| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
04/03/2011 |
|
Data da última atualização: |
16/06/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
|
Autoria: |
MARTINEZ, D. T. |
|
Afiliação: |
DIEGO TYSZKA MARTINEZ. |
|
Título: |
Avaliação genética sob heterogeneidade de variância residual dentro de tratamentos. |
|
Ano de publicação: |
2010 |
|
Fonte/Imprenta: |
2010. |
|
Páginas: |
64 p. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Tese (Doutorado em Ciências Florestais) - Setor de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Paraná, Curitiba. Orientador: Marcos Deon Vilela de Resende. |
|
Conteúdo: |
O objetivo dos programas de melhoramento é maximizar o ganho genético para
características de valor econômico, com o uso de modelos estatísticos específicos,
considerando o delineamento utilizado, buscando alta precisão experimental e
acurácia seletiva elevada. Atualmente, o uso de modelos mistos tem sido mais
indicado em programas de melhoramento genético, através da metodologia da
máxima verossimilhança restrita (REML) para estimar os componentes de variância
e melhor predição linear não viciada (BLUP), para a predição dos valores genéticos,
pois atendem a situações de dados balanceados e desbalanceados. O BLUP
considera os componentes de variância para todos os genótipos de forma igual. Em
situações com heterogeneidade de variâncias, é preciso considerar a variância
residual e estimar, para cada tratamento, as acurácias, coeficientes e
herdabilidades. Esta metodologia está disponível através do BLUP-HET, que utiliza
uma variância residual para cada tratamento genético. O presente estudo objetivou
avaliar, em duas condições distintas, a heterogeneidade de variâncias residuais e
comparar os resultados obtidos pelos procedimentos BLUP e BLUP-HET. Estas
análises são apresentadas em dois capítulos. A primeira avaliação foi realizada
através de simulação, com a geração de números aleatórios, considerando 10% de
variância genética e variância residual variável, de forma que apresentassem
heterogeneidade de variâncias e adicionados a média 10, obtendo-se assim o valor
fenotípico. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com 100 genótipos, uma
planta por parcela e com 2, 5, 10 e 20 repetições. Os valores genotípicos preditos
por cada metodologia foram comparados com os valores reais, assim como seu
ganho genético esperado, para verificar em quais condições cada procedimento é
melhor. Nas condições deste estudo, o uso de 2 e 5 repetições apresenta baixa
precisão. O aumento do número de repetições reduz os desvios padrões das
herdabilidades e das variâncias residuais dentro dos genótipos, melhorando as
condições de estimação. Neste caso, recomenda-se o uso de 10 ou mais repetições
para garantir uma maior precisão nas estimativas. Com herdabilidade próxima de
10%, o uso de 10 ou mais repetições não representa problema prático em casos de
heterogeneidade de variâncias dentro de genótipos, podendo ser utilizado qualquer
um dos métodos. Apesar disso, o procedimento BLUP-HET apresenta acurácias
mais próximas do valor esperado, para a maioria dos casos avaliados, e estima o
ganho com seleção mais próximo ao real. A segunda avaliação foi realizada com
dados de diâmetro e altura de Pinus taeda L., em um teste com 150 progênies,
plantados em blocos ao acaso, com 6 plantas por parcela e em 5 locais. Houve
elevada heterogeneidade de variâncias em algumas análises, sugerindo o
procedimento BLUP-HET como mais adequado, nestes casos. Apesar disso, devido
ao número de repetições (5 a 9 por local), os procedimentos BLUP e BLUP-HET
conduzem a resultados semelhantes. Houve interação genótipos x ambientes,
porém, esta foi de baixa magnitude. Neste caso, pode-se adotar um único programa
de melhoramento considerando todos os materiais genéticos avaliados. MenosO objetivo dos programas de melhoramento é maximizar o ganho genético para
características de valor econômico, com o uso de modelos estatísticos específicos,
considerando o delineamento utilizado, buscando alta precisão experimental e
acurácia seletiva elevada. Atualmente, o uso de modelos mistos tem sido mais
indicado em programas de melhoramento genético, através da metodologia da
máxima verossimilhança restrita (REML) para estimar os componentes de variância
e melhor predição linear não viciada (BLUP), para a predição dos valores genéticos,
pois atendem a situações de dados balanceados e desbalanceados. O BLUP
considera os componentes de variância para todos os genótipos de forma igual. Em
situações com heterogeneidade de variâncias, é preciso considerar a variância
residual e estimar, para cada tratamento, as acurácias, coeficientes e
herdabilidades. Esta metodologia está disponível através do BLUP-HET, que utiliza
uma variância residual para cada tratamento genético. O presente estudo objetivou
avaliar, em duas condições distintas, a heterogeneidade de variâncias residuais e
comparar os resultados obtidos pelos procedimentos BLUP e BLUP-HET. Estas
análises são apresentadas em dois capítulos. A primeira avaliação foi realizada
através de simulação, com a geração de números aleatórios, considerando 10% de
variância genética e variância residual variável, de forma que apresentassem
heterogeneidade de variâncias e adicionados a média 10, obtendo-se assim o valor
fenotípico.... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Ganho; Modelo misto. |
|
Thesagro: |
Parâmetro Genético; Seleção. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 03914nam a2200181 a 4500
001 1880154
005 2017-06-16
008 2010 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aMARTINEZ, D. T.
245 $aAvaliação genética sob heterogeneidade de variância residual dentro de tratamentos.
260 $a2010.$c2010
300 $a64 p.
500 $aTese (Doutorado em Ciências Florestais) - Setor de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Paraná, Curitiba. Orientador: Marcos Deon Vilela de Resende.
520 $aO objetivo dos programas de melhoramento é maximizar o ganho genético para características de valor econômico, com o uso de modelos estatísticos específicos, considerando o delineamento utilizado, buscando alta precisão experimental e acurácia seletiva elevada. Atualmente, o uso de modelos mistos tem sido mais indicado em programas de melhoramento genético, através da metodologia da máxima verossimilhança restrita (REML) para estimar os componentes de variância e melhor predição linear não viciada (BLUP), para a predição dos valores genéticos, pois atendem a situações de dados balanceados e desbalanceados. O BLUP considera os componentes de variância para todos os genótipos de forma igual. Em situações com heterogeneidade de variâncias, é preciso considerar a variância residual e estimar, para cada tratamento, as acurácias, coeficientes e herdabilidades. Esta metodologia está disponível através do BLUP-HET, que utiliza uma variância residual para cada tratamento genético. O presente estudo objetivou avaliar, em duas condições distintas, a heterogeneidade de variâncias residuais e comparar os resultados obtidos pelos procedimentos BLUP e BLUP-HET. Estas análises são apresentadas em dois capítulos. A primeira avaliação foi realizada através de simulação, com a geração de números aleatórios, considerando 10% de variância genética e variância residual variável, de forma que apresentassem heterogeneidade de variâncias e adicionados a média 10, obtendo-se assim o valor fenotípico. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com 100 genótipos, uma planta por parcela e com 2, 5, 10 e 20 repetições. Os valores genotípicos preditos por cada metodologia foram comparados com os valores reais, assim como seu ganho genético esperado, para verificar em quais condições cada procedimento é melhor. Nas condições deste estudo, o uso de 2 e 5 repetições apresenta baixa precisão. O aumento do número de repetições reduz os desvios padrões das herdabilidades e das variâncias residuais dentro dos genótipos, melhorando as condições de estimação. Neste caso, recomenda-se o uso de 10 ou mais repetições para garantir uma maior precisão nas estimativas. Com herdabilidade próxima de 10%, o uso de 10 ou mais repetições não representa problema prático em casos de heterogeneidade de variâncias dentro de genótipos, podendo ser utilizado qualquer um dos métodos. Apesar disso, o procedimento BLUP-HET apresenta acurácias mais próximas do valor esperado, para a maioria dos casos avaliados, e estima o ganho com seleção mais próximo ao real. A segunda avaliação foi realizada com dados de diâmetro e altura de Pinus taeda L., em um teste com 150 progênies, plantados em blocos ao acaso, com 6 plantas por parcela e em 5 locais. Houve elevada heterogeneidade de variâncias em algumas análises, sugerindo o procedimento BLUP-HET como mais adequado, nestes casos. Apesar disso, devido ao número de repetições (5 a 9 por local), os procedimentos BLUP e BLUP-HET conduzem a resultados semelhantes. Houve interação genótipos x ambientes, porém, esta foi de baixa magnitude. Neste caso, pode-se adotar um único programa de melhoramento considerando todos os materiais genéticos avaliados.
650 $aParâmetro Genético
650 $aSeleção
653 $aGanho
653 $aModelo misto
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
|
Data corrente: |
09/08/2017 |
|
Data da última atualização: |
09/08/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 2 |
|
Autoria: |
PICCOLI, M. L.; BRITO, L. F.; BRACCINI, J.; CARDOSO, F. F.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL, F. S. |
|
Afiliação: |
MARIO L. PICCOLI, UFRGS; LUIZ F. BRITO, University of Guelph; JOSÉ BRACCINI, UFRGS; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; MEHDI SARGOLZAEI, University of Guelph; FLÁVIO S. SCHENKEL, University of Guelph. |
|
Título: |
Genomic predictions for economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle using true and imputed genotypes. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 18, 18 Jan. 2017. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Article 2. |
|
Conteúdo: |
Genomic selection (GS) has played an important role in cattle breeding programs. However, genotyping prices are still a challenge for implementation of GS in beef cattle and there is still a lack of information about the use of low-density Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) chip panels for genomic predictions in breeds such as Brazilian Braford and Hereford. Therefore, this study investigated the effect of using imputed genotypes in the accuracy of genomic predictions for twenty economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle. Various scenarios composed by different percentages of animals with imputed genotypes and different sizes of the training population were compared. |
|
Palavras-Chave: |
Genotipagem. |
|
Thesagro: |
Gado de corte; Seleção genótipa. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/162598/1/Piccoli-et-al-2017.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01399naa a2200229 a 4500
001 2073847
005 2017-08-09
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aPICCOLI, M. L.
245 $aGenomic predictions for economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle using true and imputed genotypes.$h[electronic resource]
260 $c2017
500 $aArticle 2.
520 $aGenomic selection (GS) has played an important role in cattle breeding programs. However, genotyping prices are still a challenge for implementation of GS in beef cattle and there is still a lack of information about the use of low-density Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) chip panels for genomic predictions in breeds such as Brazilian Braford and Hereford. Therefore, this study investigated the effect of using imputed genotypes in the accuracy of genomic predictions for twenty economically important traits in Brazilian Braford and Hereford beef cattle. Various scenarios composed by different percentages of animals with imputed genotypes and different sizes of the training population were compared.
650 $aGado de corte
650 $aSeleção genótipa
653 $aGenotipagem
700 1 $aBRITO, L. F.
700 1 $aBRACCINI, J.
700 1 $aCARDOSO, F. F.
700 1 $aSARGOLZAEI, M.
700 1 $aSCHENKEL, F. S.
773 $tBMC Genetics$gv. 18, 18 Jan. 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
