| |
|
|
| Registros recuperados : 190 | |
| 141. |  | FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2004. 5 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 64). Na publicação: Michel Eduardo Beleza Yamaghishi.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
|    |
| 142. | | MAZONI, I.; KUSER, P.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. MSSP: simultaneous comparison of the same structure descriptor for different protein structures. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-50. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 143. | | BRAGHINI, C. A.; NESHICH, I. A. P.; NESHICH, G.; SOARDI, F. C.; MELLO, M. P. de; COSTA, V. P.; VASCONCELLOS, J. P. C. de; MELO, M. B. de. New mutation in the myocilin gene segregates with juvenile-onset open-angle glaucoma in a Brazilian family Gene, Amsterdam, v. 535, n. 1, p. 50-57, July 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
|  |
| 144. | | SILVA, M. C. M. da; MELLO, L. V.; COUTINHO, M. V.; RIGDEN, D. J.; NESHICH, G.; CHRISPEELS, M. J.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Mutants of common bean alpha-amylase inhibitor-2 as an approach to investigate binding specificity to alpha-amylases. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 3, p. 201-208, mar. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 145. | | SILVA, M. C. M. da; MELLO, L. V.; COUTINHO, M. V.; RIGDEN, D. J.; NESHICH, G.; CHRISPEELS, M. J.; SA, M. F. G. de. Mutants of common bean alpha-amylase inhibitor-2 as an approach to investigate binding specificity to alpha-amylases. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 3, p. 201-208, mar. 2004 Titulo em português: Mutantes do inibidor-2 de alfa-amilase do feijão-comum para investigação da especificidade de ligação a alfa-amilases.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 146. | | SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; VON ZUBEN, F.; NESHICH, G. A pattern recognition approach for catalytic site residues prediction using STING structural protein descriptors. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 41., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... [S.l]: SBBq, 2012. Não paginado. 1 pôster.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 147. | | BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; MOURA, D. S.; NESHICH, G.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ, W. Jr; SILVA-FILHO, M. C. A pipeline to study structural interactions among Spodoptera frugiperda serine proteinases and plant proteinase inhibitors. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Anais... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 320. GA 330.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 148. | | BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; NESHICH, G.; NESHICH, I. P.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ JÚNIOR, W.; SILVA-FILHO, M. C. Structural and phylogenetic analysis of Spodoptera frugiperda chymotrypsins involved on insect chemical protective barrier against plant Proteinase Inhibitors (PIs). In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 149. | | MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. Structure descriptors of chameleon sequences. In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008. Não paginado. RIB 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 150. | | MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A.; DOMINIQUINI, F.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. Sting contacts: a web-based application for identification and analysis of amino acid contacts within protein structure and across protein interfaces. Bioinformatics, v. 20, n. 13, p. 2145-2147, 2004. Na publicação: P. R. Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 152. | | SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M. da; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G.; SA, M. F. G. de. In vitro molecular evolution of bean alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to alpha-amylases. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. [Proceedings...]. Detroit: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster LB-28.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 153. | | NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MARANGONI, S.; MARTINS, D.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; NESHICH, G.; JARDINE, J. G. Xylella fastidiosa hexameric pilus retraction motor PILT interfaces are maintained by non-hydrophobic contacts. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 154. | | YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-13.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 155. | | BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; NESHICH, G. Predicting enzyme class from protein structure using Bayesian classification. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 1, p. 193-202, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 156. | | SILVEIRA, C. H. da; PIRES, D. E. V.; MINARDI, R.; RIBEIRO, C.; VELOSO, C. J. M.; LOPES, J. C. D.; MEIRA JÚNIOR, W.; NESHICH, G.; RAMOS, C. H. I.; HABESCH, R.; SANTORO, M. M. Protein cutoff scanning: a comparative analysis of cutoff dependent and cutoff free methods for prospecting contacts in proteins. Proteins, n. 74, p. 727-743, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 157. | | CRUZ, S. A. B. da; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. JMOL and STING integration: a STING for multiple patforms. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 86. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira, Paula R. Kuser, Edgard H. Santos. X-meeting 2005. Presented Posters.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 158. | | MARCELINO, L. H.; SOARES, F. X. S.; SILVA, C. M. da; ROCHA, T. L.; CARNEIRO, M.; GANDER, E. S.; SAMPAIO, M. A. M.; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G. Introduction of tryptophan in the Brazil nut 2s storage albumins by site-directed mutagenesis. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON CRYSTALLOGRAPHY AND MOLECULAR BIOLOGY, 1990, Guaruja, SP, Abstracts.[S.l.]: Institute of Advanced Studies, Sao Carlos: Universidade Federal de Sao Carlos, 1990. PS1-03.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 159. | | OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. An integrated database of structural parameters for protein analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster B-44. Na publicação: Stanley R. M. Oliveira, Paula R. Kuser-Falcão, Edgard H. Santos.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 160. | | CARDOSO, C. M. Y.; MORAES, F. R. de; NESHICH, G.; MOREIRA, E. C. de O.; COSTA, C. de N. M.; SANTOS, R. C. dos; SOUZA, C. R. B. de. Identification of cDNA sequences coding for bZIP regulatory proteins predicted to interact with putative cis-acting elements from Be2S1 gene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Forlaleza. Programas e resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. p. 212-213. Congresso da SBBiotec 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| Registros recuperados : 190 | |
|
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
04/08/2005 |
|
Data da última atualização: |
17/01/2020 |
|
Autoria: |
HIGA, R. H.; OLIVEIRA, A. G.; HORITA, L. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; YAMAGISHI, M. E. B.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G. |
|
Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; GORAN NESIC, CNPTIA. |
|
Título: |
Defining 3D residue environment in protein structures using SCORPION and FORMIGA. |
|
Ano de publicação: |
2004 |
|
Fonte/Imprenta: |
Bioinformatics, v. 20, n. 12, p. 1989-1991, 2004. |
|
DOI: |
10.1093/bioinformatics/bth190 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Na publicação: P. R. Kuser. |
|
Conteúdo: |
Two web-based applications to analyze amino acids three-dimensional (3D) local environment within protein structures-SCORPION and FORMIGA-are presented. SCORPION and FORMIGA produce a graphical presentation for simple statistical data showing the frequency of residue occurrence within a given sphere (defined here as the 3D contacts). |
|
Palavras-Chave: |
Sting Millennium Suite. |
|
Thesagro: |
Aminoácido; Proteina. |
|
Thesaurus NAL: |
Amino acids; Proteins. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 01230naa a2200313 a 4500
001 1009083
005 2020-01-17
008 2004 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1093/bioinformatics/bth190$2DOI
100 1 $aHIGA, R. H.
245 $aDefining 3D residue environment in protein structures using SCORPION and FORMIGA.$h[electronic resource]
260 $c2004
500 $aNa publicação: P. R. Kuser.
520 $aTwo web-based applications to analyze amino acids three-dimensional (3D) local environment within protein structures-SCORPION and FORMIGA-are presented. SCORPION and FORMIGA produce a graphical presentation for simple statistical data showing the frequency of residue occurrence within a given sphere (defined here as the 3D contacts).
650 $aAmino acids
650 $aProteins
650 $aAminoácido
650 $aProteina
653 $aSting Millennium Suite
700 1 $aOLIVEIRA, A. G.
700 1 $aHORITA, L. G.
700 1 $aMIURA, R. T.
700 1 $aINOUE, M. K.
700 1 $aFALCAO, P. R. K.
700 1 $aMANCINI, A. L.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aTOGAWA, R. C.
700 1 $aNESHICH, G.
773 $tBioinformatics$gv. 20, n. 12, p. 1989-1991, 2004.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
