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| Registros recuperados : 47 | |
| 4. |  | LOURENÇO, R. T.; CUNHA, A. F.; TSUKUMO, F.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Análise da composição e organização do genoma de Eucalyptus grandis com base em sequenciamento "shotgun" por amostragem ("sample sequencing"). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 30.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E.; COLOMBO, C. A.; PEREIRA, G. A. G. Coffee functional genomics in Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 21., 2006, Montpellier, France. Table of contents... Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E.; COLOMBO, C. A.; PEREIRA, G. A. G. Coffee functional genomics in Brazil. INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 21., 2006, Montpellier, France. Table of contents... Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | BATISTA, A. R. S.; LOURENÇO, R. T.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Novos microssatélltes para eucalyptus a partir de clones "shotgun". ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 79| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | LOURENÇO, R. T.; PAPPAS, G. J.; CUNHA, A. F.; PEREIRA, G. A. G.; GRATTAPAGLIA, D. Estrutura genômica de três megabases de dna genômico "shotgun" de eucalyptus: conteúdo nucleotídico, seouências repetitivas e genes. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 74| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | IVAMOTO, S. T.; REIS JUNIOR, O.; SAKURAY, L. M.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; PEREIRA, L. F. P. Transcriptome analysis in leaves, flowers and initial fruit development of Coffea arabica L. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE INTERNATIONAL, 23., 2015, San Diego, CA. Poster..., 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 11. | | NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | SALAZAR, M. S.; CAMARGO, E. L. O.; DECKMANN, A. C.; CARAZZOLLE, M. F.; LEPIKSON NETO, J.; MEDRANO, F. J.; GRATTAPAGLIA, D.; PEREIRA, G. A. G. Análise do genoma de espécies de eucalipto visando a identificação de genes/metabolismos chave para o incremento da sua produtividade para orientar o seu melhoramento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 240. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | VIDAL, R.; LEROY, L.; BELLIS, F. de; POT, D.; RODRIGUES, G. C.; PEREIRA, G. A. G.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. High-throughput sequencing of cDNA extracted from meristems of Coffea arabica cv. Rubi and Iapar59 submitted to different water field conditions. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 2010, Bali. Preceedings... [S.l]: Association for Science and Information on Coee (ASIC), 2010. p. 708-712| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | VIDAL, R. O.; ALEKCEVETCH, J. C.; LEROY, T.; DE BELLIS, F.; POT, D.; RODRIGUES, G. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. High-through put sequencing of CDNA shows that CV. Rubi and IAPAR59 of Coffea Arabica have different molecular response to water privation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 2012, San José. Proceedings... [S.l]: Association for Science and Information on Coffee (ASIC), 2012. p. 61.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | ROJAS, T. C. G.; MALUTA, R. P.; PARIZZI, L. P.; KOENIGKAN, L. V.; YANG, J.; YU, J.; PEREIRA, G. A. G.; SILVEIRA, W. D. da. Genome sequences of avian pathogenic Escherichia coli strains isolated from Brazilian commercial poultry. Genome Announcements, v. 1, n. 2, p. 1-2, Mar./Apr. 2013. Article e00110-13.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 16. | | YUYAMA, P. M.; REIS JUNIOR, O.; IVAMOTO, S. T.; DOMINGUES, D. S.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; CHARMETANT, P.; LEROY, T.; PEREIRA, L. F. P. Transcriptome analysis in Coffea eugenioides, an Arabica coffee ancestor, reveals differentially expressed genes inleaves and fruits. Molecular Genetics and Genomics, v. 291, n. 1, p. 323-336. 2016| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 17. | | SOARES-CAVALCANTI, N. M.; BELARMINO, L. C.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; RODRIGUES, F. A.; PEREIRA, G. A. G.; BENKO-ISEPPON, A. M. Overall picture of expressed Heat Shock Factors in Glycine max, Lotus japonicus and Medicago truncatula. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 247-259, May 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | LOPES, F. R.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; TEIXEIRA, J. B.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; CARARETO, C. M. A. Evolutionary changes of the gene expression pattern mediated by exonized transposable element sequences in coffee genomes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 2010, Bali. Preceedings... [S.l]: Association for Science and Information on Coee (ASIC), 2010. p. 775-779| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | CARAZZOLLE, M. F.; RABELLO, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; FREITAS-ASTUA, J.; PEREIRA, G. A. G.; MACHADO, M. A.; MEHTA, A. Identification of defence-related genes expressed in coffee and citrus during infection by Xylella fastidiosa. European Journal of Plant Pathology , v. 130, n. 4, p. 529-540, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | NASCIMENTO, L. C.; VIDAL R. O.; MONDEGO, J. M. C.; COSTA, G. G. L.; JUNIOR, O. R.; RODRIGUES, F.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. Genotipagem de cultivares brasileiros de soja através da detecção de SNPs. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 15, res. 8.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| Registros recuperados : 47 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
23/01/2013 |
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Data da última atualização: |
21/01/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
PEREIRA, J. F.; ALMEIDA, A. P. M. M.; COTA, J.; PAMPHILE, J. A.; SILVA, G. F. da; ARAUJO, E. F. de; GRAMACHO, K. P.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PEREIRA, G. A. G.; QUEIROZ, M. V. de. |
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Afiliação: |
JORGE FERNANDO PEREIRA, CNPT; ANA PAULA MORAIS MARTINS ALMEIDA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; JUNIO COTA, LABORATÓRIO NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DO BIOETANOL; JOAO ALENCAR PAMPHILE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; ELZA FERNANDES DE ARAUJO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; KARINA PERES GRAMACHO, CEPLAC; SÉRGIO HERMÍNIO BROMMONSCHENKEL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; GONCALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; MARISA VIEIRA DE QUEIROZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Boto, a class II transposon in Moniliophthora perniciosa, is the first representative of the PIF/Harbinger superfamily in a phytopathogenic fungus. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Microbiology, Reading, v. 159, p. 112-125, Jan. 2013. |
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ISSN: |
1350-0872 |
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DOI: |
10.1099/mic.0.062901-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Boto, a class II transposable element, was characterized in the Moniliophthora perniciosa genome. The Boto transposase is highly similar to plant PIF-like transposases that belong to the newest class II superfamily known as PIF/Harbinger. Although Boto shares characteristics with PIF-like elements, other characteristics, such as the transposase intron position, the position and direction of the second ORF, and the footprint, indicate that Boto belongs to a novel family of the PIF/Harbinger superfamily. Southern blot analyses detected 6?12 copies of Boto in C-biotype isolates and a ubiquitous presence among the C- and S-biotypes, as well as a separation in the C-biotype isolates from Bahia State in Brazil in at least two genotypic groups, and a new insertion in the genome of a C-biotype isolate maintained in the laboratory for 6 years. In addition to PCR amplification from a specific insertion site, changes in the Boto hybridization profile after the M. perniciosa sexual cycle and detection of Boto transcripts gave further evidence of Boto activity. As an active family in the genome of M. perniciosa, Boto elements may contribute to genetic variability in this homothallic fungus. This is the first report of a PIF/Harbinger transposon in the genome of a phytopathogenic fungus. |
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Thesagro: |
Doença; Fungo; Genética; Planta. |
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Thesaurus NAL: |
Moniliophthora perniciosa. |
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Categoria do assunto: |
--
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95572/1/2013-microbiology-v159p112.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75076/1/GILVAN-2-Boto-a-Class-II-transposon-in-Moniliophthora-perniciosa-is-the-first-representative-of-the-PIF-Harbinger-superfamily-in-a-phytopathogenic-fungus.pdf
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Marc: |
LEADER 02224naa a2200313 a 4500
001 1976811
005 2014-01-21
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1350-0872
024 7 $a10.1099/mic.0.062901-0$2DOI
100 1 $aPEREIRA, J. F.
245 $aBoto, a class II transposon in Moniliophthora perniciosa, is the first representative of the PIF/Harbinger superfamily in a phytopathogenic fungus.
260 $c2013
520 $aBoto, a class II transposable element, was characterized in the Moniliophthora perniciosa genome. The Boto transposase is highly similar to plant PIF-like transposases that belong to the newest class II superfamily known as PIF/Harbinger. Although Boto shares characteristics with PIF-like elements, other characteristics, such as the transposase intron position, the position and direction of the second ORF, and the footprint, indicate that Boto belongs to a novel family of the PIF/Harbinger superfamily. Southern blot analyses detected 6?12 copies of Boto in C-biotype isolates and a ubiquitous presence among the C- and S-biotypes, as well as a separation in the C-biotype isolates from Bahia State in Brazil in at least two genotypic groups, and a new insertion in the genome of a C-biotype isolate maintained in the laboratory for 6 years. In addition to PCR amplification from a specific insertion site, changes in the Boto hybridization profile after the M. perniciosa sexual cycle and detection of Boto transcripts gave further evidence of Boto activity. As an active family in the genome of M. perniciosa, Boto elements may contribute to genetic variability in this homothallic fungus. This is the first report of a PIF/Harbinger transposon in the genome of a phytopathogenic fungus.
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773 $tMicrobiology, Reading$gv. 159, p. 112-125, Jan. 2013.
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Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
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