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| Registros recuperados : 23 | |
| 3. |  | SANTOS, D. J. de A.; TONHATI, H.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; PENNA, V. M.; BORQUIS, R. R. A. Predição de valores genéticos para produção de leite utilizando modelos de regressão aleatória. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 8., 2010, Maringá. Melhoramento animal no Brasil: uma visão crítica - anais. Maringá: SBMA, 2010. 1 CD-ROM. 3 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | SANTOS, D. J. DE A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; TONHATI, H.; CARVALHO, M. R. S.; SILVA, M. V. G. B. Análise de associação global para identificar locos relacionados às produções de leite, de gordura e de proteína na raça Guzerá. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | SANTOS, D. J. DE A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; PANETTO, J. C. do C.; RUSBEL, R. A. B.; CAMARGO, G. M.; TONHATI, H. Acuracia das estimativas dos valores genéticos obtidos com modelos de regressão aleatória. In: Reunião ALPA, 22., 2011, Montevideo. Memorias...| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | ONO, R. K.; SANTOS, D. J. DE A.; LUGO, N. A. H.; RIBEIRO, T. B.; CAETANO, S. L.; BRUNELI, F. A. T. Análise de sobrevivência da duração da lactação de vacas Guzerá (Bos taurus indicus). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | SCALEZ, D. C. B.; RIBEIRO, T. B.; SANTOS, D. J. DE A.; TONHATI, H.; VERCESI FILHO, A. E.; VERNEQUE, R. da S. Heterogeneidade de variâncias para a produção de leite ao dia do controle em raças Gir. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | SANTOS, K. C. L. dos; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; FONSECA, I.; SANTOS, D. J. de A. dos. Sistema de armazenamento para a organização e o controle do banco de DNA de bovinos de leite. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 12.; WORKSHOP DE POLÍTICAS PÚBLICAS, 12.; SIMPÓSIO DE SUSTENTABILIDADE DA ATIVIDADE LEITEIRA, 13., 2013, Porto Velho. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 3 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | UTSYNOMIYA, A. T. H.; SANTOS, D. J. DE A. DOS; ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; VERNEQUE, R. da S.; SILVA, M. V. G. B. Tamanho efetivo de população em diferentes raças zebuínas e uma população F2. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. | | ALMEIDA, F. N.; SANTOS, D. J. DE A.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; SILVA, M. V. G. B. Caracterização de blocos haplotípicos em bovinos de quatro raças zebuinas e uma poulação F2. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 12. | | SANTOS, D. J. DE A.; UTSUNOMIYA, A. H.; TONHATI, H.; ARBEX, W. A.; SANTOS, K. C. L. dos; SILVA, M. V. G. B. Comparação de funções de ajuste do decaimento do desequilíbrio de ligação em diferentes raças zebuinas e em uma população F2. In: REUNIÓN DE LA ALPA, 23.; CONGRESO INTERNACIONAL DE PRODUCCIÓN ANIMAL TROPICAL, 4., 2013, La Habana. Por una ganadería sustentable y en armonía con el medio ambiente: memorias. La Habana: Asociación Latinoamericana de Producción Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 15. | | SANTOS, D. J. DE A. DOS; UTSUNOMIYA, A. H.; TONHATI, H.; PEIXOTO, M. G. C. D.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Desequilíbrio de ligação em diferentes raças zebuinas e em uma população F2 Gir x Holandês. In: REUNIÓN DE LA ALPA, 23.; CONGRESO INTERNACIONAL DE PRODUCCIÓN ANIMAL TROPICAL, 4., 2013, La Habana. Por una ganadería sustentable y en armonía con el medio ambiente: memorias. La Habana: Asociación Latinoamericana de Producción Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | SANTOS, D. J. DE A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S.; SILVA, M. V. G. B.; BORQUIS, R. R. A.; TONHATI, H. Distribuição dos SNPs de painel de alta densidade em bovinos da raça Guzerá por gene descrito. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 19. | | SANTOS, D. J. de A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TONHATI, H.; PENNA, V. M.; VERNEQUE, R. da S.; BORQUIS, R. R. A. Modelos de regressão aleatória para ajustamento da produção de leite no dia do controle de vacas Guzerá, considerando estrutura heterogênea de variância residual. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2010. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; SANTOS, D. J. de A.; PANETTO, J. C. do C.; VERNEQUE, R. da S.; BORQUIS, R. R. A.; TONHATI, H. Parâmetros genéticos para a produção de leite no dia do controle de vacas da raça Guzerá utilizando funções B-spline. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011. 3 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| Registros recuperados : 23 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/05/2017 |
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Data da última atualização: |
21/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
BUZANSKAS, M. E.; VENTURA, R. V.; CHUD, T. C. S.; BERNARDES, P. A.; SANTOS, D. J. de A.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUDADU, M. de A.; ZANELLA, R.; SILVA, M. V. G. B.; LI, C.; SCHENKE, F. S.; MUNARI, D. P. |
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Afiliação: |
Marcos Eli Buzanskas, Unesp; Ricardo Vieira Ventura, USP; Tatiane Cristina Seleguim Chud, Unesp; Priscila Arrigucci Bernardes, Unesp; Daniel Jordan de Abreu Santos, Unesp; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; Ricardo Zanella, UPF; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; Changxi Li, University of Alberta; Flavio Schramm Schenke, University of Guelph; Danísio Prado Munari, Unesp. |
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Título: |
Study on the introgression of beef breeds in canchim cattle using single nucleotide polymorphism markers. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos one, v. 12, p. 1-16, 2017. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0171660 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to evaluate the level of introgression of breeds in the Canchim (CA: 62.5% Charolais?37.5% Zebu) and MA genetic group (MA: 65.6% Charolais?34.4% Zebu) cattle using genomic information on Charolais (CH), Nelore (NE), and Indubrasil (IB) breeds. The number of animals used was 395 (CA and MA), 763 (NE), 338 (CH), and 37 (IB). The Bovine50SNP BeadChip from Illumina panel was used to estimate the levels of introgression of breeds considering the Maximum likelihood, Bayesian, and Single Regression method. After genotype quality control, 32,308 SNPs were considered in the analysis. Furthermore, three thresholds to prune out SNPs in linkage disequilibrium higher than 0.10, 0.05, and 0.01 were considered, resulting in 15,286, 7,652, and 1,582 SNPs, respectively. For k = 2, the proportion of taurine and indicine varied from the expected proportion based on pedigree for all methods studied. For k = 3, the Regression method was able to differentiate the animals in three main clusters assigned to each purebred breed, showing more reasonable according to its biological viewpoint. Analyzing the data considering k = 2 seems to be more appropriate for Canchim-MA animals due to its biological interpretation. The usage of 32,308 SNPs in the analyses resulted in similar findings between the estimated and expected breed proportions. Using the Regression approach, a contribution of Indubrasil was observed in Canchim-MA when k = 3 was considered. Genetic parameter estimation could account for this breed composition information as a source of variation in order to improve the accuracy of genetic models. Our findings may help assemble appropriate reference populations for genomic prediction for Canchim-MA in order to improve prediction accuracy. Using the information on the level of introgression in each individual could also be useful in breeding or crossing design to improve individual heterosis in crossbred cattle. MenosThe aim of this study was to evaluate the level of introgression of breeds in the Canchim (CA: 62.5% Charolais?37.5% Zebu) and MA genetic group (MA: 65.6% Charolais?34.4% Zebu) cattle using genomic information on Charolais (CH), Nelore (NE), and Indubrasil (IB) breeds. The number of animals used was 395 (CA and MA), 763 (NE), 338 (CH), and 37 (IB). The Bovine50SNP BeadChip from Illumina panel was used to estimate the levels of introgression of breeds considering the Maximum likelihood, Bayesian, and Single Regression method. After genotype quality control, 32,308 SNPs were considered in the analysis. Furthermore, three thresholds to prune out SNPs in linkage disequilibrium higher than 0.10, 0.05, and 0.01 were considered, resulting in 15,286, 7,652, and 1,582 SNPs, respectively. For k = 2, the proportion of taurine and indicine varied from the expected proportion based on pedigree for all methods studied. For k = 3, the Regression method was able to differentiate the animals in three main clusters assigned to each purebred breed, showing more reasonable according to its biological viewpoint. Analyzing the data considering k = 2 seems to be more appropriate for Canchim-MA animals due to its biological interpretation. The usage of 32,308 SNPs in the analyses resulted in similar findings between the estimated and expected breed proportions. Using the Regression approach, a contribution of Indubrasil was observed in Canchim-MA when k = 3 was considered. Genetic parameter estimat... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Canchim cattle; Polimorfismo de nucleotídeo único; Raças de gado. |
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Thesagro: |
Gado canchim; Gado de corte; Gado Indubrasil; Gado nelore. |
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Thesaurus NAL: |
beef cattle; Cattle breeds; Charolais; Composite breeds; polymorphism; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160251/1/journal.pone.0171660.pdf
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Marc: |
LEADER 03213naa a2200433 a 4500
001 2070093
005 2019-05-21
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0171660$2DOI
100 1 $aBUZANSKAS, M. E.
245 $aStudy on the introgression of beef breeds in canchim cattle using single nucleotide polymorphism markers.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aThe aim of this study was to evaluate the level of introgression of breeds in the Canchim (CA: 62.5% Charolais?37.5% Zebu) and MA genetic group (MA: 65.6% Charolais?34.4% Zebu) cattle using genomic information on Charolais (CH), Nelore (NE), and Indubrasil (IB) breeds. The number of animals used was 395 (CA and MA), 763 (NE), 338 (CH), and 37 (IB). The Bovine50SNP BeadChip from Illumina panel was used to estimate the levels of introgression of breeds considering the Maximum likelihood, Bayesian, and Single Regression method. After genotype quality control, 32,308 SNPs were considered in the analysis. Furthermore, three thresholds to prune out SNPs in linkage disequilibrium higher than 0.10, 0.05, and 0.01 were considered, resulting in 15,286, 7,652, and 1,582 SNPs, respectively. For k = 2, the proportion of taurine and indicine varied from the expected proportion based on pedigree for all methods studied. For k = 3, the Regression method was able to differentiate the animals in three main clusters assigned to each purebred breed, showing more reasonable according to its biological viewpoint. Analyzing the data considering k = 2 seems to be more appropriate for Canchim-MA animals due to its biological interpretation. The usage of 32,308 SNPs in the analyses resulted in similar findings between the estimated and expected breed proportions. Using the Regression approach, a contribution of Indubrasil was observed in Canchim-MA when k = 3 was considered. Genetic parameter estimation could account for this breed composition information as a source of variation in order to improve the accuracy of genetic models. Our findings may help assemble appropriate reference populations for genomic prediction for Canchim-MA in order to improve prediction accuracy. Using the information on the level of introgression in each individual could also be useful in breeding or crossing design to improve individual heterosis in crossbred cattle.
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700 1 $aMUNARI, D. P.
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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