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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; BRAGA, I. de O.; RODRIGUES NETO, J. C.; LEAO, A. P.; RIBEIRO, J. A. de A.; VALADARES, L. F.; ABDELNUR, P. V.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; VIVIANNY NAYSE BELO SILVA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; ÍTALO DE OLIVEIRA BRAGA, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, Universidade Federal de Lavras, MG, Brasil.; JORGE CANDIDO RODRIGUES NETO, Instituto de Química, Universidade Federal de Goiás, Goiânia, GO, Brasil.; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; LEONARDO FONSECA VALADARES, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Integration of metabolomics and transcriptomics data to further characterize Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth under high salinity stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Genome, e20182, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response. MenosSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptation; Salinization protocol. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230514/1/The-Plant-Genome-2022-Integration.pdf
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Marc: |
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520 $aSoil salinity is one abiotic stress that threatens agriculture in more than 100 countries. Gliricidia [Gliricidia sepium (Jacq.) Kunth] is a multipurpose tree known for its ability to adapt to a wide range of soils; however, its tolerance limits and responses to salt stress are not yet well understood. In this study, after characterizing the morphophysiological responses of young gliricidia plants to salinity stress, leaf metabolic and transcription profiles were generated and submitted to single and integrated analyses. RNA from leaf samples were subjected to RNA sequencing using an Illumina HiSeq platform and the paired-end strategy. Polar and lipidic fractions from leaf samples were extracted and analyzed on an ultra-high-performance liquid chromatography (UHPLC) coupled with electrospray ionization quadrupole time-offlight high-resolution mass spectrometry (MS) system. Acquired data were analyzed using the OmicsBox, XCMS Online, MetaboAnalyst, and Omics Fusion platforms. The substrate salinization protocol used allowed the identification of two distinct responses to salt stress: tolerance and adaptation. Single analysis on transcriptome and metabolome data sets led to a group of 5,672 transcripts and 107 metabolites differentially expressed in gliricidia leaves under salt stress. The phenylpropanoid biosynthesis was the most affected pathway, with 15 metabolites and three genes differentially expressed. Results showed that the differentially expressed metabolites and genes from this pathway affect mainly short-term salt stress (STS). The single analysis of the transcriptome identified 12 genes coding for proteins that might play a role in gliricidia response at both STS and long-termsalt stress (LTS). Further studies are needed to reveal the mechanisms behind the adaptation response.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 20 | |
| 9. |  | ARRUDA, M. B.; PROENÇA, C. E. B.; RODRIGUES, S. C.; CAMPOS, R. N.; MARTINS, R. C.; MARTINS, E. de S. Ecorregiões, unidades de conservação e representatividade ecológica do bioma Cerrado. In: SANO, S. M.; ALMEIDA, S. P. de; RIBEIRO, J. F. (Ed.). Cerrado: ecologia e flora. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica: Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. cap. 8, p. 229-272.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 10. | | RODRIGUES, S. C. A.; SANTOS, C. A. F.; SOUSA, M. E. M. de; MARQUES, M. M. de L.; PAIVA, L. E. Avaliação de diferentes doses de ácido giberélico na produção de frutos de goiaba. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 17. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | SOUSA, M. E. M. de; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, S. C. A.; MARQUES, M. M. de L.; SANTOS, L. S. dos. Correlações fenotípicas para caracteres de vagens, grãos e porte de planta em linhagens F6 de guandu. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 66. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | AZEREDO, A. B. de; SILVA, V. M. da; MATIAS, A. G. da S.; RODRIGUES, S. C.; PAIXÃO, P. S. da; VOLTOLINI, T. V. Características qualitativas de frutos da melancia-forrageira em diferentes idades de colheita. In: JORNADA DE INTEGRAÇÃO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 1., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 57-58. (Embrapa Semiárido. Documentos, 274).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | RODRIGUES, S. C.; LUCAS, C.; BORSUK, S.; FERNANDES, C. H.; ANDREOTTI, R.; LEITE, F. P. L.; OSHIRO, L. M.; MATOS, M. de F. C.; BERNE, M. E. A. Desenvolvimento de um ELISA para diagnóstico de Neospora caninum em bovinos utilizando NCSR2 recombinante. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA 21.; ENCONTRO DE PARASITOLOGIA DO MERCOSUL, 2., 2009, Foz do Iguaçu. Novos horizontes em parasitologia: anais. Foz do Iguaçu: SBP, 2009. p. 200. Revista Patologia Tropical, v. 38, jul.-set 2009. Suplemento 2.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | RODRIGUES, S. C.; LUCAS, C.; BORSUK, S.; FERNANDES, C. H.; LEITE, F. P. L.; PINTO, L. da S.; ANDREOTTI, R.; BERNE, M. E. A. Desenvolvimento de vacinas recombinantes para o controle de Neospora caninum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA 21.; ENCONTRO DE PARASITOLOGIA DO MERCOSUL, 2., 2009, Foz do Iguaçu. Novos horizontes em parasitologia: anais. Foz do Iguaçu: SBP, 2009. p. 122. Revista Patologia Tropical, v. 38, jul.-set 2009. Suplemento 2.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 15. | | FERREIRA, R. S.; VEIGA, H. P.; SANTOS, R. G. B. dos; SAIA, A.; RODRIGUES, S. C.; BEZERRA, A. F. M.; HERMES, L. C.; MOURA, A.; CUNHA, L. H. Empowering Brazilian Northeast rural communities to desalinated drinking water access: Programa Água Doce. In: THE INTERNATIONAL DESALINATION ASSOCIATION WORLD CONGRESS, 2017, São Paulo. Water reuse & desalination ensure your water future: [proceedings...]. São Paulo: International Desalination Association, 2017. p. 1-13| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 16. | | MARQUES, M. M. de L.; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, S. C. A.; SOUSA, M. E. M. de; SANTOS, L. S. dos. Herdabilidade ampla para caracteres de vagens, grãos e porte de planta em linhagens F6 de guandu. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 67. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | LIMA, C. E. P.; SOARES, D. C.; RODRIGUES, S. C. V. A.; MENDES, L. S.; SANTOS, K. C. B. dos; FONTENELLE, M. R. Short term alterations in microbial attributes in a ferralsol cultivated with melon in diferent soil management systems in greenhouse. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015. Resumo 1720-2, on line.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 18. | | RODRIGUES, S. C. V. A.; FONTENELLE, M. R.; BOMFIM, C. A.; SANTOS, K. C. B. dos; ZANDONADI, D. B.; LIMA, C. E. P. Respostas de cultivares de alface ao biofertilizante Hortibio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 19. | | SANTOS, L. S. dos; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, S. C. A.; SOUSA, M. E. M. de; MARQUES, M. M. de L. Seleção preliminar de linhagens F6 de guandu granífero. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 68. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 20. | | SOUSA, M. E. M. de; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, S. C. A.; MARQUES, M. M. de L.; SANTOS, L. S. dos. Segregação para cor em cruzamentos de cebola de bulbo amarelo x bulbo roxo. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 36. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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