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| Registros recuperados : 75 | |
| 61. |  | OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, G. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Differentially expressed miRNAs in skeletal muscle related to feed efficiency in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 62. | | OLIVEIRA, G. B. A.; TERRILE, A. E.; OLIVEIRA, M. A. de; MANDARINO, J. M. G.; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; LEITE, R. S.; SANTOS, H. M. C.; MOREIRA, A. A.; SILVA, C. E. Produção de brotos de soja da cultivar BRS 216. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 70-72. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 63. | | SILVA NETO, A. M. da; NASCIMENTO, A. S. do; BRAVO, I. S. J.; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; SILVA, M. V. L.; BENEVIDES, L.; OLIVEIRA, G. B. de. Fontes protéicas oriundas de produtos comerciais nacionais como potenciais substitutos do hidrolisado importado para a criação massal de Ceratitis capitata. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 64. | | SILVA NETO, A. M. da S.; BENEVIDES, L. de J.; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; LOPES, M. V.; JOACHIM-BRAVO, I. S.; OLIVEIRA, G. B. de; NASCIMENTO, A. S. do. Resíduos agroindustriais na alimentação da mosca do Mediterrâneo (Diptera: Tephritidae). In:CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. pdf P444| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 65. | | BENEVIDES, L. de J.; SILVA NETO, A. M. da; DIAS, V. S.; BENEVIDES, C. M. de J.; LOPES, M. V.; BRAVO, I. S. J.; OLIVEIRA, G. B. de; NASCIMENTO, A. S. do. Subprodutos agroindustriais na elaboração de dietas para moscas-das-frutas (Ceratitis capitata). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 66. | | OLIVEIRA, G. B. A.; TERRILE, A. E.; OLIVEIRA, M. A. de; CARRÃO-PANIZZI, M. C.; MANDARINO, J. M. G.; LEITE, R. S.; SANTOS, H. M. C.; MOREIRA, A. A.; SILVA, C. E. Teste de aceitabilidade de brotos de soja da cultivar BRS 216. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 73-75. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 67. | | MOREIRA, A. A.; MANDARINO, J. M. G.; CARRÃO PANIZZI, M. C.; OLIVEIRA, M. A. de; LEITE, R. S.; OLIVEIRA, G. B. A.; SANTOS, H. M. C.; SILVA, C. E. Teste para comprovar a eficiência do método de extração e determinação de ácido fítico em sementes de soja utilizado na Embrapa Soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 13-15. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 68. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. Article number: 17072. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 69. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; DINIZ, W, J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; REGITANO, L. C. de A. An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle. Scientific Reports, v. 8, n. 17072, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 70. | | SILVA NETO, A. M. da; SANTOS, T. R. de O.; DIAS, V. S.; BRAVO, I. S. J.; BENEVIDES, L. de J.; BENEVIDES, C. M. de J.; SILVA, M. V. L.; SANTOS, D. C. C. dos; VIRGÍNIO, J.; OLIVEIRA, G. B.; WALDER, J. M. M.; PARANHOS, B. A. J.; NASCIMENTO, A. S. do. Mass-rearing of Mediterranean fruit fly using low-cost yeast products produced in Brazil. Scientia Agricola, v. 69, n. 6, p. 364-369, nov./dez. 2012| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Semiárido. |
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| 71. | | MARTINS, M. T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELlNO, F. C.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R.; MARIN S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA K.; PAIVA, A. A. R.; BENEVENTI, M. A.; STOLF, R.; OLIVEIRA, G. B. A. de. Caracterização molecular de eventos transformados com a construção rd29A: DREB1 A. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2008, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 125-128 (Embrapa Soja. Documentos, 297).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 72. | | SENE, G. A. de; ASSUMPÇÃO, A. H. P. M.; OLIVEIRA, G. B.; BERTOLONI, A. V.; ANDRADE, W. R.; TRETTEL, M.; LELIS, A. L. J.; TROPALDI, C. B.; SILVA, G. V. da; PASQUINI NETO, R.; PERNA JUNIOR, F.; HENRIQUE, F. L.; CORTE, R. R.; OLIVEIRA, P. P. A.; RODRIGUES, P. H. M. Práticas estratégicas com vistas à mitigação dos gases do efeito estufa na produção de bovinos a pasto. In: RODRIGUES, P. H. M.; ARAÚJO, C. S. da S.; PEREIRA, A. S. C.; GARNEIRO, A. H.; BRUNETTO, M. A.; POPSISSIL, C. A. G.; VENTURA, R. V. (Orgs.). Novos desafios da pesquisa em nutrição e produção animal. Pirassununga: 5D Editora, 2019. p. 268-294. Programa de Pós-Graduação em Nutrição e Produção Animal.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 73. | | SILVA NETO, A. M.; SANTOS, T. R. O.; DIAS, V. S.; BRAVO, I. S. J.; BENEVIDES, L. J.; BENEVIDES, C. M. J.; SILVA, M. V. L.; SANTOS, D. C. C.; VIRGINIO, J. F.; OLIVEIRA, G. B.; WALDER, J. M. M.; PARANHOS, B. A. J.; NASCIMENTO, A. S. do. Protein resource alternatives for mass rearing of Ceratitis capitata wiedemann (Diptera: Tephritidae). In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FRUIT FLIES OF ECONOMIC IMPORTANCE, 8., Valencia, 2010. Abstracts... Valencia: Universitat Politècnica de Valencia, 2010. p. 232.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 74. | | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N. de; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. BMC Genomics, v. 19, p. 1-20, 2018. Article number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 75. | | RODRIGUES, P. H. M.; OLIVEIRA, P. P. A.; BERNDT, A.; GERDES, L.; MATTOS, W. T. DE; FURTADO, A. J.; BERTOLONI, A. V.; LELIS, A. L. J.; LOBO, A. A. G.; UZAN, B. Z.; PERNA JUNIOR, F.; OLIVEIRA, G. B.; SILVA, G. V. DA; PASQUINI NETO, R.; ZAMBOIN, S. S.; ANDRADE, W. R. Uso de leguminosas na dieta de ruminantes: adaptação às mudanças climáticas e mitigação da emissão de gases de efeito estufa. In: NOVOS desafios da pesquisa em nutrição e produção animal. Pirassununga: 5D Editora, 2021. p.182-205.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 75 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
20/12/2018 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N. de; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
ALINE S. M. CESAR, USP, Iowa State University; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; JAMES M. REECY, Iowa State University; MIRELE D. POLETI, USP; Priscila Silva Neubern de Oliveira, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; GABRIELLA B. DE OLIVEIRA, USP; GABRIEL C. M. MOREIRA, USP; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; POLYANA C. TIZIOTO, USP; JAMES EUGENE KOLTES, Iowa State University; Elyn Fritz-Waters, Iowa State University; LUKE KRAMER, Iowa State University; DORIAN GARRICK, Massey University; HAMID BEIKI, Iowa State University; LUDWIG GEISTLINGER, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; GERSON B. MOURÃO, USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; Luiz Lehmann Coutinho, USP. |
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Título: |
Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 19, p. 1-20, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12864-018-4871-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini. |
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Conteúdo: |
Background: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in lipid metabolism. From co-expression network analysis, we further identified modules significantly correlated with IMF content and associated with relevant processes such as fatty acid metabolism, carbohydrate metabolism and lipid metabolism. Conclusion: This study provides novel insights into the link between genotype and IMF content as evident from the expression level. It thereby identifies genomic regions of particular importance and associated regulatory factors. These new findings provide new knowledge about the biological processes associated with genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. MenosBackground: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in l... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ácidos graxos; Doenças metabólicas; EQTL; Expressão gênica; Expression quantitative trait loci. |
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Thesaurus NAL: |
Fatty acids; Gene expression; Mammals; Metabolic diseases. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189052/1/AP-Identification-Cesar-etal.pdf
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Marc: |
LEADER 03558naa a2200457 a 4500
001 2106227
005 2019-02-19
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
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100 1 $aCESAR, A. S. M.
245 $aIdentification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits.$h[electronic resource]
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500 $aArticle number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini.
520 $aBackground: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in lipid metabolism. From co-expression network analysis, we further identified modules significantly correlated with IMF content and associated with relevant processes such as fatty acid metabolism, carbohydrate metabolism and lipid metabolism. Conclusion: This study provides novel insights into the link between genotype and IMF content as evident from the expression level. It thereby identifies genomic regions of particular importance and associated regulatory factors. These new findings provide new knowledge about the biological processes associated with genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals.
650 $aFatty acids
650 $aGene expression
650 $aMammals
650 $aMetabolic diseases
653 $aÁcidos graxos
653 $aDoenças metabólicas
653 $aEQTL
653 $aExpressão gênica
653 $aExpression quantitative trait loci
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aREECY, J. M.
700 1 $aPOLETI, M. D.
700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de
700 1 $aOLIVEIRA, G. B. de
700 1 $aMOREIRA, G. C. M.
700 1 $aMUDADU, M. de A.
700 1 $aTIZIOTO, P. L.
700 1 $aKOLTES, J. E.
700 1 $aFritz-Waters, E.
700 1 $aKRAMER, L.
700 1 $aGARRICK, D.
700 1 $aBEIKI, H.
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700 1 $aMOURÃO, G. B.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
773 $tBMC Genomics$gv. 19, p. 1-20, 2018.
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