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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura.
Data corrente:  13/10/2021
Data da última atualização:  28/10/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  VARELA, E. S.; BEKAERT, M.; KIRSCHNIK, L. N. G.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; O'SULLIVAN, F. L. A.; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; BARROSO, A. da S.; FREITAS, L. E. L. de; TAGGART, J. B.; MIGAUD, H.
Afiliação:  EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; MICHAËL BEKAERT; LUCIANA NAKAGHI GANECO KIRSCHNIK, CNPASA; LUCAS SIMON TORATI, CNPASA; LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; FERNANDA LOUREIRO ALMEIDA OSULLIVAN, CPAA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; FABRICIO PEREIRA REZENDE, CNPASA; AURISAN DA SILVA BARROSO; LUIZ EDUARDO LIMA DE FREITAS, CNPASA; JOHN BERNARD TAGGART; HERVE MIGAUD.
Título:  A high-density linkage map and sex-linked markers for the Amazon tambaqui Colossoma macropomum.
Ano de publicação:  2021
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 22, n. 709, 2021.
ISSN:  1471-2164
DOI:  https://doi.org/10.1186/s12864-021-08037-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Tambaqui (Colossoma macropomum, Cuvier, 1818) is the most economically important native freshwater fish species in Brazil. It can reach a total length of over 1 m and a weight of over 40 kg. The species displays a clear sex dimorphism in growth performance, with females reaching larger sizes at harvest. In aquaculture, the production of monosex populations in selective breeding programmes has been therefore identified as a key priority. In the present study, a genetic linkage map was generated by double digest restriction-site associated DNA (ddRAD) sequencing from 248 individuals sampled from two F1 families. The map was constructed using 14,805 informative SNPs and spanned 27 linkage groups. From this, the tambaqui draft genome was improved, by ordering the scaffolds into chromosomes, and sex-linked markers were identified. A total of 235 markers on linkage group 26 showed a significant association with the phenotypic sex, supporting an XX/XY sex determination system in the species. The four most informative sex-linked markers were validated on another 206 sexed individuals, demonstrating an accuracy in predicting sex ranging from 90.0 to 96.7%.
Palavras-Chave:  Linkage map; Monosex; Sex-linked markers.
Thesagro:  Aquicultura; Colossoma Macropomum; Peixe; Tambaqui.
Thesaurus Nal:  Aquaculture; Fish; Genetic markers; Sex determination.
Categoria do assunto:  --
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/227302/1/bmc-2021.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/226902/1/s12864-021-08037-8.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPASA1076 - 1UPCAP - DD20212021
CPAA38559 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P. Levantamento detalhado de solos da área da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, com base em fotografias aéreas e prospecção do terreno. 1970. 125 f. Dissertação (Magister Scientiae) - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Itaguaí. Orientador: Abeilard Fernando de Castro.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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2.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; VELLOSO, A. C. X. Características de alguns solos da Região do Médio-Amazonas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 12 (único), p. 97-104, 1977 Título em inglês: Characteristics of some soils of he Medium-Amazon river region.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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3.Imagem marcado/desmarcadoBOREM, R. A. T.; RAMOS, D. P. Estoque e conteúdo de nutrientes da serrapilheira de duas toposseqüências de solo sob vegetação de Mata Atlântica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 28., 2001, Londrina. Ciência do solo: fator de produtividade competitiva com sustentabiblidade. [resumos]... Londrina: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo; Embrapa Soja; IAPAR; UEL; UEM, 2001. p. 296
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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4.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; MANZATTO, C. V. Estudos de solos para ordenamento do uso cerâmico das argilas da baixada campista - Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2003. 19 p. il. color. (Embrapa Solos. Documentos, 52). Acompanha 1 mapa, color. Escala 1:50.000. Mapa semidetalhado de solos de parte da Baixada Campista.
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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5.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; CASTRO, A. F. de; CAMARGO, M. N.; RAMOS, D. P.; CAMARGO, M. N. Levantamento detalhado de solos da área da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Série Agronomia, Rio de Janeiro, v. 8, p. 1-27, 1973.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCONCEIÇÃO, M. da; SANTOS, G. de A.; RAMOS, D. P. Caracterização de solos com elevado teor de matéria orgânica da região de Itaguaí-Santa Cruz, RJ e sua importância para uso e manejo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E ÁGUA, 10., 1994, Florianópolis. Resumos... Florianópolis: SBCS, 1994.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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7.Imagem marcado/desmarcadoDUARTE, M. N.; RAMOS, D. P.; LIMA, P. C. de. Caracterizacao e genese de solos desenvolvidos de cobertura quaternaria sobre embasamento cristalino, na Baixada Litoranea do Estado do Rio de Janeiro. Revista Brasileira de Ciencia do Solo, Campinas, v.20, n.2, p.291-304, 1996.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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8.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; DÖBEREINER, Johanna; GOEDERT, W. (coord.). Relatório sobre as atividades no ano 1975. s.l.: CNPq: EMBRAPA: UFRRJ, 1975. 41 p. Programa de Cooperação Internacional de Treinamento e Pesquisa Básica em Fixação de Nitrogênio nos Trópicos.
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoPANOSO, L. A.; RAMOS, D. P.; BRANDÃO, M. Solos do campo experimental da Embrapa Milho e Sorgo: suas características e classificação no novo Sistema Brasileiro. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2002. 92 p. (Embrapa Solos. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 5).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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10.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; CASTRO, J. A. B. de. Levantamento detalhado de solos de área piloto (Série Seropédica) ao nível de tipo de solos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 8, n. 6, p. 53-62, 1973. (Agronomia). Título em inglês: Detailed survey of the Seropédica soil series (Itaguaí, RJ).
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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11.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; CASTRO, A. F. de; CAMARGO, M. N. Levantamento detalhado de solos da área da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Série Agronomia, v. 8, n. 6, p. 1-27, 1973.
Biblioteca(s): Embrapa Solos; Embrapa Unidades Centrais.
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12.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; CASTRO, J. A. B. de. Ocorrência e classificação de alguns solos com teores elevados de sódio trocável no Município de Itaguaí, Rio de Janeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 8, n. 6, p. 69-76, 1973. (Agronomia). Título em inglês: Occurrence and classification of some soils with high exchangeable sodium in the Itaguaí municipality, Rio de Janeiro.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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13.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; MANZATTO, C. V.; MANZATTO, H. R. H.; SHINZATO, E. Bases metodológicas para a reorganização da ocupação das terras do assentamento Cambucaes, Silva Jardim, RJ. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 1999. 38 p. (Embrapa Solos. Boletim de pesquisa, 3).
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, J. M. L. da; RODRIGUES, T. E.; RAMOS, D. P. Contribuição da fração argila e matéria orgânica na CTC de solos do terceário no nordeste do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 25., 1995, Viçosa. O solo nos grandes domínios morfoclimáticos do Brasil e o desenvolvimento sustentado: resumos expandidos. Viçosa: SBCS, 1995. v. 2, p. 226-227.
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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15.Imagem marcado/desmarcadoVELLOSO, A. C. X.; SANTOS, G. de A.; RAMOS, D. P. Capacidade de troca de cátions e adsorção de fosfato de solos sob vegetação de cerrado do Amapá. Pesquisa Agropecáaria Brasileira, Brasília, v.17, n.1, p. 27-32, jan. 1982. Título em inglês: Cation exchange capacity and phosphate adsortion of soils under cerrado (Savannah) vegetation of Amapá, Amazonian Region.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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16.Imagem marcado/desmarcadoANJOS, L. H. C. dos; PEREIRA, M. G.; PEREZ, D. V.; RAMOS, D. P. Caracterização e classificação de plintossolos no município de Pinheiro-MA. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 31, n. 5, p. 1035-1044, set./out. 2007.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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17.Imagem marcado/desmarcadoALVES, E. A. B.; MANZATTO, C. V.; RAMOS, D. P.; MANZATTO, H. R. H. Variacoes na condutividade eletrica, pH e carbono organico de um solo organico salino tiomorfico em funcao da calagem e drenagem controlada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 26., 1997. Rio de Janeiro, RJ. Resumos... Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Ciencia do Solo, 1997. p.434.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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18.Imagem marcado/desmarcadoARAUJO, A. C. B. de; MENDONÇA. M. L. S.; MOREIRA, F. M. S.; RAMOS, D. P. Reorganização da ocupação das terras da região canavieira de Campos (RJ). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 23., 1991, Porto Alegre. Produzir sem degradar: programa e resumos. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 1991. p. 293.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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19.Imagem marcado/desmarcadoRAMOS, D. P.; MANZATTO, C. V.; BRAGA, D.; ARAUJO, A. P. de. Nova concepcao de projetos de assentamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 26., 1997. Rio de Janeiro, RJ. Resumos... Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Ciencia do Solo, 1997. p.421.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, J. M. L. da; RAMOS, D. P.; RODRIGUES, T. E. Ponto de carga zero como parâmetro diferencial de solos do terciário no Nordeste paraense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 26., 1997, Rio de Janeiro. Informação de solo na globalização do conhecimento sobre o uso das terras: resumos. Rio de Janeiro: SBCS, 1997. p. 51.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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