|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
16/03/2023 |
Data da última atualização: |
16/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, L. C. de; NAKASONE, A. K.; SILVA, C. S.; BONFIM, K. |
Afiliação: |
LUANA CARDOSO DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; ALESSANDRA KEIKO NAKASONE, CPATU; CAIO SANTOS SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; KENNY BONFIM DE ARRUDA CARVALHO, Cenargen. |
Título: |
Characterization and variability of strains of Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae from the state of Pará, Brazil. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Ceres, Viçosa, v. 70, n. 1, p. 124-132, jan./feb. 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/0034-737X202370010014 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Bacterial spot, caused by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, is a disease that has limited the cultivation of passionfruit in various orchards in Brazil. The objective of this work is to characterize and evaluate the variability of 29 strains of X. axonopodis pv. passiflorae from different municipalities producing yellow passionfruit in the state of Pará. The characterization was performed by the biochemical methods of KOH solubility, oxidase and Bactray, and the molecular methods of Xapas-F, Xapas-Ri and Xapas-Ro primers. The variability was evaluated by pathogenicity test and RAPD (randomly amplified polymorphic DNA). The strains of X. axonopodis pv. passiflorae were Gram-negative and oxidase-negative, and tests with the Bactray kit showed no relation between the collection municipality and group composition. The Xapas-F/Ri/Ro primers were specific for the strains. The primers used amplified 118 polymorphic bands in the RAPD reactions and the highest genetic similarity was between the strains PA15 and PA16. As the pathogenicity test evidenced a pathogenic variability, the strains PA2.1, PA4.5, PA14, PA4.2, PA4.1, PA4.6, PA3.4 and PA4.3 present the highest severity values for the disease. The strains of X. axonopodis pv. passiflorae show characteristics typical of the species, and genetic and pathogenic variability among them. |
Palavras-Chave: |
Bacterial spot; Biochemical tests. |
Thesagro: |
Doença de Planta; Mancha Bacteriana; Maracujá; Passiflora Edulis Flavicarpa. |
Thesaurus Nal: |
Detection. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152411/1/CharacterizationVariabilityStrainsXanthomonas.pdf
|
Marc: |
LEADER 02174naa a2200253 a 4500 001 2152411 005 2023-03-16 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/0034-737X202370010014$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, L. C. de 245 $aCharacterization and variability of strains of Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae from the state of Pará, Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aBacterial spot, caused by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, is a disease that has limited the cultivation of passionfruit in various orchards in Brazil. The objective of this work is to characterize and evaluate the variability of 29 strains of X. axonopodis pv. passiflorae from different municipalities producing yellow passionfruit in the state of Pará. The characterization was performed by the biochemical methods of KOH solubility, oxidase and Bactray, and the molecular methods of Xapas-F, Xapas-Ri and Xapas-Ro primers. The variability was evaluated by pathogenicity test and RAPD (randomly amplified polymorphic DNA). The strains of X. axonopodis pv. passiflorae were Gram-negative and oxidase-negative, and tests with the Bactray kit showed no relation between the collection municipality and group composition. The Xapas-F/Ri/Ro primers were specific for the strains. The primers used amplified 118 polymorphic bands in the RAPD reactions and the highest genetic similarity was between the strains PA15 and PA16. As the pathogenicity test evidenced a pathogenic variability, the strains PA2.1, PA4.5, PA14, PA4.2, PA4.1, PA4.6, PA3.4 and PA4.3 present the highest severity values for the disease. The strains of X. axonopodis pv. passiflorae show characteristics typical of the species, and genetic and pathogenic variability among them. 650 $aDetection 650 $aDoença de Planta 650 $aMancha Bacteriana 650 $aMaracujá 650 $aPassiflora Edulis Flavicarpa 653 $aBacterial spot 653 $aBiochemical tests 700 1 $aNAKASONE, A. K. 700 1 $aSILVA, C. S. 700 1 $aBONFIM, K. 773 $tRevista Ceres, Viçosa$gv. 70, n. 1, p. 124-132, jan./feb. 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
Data corrente: |
03/03/2017 |
Data da última atualização: |
03/03/2017 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SILVA, K. N.; SOUZA, J. M.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; SILVA, M. S.; ORILIO, A. F.; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; VERZIGNASSI, J. R.; FRAGOSO, R. da R.; DESSAUNE, S. N.; RESENDE, R. O. |
Afiliação: |
UNB; UNB; UNB; UNB; MARILIA SANTOS SILVA, Cenargen; UNB; CELSO DORNELAS FERNANDES, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC; JAQUELINE ROSEMEIRE VERZIGNASSI, CNPGC; RODRIGO DA ROCHA FRAGOSO, CPAC; SUELEN NOGUEIRA DESSAUNE TAMEIRAO, CPAC; UNB. |
Título: |
Caracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In In: WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL: CONTRIBUIÇÕES, AVANÇOS E PERSPECTIVAS PARA O CERRADO BRASILEIRO, 2., 2016. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Em área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a tecnologia Illumina HiSeq de 2000. Obtiveram-se cerca de 48 milhões de sequências, que foram processadas e montadas?de novo? usando-se CLC Genomics Workbench 7.0. |
Palavras-Chave: |
Diversidade viral. |
Thesagro: |
Estilosante; Filogenia; Genoma; Graminea. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/157032/1/Caracterizacao-de-novas-especies-virais.pdf
|
Marc: |
LEADER 01969nam a2200313 a 4500 001 2066082 005 2017-03-03 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, K. N. 245 $aCaracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose.$h[electronic resource] 260 $aIn In: WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL: CONTRIBUIÇÕES, AVANÇOS E PERSPECTIVAS PARA O CERRADO BRASILEIRO, 2., 2016. Anais... Campo Grande, MS: SBMP$c2016 520 $aEm área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a tecnologia Illumina HiSeq de 2000. Obtiveram-se cerca de 48 milhões de sequências, que foram processadas e montadas?de novo? usando-se CLC Genomics Workbench 7.0. 650 $aEstilosante 650 $aFilogenia 650 $aGenoma 650 $aGraminea 653 $aDiversidade viral 700 1 $aSOUZA, J. M. 700 1 $aMELO, F. L. 700 1 $aNAGATA, T. 700 1 $aSILVA, M. S. 700 1 $aORILIO, A. F. 700 1 $aFERNANDES, C. D. 700 1 $aJANK, L. 700 1 $aSANTOS, M. F. 700 1 $aVERZIGNASSI, J. R. 700 1 $aFRAGOSO, R. da R. 700 1 $aDESSAUNE, S. N. 700 1 $aRESENDE, R. O.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|