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| Registros recuperados : 91 | |
| 61. |  | SANTOS, R. D. dos; LARACH, J. O. I.; PALMIERI, F.; MOTHCI, E. P.; PIRES FILHO, A. M.; SANTOS, H. G. dos; CARVALHO, L. G. de O. Levantamento exploratorio dos solos que ocorrem ao longo da rodovia transamazonica (trecho Itaituba-Estreito), 1973. Rio de Janeiro: Divisao de Pesquisa Pedologica-DNPEA-Ministerio da Agricultura, 1973. 39p. (Divisao de Pesquisa Pedologica, Rio de Janeiro. Boletim Tecnico, 33).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Solos / UEP-Recife. |
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| 63. | | SANTOS, R. D. dos; LARACH, J. O. I.; PALMIERI, F.; MOTHCI, E. P.; PIRES FILHO, A. M.; SANTOS, H. G. dos; CARVALHO, L. G. de O. Levantamento exploratorio dos solos que ocorrem ao longo da rodovia Transamazonica (trecho Itaituba-Estreito). Rio de Janeiro: MA-DNPEA-DPP, 1973. 39p. (Brasil. Ministerio da Agricultura-DNPEA-DPP. Boletim Tecnico, 33). Acompanha mapa, escalas hor. 1:500.000 e vert. 1:10.000.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 64. | | SANTOS, R. D. dos; LARACH, J. O. I.; PALMIERI, F.; MOTHCI, E. P.; PIRES FILHO, A. M.; SANTOS, H. G. dos; CARVALHO, L. G. de O. Levantamento exploratorio dos solos que ocorrem ao longo da rodovia Transamazônica (trecho Itaituba-Estreito). Rio de Janeiro: Ministério da Agricultura, DNPEA, 1973. il. (Ministério da Agricultura. DNPEA-DPP. Boletim técnico, 33).| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 65. | | LUMBRERAS, J. F.; CUNHA, T. J. F.; MARTINS, J. S.; PEREIRA, N. R.; OLMOS ITURRI LARACH, J.; PALMIERI, F.; CALDERANO, S. B. Levantamento semidetalhado de solos do Municipio de Paty do Alferes e sub-bacias do afluentes do Corrego do Saco-Rio Uba, Estado do Rio de Janeiro. In: WORKSHOP NACIONAL DE AGRICULTURA SUSTENTAVEL EM REGIOES DE RELEVO ACIDENTADO, 3., 1997. Paty do Alferes, RJ. Anais... Rio de Janeiro: EMBRAPA-CNPS, 1998. CD-ROM Nao paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 66. | | BERTOLINO, A. V. F. A.; FERNANDES, N. F.; MIRANDA, J. P. L.; SOUZA, A. P.; LOPES, M. R. S.; PALMIERI, F. Effects of plough pan development on surface hydrology and on soil physical properties in Southeastern Brazilian plateau. Journal of Hydrology, v. 393, n. 1/2, p. 94-104, Oct. 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 67. | | MACEDO, J. R. de; PALMIERI, F.; PAULA, J. L. de; FONSECA, O. O. M. da; CAPECHE, C. L.; SILVA, E. F. da. Caracterizacao fisico-hidrica dos solos da microbacia Corrego da Cachoeira, Paty do Alferes, RJ. In: WORKSHOP NACIONAL DE AGRICULTURA SUSTENTAVEL EM REGIOES DE RELEVO ACIDENTADO, 3., 1997. Paty do Alferes, RJ. Anais... Rio de Janeiro: EMBRAPA-CNPS, 1998. CD-ROM Nao paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 68. | | TURETTA, A. P. D.; ANJOS, L. H. C. dos; PINHEIRO, E. F. M.; SOUZA, R. C. de; PALMIERI, F.; PEREIRA, M. G. Efeito de sistemas de manejo nas propriedades quimicas de um latossolo vermelho sob cultivo de oleraceas em Paty do Alferes, RJ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 28., 2001, Londrina. Ciencia do solo: fator de produtividade competitiva com sustentabilidade: [resumos]... Londrina: Sociedade Brasileira de Ciencia do Solo; Embrapa Soja; IAPAR; UEL; UEM, 2001. p.251| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 69. | | MACEDO, J. R. de; OTTONI FILHO, T. B.; BRITO, F. S.; OTTONI, M. V.; BHERING, S. B.; PEREIRA, N. R.; PALMIERI, F.; ANJOS, L. H. C. dos. Contribuição ao sistema brasileiro de classificação de solos com a inclusão da nomenclatura físico-hídrica nos 5º e 6º níveis categóricos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 30., 2005, Recife. Solos, sustentabilidade e qualidade ambiental. Recife: SBCS: UFRPE: Embrapa Solos, UEP Recife, 2005. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 73. | | LUMBRERAS, J. F.; NAIME, U. J.; MOTTA, P. E. F. da; CARVALHO FILHO, A. de; FERNANDES, N. F.; BARUQUI, A. M.; CALDERANO, S. B.; SHINZATO, E.; PALMIERI, F. Qualidade de solos da região Noroeste do estado do Rio de Janeiro: atributos químicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 74. | | LUMBRERAS, J. F.; NAIME, U. J.; MOTTA, P. E. F. da; CARVALHO FILHO, A. de; PALMIERI, F; BARUQUI, A. M. L; CALDERANO, S. B.; FIDALGO, E. C. C.; MOREITA, D. M.; ABREU, M. B. de; MOURA, I. B. de. Aspectos gerais dos solos da bacia hidrográfica do rio São Domingos - municípios de São José de Ubá e Itaperuna, RJ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Resumo| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 75. | | FONSECA, O. O. M. da; PALMIERI, F.; MACEDO J. R. de; CAPECHE, C. L.; LEMOS, A. L.; SILVA, E. F. da; CALDERANO FILHO, B.; LUMBREIRAS, J. F.; CALDERANO, S. B.; CUNHA, T. J. F.; OLMOS ITURRI LARACH, J. Levantamento semidetalhado dos solos da microbacia do Corrego da Cachoeira em Paty do Alferes, RJ. In: WORKSHOP NACIONAL DE AGRICULTURA SUSTENTAVEL EM REGIOES DE RELEVO ACIDENTADO, 3., 1997. Paty do Alferes, RJ. Anais... Rio de Janeiro: EMBRAPA-CNPS, 1998. CD-ROM Nao paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 76. | | LUMBRERAS, J. F.; CUNHA, T. J. F.; MARTINS, J. S.; PEREIRA, N. R.; LARACH, J. O. I.; PALMIERI, F.; CALDERANO, S. B.; CARVALHO JUNIOR, W. de; NAPOLEÃO, R. P. Levantamento semidetalhado de solos do Município de Paty do Alferes e sub-bacias do Córrego do Saco-Rio Ubá, estado do Rio de Janeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 27., 1999, Brasília, DF. Resumos [...]. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 1999. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 77. | | CALDERANO FILHO, B.; PALMIERI, F.; GUERRA, A. J. T.; CALDERANO, S. B.; FIDALGO, E. C. C.; PRADO, R. B.; SILVA, E. F. da; CAPECHE, C. L.; FONSECA, O. O. M. da. Levantamento de solos e avaliação da aptidão agrícola das terras da microbacia Janela das Andorinhas no Município de Nova Friburgo, RJ. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2003. 51 p. il. color. (Embrapa Solos. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 27).| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 78. | | LUMBRERAS, J. F.; CARVALHO FILHO, A. de; MOTTA, P. E. F. da; PALMIERI, F.; CALDERANO, S. B.; BARUQUI, A. M.; PEREIRA, N. R.; NAIME, U. J.; LEMOS, A. L. Macropedoambientes da região Noroeste Fluminense: uma contribuição ao planejamento ambiental. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2004. 21 p. (Embrapa Solos. Documentos, 64).| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 79. | | RODRIGUES, T. E.; PALMIERI, F.; CAMARGO, M. N.; JACOMINE, P. K. T.; LARACH, J. O. I.; SANTOS, R. D. dos; SILVA, J. M. L. D.; SANTOS, P. L. dos. Estudo expedito de solos do Território Federal de Rondônia para fins de classificação, correlação e legenda preliminar. Rio de Janeiro: EMBRAPA-SNLCS, 1980. 145 p. (EMBRAPA-SNLCS. Boletim técnico, 73). Contrato EMBRAPA/SNLCS - Governo do Território Federal de Rondônia.| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 80. | | RODRIGUES, T. E.; PALMIERI, F.; CAMARGO, M. N.; JACOMINE, P. K. T.; LARACH, J. O. I.; SANTOS, R. D. dos; SILVA, J. M. L. da; SANTOS, P. L. dos. Estudo expedito dos solos do Território Federal de Rondônia para fins de classificação, correlação e legenda preliminar. Rio de Janeiro: EMBRAPA-SNLCS, 1980. 145 p. il. (EMBRPAA-SNLCS. Boletim Tecnico, 073).| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Solos / UEP-Recife. |
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| Registros recuperados : 91 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amazônia Oriental. Para informações adicionais entre em contato com cpatu.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
28/01/2021 |
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Data da última atualização: |
10/06/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
ARAÚJO, F. C. B. das; CUNHA, E. F. M.; RODRIGUES, S. de M.; BONFIM, K.; TAVARES, E. J. M.; MOURA, M. F.; SILVA, G. F. da. |
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Afiliação: |
Francisca Chagas Bezerra das Araújo, UFRA; ELISA FERREIRA MOURA CUNHA, CPATU; SIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATU; KENNY BONFIM DE ARRUDA CARVALHO, Cenargen; ERALDO JOSE MADUREIRA TAVARES, CPATSA; Mônika Fecury Moura, CPATU; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA. |
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Título: |
Identification and validation of SNPs in the phytoene synthase 2 (psy2) gene associated with yellow color of the root in cassava (Manihot esculenta Crantz) accessions of the Brazilian Amazon. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetic Resources and Crop Evolution, v. 68, p. 1809-1824, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10722-020-01097-x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The biofortification of cassava (Manihot esculenta Crantz) roots is one of the actual goals of genetic breeding, with the development of roots richer in carotenoids. In order to evaluate the natural genetic variation of cassava, this study analyzed 78 accessions from the Brazilian Amazon to verify the presence of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers in the phytoene synthase 2 (psy2) gene associated with root color. From the sequencing of 294 bp containing part of the intron 2 and the exon 3 of the psy2 gene, three SNPs located in the coding region and the existence of eight haplotypes were identified. The c.1434G > C (SNP1) and c.1485C > A (SNP3) variations were found in yellow and cream root accessions and nucleotide polymorphism resulted in amino acid substitution. SNP2 (c.1462T > C) was identified in accessions with white roots and its allelic variation did not result in amino acid substitution. Four haplotypes that presented SNP3 were widely distributed in the states of Pará, Amapá, Rondônia and Amazonas. All accessions of yellow or cream root that presented the SNP3 were in heterozygosity, confirming the dominance of the SNP, except for one accession, that could be used in genetic breeding. The effect of mutations on the structure and function of PSY2 was in silico evaluated by molecular dynamics and it was indicated that the aminoacid substitutions affected the active site of the protein depending on the distance. The results were compatible with the phenotype detected experimentally. MenosThe biofortification of cassava (Manihot esculenta Crantz) roots is one of the actual goals of genetic breeding, with the development of roots richer in carotenoids. In order to evaluate the natural genetic variation of cassava, this study analyzed 78 accessions from the Brazilian Amazon to verify the presence of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers in the phytoene synthase 2 (psy2) gene associated with root color. From the sequencing of 294 bp containing part of the intron 2 and the exon 3 of the psy2 gene, three SNPs located in the coding region and the existence of eight haplotypes were identified. The c.1434G > C (SNP1) and c.1485C > A (SNP3) variations were found in yellow and cream root accessions and nucleotide polymorphism resulted in amino acid substitution. SNP2 (c.1462T > C) was identified in accessions with white roots and its allelic variation did not result in amino acid substitution. Four haplotypes that presented SNP3 were widely distributed in the states of Pará, Amapá, Rondônia and Amazonas. All accessions of yellow or cream root that presented the SNP3 were in heterozygosity, confirming the dominance of the SNP, except for one accession, that could be used in genetic breeding. The effect of mutations on the structure and function of PSY2 was in silico evaluated by molecular dynamics and it was indicated that the aminoacid substitutions affected the active site of the protein depending on the distance. T... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Biofortificação; Raíz rica em carotenoide. |
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Thesagro: |
Carotenóide; Mandioca; Manihot Esculenta; Polimorfismo; Proteína; Raiz Alimentícia; Variação Genética. |
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Thesaurus NAL: |
Carotenoids; Cassava; Haplotypes; Polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02740naa a2200361 a 4500
001 2129648
005 2021-06-10
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s10722-020-01097-x$2DOI
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260 $c2021
520 $aThe biofortification of cassava (Manihot esculenta Crantz) roots is one of the actual goals of genetic breeding, with the development of roots richer in carotenoids. In order to evaluate the natural genetic variation of cassava, this study analyzed 78 accessions from the Brazilian Amazon to verify the presence of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers in the phytoene synthase 2 (psy2) gene associated with root color. From the sequencing of 294 bp containing part of the intron 2 and the exon 3 of the psy2 gene, three SNPs located in the coding region and the existence of eight haplotypes were identified. The c.1434G > C (SNP1) and c.1485C > A (SNP3) variations were found in yellow and cream root accessions and nucleotide polymorphism resulted in amino acid substitution. SNP2 (c.1462T > C) was identified in accessions with white roots and its allelic variation did not result in amino acid substitution. Four haplotypes that presented SNP3 were widely distributed in the states of Pará, Amapá, Rondônia and Amazonas. All accessions of yellow or cream root that presented the SNP3 were in heterozygosity, confirming the dominance of the SNP, except for one accession, that could be used in genetic breeding. The effect of mutations on the structure and function of PSY2 was in silico evaluated by molecular dynamics and it was indicated that the aminoacid substitutions affected the active site of the protein depending on the distance. The results were compatible with the phenotype detected experimentally.
650 $aCarotenoids
650 $aCassava
650 $aHaplotypes
650 $aPolymorphism
650 $aCarotenóide
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650 $aProteína
650 $aRaiz Alimentícia
650 $aVariação Genética
653 $aBiofortificação
653 $aRaíz rica em carotenoide
700 1 $aCUNHA, E. F. M.
700 1 $aRODRIGUES, S. de M.
700 1 $aBONFIM, K.
700 1 $aTAVARES, E. J. M.
700 1 $aMOURA, M. F.
700 1 $aSILVA, G. F. da
773 $tGenetic Resources and Crop Evolution$gv. 68, p. 1809-1824, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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