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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
26/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERNANDES, E. da C.; DIAS, L. A. dos S.; CAIXETA, E. T.; CORRÊA, T. R.; MUNIZ, D. R.; ALMEIDA, O. F. de. |
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Afiliação: |
ERIKA DA COSTA FERNANDES, UFV; LUIZ ANTÔNIO DOS SANTOS DIAS, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; THAIS ROSELI CORRÊA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO MARANHÃO; DANDARA REGO MUNIZ, UFV; ODIMAR FERREIRA DE ALMEIDA, UFV. |
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Título: |
Wide genetic variability within and among families in a germplasm collection of jatropha curcas l. as revealed by microsatellite markers. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Functional Plant Breeding Journal, v. 3, n. 1, 2021. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.35418/2526-4117/v3n1a4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
J. curcas is a species with wide potential for biofuel production. However, there are few breeding programs and little information on its genetic structure. Studies indicate that the species has narrow genetic variability. We quantify genetic variability, and decomposing it within and among 28 families of a genebank by means of microsatellite markers. Thirty-nine pairs of primers were tested, of which six were polymorphic for a total of 18 alleles, with a mean of three alleles/locus. These six markers allowed genetic variability to be estimated within and among the families through estimates of PIC (0.36), expected (He=0.44) and observed (Ho=0.48) heterozygosity, inbreeding coefficient (f=-0.03), Shannon-Wiener index (H?=0.71), and the formation of 11 clusters. Bayesian analysis classified the families in four groups. The present study was the first to portray the formation of four groups and detect high genetic variability using only accessions from outside the main center of diversity of the species. Analysis of molecular variance showed that most of the variability (92.4%) is contained within families. There was low differentiation among the families (FST=0.07). Collection of genotypes within families should be prioritized because they are where greater variability is concentrated. This strategy was used in setting up the present genebank, which prioritized the collection of more plants per family, efficiently bringing together greater variability. For the first time, the diversity statistics revealed high genetic variability to be exploited in this collection, on the contrary to most studies with J. curcas that have claimed low genetic diversity in the species. MenosJ. curcas is a species with wide potential for biofuel production. However, there are few breeding programs and little information on its genetic structure. Studies indicate that the species has narrow genetic variability. We quantify genetic variability, and decomposing it within and among 28 families of a genebank by means of microsatellite markers. Thirty-nine pairs of primers were tested, of which six were polymorphic for a total of 18 alleles, with a mean of three alleles/locus. These six markers allowed genetic variability to be estimated within and among the families through estimates of PIC (0.36), expected (He=0.44) and observed (Ho=0.48) heterozygosity, inbreeding coefficient (f=-0.03), Shannon-Wiener index (H?=0.71), and the formation of 11 clusters. Bayesian analysis classified the families in four groups. The present study was the first to portray the formation of four groups and detect high genetic variability using only accessions from outside the main center of diversity of the species. Analysis of molecular variance showed that most of the variability (92.4%) is contained within families. There was low differentiation among the families (FST=0.07). Collection of genotypes within families should be prioritized because they are where greater variability is concentrated. This strategy was used in setting up the present genebank, which prioritized the collection of more plants per family, efficiently bringing together greater variability. For the first time, the... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Genetic variance; Germplasm; Jatropha. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230516/1/WIDE-GENETIC-VARIABILITY.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
24/09/2020 |
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Data da última atualização: |
24/09/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
NASCIMENTO, S. M. C. do; NAKASONE, A. K.; OLIVEIRA NETO, C. F. de; ALVES, K. F.; ALENCAR SOBRINHO, R. S.; CONCEIÇÃO, S. S.; CAMPOS, K. R. de A.; CARVALHO, E. de A. |
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Afiliação: |
Silvia Mara Coelho do Nascimento, UFRA; ALESSANDRA KEIKO NAKASONE, CPATU; Cândido Ferreira de Oliveira Neto, UFRA; Kézia Ferreira Alves, IFPA; Rayanne Savina Alencar Sobrinho, UFRA; Susana Silva Conceição, UFRA; Kátia Regina de Andrade Campos, UFRA; EUDES DE ARRUDA CARVALHO, SIQ. |
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Título: |
Patogenicidade e caracterização de Thielaviopsis ethacetica em palma de óleo. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 46, n. 3, p. 236-241, 2020. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/0100-5405/193244 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Thielaviopsis paradoxa é fungo do solo, patógeno amplamente distribuído em todo o mundo e capaz de infectar uma ampla gama de hospedeiros. Em palma de óleo é o agente etiológico da podridão basal, uma importante doença que pode causar sérios prejuízos devido à sua severidade e à rápida dispersão do patógeno. O trabalho teve como objetivo avaliar a patogenicidade e caracterizar um isolado de Thielaviopsis sp. em palma de óleo. O isolado de Thielaviopsis sp. foi obtido do estipe de plantas de palma de óleo, com aparentes sintomas de podridão. A patogenicidade foi avaliada em duas cultivares de palma de óleo, o híbrido interespecífico Manicoré e o híbrido intraespecífico Tenera. As mudas foram inoculadas por suspensão de conídios na concentração de 1x107 conídios por mililitro e discos de micélios, com e sem ferimentos na ráquis de folhas. O isolado foi cultivado em meio de cultura BDA para a caracterização morfológica. A análise filogenética foi realizada com base em comparação de sequências das regiões EF-1? e ITS com sequências disponíveis no GenBank-NCBI e analisadas no Mega 6.0. O isolado foi patogênico nas duas cultivares da palma de óleo em mudas previamente feridas, causando sintomas de podridão de coloração marrom, com formação de um halo amarelado na ráquis. Com o progresso da doença, as folhas apresentaram coloração amarelo progredindo para seca até a quebra da ráquis. O isolado de Thielaviopsis sp. apresentou crescimento rápido com velocidade de crescimento micelial de 50,76 mm dia-1 e com dois dias ocupou totalmente a placa de Petri de 90 mm. A colônia, de coloração inicialmente branca, tornou-se negra com a esporulação e produção de dois tipos de conídios: os endoconídios e aleuroconídios. Após as análises filogenéticas, foi possível comprovar a espécie Thielaviopsis ethacetica como agente etiológico da podridão basal da palma de óleo, distinguindo-a da espécie T. paradoxa. MenosThielaviopsis paradoxa é fungo do solo, patógeno amplamente distribuído em todo o mundo e capaz de infectar uma ampla gama de hospedeiros. Em palma de óleo é o agente etiológico da podridão basal, uma importante doença que pode causar sérios prejuízos devido à sua severidade e à rápida dispersão do patógeno. O trabalho teve como objetivo avaliar a patogenicidade e caracterizar um isolado de Thielaviopsis sp. em palma de óleo. O isolado de Thielaviopsis sp. foi obtido do estipe de plantas de palma de óleo, com aparentes sintomas de podridão. A patogenicidade foi avaliada em duas cultivares de palma de óleo, o híbrido interespecífico Manicoré e o híbrido intraespecífico Tenera. As mudas foram inoculadas por suspensão de conídios na concentração de 1x107 conídios por mililitro e discos de micélios, com e sem ferimentos na ráquis de folhas. O isolado foi cultivado em meio de cultura BDA para a caracterização morfológica. A análise filogenética foi realizada com base em comparação de sequências das regiões EF-1? e ITS com sequências disponíveis no GenBank-NCBI e analisadas no Mega 6.0. O isolado foi patogênico nas duas cultivares da palma de óleo em mudas previamente feridas, causando sintomas de podridão de coloração marrom, com formação de um halo amarelado na ráquis. Com o progresso da doença, as folhas apresentaram coloração amarelo progredindo para seca até a quebra da ráquis. O isolado de Thielaviopsis sp. apresentou crescimento rápido com velocidade de crescimento micelial... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Elaies spp; Palma de óleo; Thielaviopsis ethacetica. |
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Thesagro: |
Filogenia; Fungo; Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Thielaviopsis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216178/1/1980-5454-sp-46-3-0236.pdf
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Marc: |
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245 $aPatogenicidade e caracterização de Thielaviopsis ethacetica em palma de óleo.$h[electronic resource]
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520 $aThielaviopsis paradoxa é fungo do solo, patógeno amplamente distribuído em todo o mundo e capaz de infectar uma ampla gama de hospedeiros. Em palma de óleo é o agente etiológico da podridão basal, uma importante doença que pode causar sérios prejuízos devido à sua severidade e à rápida dispersão do patógeno. O trabalho teve como objetivo avaliar a patogenicidade e caracterizar um isolado de Thielaviopsis sp. em palma de óleo. O isolado de Thielaviopsis sp. foi obtido do estipe de plantas de palma de óleo, com aparentes sintomas de podridão. A patogenicidade foi avaliada em duas cultivares de palma de óleo, o híbrido interespecífico Manicoré e o híbrido intraespecífico Tenera. As mudas foram inoculadas por suspensão de conídios na concentração de 1x107 conídios por mililitro e discos de micélios, com e sem ferimentos na ráquis de folhas. O isolado foi cultivado em meio de cultura BDA para a caracterização morfológica. A análise filogenética foi realizada com base em comparação de sequências das regiões EF-1? e ITS com sequências disponíveis no GenBank-NCBI e analisadas no Mega 6.0. O isolado foi patogênico nas duas cultivares da palma de óleo em mudas previamente feridas, causando sintomas de podridão de coloração marrom, com formação de um halo amarelado na ráquis. Com o progresso da doença, as folhas apresentaram coloração amarelo progredindo para seca até a quebra da ráquis. O isolado de Thielaviopsis sp. apresentou crescimento rápido com velocidade de crescimento micelial de 50,76 mm dia-1 e com dois dias ocupou totalmente a placa de Petri de 90 mm. A colônia, de coloração inicialmente branca, tornou-se negra com a esporulação e produção de dois tipos de conídios: os endoconídios e aleuroconídios. Após as análises filogenéticas, foi possível comprovar a espécie Thielaviopsis ethacetica como agente etiológico da podridão basal da palma de óleo, distinguindo-a da espécie T. paradoxa.
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Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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