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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com cnpms.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
21/03/2022 |
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Data da última atualização: |
12/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, K. O. G.; SANTOS, J. P. R. dos; KRAUSE, M. D.; PIEPHO, H.-P.; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F. |
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Afiliação: |
KAIO O. G. DIAS, Universidade Federal de Viçosa; JHONATHAN P. R. DOS SANTOS, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; MATHEUS D. KRAUSE, Iowa State University; HANS-PETER PIEPHO, University of Hohenheim; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; ANTONIO A. F. GARCIA, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. |
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Título: |
Leveraging probability concepts for cultivar recommendation in multi?environment trials. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 135, n. 4, p. 1385-1399, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-022-04041-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Statistical models that capture the phenotypic plasticity of a genotype across environments are crucial in plant breeding programs to potentially identify parents, generate ofspring, and obtain highly productive genotypes for target environments. In this study, our aim is to leverage concepts of Bayesian models and probability methods of stability analysis to untangle genotype-by-environment interaction (GEI). The proposed method employs the posterior distribution obtained with the NoU-Turn sampler algorithm to get Hamiltonian Monte Carlo estimates of adaptation and stability probabilities. We applied the proposed models in two empirical tropical datasets. Our fndings provide a basis to enhance our ability to consider the uncertainty of cultivar recommendation for global or specifc adaptation. We further demonstrate that probability methods of stability analysis in a Bayesian framework are a powerful tool for unraveling GEI given a defned intensity of selection that results in a more informed decision-making process toward cultivar recommendation in multi-environment trials. |
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Palavras-Chave: |
Modelo Bayesiano; Modelo misto; Previsão genômica; Regressão de parâmetro. |
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Thesagro: |
Genótipo; Melhoramento Genético Vegetal; Variedade. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 01993naa a2200289 a 4500
001 2141063
005 2022-07-12
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00122-022-04041-y$2DOI
100 1 $aDIAS, K. O. G.
245 $aLeveraging probability concepts for cultivar recommendation in multi?environment trials.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aStatistical models that capture the phenotypic plasticity of a genotype across environments are crucial in plant breeding programs to potentially identify parents, generate ofspring, and obtain highly productive genotypes for target environments. In this study, our aim is to leverage concepts of Bayesian models and probability methods of stability analysis to untangle genotype-by-environment interaction (GEI). The proposed method employs the posterior distribution obtained with the NoU-Turn sampler algorithm to get Hamiltonian Monte Carlo estimates of adaptation and stability probabilities. We applied the proposed models in two empirical tropical datasets. Our fndings provide a basis to enhance our ability to consider the uncertainty of cultivar recommendation for global or specifc adaptation. We further demonstrate that probability methods of stability analysis in a Bayesian framework are a powerful tool for unraveling GEI given a defned intensity of selection that results in a more informed decision-making process toward cultivar recommendation in multi-environment trials.
650 $aGenótipo
650 $aMelhoramento Genético Vegetal
650 $aVariedade
653 $aModelo Bayesiano
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653 $aPrevisão genômica
653 $aRegressão de parâmetro
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700 1 $aPIEPHO, H.-P.
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700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aGARCIA, A. A. F.
773 $tTheoretical and Applied Genetics$gv. 135, n. 4, p. 1385-1399, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
15/02/2024 |
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Data da última atualização: |
15/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
OLIVEIRA, I. A. de; REIS, L. de N. A. dos; NERY, F. M. B.; FERNANDES, N. A. N.; GONÇALVES, V. P. M. R.; ROJAS, M. R.; GILBERTSON, R. L.; REIS, A.; BOITEUX, L. S.; FONSECA, M. E. N.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C. |
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Afiliação: |
IZAÍAS ARAÚJO DE OLIVEIRA; LUCIANE DE NAZARÉ ALMEIDA DOS REIS; FLÁVIA MILENE BARROS NERY; NIDAY ALLINE NUNES FERNANDES; VINÍCIUS PERES MACHADO REIS GONÇALVES; MARIA R. ROJAS; ROBERT L. GILBERTSON; AILTON REIS, CNPH; LEONARDO SILVA BOITEUX, CNPH; MARIA ESTHER DE N FONSECA BOITEUX, CNPH; RITA DE CÁSSIA PEREIRA-CARVALHO. |
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Título: |
Genomic characterization of a highly divergent tomato chlorotic mottle Guyane virus strain in the Brazilian Amazon River Basin |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Phytoparasitica v. 52, n. 13, 2024. |
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Páginas: |
5 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12600-024-01122-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: Maria Esther de Noronha Fonseca‐Boiteux. |
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Palavras-Chave: |
Cultivar IPA-6; Iranduba. |
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Thesagro: |
Tomate; Vírus. |
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Thesaurus NAL: |
Begomovirus; French Guiana; Solanum lycopersicum; Tomatoes. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
LEADER 01121naa a2200361 a 4500
001 2161987
005 2024-02-15
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s12600-024-01122-0$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, I. A. de
245 $aGenomic characterization of a highly divergent tomato chlorotic mottle Guyane virus strain in the Brazilian Amazon River Basin$h[electronic resource]
260 $c2024
300 $a5 p.
500 $aNa publicação: Maria Esther de Noronha Fonseca‐Boiteux.
650 $aBegomovirus
650 $aFrench Guiana
650 $aSolanum lycopersicum
650 $aTomatoes
650 $aTomate
650 $aVírus
653 $aCultivar IPA-6
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700 1 $aREIS, A.
700 1 $aBOITEUX, L. S.
700 1 $aFONSECA, M. E. N.
700 1 $aPEREIRA-CARVALHO, R. de C.
773 $tPhytoparasitica$gv. 52, n. 13, 2024.
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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