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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
02/02/2023 |
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Data da última atualização: |
24/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VANEGAS K. G.; RENDSVIG, J. K. H.; JARCZYSKA, Z. D.; CÔRTES, M. V. de C. B.; VAN ESCH, A. P.; MORERA-GÓMEZ, M.; CONTESINI, F. J.; MORTENSEN, U. H. |
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Afiliação: |
KATHERINA GARCIA VANEGAS, UNIVERSITY OF DENAMARK; JAKOB KRÆMMER HAAR RENDSVIG, UNIVERSITY OF DENMARK; ZOFIA DOROTA JARCZYNSKA, UNIVERSITY OF DENMARK; MARCIO VINICIUS DE C BARROS CORTES, CNPAF; ABEL PETER VAN ESCH, UNIVERSITY OF DENAMARK; MARTÍ MORERA-GÓMEZ, UNIVERSITY OF DENAMARK; FABIANO JARES CONTESINI, UNIVERSITY OF DENAMARK; UFFE HASBRO MORTENSEN, UNIVERSITY OF DENAMARK. |
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Título: |
A Mad7 system for genetic engineering of filamentous fungi. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Fungi, v. 9, n. 1, 16, 2023. |
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ISSN: |
2309-608X |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/jof9010016 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The introduction of CRISPR technologies has revolutionized strain engineering in filamentous fungi. However, its use in commercial applications has been hampered by concerns over intellectual property (IP) ownership, and there is a need for implementing Cas nucleases that are not limited by complex IP constraints. One promising candidate in this context is the Mad7 enzyme, and we here present a versatile Mad7-CRISPR vector-set that can be efficiently used for the genetic engineering of four different Aspergillus species: Aspergillus nidulans, A. niger, A. oryzae and A. campestris, the latter being a species that has never previously been genetically engineered. We successfully used Mad7 to introduce unspecific as well as specific template-directed mutations including gene disruptions, gene insertions and gene deletions. Moreover, we demonstrate that both single-stranded oligonucleotides and PCR fragments equipped with short and long targeting sequences can be used for efficient marker-free gene editing. Importantly, our CRISPR/Mad7 system was functional in both non-homologous end-joining (NHEJ) proficient and deficient strains. Therefore, the newly implemented CRISPR/Mad7 was efficient to promote gene deletions and integrations using different types of DNA repair in four different Aspergillus species, resulting in the expansion of CRISPR toolboxes in fungal cell factories. |
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Palavras-Chave: |
CRISPR; Filamentous fungi; Fungal strain engineering; Mad7. |
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Thesagro: |
Fungo. |
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Thesaurus Nal: |
Aspergillus; Fungi; Genetic engineering. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151460/1/jof-2023.pdf
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Marc: |
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520 $aThe introduction of CRISPR technologies has revolutionized strain engineering in filamentous fungi. However, its use in commercial applications has been hampered by concerns over intellectual property (IP) ownership, and there is a need for implementing Cas nucleases that are not limited by complex IP constraints. One promising candidate in this context is the Mad7 enzyme, and we here present a versatile Mad7-CRISPR vector-set that can be efficiently used for the genetic engineering of four different Aspergillus species: Aspergillus nidulans, A. niger, A. oryzae and A. campestris, the latter being a species that has never previously been genetically engineered. We successfully used Mad7 to introduce unspecific as well as specific template-directed mutations including gene disruptions, gene insertions and gene deletions. Moreover, we demonstrate that both single-stranded oligonucleotides and PCR fragments equipped with short and long targeting sequences can be used for efficient marker-free gene editing. Importantly, our CRISPR/Mad7 system was functional in both non-homologous end-joining (NHEJ) proficient and deficient strains. Therefore, the newly implemented CRISPR/Mad7 was efficient to promote gene deletions and integrations using different types of DNA repair in four different Aspergillus species, resulting in the expansion of CRISPR toolboxes in fungal cell factories.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
12/08/2002 |
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Data da última atualização: |
25/02/2019 |
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Autoria: |
RUSCHEL, R.; PENTEADO, A. de F. |
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Afiliação: |
Renato Ruschel, Instituto de Pesquisas e Experimentaçãa Agropecuárias do Centro-Sul - IFEACS/Setor de Fitotecnia; Alberto de Figueiredo Penteado, Escritório do Pesquisas e Experimentação - EPE/Seção de Estatística Experimental e Análise Econômica. |
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Título: |
Análise dos componentes da variância de duas classes de cultivares de milho e estimativa do progresso genético médio em ensaios de produção. |
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Ano de publicação: |
1970 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 5, p. 381-388, 1970. |
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Série: |
(Agronomia, 3). |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Components of variance analyses for two classes of cultivars and average genetic advance estimated in corn yield trials.
A partir do v. 3(1968) é constituída de duas partes: Série Agronomia e Série Veterinária, publicadas também separadamente. |
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Conteúdo: |
Foram analisados os componentes da variância devidos às interações de cultivares de milho com localidades e anos, utilizando-se dados fornecidos por 81 experimentos do Projeto EPE-1 (Ensaio Nacional de Milho), conduzidos entre os anos agrícolas 1962/63 e 1967/68. Esta análise mostrou que o efeito da localidade sobre a variação de produção dos cultivares foi maior do que o efeito do ano. No estudo foram analisados híbridos e variedades como dois grupos distintos, levando-se em consideração a diferente amplitude da base genética dos seus cultivares. Maior variação na produção foi encontrada entre os cultivares classificados como variedades. Os híbridos mostraram-se mais homeostáticos do que os cultivares de base genética mais ampla, agrupados na classe das variedades, sendo estes últimos menos influenciados pela variação dás condições climáticas em anos sucessivos na mesma localidade. Foi estimado o Progresso Genético Médio para a produção, concluindo-se que a segurança dos resultados nos ensaios é dada de forma mais notável pelo número de localidades nas quais os ensaios se repetem. Com base na discussão dos resultados foram feitas considerações sobre os Ensaios Nacionais de Milho, e a análise de seus resultados. |
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Palavras-Chave: |
Base genética; Condição climática; Progresso Genético. |
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Thesagro: |
Milho; Milho Hibrido; Produção Agrícola; Rendimento; Variedade. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193053/1/Analise-dos-componentes-da-variancia.pdf
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Marc: |
LEADER 02313naa a2200253 a 4500
001 1108093
005 2019-02-25
008 1970 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aRUSCHEL, R.
245 $aAnálise dos componentes da variância de duas classes de cultivares de milho e estimativa do progresso genético médio em ensaios de produção.
260 $c1970
490 $a(Agronomia, 3).
500 $aTítulo em inglês: Components of variance analyses for two classes of cultivars and average genetic advance estimated in corn yield trials. A partir do v. 3(1968) é constituída de duas partes: Série Agronomia e Série Veterinária, publicadas também separadamente.
520 $aForam analisados os componentes da variância devidos às interações de cultivares de milho com localidades e anos, utilizando-se dados fornecidos por 81 experimentos do Projeto EPE-1 (Ensaio Nacional de Milho), conduzidos entre os anos agrícolas 1962/63 e 1967/68. Esta análise mostrou que o efeito da localidade sobre a variação de produção dos cultivares foi maior do que o efeito do ano. No estudo foram analisados híbridos e variedades como dois grupos distintos, levando-se em consideração a diferente amplitude da base genética dos seus cultivares. Maior variação na produção foi encontrada entre os cultivares classificados como variedades. Os híbridos mostraram-se mais homeostáticos do que os cultivares de base genética mais ampla, agrupados na classe das variedades, sendo estes últimos menos influenciados pela variação dás condições climáticas em anos sucessivos na mesma localidade. Foi estimado o Progresso Genético Médio para a produção, concluindo-se que a segurança dos resultados nos ensaios é dada de forma mais notável pelo número de localidades nas quais os ensaios se repetem. Com base na discussão dos resultados foram feitas considerações sobre os Ensaios Nacionais de Milho, e a análise de seus resultados.
650 $aMilho
650 $aMilho Hibrido
650 $aProdução Agrícola
650 $aRendimento
650 $aVariedade
653 $aBase genética
653 $aCondição climática
653 $aProgresso Genético
700 1 $aPENTEADO, A. de F.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Rio de Janeiro$gv. 5, p. 381-388, 1970.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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