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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
01/08/2014 |
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Data da última atualização: |
19/06/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ZULETA, L. F. G.; CUNHA, C. de O.; CARVALHO, F. M. de; CIAPINA, L. P.; SOUZA, R. C; MERCANTE, F. M.; FARIA, S. M. de; BALDANI, J. I.; STRALIOTTO, R.; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. de. |
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Afiliação: |
LUIZ FERNANDO GODA ZULETA, LNCC; CLÁUDIO DE OLIVEIRA CUNHA, UFCE / CNPQ; FABÍOLA MARQUES DE CARVALHO, LNCC; LUCIANE PRIOLI CIAPINA, LNCC; RANGEL CELSO SOUZA, LNCC; FABIO MARTINS MERCANTE, CPAO; SERGIO MIANA DE FARIA, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; ROSANGELA STRALIOTTO, CNPAB; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO; ANA TEREZA RIBEIRO DE VASCONCELOS, LNCC. |
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Título: |
The complete genome of Burkholderia phenoliruptrix strain BR3459a, a symbiont of Mimosa flocculosa: highlighting the coexistence of symbiotic and pathogenic genes. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v.15, p. 535, Jun. 2014. |
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ISSN: |
1471-2164 |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-15-535 |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
BACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobenzene and caprolactam were identified. The genomic analyses also revealed a large number of antibiotic-related genes, the most important of which were correlated with streptomycin and novobiocin. The symbiotic plasmid showed high sequence identity with the symbiotic plasmid of B. phymatum. Additionally, comparative analysis of 545 housekeeping genes among pathogenic and non-pathogenic Burkholderia species strongly supports the definition of a new genus for the second branch, which would include BR3459a. CONCLUSIONS: The analyses of B. phenoliruptrix BR3459a showed key property of fixing nitrogen that together with genes for high tolerance to environmental stresses might explain a successful strategy of symbiosis in the tropics. The strain also harbours interesting sets of genes with biotechnological potential. However, the resemblance of certain genes to those of pathogenic Burkholderia raise concerns about large-scale applications in agriculture or for bioremediation. MenosBACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Comparative genomics; FBN; Genômica; Nitrogen fixing; Pathogenic Bacteria. |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/107252/1/BR3459.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
11/01/2012 |
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Data da última atualização: |
12/04/2018 |
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Autoria: |
RICCE, W. da S.; ALVES, S. J.; PRETE, C. E. C. |
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Afiliação: |
Wilian da Silva Ricce, Instituto Agronômico do Paraná; Sérgio José Alves, Instituto Agronômico do Paraná; Cássio Egídio Cavenaghi Prete, Universidade Estadual de Londrina/Departamento de Agronomia. |
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Título: |
Época de dessecação de pastagem de inverno e produtividade de grãos de soja. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 10, p. 1220-1225, out. 2011 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Burndown time of winter pastures and soybean grain yield. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi determinar o efeito da época de dessecação da pastagem de inverno sobre a produtividade de grãos de soja e seus componentes do rendimento. O experimento foi realizado em área de integração lavoura-pecuária, em Campo Mourão, PR nos anos agrícolas de 2002 a 2005. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso com oito repetições. Os tratamentos foram: dessecação 30, 20 10 e 0 dias antes da semeadura (DAS). Foram avaliados: a quantidade de massa de matéria seca da pastagem de inverno, no dia da semeadura; a altura de plantas; o número de plantas por metro; o número de vagens por planta; o número de grãos por vagem; a massa de mil grãos; e a produtividade de grãos. A dessecação pode ser realizada a 0, 10, 20 e 30 DAS, sem prejuízo para a produtividade de grãos de soja. Os componentes de produção se ajustam para reduzir as variações da produtividade de grãos. A redução no número de plantas por metro é compensada pelo maior número de vagens por planta. |
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Palavras-Chave: |
Componentes do rendimento; Glifosato; Integração lavoura-pecuária; Integrated crop-livestock. |
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Thesagro: |
Glycine max; Plantio direto. |
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Thesaurus NAL: |
Glyphosate; No-tillage; Yield components. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/52043/1/46n10a14.pdf
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Marc: |
LEADER 01875naa a2200265 a 4500
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500 $aTítulo em inglês: Burndown time of winter pastures and soybean grain yield.
520 $aO objetivo deste trabalho foi determinar o efeito da época de dessecação da pastagem de inverno sobre a produtividade de grãos de soja e seus componentes do rendimento. O experimento foi realizado em área de integração lavoura-pecuária, em Campo Mourão, PR nos anos agrícolas de 2002 a 2005. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso com oito repetições. Os tratamentos foram: dessecação 30, 20 10 e 0 dias antes da semeadura (DAS). Foram avaliados: a quantidade de massa de matéria seca da pastagem de inverno, no dia da semeadura; a altura de plantas; o número de plantas por metro; o número de vagens por planta; o número de grãos por vagem; a massa de mil grãos; e a produtividade de grãos. A dessecação pode ser realizada a 0, 10, 20 e 30 DAS, sem prejuízo para a produtividade de grãos de soja. Os componentes de produção se ajustam para reduzir as variações da produtividade de grãos. A redução no número de plantas por metro é compensada pelo maior número de vagens por planta.
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650 $aGlycine max
650 $aPlantio direto
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653 $aGlifosato
653 $aIntegração lavoura-pecuária
653 $aIntegrated crop-livestock
700 1 $aALVES, S. J.
700 1 $aPRETE, C. E. C.
773 $tPesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 10, p. 1220-1225, out. 2011
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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