| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
25/07/2018 |
|
Data da última atualização: |
25/07/2018 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SILVA, F. F.; JEREZ, E. A. Z.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; NASCIMENTO, M.; LIMA, R. O. de; GUIMARÃES, S. E. F. |
|
Afiliação: |
Fabyano Fonseca Silva, UFV; Elcer Albenis Zamora Jerez, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; José Marcelo Soriano Viana, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Paulo Sávio Lopes, UFV; Moysés Nascimento, UFV; Rodrigo Oliveira de Lima, UFV; Simone Eliza Facioni Guimarães, UFV. |
|
Título: |
Bayesian model combining linkage and linkage disequilibrium analysis for low density-based genomic selection in animal breeding. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Journal of Applied Animal Research, v. 46, n. 1, p. 873-878, 2018. |
|
DOI: |
10.1080/09712119.2017.1415903 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
We combined linkage (LA) and linkage disequilibrium (LDA) analyses (emerging the term ?LALDA?) for genomic selection (GS) purposes. The models were fitted to a simulated dataset and to a real data of feed conversion ratio in pigs. Firstly, the significant QTLs (quantitative trait locus) were identified through LA-based mixed models considering the QTL-genotypes as random effects by means of genotypic identity by descent matrix. This matrix was calculated at the positions of significant QTLs (based on LA) allowing to include the QTL-genotype effects additionally to SNP (single nucleotide polymorphism) markers (based on LDA) and additive polygenic effects in several GS models (Bayesian Ridge Regression ? BRR; Bayes A ? BA; Bayes B ? BB; Bayes C ? BC and Bayesian LASSO ? BL). These models combing all mentioned effects were denominated LALDA. Goodness-of-fit and predictive ability analyses were performed to evaluate the efficiency of these models. For the real data, although slightly, the superiority of the LALDA models was verified in comparison to traditional LDA models for GS. For the simulated dataset, the models presented similar results. For both LDA and LALDA frameworks, BA showed the best fitting through Deviance Information Criterion and higher predictive ability in the simulated and real datasets. |
|
Palavras-Chave: |
x. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180314/1/2018-M.Deon-JAAQR-Bayesian.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02093naa a2200241 a 4500
001 2093541
005 2018-07-25
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1080/09712119.2017.1415903$2DOI
100 1 $aSILVA, F. F.
245 $aBayesian model combining linkage and linkage disequilibrium analysis for low density-based genomic selection in animal breeding.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aWe combined linkage (LA) and linkage disequilibrium (LDA) analyses (emerging the term ?LALDA?) for genomic selection (GS) purposes. The models were fitted to a simulated dataset and to a real data of feed conversion ratio in pigs. Firstly, the significant QTLs (quantitative trait locus) were identified through LA-based mixed models considering the QTL-genotypes as random effects by means of genotypic identity by descent matrix. This matrix was calculated at the positions of significant QTLs (based on LA) allowing to include the QTL-genotype effects additionally to SNP (single nucleotide polymorphism) markers (based on LDA) and additive polygenic effects in several GS models (Bayesian Ridge Regression ? BRR; Bayes A ? BA; Bayes B ? BB; Bayes C ? BC and Bayesian LASSO ? BL). These models combing all mentioned effects were denominated LALDA. Goodness-of-fit and predictive ability analyses were performed to evaluate the efficiency of these models. For the real data, although slightly, the superiority of the LALDA models was verified in comparison to traditional LDA models for GS. For the simulated dataset, the models presented similar results. For both LDA and LALDA frameworks, BA showed the best fitting through Deviance Information Criterion and higher predictive ability in the simulated and real datasets.
653 $ax
700 1 $aJEREZ, E. A. Z.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aVIANA, J. M. S.
700 1 $aAZEVEDO, C. F.
700 1 $aLOPES, P. S.
700 1 $aNASCIMENTO, M.
700 1 $aLIMA, R. O. de
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
773 $tJournal of Applied Animal Research$gv. 46, n. 1, p. 873-878, 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 228 | |
| 101. |  | PEREIRA, M. C.; CARNEIRO, R. V.; PEIXOTO, M. G. C. D.; PENNA, V. M.; VERNEQUE, R. da S.; PIRES, M. de F. A. Guzerá para leite: em busca do bem-estar, de olho no mercado. Revista Guzerá, Uberaba, n. 3, p. 44-46, 2010.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|    |
| 103. | | VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; LEDIC, I. L.; MACHADO, M. A.; PIRES, M. de F. A.; PEIXOTO, M. G. C. D. La importancia del Gyr lechero en la ganadería lechera tropical. In: MARTINS, P. do C.; DINIZ, F. H.; MOREIRA, M. S. de P.; NOGUEIRA NETTO, V.; ARCURI, P. B. (Ed.). Conocimientos y estratégias tecnológicas para la producción de leche en regiones tropicales. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2007. p. 377-385.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 104. | | SANTANA, C. J. L.; PRADO, A. R. do; VICENTINI, R. R.; CARVALHO, B. C. de; BORGES, C. A. V.; FERNANDES, J. de A.; PIRES, M. de F. A. Comportamento ingestivo de fêmeas bovinas mestiças no pré-parto em relação a posição social no rebanho. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|  |
| 105. | | BRAGA, L. D. da C.; PRAXEDES, V. A.; BRITO, L. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; OLIVEIRA, M. M. N. F. de; PIRES, M. de F. A. Comportamento materno-filial de vacas Guzerá com bezerros mestiços Holandês x Guzerá em rebanhos leiteiros. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 7.; FÓRUM DE COORDENADORES DE PÓS GRADUAÇÃO EM PRODUÇÃO ANIMAL DO NORDESTE, 1.; FÓRUM DE AGROECOLOGIA RO RIO GRANDE DO NORTE, 1., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: Sociedade Nordestina de Producao Animal; UFERSA, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 108. | | SANTANA, C. J. L.; PRADO, A. R. do; VICENTINI, R. R.; CARVALHO, B. C. de; BORGES, C. A. V.; PIRES, M. de F. A. Comportamento social de vacas e novilhas leiteiras no pré-parto. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 110. | | LEME, T. M. S. P.; PIRES, M. de F. A.; VERNEQUE, R. da S.; ALVIM, M. J.; AROEIRA, L. J. M. Comportamento de vacas mestiças holandês x zebu em pastagem de Brachiaria decumbens em sistema silvipastoril. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 29, n. 3, p. 668-675, 2005. v. 29 p. 668-675| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 111. | | PRAXEDES, V. A.; PIRES, M. de F. A.; PEREIRA, M. C.; VERNEQUE, R. da S.; VICCINI, R. C.; PEIXOTO, M. G. C. D. Comportamento animal em um rebanho Guzerá no estado de Minas gerais: do pré-parto ao parto. In: ENCONTRO ANUAL DE ETOLOGIA, 27., 2009, Bonito. Anais... Bonito: SE, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 112. | | MATOS, J. P. C. De; RUFINO, S. R. De A.; CARVALHO, B. C. de; CAMPOS, M. M.; COELHO, S. G.; PIRES, M. de F. A. Comportamento de bezerros na fase de cria: utilização de abrigo móvel. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL., 8.; INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUSTAINABLE AGRICULTURE, 5. Sinop. Ciência, tecnologia e inovação para o desenvolvimento sustentável das novas fronteiras agrícolas: anais. [Sinop: SIMBRAS], 2016. p. 180-184.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 113. | | CIRINO, A. L.; MARLIÉRE, J. de B. L.; PIRES, M. de F. A.; BRUNELI, F. A. T.; MACHADO, F. S.; PEIXOTO, M. G. C. D. Caracterização de rebanhos em sistemas de produção orgânica de leite no Sudeste do Brasil. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE PIBIC/CNPQ, 26., 2022, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2022. p. 75-79.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 114. | | MATOS, J. P. C. De; SEABRA, J. C. F.; DINIZ, F. H.; MARTINS, C. E.; ROCHA, W. S. D. da; PIRES, M. de F. A. Caracterização da produção de leite no município de Alagoa (MG). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL., 8.; INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUSTAINABLE AGRICULTURE, 5. Sinop. Ciência, tecnologia e inovação para o desenvolvimento sustentável das novas fronteiras agrícolas: anais. [Sinop: SIMBRAS], 2016. p. 124-128.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 115. | | PEREIRA, M. R.; GUIMARAES, A. S.; SILVA, B. C. da M. e; JUNIOR, L. A. R. A. P.; FARIA, L. S. de; PIRES, M. de F. A. Caracterização do comportamento de vacas holandesas em lactação confinadas em sistemas Compost Barn em clima tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOMETEOROLOGIA, AMBIÊNCIA, COMPORTAMENTO E BEM-ESTAR ANIMAL, 7., 2017, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: SBBIOMET, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 116. | | MENDONÇA, J. F. M. De; SOUZA, G. N. de; DINIZ, F. H.; VICENTINI, N. M.; REIS, E. S. dos; PIRES, M. de F. A. Avaliação da qualidade do leite cru de propriedades de agricultura familiar produtoras de queijo parmesão artesanal de Alagoa e Bocaina de Minas Gerais In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL., 8.; INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUSTAINABLE AGRICULTURE, 5. Sinop. Ciência, tecnologia e inovação para o desenvolvimento sustentável das novas fronteiras agrícolas: anais. [Sinop: SIMBRAS], 2016. p. 6-9.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 117. | | MENDONÇA, J. F. M De; SOUZA, G. N. de; DINIZ, F. H.; VICENTINI, N. M.; PAULA, J. C. J. De; PIRES, M. de F. A. Avaliação da qualidade microbiológica do leite cru de propriedades de agricultura familiar produtoras de queijo parmesão artesanal de Alagoa e Bocaina de Minas Gerais In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL., 8.; INTERNATIONAL CONFERENCE ON SUSTAINABLE AGRICULTURE, 5. Sinop. Ciência, tecnologia e inovação para o desenvolvimento sustentável das novas fronteiras agrícolas: anais. [Sinop: SIMBRAS], 2016. p. 10-13| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 118. | | LANGE, C. C.; NOGUEIRA, J. S.; MELLO, P. C.; SILVA, M. A. S.; VICENTINI, N. M.; DINIZ, F. H.; ARAUJO, A. L. R.; PIRES, M. de F. A. Avaliação da qualidade microbiológica de queijo artesanal produzido no município de Carvalhos, Minas Gerais. In: XXII Workshop de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite. XXII. Anais. Juiz de Fora/MG. Embrapa Gado de Leite, 2018. 4 p| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 119. | | AZEVEDO, M. de; PIRES, M. de F. a.; SATURNINO, H. M.; LANA, A. M. Q.; SAMPAIO, I. B. M.; MONTEIRO, J. B. N.; MORATO, L. E. Estimativa de níveis críticos superiores do índice de temperatura e umidade para vacas leiteiras 1/2, 3/4 e 7/8 holandês-zebu em lactação. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 6, p. 2000-2008, 2005. v. 34| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 120. | | ALVES, N. G.; PIRES, M. de F. A.; SILVA FILHO, J. M. da; SATURNINO, H. M.; SÁ, W. F. de; TORRES, C. A. A. Estrus behavior in Guzera (Bos taurus indicus) breed cows. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 33, n. 5, p. 1424-1430, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| Registros recuperados : 228 | |
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
