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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
10/03/2008 |
Data da última atualização: |
14/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
ISSN: |
1415-4757 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
LEADER 01914naa a2200277 a 4500 001 1065872 005 2023-09-14 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1415-4757 100 1 $aDINIZ, F. M. 245 $aApplication of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping.$h[electronic resource] 260 $c2007 520 $aThe number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. 653 $aBanda polimórfica 653 $adouble-enrichment 653 $adouble-hybridization 653 $aEnriquecimento duplo 653 $aHibridação dupla 653 $aMicrossatélite 653 $astutter bands 653 $atailed microsatellite primer 700 1 $aIYENGAR, A. 700 1 $aLIMA, P. S. da C. 700 1 $aMACLEAN, N. 700 1 $aBENTZEN, P. 773 $tGenetics and Molecular Biology, São Paulo$gv. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Registros recuperados : 175 | |
121. | | MELO, E. S. P.; SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; NASCIMENTO, V. A.; ARAUJO, F. R. Teste intradérmico com proteínas recombinantes de Mycobacterium bovis como antígenos em Cavia porcellus1. Pesquisa Veterinária Brasileira, v.34, n. 10, p. 957-962, outubro 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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122. | | BIER, D.; KICH, J. D.; DUARTE, S. C.; SILVA, M. R.; VALSONI, L. M.; RAMOS, C. A. N.; RODRIGUES, D. P.; ARAUJO, F. R. Survey of Salmonella spp. in beef meat for export at slaughterhouses in Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 11, p. 2037-2043, novembro, 2018 Título em português: Pesquisa de Salmonella spp. em carcaças bovinas durante o processamento em abatedouros‑frigoríficos exportadores.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
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123. | | OLIVEIRA, J. S.; SOUZA SOBRINHO, F.; SANTIAGO, A. D.; SANTOS, D. M.; GOMIDE, C. A. M.; PEREIRA, A. V.; LANES, É. C. M.; ALMEIDA, E. J. D.; RAMOS, C. R. Avaliação de híbridos comerciais de milho para utilização na forma de silagem na Mesorregião do Leste Alagoano. Medicina Veterinária, Recife, v. 1, n. 2, p. 26-33, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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124. | | SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. N.; ARAUJO, F. R.; GUEDES JUNIOR, D. S.; OLIVEIRA, R. H. M. de; ELISEI, C.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O. Caracterização molecular de isolados brasileiros de babesia bovis. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 1 p. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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125. | | RAMOS, C. A. N.; RAMOS, R. A. N.; ARAUJO, F. R.; GUEDES JR, D. S. G.; SOUZA, I. I. F.; ONO, T. M.; VIEIRA, A. S.; PIMENTEL, D. S.; ROSAS, E. O.; FAUSTINO, M. A. G.; ALVES, L. C. Comparação de nested-PCR com o diagnóstico direto na detecção de Ehrlichia canis e Anaplasma platys em cães. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 18, p. 58-62, dez. 2009. Suplemento 1.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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126. | | RAMOS, C. A. N.; ARAUJO, F. R.; SOUZA, I. F.; GUEDES JUNIOR, DANIEL S.; OLIVEIRA, R. H. M. de; FARIAS, T. A.; OLIVEIRA, J. B.; ALVES, L. C.; FAUSINO, M. A. Comparação entre diversos antígenos para o diagnóstico de Anaplasma marginale por ELISA. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 30, n. 1, p. 37-41, jan. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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127. | | SOUZA, F. G.; ELISEI, C.; ROSINHA, G. M. S.; ARAÚJO, F. R.; SOARES, C. O.; MADRUGA, C. R.; FARIAS, T. A.; SANCHES, C. C.; RAMOS, C. A. D. N. Clonagem e expressão dos genes virb9 e virb10 de Brucella abortus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 24.; ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE MICROBACTÉRIAS, 2.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBACTÉRIAS, 12.; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA, 2.; ENCONTRO DE ENSINO EM MICROBIOLOGIA, 4., 2007, Brasília, DF. Anais... São Paulo: SBM, 2007. 1 p. CNPGC.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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128. | | CORREZZI, A. C.; DIAS, S. C.; FRANCO, O. L.; BATISTA, C. L.; RAMOS, C. S.; GOMES, D. G.; SILVA, O. N.; MIGLIOLIO, L.; SA, M. F. G. de; OLIVEIRA, U. A.; SILVA, M. C. M. da. Biotechnological potential of the brazilian cerrado plants: investigating the inhibition of insect alpha amylases. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 146.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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129. | | HECKLER, R. F.; LEMOS, R. A. A. de; GOMES, D. C.; DUTRA, I. S.; SILV, A R. O. S.; LOBATO, F. C. F.; RAMOS, C. A. N.; BRUMATTI, R. C. Blackleg in cattle in the state Mato Grosso do Sul, Brazil: 59 cases. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 1, p. 6-14, janeiro 2018. Título em português: Carbúnculo sintomático em bovinos em Mato Grosso do Sul: 59 casos.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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130. | | MELO, E. S. de P.; SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; ROSA, P. M. G.; RUSSI, L. S.; FARIAS, T. A.; ARAUJO, F. R. Avaliação preliminar de proteínas recombinantes de Mycobacterium bovis em teste de tuberculinização intradérmica em cobaios (Cavia porcellus). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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131. | | SANTOS, E. C. dos; CUNHA-SANTOS, R.; RAMOS, C. A. N.; SOUSA, L. C.; SOUZA, I. I. F.; MELO, E. S. P. de; ARAÚJO, C. P. de; ARAUJO, F. R. Avaliação preliminar de teste de soroaglutinação em látex com MSP5 recombinante para anticorpos contra Anaplasma marginale. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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132. | | MENESES, I. I. F. de S.; MELO, E. S. P.; RAMOS, C. A. N.; Osório, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; VIDAL, C. E. S.; SILVA, A. S.; SILVA, M. R.; PELLEGRIN, A. O.; ARAUJO, F. R. Avaliação de proteínas recombinantes para detecção de anticorpos contra Mycobacterium bovis por ELISA. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011. P. 32-33.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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133. | | SOUZA, I. I. F.; MELO, E. S. P.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; VIDAL, C. E. S.; SILVA, A. S.; SILVA, M. R.; PELLEGRIN, A. O.; ARAUJO, F. R. Avaliação de proteínas recombinantes para detecção de anticorpos contra Mycobacterium bovis por ELISA In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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134. | | ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; LUÍZ, H. L.; PÉRES, I. A. H. F. S.; OLIVEIRA, R. H. M. de; SOUZA, I. I. F. de; RUSSI, L. dos S. Avaliação de um protocolo de extração de DNA genômico a partir de sangue total. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 5 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 120).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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135. | | OLIVEIRA, V. V. G. de; MACEDO. S. R. B. de; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; RAMOS, R. A. N.; MAIA, F. C. L.; ALVES, L. C.; SILVA JUNIOR, V. A. da (ed.). Histopathological evaluation and parasite quantification (qPCR) in the male dog's genital system after natural infection with Leishmania infantum. Ciência Rural, Santa Maria, v. 46, n. 4, p. 641-647, abr. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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136. | | ARAÚJO, F. R.; COSTA, C. M.; RAMOS, C. A. N.; FARIAS, T. A.; SOUZA, I. I.; F. de; MELO, E. S. P.; ELISEI, C.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; FRAGOSO, S. P.; FONSECA, A. H. IgG and IgG2 antibodies from cattle naturally infected with Anaplasma marginale recognize the recombinant vaccine candidate antigens VirB9, VirB10, and elongation factor-Tu. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 103, n. 2, p. 186-190, Mar., 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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137. | | ROSA, M. S.; FANCELLI, M.; MEDEIROS, N. G. F. de; RAMOS, C. E. C. de O.; SILVA, J. N. da; RGÔLO, R. da S.; FERREIRA, C. F.; LEDO, C. A. da S. Efeito do protótipo emissor de ondas mecânicas sobre o comportamento de Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae) In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. Manejo das principais doenças e insetos-pragaTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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138. | | BASSOI, L. H.; TEIXEIRA, A. H. de C.; LIMA FILHO, J. M. P.; SILVA, J. A. M. e; SILVA, E. E. G. da; RAMOS, C. M. C.; SEDIYAMA, G. C. Guidelines for irrigation scheduling of banana crop in São Francisco Valley, Brazil. II - Water consumption, crop coeficient, and physiologycal behavior. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 26, n. 3, p. 464-467, dez. 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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139. | | BASSOI, L. H.; TEIXEIRA, A. H. de C.; SILVA, J. A. M. e; SILVA, E. E. G. da; RAMOS, C. M. C.; TARGINO, E. de L.; MAIA, J. L. T.; FERREIRA, M. de N. L. Consumo de água e coeficiente de cultura em bananeira irrigada por microaspersão. Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2001. 4 p. (Embrapa Semi-Árido. Comunicado Técnico, 108).Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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140. | | DUQUE, A. C. A.; LOPES, F. C. F.; MOTTA, A. C. S.; CARMO, S. G.; DORNELLAS, R. A. de C.; PAIVA, S. B. de; RAMOS, C. R.; CASTILHO, J. M. de. Consumo de matéria seca de vacas holandês x zebu em lactação manejadas sob condição de pastejo em capim-braquiária suplementado com silagem de milho e concentrados. In: SEMANA DE BIOLOGIA, 30., 2007, Juiz de Fora. O mundo se tornou pequeno para você mas você não é grande para o mundo: anais. Juiz de Fora: DACBIO/UFJF, 2007. p. 21-27.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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