Data/hora: 01/06/2024 02:04:19

Biblioteca(s): | Embrapa Unidades Centrais.
Data corrente: | 30/12/2016
Data da última atualização: | 29/12/2017
Autoria: | SILVA, M. I. V.; CHITARRA, C. S.; OLIVEIRO FILHO, J. X. de; MORES, N.; ITO, A. T. H.; ROCHA, I. S. M.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V.
Afiliação: | MAYARA I. V. SILVA, UFMT; MAYARA I. V. SILVA, UFMT; JOÃO X. DE OLIVEIRA FILHO, CNPGL; NELSON MORES, CNPSA; ALESSANDRA TAMMY HAYAKAWA ITO, UFMT; ICARO SERGIO MAGALHÃES ROCHA, UFMT; LUCIANO NAKAZATO, UFMT; VALÉRIA DUTRA, UFMT.
Título: | Identificação de transcritos diferencialmente expressos por Pasteurella multocida em condições de privação de ferro.
Ano de publicação: | 2016
Fonte/Imprenta: | Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 10, p. 965-970, out. 2016.
Idioma: | Português
Conteúdo: | Ferro (Fe) é um elemento essencial e a capacidade de adquiri-lo in vivo têm sido descrita em diversos agentes patogênicos através de fatores de virulência. Análises de transcritos durante a privação de Fe tem sido descritos através da técnica de microarray?, entretanto a técnica de RNA-seq recentemente tem demonstrado resultados superiores. Neste trabalho, o isolado de Pasteurella multocida (Pm 16759) altamente patogênico em suínos foi cultivado em duas condições com diferentes concentrações de Fe (controle e privação) com o objetivo de analisar transcritos diferencialmente expressos. O RNA total das duas condições foi extraído e sequenciado através da plataforma de nova geração Ion Torrent. Os dados foram analisados no Software Ion Reporter? e processados no programa Rockhopper. Foram obtidas 1.341.615 leituras com tamanho médio de 81pb, com 96% de alinhamento com o genoma de Pasteurella multocida subsp. multocida 3480 e 98,8% de acurácia. No mapeamento das leituras das duas condições, observou-se 2,652 transcritos e destes, 177 (6,7%) foram diferencialmente expressos, sendo 93 na condição controle (Fe+) e 84 na condição de privação (Fe-). Na condição de privação de Fe, o perfil de transcritos foram associados a função de transporte celular (fbp ABC, permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteína periplasmática de alta afinidade com Fe2+), reguladores transcricionais e proteínas hipotéticas. O perfil na condição controle (Fe+) apresentou transcritos diferencialmente expressos associados ao RNAs anti-sense (asRNA) e genes do metabolismo energético (fructose-1,6-bisfosfatase). O estudo comprovou que a restrição de Fe aumenta a expressão de genes envolvidos no transporte celular, reguladores transcricionais, proteínas hipotéticas e desconhecidas e permitiu ainda a identificação de novos genes como a permease de alta afinidade com Fe2+/Pb2+ e proteina periplasmática de alta afinidade com Fe2+, que configuram uma possível via alternativa de absorção de Fe.
Palavras-Chave: | Expresão genica; Fe deprivation; Gene experession; New generation sequencing; Privação de Fe; RNA-seq; Sequenciamento de nova geração.
Thesagro: | Pasteurella Multocida.
Thesaurus Nal: | Pasteurellosis.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152574/1/Identificacao-de-transcritos.pdf
Registro original: | Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE)
Exemplares: | AI-SEDE - (60405-1) - UPE - AP - DD -  -  -  - DIS