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| Registros recuperados : 190 | |
| 101. |  | GOMIDE, J.; MELO-MINARDI, R.; SANTOS, M. A. dos; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; LOPES, J. C.; SANTORO, M. Using linear algebra for protein structural comparison and classification. Genetics and Molecular Biology, v. 32, n. 3, p. 645-651, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 102. | | VINCENTZ, M.; LEITE, A.; MATTAR, S. C. M. da; NESHICH, G.; BARROS, L.; WEINBERG, D.; ALMEIDA, E. R. de; PAES, C. M. de; ARAGAO, F.; GANDER, E. S. ACGT and vicilin core sequences in an essential seed specific promoter region from Brazil nut albumin gene recognized by the opaque-2 regulatory protein. In: ENCUENTRO LATINO AMERICANO DE BIOTECNOLOGIOA VEGETAL, 2.,1995, Puerto Iguazu, Argentina. REDBIOS95. [S.1.:s.n.],1995. n.D-23.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 103. | | VINCENTZ, M.; LEITE, A.; NESHICH, G.; VRIED, G.; MATTAR, C.; BARROS, L.; WEINBERG, D.; ALMEIDA, E. R. de; PAES de CARVALHO, M.; ARAGÃO, F.; GANDER, E. ACGT and vicilin core sequences in a promoter domain required for seed-specific expression of a 2S storage protein gene are recognized by the opaque-2 regulatory protein. Plant Molecular Biology, v. 34, n. 6, p. 879-889, 1997.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 104. | | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006. 4 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 77). Na publicação: Goran Neshich.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 105. | | NARCISO, M. G.; NESHICH, G.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer usando o software Sting. In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. p. 166-175. COMPSULMT 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 106. | | KUSER, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. BlueStar STING - a multiplatform environment for protein structure analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-22. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira, Edgard H. Santos.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 107. | | SILVA; C. M. da; ROCHA, T. L.; MARCELINO, L. H.; SOARES, F. X. S.; GANDER, E.; SAMPAIO, M. J. A. M.; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G. Brazil nut 2s storage albumin isoform purification and circular dichroism assisted secondary structure confirmation. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON CRYSTALLOGRAPHY AND MOLECULAR BIOLOGY, 1990, Guaruja, SP. Abstracts. [S.l.]: Institute of Advanced Studies, Sao Carlos: Universidade Federal de Sao Carlos, 1990. PS1-04.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 108. | | HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. Building multiple sequence alignments with a flavour of HSSP alignments. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 28. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Regina Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 109. | | CARVALHO, P. G. B. de; BLOCH JUNIOR, C.; MORHY, L.; SILVA, M. C. M. da; MELLO, L. V. de; NESHICH, G. The amino acid sequence of the Phaseolus vulgaris var. "Fogo na Serra" inhibitor and interactive surface modeling for the enzyme inhibitor complex. Journal of Protein Chemistry, New York, v.15, n.6, p.591-598, 1996.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 110. | | VIART, B.; DIAS-LOPES, C.; KOZLOVA, E.; OLIVEIRA, C. F. B.; NGUYEN, C.; NESHICH, G.; CHÁVEZ-OLÓRTEGUI, C.; MOLINA, F.; FELICORI, L. F. EPI-peptide designer: a tool for designing peptide ligand libraries based on epitope-paratope interactions. Bioinformatics, v. 32, n. 10, p. 1462-1470, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 111. | | SILVA, M. C. M.; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M.; COUTINHO, M. V.; ROCHA, T. L.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; NESHICH, G.; GROSSI DE SÁ, M. F. Bean shuffled alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to insect alpha-amylases. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 1., 2007, Natal, Rio Grande do Norte. [Resumos...]. [S.l]: Monsanto; Brasília: CNPq, 2007. p. 26.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 113. | | MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 946-963, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 114. | | DIAS-LOPES, C.; NESHICH, I. A. P.; NESHICH, G.; ORTEGA, J. M.; GRANIER, C.; CHÁVEZ-OLORTEGUI, C.; MOLINA, F.; FELICORI, L. Identification of new Sphingomyelinases D in pathogenic fungi and other pathogenic organisms. PLoS ONE, San Francisco, v. 8, n. 11, p. 1-12, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 115. | | CAMPEIRO, J. D'A.; NESHICH, I. P.; SANT'ANNA, O. A.; LOPES, R.; IANZER, D.; ASSAKURA, M. T.; NESHICH, G.; HAYASHI, M. A. F. Identification of snake bradykinin-potentiating peptides (BPPs)-simile sequences in rat brain: potential BPP-like precursor protein? Biochemical Pharmacology, New York, v. 96, n. 3, p. 202-215, Aug. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 116. | | JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECÍLIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. How did the structure function descriptors of proteins change with introduction of 'remediated' PDB files. In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Santiago. Program and abstracts... Santiago. Pontificia Universidade Católica de Chile, 2008. p. 15.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 117. | | MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. Plos One, San Francisco, v. 9, n. 1, p. 1-15, Jan. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 118. | | BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; MOURA, D. S.; NESHICH, G.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ, W. Jr; SILVA-FILHO, M. C. A pipeline to study structural interactions among Spodoptera frugiperda serine proteinases and plant proteinase inhibitors. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Anais... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 320. GA 330.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 119. | | MAZONI, I.; SALIM, J. A.; YANO, I. H.; MORAES, F. R.; CARVALHO, J. G.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I.; NESHICH, G. Prediction of a-helix using data mining decision tree technique. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 41., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... [S.l]: SBBq, 2012. Não paginado. Poster.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 120. | | FALCÃO, P. R. K.; MAZONI, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G. Protein ligand contacts analyzed in an integrated environment with the other sequence and structure related parameters. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. Na publicação: Paula Kuser, Stanley R. M. Oliveira. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-49.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| Registros recuperados : 190 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
27/02/2008 |
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Data da última atualização: |
16/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
NARCISO, M. G.; NESHICH, G.; YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I. |
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Afiliação: |
MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPTIA; GORAN NESIC, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA. |
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Título: |
Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer usando o software Sting. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DE COMPUTAÇÃO DO SUL DE MATO GROSSO, 2., 2006, Rondonópolis. Computação e educação: anais. Rondonópolis: UFMT, 2006. |
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Páginas: |
p. 166-175. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
COMPSULMT 2006. |
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Conteúdo: |
Este artigo descreve um dos recursos do software Sting, que se trata da análise da co-evolução em um alinhamento de aminoácidos. Basicamente, os aminoácidos mais importantes para a proteína, em termos de funcionalidade e estrutura, são os que co-evoluem. Para verificar a co-evolução de um aminoácido em relação aos demais, é feito um calculo estatístico, o qual mede a co-evolução de cada aminoácido na cadeia. Este cálculo de co-evolução, bem como o software que mostram os resultados, é o objetivo deste trabalho. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Co-evolução de aminoácidos; Software Sting. |
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Thesagro: |
Aminoácido; Proteína. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Proteins. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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700 1 $aMAZONI, I.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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