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21.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; NASCIMENTO, J. A. S. do. A insercao regional de empreendimentos hidreletricos: uma discussao acerca da tecnologia, o espaco e o meio ambiente. Cadernos de Geociencias, Rio de Janeiro, n.14, p.29-37, abr./jun. 1995.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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22.Imagem marcado/desmarcadoASAIM.; SANTOS, M. A. dos; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Uso de marcadores moleculares em soja visando identificar caracteres da fixação biológica do nitrogênio. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 123-127. (Embrapa Soja. Documentos, 268).

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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23.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, S. do C.; RIBEIRO, A. G.; SANTOS, M. A. dos; ROSA, D. B. Aspectos ambientais da ocupacao dos cerrados na regiao de Irai de Minas, area do PRODECER - I. In: SIMPOSIO SOBRE O CERRADO, 8.; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON TROPICAL SAVANNAS, 1., 1996, Brasilia, DF. Biodiversidade e producao sustentavel de alimentos e fibras nos Cerrados: anais... Planaltina: EMBRAPA-CPAC, 1996. p.230-233.

Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.

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24.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, A. de S.; OLIVEIRA, R. S. de; SANTOS, M. A. dos; BORGES, E. N. Atividade respiratória da microbiota e conteúdo de glicose em resposta à adição de fósforo em solo de Cerrado. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 32, n. 5, p. 1891-1897, set./out., 2008. Separata de Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 32, n. 5, set./out., 2008.

Biblioteca(s): Embrapa Solos / UEP-Recife.

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25.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, C. M. G. de; SANTOS, M. A. dos; CASTRO, L. H. S. e (org.). Diagnose de fitonematoides. Campinas: Millennium, 2016. 367 p.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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26.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; AIRES, A. A.; HAMAWAKI, O. T.; JULIATTI, F. C. Hospedabilidade de cultivares de soja ao nematoide Meloidogyne javanica. In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 20., 1998, Londrina, PR. Ata e resumos. Londrina: EMBRAPA-CNPSo, 1998. p.237-238.

Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.

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27.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; NICOLÁS, M. F.; VEDOVATI, T. C. S.; HUNGRIA, M. Identificação de QTL associados a fixação biológica do nitrogênio em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 113-117. (Embrapa Soja. Documentos, 268).

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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28.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; MOUSINHO, M. de C.; GALVAO, J. F. Identificacao do bromato de potassio em pao na cidade de Manaus. Revista da Universidade do Amazonas. Serie: Ciências da Saúde, Manaus, v. 1, n. 2, p. 29-38, jul./dez. 1992.

Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.

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29.Imagem marcado/desmarcadoGONZAGA, V.; SANTOS, J. M. dos; MENDONÇA, R. S. de; SANTOS, M. A. dos. Gênero Pratylenchus. In: OLIVEIRA, C. M. G. de; SANTOS, M. A. dos; CASTRO, L. H. S. e (Org.). Diagnose de fitonematoides. Campinas: Millennium, 2016. p. 71-98.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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30.Imagem marcado/desmarcadoLANDAU, E. C.; OLIVEIRA, R. P. C. de; SANTOS, M. A. dos; GUIMARAES, D. P. Expansão urbana da cidade de Sete Lagoas/MG entre 1949 e 2010. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 15., 2011, Curitiba. Anais... São José dos Campos: INPE, 2011. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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31.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. J. dos; SOUZA, J. L. de; LYRA, G. B.; SANTOS, M. A. dos. Espacialização da temperatura do ar anual no estado de Alagoas com diferentes modelos digitais de elevação e resoluções espaciais. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 21, n. 2, p. 275-287, abr./jun. 2011.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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32.Imagem marcado/desmarcadoGOMES, A. A.; SANTOS, M. A. dos; FILGUEIRA, F. A. R. Estudo da distribuicao horizontal de fitonematoides em uma propriedade agricola no Municipio de Uberlandia-MG. Horticultura Brasileira, Brasilia, v.14, n.1, p.87, maio 1996. Resumo.

Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.

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33.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; SILVA, J. A. A.; LOPES, S. C.; KARAM, D. Monitoramento espacial de plantas daninhas sob sistema de integração lavoura-pecuária. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE ECOLOGIA, 3.; CONGRESSO DE ECOLOGIA DO BRASIL, 9., 2009, São Lourenço. Ecologia e o futuro da biosfera. São Paulo: SEB, 2009. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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34.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, J. A. A.; SANTOS, M. A. dos; LOPES, S. de C.; KARAM, D. Monitoramento espaço-temporal de espécies de plantas daninhas sob sistema de plantio direto. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE ECOLOGIA, 3.; CONGRESSO DE ECOLOGIA DO BRASIL, 9., 2009, São Lourenço. Ecologia e o futuro da biosfera. São Paulo: SEB, 2009. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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35.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; OLIVEIRA, O. F.; LIMA, V. P. M. S. Observação sobre o comportamento de três cultivares de cenoura, Daucus carota L., nos municípios de Mossoró e Martins, Rio Grande do Norte. Caatinga, Mossoró, v. 1, n. 1, p. 65-80, 1976.

Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.

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36.Imagem marcado/desmarcadoNICOLÁS, M. F.; SANTOS, M. A. dos; CRANCIANINOV, W. S.; PIPOLO, A. E.; HUNGRIA, M. Correlação entre o teor de proteína na semente e QTL ("quantitative trait loci") associados com a fixação biológica do nitrogênio em linhagens de soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 26.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 10.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 8.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 5., 2004, Lages. Fertbio 2004. Lages: SBCS, 2004. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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37.Imagem marcado/desmarcadoAPPELT, J. R.; SANTOS, M. A. dos; CARMO, A. L. B. do. Aplicacao do fungo Monacrosporium ellipsosporum para o controle de Meloidogyne javanica em alface. Nematologia Brasileira, Piracicaba, v.21, n.1, p.9-10, 1997. Resumo.

Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.

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38.Imagem marcado/desmarcadoGOES, M.; SANTOS, M. A. dos; MENDES, R. A.; CARDOSO, L. D. Conservacao de quatro plantas medicinais in vitro. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTANICA, 47., 1996 Nova Friburgo, RJ, Resumos... Nova Friburgo: Sociedade Brasileira de Botanica, 1996. p. 435. Resumo

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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39.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A. dos; NICOLÁS, M. F.; BORGES, E.; HUNGRIA, M. Confirmation of quantitative trait loci controlling nodulation and shoot mass in progenies from two brazilian soybean cultivars. In: LATIN-AMERICAN CONFERENCE ON RHIZOBIOLOGY, 22.; BRAZILIAN CONFERENCE ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION, 1., 2004, Miguel Pereira. Programme and Abstracts. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2004. p. 120. Editado por Veronica Massena Reis, Marta Bahia.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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40.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, C. B. E.; SANTOS FILHO, S. V. DOS.; SANTOS, M. A. DOS.; OLIVEIRA, M. DE. Desenvolvimento da mamoneira, cultivada em vasos, sob diferentes níveis de salinidade da água em latossolo vermelho-amarelo eutrófico. Revista Caatinga, v. 21, n. 5, p. 50-56, supl., dez., 2008.

Biblioteca(s): Embrapa Algodão.

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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  15/04/2010
Data da última atualização:  29/09/2016
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  B - 1
Autoria:  GOMIDE, J.; MELO-MINARDI, R.; SANTOS, M. A. dos; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; LOPES, J. C.; SANTORO, M.
Afiliação:  JANAÍNA GOMIDE, UFMG; RAQUEL MELO-MINARDI, UFMG; MARCOS AUGUSTO DOS SANTOS, UFMG; GORAN NESHICH, CNPTIA; WAGNER MEIRA JUNIOR, UFMG; JÚLIO CÉSAR LOPES, UFMG; MARCELO SANTORO, UFMG.
Título:  Using linear algebra for protein structural comparison and classification.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Biology, v. 32, n. 3, p. 645-651, 2009.
DOI:  http://dx.doi.org/10.1590/S1415-47572009000300032
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  In this article, we describe a novel methodology to extract semantic characteristics from protein structures using linear algebra in order to compose structural signature vectors which may be used efficiently to compare and classify protein structures into fold families. These signatures are built from the pattern of hydrophobic intrachain interactions using Singular Value Decomposition (SVD) and Latent Semantic Indexing (LSI) techniques. Considering proteins as documents and contacts as terms, we have built a retrieval system which is able to find conserved contacts in samples of myoglobin fold family and to retrieve these proteins among proteins of varied folds with precision of up to 80%. The classifier is a web tool available at our laboratory website. Users can search for similar chains from a specific PDB, view and compare their contact maps and browse their structures using a JMol plug-in.
Palavras-Chave:  Contact maps; Latent semantic indexing; Linear algebra; Protein classification; Singular value decomposition.
Thesagro:  Biologia molecular.
Thesaurus NAL:  Molecular biology.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/147910/1/AP-UsingLinearAlgebra-Gomide-2009.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA14810 - 2UPCAP - DD
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