| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
|
Data corrente: |
25/10/2023 |
|
Data da última atualização: |
13/05/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; PETERS, L. P.; ASSIS, G. M. L. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de. |
|
Afiliação: |
JÔNATAS CHAGAS DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; ANDRÉ LUCAS DOMINGOS DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; LUCIELIO MANOEL DA SILVA, CPATC; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; LEILA PRISCILA PETERS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; GISELLE MARIANO LESSA DE ASSIS, CPAF-AC; CARLA CRISTINA DA SILVA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; ANETE PEREIRA DE SOUZA, UNIVERSIDADE DE CAMPINAS; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC. |
|
Título: |
Novel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification. |
|
Ano de publicação: |
2024 |
|
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, v. 42, p. 183-192, Mar. 2024. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11105-023-01402-9 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Forage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first gene-derived SSR for A. pintoi. These new informative microsatellites may be linked to agronomically important genes to be used in genetic studies. MenosForage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Amendoim forrageiro; Anotação funcional; Cacahuetes forrajeros; Fitomejoramiento; Forage peanut; Identificación de especies; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; RNA-Seq; Transcriptoma; Transferencia de genes. |
|
Thesagro: |
Arachis Hypogaea; Genoma; Identificação de Estirpe; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal. |
|
Thesaurus Nal: |
Arachis pintoi; Gene transfer; Genetic markers; Genome; Microsatellite repeats; Plant breeding; Species identification; Transcriptome. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 03263naa a2200517 a 4500
001 2157490
005 2024-05-13
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11105-023-01402-9$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, J. C. de
245 $aNovel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification.$h[electronic resource]
260 $c2024
520 $aForage peanut (Arachis pintoi) is an important leguminous forage that has gained popularity due to increased livestock productivity. Furthermore, the species helps with soil fertility and the restoration of degraded areas. However, A. pintoi has a limited number of molecular markers. The objective of this study was to create and characterize gene-derived microsatellite markers as well as to test their transferability to the peanut (Arachis hypogaea) and other six wild Arachis species. A total of 4461 putative simple sequence repeats (SSR) were identified, and PCR primer pairs were designed for 999 SSR regions after filtering out primers with the same annealing site and searching for sequences related to open reading frames (ORFs). The dinucleotide motif was the most common (628; 62.86%). For validation, 186 primer pairs were chosen at random, of which 63 (33.87%) were polymorphic, with an average of 7.37 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC=0.70) and discriminatory power (D=0.80) were both high on average. The functional annotation discovered 120 sequences that were assigned to 87 gene ontology functional groups divided into three main categories: molecular function (27 sub-categories), cellular components (21 sub-categories), and biological process (39 sub-categories). Thirty-three SSRs were tested for transferability to peanut and six other wild Arachis species, resulting in variable cross-species amplification (63.64 to 100%). Here, we present the first gene-derived SSR for A. pintoi. These new informative microsatellites may be linked to agronomically important genes to be used in genetic studies.
650 $aArachis pintoi
650 $aGene transfer
650 $aGenetic markers
650 $aGenome
650 $aMicrosatellite repeats
650 $aPlant breeding
650 $aSpecies identification
650 $aTranscriptome
650 $aArachis Hypogaea
650 $aGenoma
650 $aIdentificação de Estirpe
650 $aMarcador Molecular
650 $aMelhoramento Genético Vegetal
653 $aAmendoim forrageiro
653 $aAnotação funcional
653 $aCacahuetes forrajeros
653 $aFitomejoramiento
653 $aForage peanut
653 $aIdentificación de especies
653 $aMarcadores genéticos
653 $aRepeticiones de microsatélite
653 $aRNA-Seq
653 $aTranscriptoma
653 $aTransferencia de genes
700 1 $aSILVA, A. L. D. da
700 1 $aSILVA, L. M. da
700 1 $aFORMIGHIERI, E. F.
700 1 $aPETERS, L. P.
700 1 $aASSIS, G. M. L. de
700 1 $aSILVA, C. C. da
700 1 $aSOUZA, A. P. de
700 1 $aCAMPOS, T. de
773 $tPlant Molecular Biology Reporter$gv. 42, p. 183-192, Mar. 2024.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|
Data corrente: |
10/01/2017 |
|
Data da última atualização: |
17/05/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SILVA, S. F.; ROGERIO, M. C. P.; CARNEIRO, M. S. de S.; POMPEU, R. C. F. F.; SOUZA, H. A. de; OLIVEIRA, D. de S.; MOURÃO, E. B. |
|
Afiliação: |
SHIRLENNE FERREIRA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ (UFC) - Fortaleza, CE, Brasil; MARCOS CLAUDIO PINHEIRO ROGERIO, CNPC; MARIA SOCORRO DE SOUZA CARNEIRO, Universidade Estadual Vale do Acaraú (UVA) - Sobral, CE, Brasil; ROBERTO CLAUDIO FERNANDES F POMPEU, CNPC; HENRIQUE ANTUNES DE SOUZA, CPAMN; DELANO DE SOUSA OLIVEIRA, Universidade Federal do Piauí (UFPI) - Teresina, PI, Brasil.; ELOMIR BRITO MOURÃO, Universidade Federal do Tocantins (UFT) - Palmas, TO, Brasil. |
|
Título: |
Composição químico-bromatológica de silagens de milho consorciado com gramíneas forrageiras em condições de sequeiro. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 226-297, 2016. Resumo 293-1. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil. |
|
Conteúdo: |
Resumo: Por ser um volumoso que concentra mais energia que os demais, o milho é a cultura mais utilizada pelos produtores para a confecção de silagem, além de apresentar alta digestibilidade e possuir a vantagem de ser armazenado por longos períodos sem alteração no seu valor nutritivo. O consórcio com gramíneas forrageiras pode beneficiar não só o aumento da produção de massa verde, mas também melhorar o valor nutritivo das silagens. Diante desse contexto, objetivou-se com a realização deste trabalho avaliar a composição química de silagens de milho em consórcio com gramíneas forrageiras em condições de sequeiro. |
|
Palavras-Chave: |
Alimento consentrado; Brasil; Estádio vegetativo; Feed grasses; Semiárido. |
|
Thesagro: |
Alimento para animal; Gramínea forrageira; Milho; Nutrição animal; Silagem; Volumosos. |
|
Thesaurus NAL: |
Animal feeding; Animal nutrition; Brazil; Silage. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153072/1/CNPC-2016-Composicao-quimico-bromatologica..pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01889nam a2200373 a 4500
001 2060336
005 2022-05-17
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, S. F.
245 $aComposição químico-bromatológica de silagens de milho consorciado com gramíneas forrageiras em condições de sequeiro.$h[electronic resource]
260 $aArquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 226-297, 2016. Resumo 293-1.$c2016
500 $aEdición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.
520 $aResumo: Por ser um volumoso que concentra mais energia que os demais, o milho é a cultura mais utilizada pelos produtores para a confecção de silagem, além de apresentar alta digestibilidade e possuir a vantagem de ser armazenado por longos períodos sem alteração no seu valor nutritivo. O consórcio com gramíneas forrageiras pode beneficiar não só o aumento da produção de massa verde, mas também melhorar o valor nutritivo das silagens. Diante desse contexto, objetivou-se com a realização deste trabalho avaliar a composição química de silagens de milho em consórcio com gramíneas forrageiras em condições de sequeiro.
650 $aAnimal feeding
650 $aAnimal nutrition
650 $aBrazil
650 $aSilage
650 $aAlimento para animal
650 $aGramínea forrageira
650 $aMilho
650 $aNutrição animal
650 $aSilagem
650 $aVolumosos
653 $aAlimento consentrado
653 $aBrasil
653 $aEstádio vegetativo
653 $aFeed grasses
653 $aSemiárido
700 1 $aROGERIO, M. C. P.
700 1 $aCARNEIRO, M. S. de S.
700 1 $aPOMPEU, R. C. F. F.
700 1 $aSOUZA, H. A. de
700 1 $aOLIVEIRA, D. de S.
700 1 $aMOURÃO, E. B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
