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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
Data corrente: |
03/11/2021 |
Data da última atualização: |
04/11/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
ADOLFI, M. C.; DU, K.; KNEITZ, S.; CABAU, C.; ZAHM, M.; KLOPP, C.; FERON, R.; PAIXÃO, R. V.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A.; OLIVEIRA, M. A. de; NÓBREGA, R. H.; LOPEZ-ROQUES, C.; IAMPIETRO, C.; LLUCH, J.; KLOAS, W.; WUERTZ, S.; SCHAEFER, F.; STÖCK, M.; GUIGUEN, Y.; SCHARTL, M. |
Afiliação: |
MATEUS C. ADOLFI, University of Wuerzburg; KANG DU, University of Wuerzburg; SUSANNE KNEITZ, University of Wuerzburg; CÉDRIC CABAU, Université de Toulouse; MARGOT ZAHM, Université de Toulouse; CHRISTOPHE KLOPP, INRA; ROMAIN FERON, INRAE; RÔMULO V. PAIXÃO, Bolsista CPAA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; FERNANDA LOUREIRO ALMEIDA OSULLIVAN, CPAA; MARCOS A. DE OLIVEIRA, UNESP; RAFAEL H. NÓBREGA, UNESP; CÉLINE LOPEZ-ROQUES, INRAE; CAROLE IAMPIETRO, INRAE; JÉRÔME LLUCH, INRAE; WERNER KLOAS, Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries; SVEN WUERTZ, Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries; FABIAN SCHAEFER, Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries; MATTHIAS STÖCK, Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries; YANN GUIGUEN, INRAE; MANFRED SCHARTL, Comprehensive Cancer Center Mainfranken. |
Título: |
A duplicated copy of id2b is an unusual sex-determining candidate gene on the Y chromosome of arapaima (Arapaima gigas). |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 11, art. 21544, 2021. |
ISSN: |
2045-2322 |
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-021-01066-z |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Arapaima gigas is one of the largest freshwater fish species of high ecological and economic importance. Overfishing and habitat destruction are severe threats to the remaining wild populations. By incorporating a chromosomal Hi-C contact map, we improved the arapaima genome assembly to chromosome-level, revealing an unexpected high degree of chromosome rearrangements during evolution of the bonytongues (Osteoglossiformes). Combining this new assembly with pool-sequencing of male and female genomes, we identified id2bbY, a duplicated copy of the inhibitor of DNA binding 2b (id2b) gene on the Y chromosome as candidate male sex-determining gene. A PCR-test for id2bbY was developed, demonstrating that this gene is a reliable male-specific marker for genotyping. Expression analyses showed that this gene is expressed in juvenile male gonads. Its paralog, id2ba, exhibits a male-biased expression in immature gonads. Transcriptome analyses and protein structure predictions confirm id2bbY as a prime candidate for the master sex-determiner. Acting through the TGF B signaling pathway, id2bbY from arapaima would provide the first evidence for a link of this family of transcriptional regulators to sex determination. Our study broadens our current understanding about the evolution of sex determination genetic networks and provide a tool for improving arapaima aquaculture for commercial and conservation purposes. |
Thesagro: |
Cromossoma; Peixe; Pirarucu. |
Thesaurus Nal: |
Arapaima gigas; Chromosomes; Cytogenetics; Fish; Sex chromosomes; Sex determination. |
Categoria do assunto: |
-- L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/227368/1/Arapaima-sexmaster-gene-2021.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
25/11/1996 |
Data da última atualização: |
10/05/2002 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
Nacional - A |
Autoria: |
PIMENTEL-GOMES, F.; ROSSETTI, A. G.; VIÉGAS, R. M. F. |
Título: |
Tamanho Ótimo de Parcelas para Experimentação com Seringueira. |
Ano de publicação: |
1989 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.24, n.8, p. 1021-1026, ago. 1989. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O estudo matematico-estatistico do problema do tamanho otimo de parcelas da seringueira atraves da metodologia do coeficiente de correlacao intraclasse (p) foi feito com a utilizacao de dados de quatro experimentos brasileiros; um (1) realizado no Para e tres no Amazonas. Na metodologia aplicada, define-se como tamanho otimo o numero (k) de plantas uteis por parcela, que minimiza a variancia da media de cada tratamento para um numero total fixo (N) de arvores por tratamento. No caso de bordadura completa, obteve-se a recomendacao de seis a doze arvores em duas linhas uteis ou nove a 18 em tres linhas. As parcelas com meia bordadura devem ter de quatro a dez plantas uteis em duas linhas ou seis a quinze em tres linhas. O numero usual de repeticoes em experimento de seringueira (geralmaente tres) e' suficiente em muitos casos. Os dados analisados sugerem que, nas condicoes dos estados (Amazonas e Para), as parcelas experimentais de seringueiras adultas com bordadura completa devem ter duas linhas com seis a doze arvores uteis ou tres linhas com nove a 18 arvores uteis ou, ainda, quatro linhas com 16 a 20 arvores uteis. No caso de meia bordadura, as parcelas devem ter duas linhas com quatro a dez arvores uteis ou tres linhas com seis a quinze arvores uteis ou, ainda, quatro linhas com 16 a 20 arvores uteis. Parcelas com uma unica linha util ou com mais de quatro linhas uteis nao sao recomendaveis quando se usa bordadura. O uso do tamnaho otimo da parcela pode reduzir consideravelmente a area experimental sem prejuizo. MenosO estudo matematico-estatistico do problema do tamanho otimo de parcelas da seringueira atraves da metodologia do coeficiente de correlacao intraclasse (p) foi feito com a utilizacao de dados de quatro experimentos brasileiros; um (1) realizado no Para e tres no Amazonas. Na metodologia aplicada, define-se como tamanho otimo o numero (k) de plantas uteis por parcela, que minimiza a variancia da media de cada tratamento para um numero total fixo (N) de arvores por tratamento. No caso de bordadura completa, obteve-se a recomendacao de seis a doze arvores em duas linhas uteis ou nove a 18 em tres linhas. As parcelas com meia bordadura devem ter de quatro a dez plantas uteis em duas linhas ou seis a quinze em tres linhas. O numero usual de repeticoes em experimento de seringueira (geralmaente tres) e' suficiente em muitos casos. Os dados analisados sugerem que, nas condicoes dos estados (Amazonas e Para), as parcelas experimentais de seringueiras adultas com bordadura completa devem ter duas linhas com seis a doze arvores uteis ou tres linhas com nove a 18 arvores uteis ou, ainda, quatro linhas com 16 a 20 arvores uteis. No caso de meia bordadura, as parcelas devem ter duas linhas com quatro a dez arvores uteis ou tres linhas com seis a quinze arvores uteis ou, ainda, quatro linhas com 16 a 20 arvores uteis. Parcelas com uma unica linha util ou com mais de quatro linhas uteis nao sao recomendaveis quando se usa bordadura. O uso do tamnaho otimo da parcela pode reduzir considerav... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Amazonas; bordaduras; Brasil; coeficiente de correlação intraclasse; Para; Plant population; Rubber tree; Species; variância da média de um tratamento. |
Thesagro: |
Análise Estatística; Densidade de Plantio; Espécie; Estatística; Hevea; População de Planta; Seringueira. |
Thesaurus NAL: |
planting date; statistical analysis. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/177989/1/18411-78806-1-SM.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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