE, CNPGL; MARINELLA SILVA LAPORT; MARIA APARECIDA VASCONCELOS PAIVA BRITO; CIRO CÉSAR ROSSI; MARCIA GIAMBIAGI-DEMARVAL. |
Título: |
Accurate identification of atypical Staphylococcus chromogenes plasma-clotting strains causing bovine mastitis. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, v. 49, n. 6, e20190168, 2019. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/0103-8478cr20190168 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
ABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento do gene do rRNA 16S e do gene do fator de elongação Tu, tuf, foram avaliados. Os resultados dos quatro métodos foram coincidentes para apenas metade das cepas, devido à baixa precisão da PCR-RFLP com groEL (51,2% de acurácia). Apesar de todos os resultados do sequenciamento serem idênticos, a alta precisão dos resultados do MALDI-TOF (97,7% de acurácia, com apenas uma cepa identificada incorretamente) encoraja o uso dessa técnica, pois, não requer preparação laboriosa de amostras, sendo rápida e simples de executar. MenosABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
GroEL; MALDI-TOF; Tuf. |
Thesaurus Nal: |
Mastitis; Staphylococcus chromogenes. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207948/1/CiRural-Lange-Accurate.pdf
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Marc: |
LEADER 02850naa a2200265 a 4500 001 2117891 005 2022-08-22 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/0103-8478cr20190168$2DOI 100 1 $aAVELLAR-COSTA, P. 245 $aAccurate identification of atypical Staphylococcus chromogenes plasma-clotting strains causing bovine mastitis.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento do gene do rRNA 16S e do gene do fator de elongação Tu, tuf, foram avaliados. Os resultados dos quatro métodos foram coincidentes para apenas metade das cepas, devido à baixa precisão da PCR-RFLP com groEL (51,2% de acurácia). Apesar de todos os resultados do sequenciamento serem idênticos, a alta precisão dos resultados do MALDI-TOF (97,7% de acurácia, com apenas uma cepa identificada incorretamente) encoraja o uso dessa técnica, pois, não requer preparação laboriosa de amostras, sendo rápida e simples de executar. 650 $aMastitis 650 $aStaphylococcus chromogenes 653 $aGroEL 653 $aMALDI-TOF 653 $aTuf 700 1 $aSANTOS, D. C. DOS 700 1 $aLANGE, C. C. 700 1 $aLAPORT, M. S. 700 1 $aBRITO, M. A. V. P. 700 1 $aROSSI, C. C. 700 1 $aGIAMBIAGI-DEMARVAL, M. 773 $tCiência Rural$gv. 49, n. 6, e20190168, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 73 | |
2. | | SANTOS, M. F. A.; CARNEIRO, R. M. D. G. Uso de diferentes marcadores SCAR para identificação de populações de Meloidogyne incognita. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 2, p. 111, 2007. Edição dos resumos do XXVII Congresso Brasileiro de Nematologia, Goiânia, GO, maio 2007. Disponível também em: In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos...Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. | | SANTOS, M. F. A.; RANDIG, O.; CARNEIRO, R. M. D. G. Uso de marcadores SCAR para identificação de Meloidogyne incognita, M. javanica e M. arenaria. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 29, n. 1, p. 113, jun. 2005. Resumos do Congresso Brasileiro de Nematologia, 25., 2005, Piracicaba, SP.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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6. | | SANTOS, M. F. A.; RANDIG, O.; CARNEIRO, R. M. D. G. Uso de marcadores scar para identificação de Meloidogyne incognita, M. javanica e M. arenaria. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 216.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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8. | | SANTOS, M. F. A.; TIGANO, M.; SILVEIRA, N. O. R.; CARNEIRO, R. M. D. G. Uso do marcador "SCAR" para identificação de diferentes populações de Meloidogyne arenaria. Nematologia Brasileira, v. 30, n. 1, p. 129, 2006. Resumos apresentados no CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 26., 2006, Campos de Goytacazes, Rio de Janeiro.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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10. | | SANTOS, M. F. A.; MATTOS, V. S.; SOUZA, D. A.; TORRES, C. A. R.; CARNEIRO, R. M. D. G. Caracterização filogenética de diferentes populações de Meloidogyne izalcoensis, nova espécie parasita do cafeeiro no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 36, 2019, Caldas Novas. Nematoides: da Ciência ao Campo. [Anais, palestras e resumos]. Campinas: Infobibos, 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. | | MONTEIRO, J. M. S.; CARES, J. E.; MATTOS, V. S.; SANTOS, M. F. A.; CARNEIRO, R. M. D. G. Diversidade de populações brasileiras de Meloidogyne spp.: marcadores enzimáticos e moleculares, sinonimização e caracterização de espécies válidas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 36, 2019, Caldas Novas. Nematoides: da Ciência ao Campo. [Anais, palestras e resumos]. Campinas: Infobibos, 2019.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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13. | | RANDIG, O.; DEAU, F.; SANTOS, M. F. A. dos; TIGANO, M. S.; CARNEIRO, R. M. D. G.; CASTAGNONE-SERENO, P. A novel species-specific satellite DNA family in the invasive root-knot nematode Meloidogyne mayaguensis and its potential use for diagnostics. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF TROPICAL NEMATOLOGY, 2., 2009, Maceió. Abstracts... Maceió: ONTA: SBN, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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14. | | CARNEIRO, R. M. D. G.; SIQUEIRA, K. M. S.; SANTOS, M. F. A.; ALMEIDA, M. R. A.; TIGANO, M. S. Ocorrência de Meloidogyne mayaguensis em goiabeira e mamoeiro no estado de Goiás. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 41., 2008, Belo Horizonte. [Resumos...]. Tropical Plant Pathology, v. 33, 2008. Suplemento. Resumo NEM-42. p. S258.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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16. | | SANTOS, M. F. A.; TIGANO, M. S.; ALMEIDA, M. R. A.; RANDIG, O.; CARNEIRO, R. M. D. G. Variabilidade genética de populações de Meloidogyne arenaria através da análise de marcadores "RAPD". Nematologia Brasileira, v. 30, n. 1, p. 129, 2006. Resumos apresentados no CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 26., 2006, Campos de Goytacazes, Rio de Janeiro.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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17. | | SANTOS, M. F. A.; TIGANO, M. S.; ALMEIDA, M. R. A.; RANDIG, O.; CARNEIRO, R. M. D. G. Variabilidade genética de populações de Meloidogyne arenaria através da análise de marcadores RAPD. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 245.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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18. | | MATTOS, V. S.; SANTOS, M. F. A.; ALMEIDA, M. R. A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; TIGANO, M. S. Variabilidade genética de populações de meloidogyne ethiopica através de marcadores moleculares. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 117. p.162.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | | SILVEIRA, N. O. R.; SILVA, J. G. P.; SANTOS, M. F. A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; TIGANO, M. S. Polimorfismo de Meloidogyne incognita E M. hispanica através da análise de marcadores ISSR. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 2, p. 159, 2007. Edição dos resumos do XXVII Congresso Brasileiro de Nematologia, Goiânia, GO, maio 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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20. | | CARNEIRO, R. M. D. G.; MENDES, M. L.; ALMEIDA, M. R. A.; SANTOS, M. F. A.; GOMES, A. C. M. M.; KARSSEN, G. Additional information on Meloidogyne inornata lordello, 1956 (Tylenchida: Meloidoginidae) and its characterization as a valid species. In: REUNIÓN ANUAL DE LA ORGANIZACIÓN DE NEMATÓLOGOS DE LOS TRÓPICOS AMERICANOS, 39., 2007, Córdoba, Argentina. Programa y resúmenes...Córdoba: ONTA, 2007. p. 50. S 15.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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