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| Registros recuperados : 58 | |
| 21. |  | HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. B. G.; NASCIMENTO, L. C.; DIAS, W. P.; HEWEZI, T.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Caracterização da proteína 14-3-3 nos nematoides que infectam a soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 15., 2020, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2020. 244 p. (Embrapa Soja. Documentos, 429). p. 143-151 (Embrapa Soja. Documentos, 429). Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 22. | | CAITAR, V. S. L.; NASCIMENTO, L. C.; CARVALHO, M. C. D. C. G. D.; DARBEN, L. M; PODANOSQUI, A. M. P.; DIAS, W. P.; GUIMARÃES, F. C. M. Earlier transcriptome interaction from resistant and susceptible soybean genotypes under Pratylenchus brachyurus infection revealed by RNA-seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 46.; REUNIÃO BRASILEIRA DE CONTROLE BIOLÓGICO, 11., 2013, Ouro Preto. [Anais...]. [Brasília]: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2013. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 23. | | CASTRO, N. B.; ROLIM, V. M.; NASCIMENTO, L. C. do; SILVEIRA, A. F. V.; ARGENTA, F. F.; FERREIRO, L.; DRIEMEIER, D.; SONNE, L. Doenças micóticas em gatos no Rio Grande do Sul. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 37, n. 11, p. 1313-1321, novembro 2017. Título em inglês: Fungal diseases in cats in Rio Grande do Sul, Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 24. | | SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; RODRIGUES, D. R.; PINHEIRO, G. S.; FERNANDES, H. A.; PEIXOTO, A. R.; COSTA, N. D. Desenvolvimento do oídio em feijão-caupi sob aumento da concentração de CO2. Horticultura Brasileira, v. 30, n. 2, p. S1937-S1941, jul. 2012. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos Anais do 52 Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, jul. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 25. | | LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. B. G.; NASCIMENTO, L. C.; AGUDELO, P.; DIAS, W. P.; HEWEZI, T.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Mining the transcriptome of root-lesion nematode Pratylenchus brachyurus for effector candidates (Transcriptoma de Pratylenchus brachyurus para identificação de candidatos a effetores). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2019, Recife. Anais... Brasília, DF: SBF, 2019. p. 167.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 26. | | NASCIMENTO, L. C. do; PENSUK, V.; COSTA, N. P. da; ASSIS FILHO, F. M. de; PIO-RIBEIRO, G.; DEOM, C. M.; SHERWOOD, J. Evaluation of peanut genotypes for resistance to Tomato spotted wilt virus by mechanical and thrips inoculation. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 6, p. 937-942, jun. 2006 Título em português: Avaliação de genótipos de amendoim em relação à resistência ao Tomato spotted wilt virus por meio de inoculação mecânica e por tripes.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 27. | | AMORIM, A. M. de; SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; PEIXOTO, A. R.; PINHEIRO, G. S.; RODRIGUES, D. R. Germinação de conídios de Oidium sp. sob diferentes temperaturas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. p. 278-281. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 28. | | SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; PINHEIRO, G. S.; RODRIGUES, D. R.; FERNANDES, H. A.; COSTA, N. D.; PEIXOTO, A. R. Impacto de alterações da temperatura sobre a infecção de Oidium sp em feijão-caupi. In: WORKSHOP SOBRE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E PROBLEMAS FITOSSANITÁRIOS, 2012, Jaguariúna. Mudanças climáticas e problemas fitossanitários: anais... Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2012. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 29. | | SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; RODRIGUES, D. R.; PINHEIRO, G. S.; FERNANDES, H. A.; PEIXOTO, A. R.; COSTA, N. D. Impacto do aumento da concentração de CO2 sobre o oídio em feijão-caupi. In: WORKSHOP SOBRE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E PROBLEMAS FITOSSANITÁRIOS, 2012, Jaguariúna. Mudanças climáticas e problemas fitossanitários: anais... Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2012. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 30. | | SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; PINHEIRO, G. S.; RODRIGUES, D. R.; FERNANDES, H. A.; COSTA, N. D.; PEIXOTO, A. R. Severidade do oídio em feijão-caupi sob diferentes temperaturas. Horticultura Brasileira, v. 30, n. 2, p. S1931-S1936, jul. 2012. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos Anais do 52 Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, jul. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 31. | | GOMES, E. C. de S.; GONDIM, P. J. S.; SANTOS, M. de F. G. dos; NASCIMENTO, L. C. do; BATISTA, J. de L.; SILVA, S. de M. Podridão peduncular e qualidade de mangas 'Tommy atkins' procedentes do mercado atacadista de Campina Grande-PB. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 32, n. 4, p. 1267-1271, dez. 2010. Também disponível em:.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 32. | | NOMURA, R. B. G.; HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NASCIMENTO, L. C.; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Prospecção de genes ortólogos de fitonematoides visando estratégias de amplo alcance. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 15., 2020, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2020. 244 p. (Embrapa Soja. Documentos, 429). P. 76-82 (Embrapa Soja. Documentos, 429). Artigo de acesso aberto.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 33. | | GOMES, R. dos S. S.; FARIAS, O. R.; DUARTE, I. G.; SILVA, R. T. da; CRUZ, J. M. F. L.; NASCIMENTO, L. C. do. Qualidade de sementes de Bauhinia variegata tratadas com óleos essenciais. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, e201801647, 2019. 5 p. Nota científica.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 34. | | HERAI, R. H.; COSTA, G. G. D. L.; R. JÚNIOR, O.; VIDAL, R. O.; NASCIMENTO, L. C.; PARIZZI, L. P.; PEREIRA, G. G. A.; CARAZZOLLE, M. F. TORNADO: an automated pipeline for de novo hybrid genome assembly based on free software packages for sanger and next generation sequencing technologies (NGS). In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 119. X-meeting 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 35. | | TAKITA, M. A.; ASTUA, J. de F.; PALMIERI, D. A.; KISHI, L. T.; CAMARGO, G. C.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MACHADO, M. A. Introns and exons in citrus genome. In: CONFERENCE PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH , 20., 2012, San Diego. The Largest Ag-Genomics Meeting in the World. SanDiego: Intl-Pag, 2012. Anais Web.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 36. | | FARIAS, O. R. de; NASCIMENTO, L. C. de; CRUZ, J. M. F. de L.; SILVA, H. A. O.; OLIVEIRA, M. D. de M.; BRUNO, R. de L. A.; ARRIEL, N. H. C. Biocontrol potential of Trichoderma and Bacillus species on Fusarium oxysporum f. sp vasinfectum. Journal of Experimental Agriculture International, v. 34, n. 1, p. 1-11, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 37. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A brazilian soybean database. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 38. | | NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; VIDAL, R. O.; MEYER, L.; BINNECK, E.; KIDO, E. A.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. Bioinformatics analysis applied to genosoja project. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book ... Rio de Janeiro: AB3C, 2009. p. 22. X-Meeting 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 39. | | RINCÃO, M. P.; CARVALHO, M. C. da C G. de; NASCIMENTO, L. C.; LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, K. de; DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; CARAZZOLLE, M. F.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. New insights into Phakopsora pachyrhizi infection based on transcriptome analysis in planta. Genetics and Molecular Biology, v. 41, n. 3, p. 671-691, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 40. | | CAMPOS, M. L.; PRADO, G. S.; SANTOS, V. O. dos; NASCIMENTO, L. C.; DOHMS, S. M.; CUNHA, N. B. da; RAMADA, M. H. S.; GROSSI-DE-SA, M. F.; DIAS, S. C. Mosses: versatile plants for biotechnological applications. Biotechnology Advances, v. 41, article 107533, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 58 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
02/12/2010 |
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Data da última atualização: |
27/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; HERAI, R. H.; R. JÚNIOR, O.; NASCIMENTO, L. C.; TEIXEIRA, P. J.; TIBURCIO, R. A.; MONDEGO, J. M. C.; PEREIRA, G. A. G. |
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Afiliação: |
IB, CENAPAD/UNICAMP; IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP, LBA/CNPTIA; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP; IAC; LGE/IB/UNICAMP. |
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Título: |
The genome projects of the closely related cacao pathogens Moniliophthora roreri and Moniliophthora perniciosa. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. |
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Páginas: |
p. 22. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2010. |
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Conteúdo: |
The basidiomycetes Moniliophthora roreri and Moniliophthora perniciosa are the etiologic agents of the two most devastating diseases in cacao (Theobroma cacao ): frosty pod rot and the witches? broom, respectively. The species are very closely related and even hybrid cells have been previously obtained. In cacao, both species infect pods, causing necrosis, and M. perniciosa is also able to invade other tissues causing changes in plant metabolisms, such as hyperplasia and hypertrophy. In order to understand the molecular basis of these organisms, we sequenced the genome of these two species. We also obtained transcriptomic data (RNA-seq) in several different conditions including the interaction between cacao and both pathogens. This work reports a pipeline utilized to assembly and compare these genomes, and to identify differential gene expression between libraries. The genomic and transcriptomic sequences for both organisms were obtained using high-throughput sequencing technology (454/Roche and Solexa/Illumina). The Solexa and 454 reads were assembled into longer contigs using de novo assembler Velvet and Newbler, respectively. The hybrid assembly was performed through the combination of Solexa contigs and 454 contigs resulting in ?nal hybrid contigs using a pipeline developed in our group. Ab initio and comparative gene predictions were obtained with Augustus and Exonerate programs using previous training set (including RNA-seq data) and the closely related organisms, respectively. The ?nal set of gene models were obtained through a union between ab-initio and comparative approaches. The identi?cation of gene expressed in both pathogens, for each library, was obtained mapping the RNA-seq reads into the predicted gene models. In order to identify the gene expressed in T. cacao , the RNA-seq reads were mapped into transcriptome assembly of T. cacao. The transcriptome assembly was obtained using around 160.000 T. cacao ESTs available at NCBI and assembled by CAP3 program. The analysis of differential expressed genes between libraries was performed using DEG-seq package. The M. perniciosa genome project (www.lge.ibi.unicamp.br/vassoura) and M. roreri genome project (www.lge.ibi.unicamp.br/roreri) involve several Brazilian and international laboratories. The comparative genomics in the structure level, gene content level, and orthologous gene sequence can provide new insights that can help this community to increase efforts in cacao diseases investigation. MenosThe basidiomycetes Moniliophthora roreri and Moniliophthora perniciosa are the etiologic agents of the two most devastating diseases in cacao (Theobroma cacao ): frosty pod rot and the witches? broom, respectively. The species are very closely related and even hybrid cells have been previously obtained. In cacao, both species infect pods, causing necrosis, and M. perniciosa is also able to invade other tissues causing changes in plant metabolisms, such as hyperplasia and hypertrophy. In order to understand the molecular basis of these organisms, we sequenced the genome of these two species. We also obtained transcriptomic data (RNA-seq) in several different conditions including the interaction between cacao and both pathogens. This work reports a pipeline utilized to assembly and compare these genomes, and to identify differential gene expression between libraries. The genomic and transcriptomic sequences for both organisms were obtained using high-throughput sequencing technology (454/Roche and Solexa/Illumina). The Solexa and 454 reads were assembled into longer contigs using de novo assembler Velvet and Newbler, respectively. The hybrid assembly was performed through the combination of Solexa contigs and 454 contigs resulting in ?nal hybrid contigs using a pipeline developed in our group. Ab initio and comparative gene predictions were obtained with Augustus and Exonerate programs using previous training set (including RNA-seq data) and the closely related organisms, resp... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Patógenos do cacau. |
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Thesagro: |
Genoma; Theobroma Cacao. |
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Thesaurus NAL: |
Genome; Moniliophthora perniciosa; Moniliophthora roreri. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23821/1/p22.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.]$c2010
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520 $aThe basidiomycetes Moniliophthora roreri and Moniliophthora perniciosa are the etiologic agents of the two most devastating diseases in cacao (Theobroma cacao ): frosty pod rot and the witches? broom, respectively. The species are very closely related and even hybrid cells have been previously obtained. In cacao, both species infect pods, causing necrosis, and M. perniciosa is also able to invade other tissues causing changes in plant metabolisms, such as hyperplasia and hypertrophy. In order to understand the molecular basis of these organisms, we sequenced the genome of these two species. We also obtained transcriptomic data (RNA-seq) in several different conditions including the interaction between cacao and both pathogens. This work reports a pipeline utilized to assembly and compare these genomes, and to identify differential gene expression between libraries. The genomic and transcriptomic sequences for both organisms were obtained using high-throughput sequencing technology (454/Roche and Solexa/Illumina). The Solexa and 454 reads were assembled into longer contigs using de novo assembler Velvet and Newbler, respectively. The hybrid assembly was performed through the combination of Solexa contigs and 454 contigs resulting in ?nal hybrid contigs using a pipeline developed in our group. Ab initio and comparative gene predictions were obtained with Augustus and Exonerate programs using previous training set (including RNA-seq data) and the closely related organisms, respectively. The ?nal set of gene models were obtained through a union between ab-initio and comparative approaches. The identi?cation of gene expressed in both pathogens, for each library, was obtained mapping the RNA-seq reads into the predicted gene models. In order to identify the gene expressed in T. cacao , the RNA-seq reads were mapped into transcriptome assembly of T. cacao. The transcriptome assembly was obtained using around 160.000 T. cacao ESTs available at NCBI and assembled by CAP3 program. The analysis of differential expressed genes between libraries was performed using DEG-seq package. The M. perniciosa genome project (www.lge.ibi.unicamp.br/vassoura) and M. roreri genome project (www.lge.ibi.unicamp.br/roreri) involve several Brazilian and international laboratories. The comparative genomics in the structure level, gene content level, and orthologous gene sequence can provide new insights that can help this community to increase efforts in cacao diseases investigation.
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Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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