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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
15/10/2015 |
Data da última atualização: |
26/01/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA JÚNIOR, J. V. J.; ARENHART, S.; SANTOS, H. F. dos; ALMEIDA-QUEIROZ, S. R.; SILVA, A. N. M. R.; TREVISOL, I. M.; BERTANI, G. R.; GIL, L. H. V. G. |
Afiliação: |
JOSÉ VALTER JOAQUIM SILVA JÚNIOR, FIOCRUZ; SANDRA ARENHART, FIOCRUZ; HELTON FERNANDES DOS SANTOS, UFRGS/ICBS; SABRINA RIBEIRO DE ALMEIDA-QUEIROZ, FIOCRUZ; ANDRÉA NAZARÉ MONTEIRO RANGEL DA SILVA, FIOCRUZ; IARA MARIA TREVISOL, CNPSA; GIOVANI ROTA, UFPE/LIKA; LAURA HELENA VEGA GONZALES GIL, FIOCRUZ. |
Título: |
Efficient assembly of full-length infectious clone of Brazilian IBDV isolate by homologous recombination in yeast. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 45, n. 4, p. 1555-1563, 2014. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) causes immunosuppression in young chickens. Advances in molecular virology and vaccines for IBDV have been achieved by viral reverse genetics (VRG). VRG for IBDV has undergone changes over time, however all strategies used to generate particles of IBDV involves multiple rounds of amplification and need of in vitro ligation and restriction sites. The aim of this research was to build the world?s first VRG for IBDV by yeast-based homologous recombination; a more efficient, robust and simple process than cloning by in vitro ligation. The wild type IBDV (Wt-IBDV-Br) was isolated in Brazil and had its genome cloned in pJG-CMV-HDR vector by yeast-based homologous recombination. The clones were transfected into chicken embryo fibroblasts and the recovered virus (IC-IBDV-Br) showed genetic stability and similar phenotype to Wt-IBDV-Br, which were observed by nucleotide sequence, focus size/morphology and replication kinetics, respectively. Thus, IBDV reverse genetics by yeast-based homologous recombination provides tools to IBDV understanding and vaccines/viral vectors development. |
Palavras-Chave: |
IBVD; Virologia molecular. |
Thesagro: |
Doença de Gumboro; Frango; Genética molecular. |
Thesaurus Nal: |
Avibirnavirus; Chickens; Infectious bursal disease virus; Molecular genetics; Vertebrate viruses. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/131119/1/final7824.pdf
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Marc: |
LEADER 02128naa a2200325 a 4500 001 2026478 005 2018-01-26 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA JÚNIOR, J. V. J. 245 $aEfficient assembly of full-length infectious clone of Brazilian IBDV isolate by homologous recombination in yeast.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aThe Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) causes immunosuppression in young chickens. Advances in molecular virology and vaccines for IBDV have been achieved by viral reverse genetics (VRG). VRG for IBDV has undergone changes over time, however all strategies used to generate particles of IBDV involves multiple rounds of amplification and need of in vitro ligation and restriction sites. The aim of this research was to build the world?s first VRG for IBDV by yeast-based homologous recombination; a more efficient, robust and simple process than cloning by in vitro ligation. The wild type IBDV (Wt-IBDV-Br) was isolated in Brazil and had its genome cloned in pJG-CMV-HDR vector by yeast-based homologous recombination. The clones were transfected into chicken embryo fibroblasts and the recovered virus (IC-IBDV-Br) showed genetic stability and similar phenotype to Wt-IBDV-Br, which were observed by nucleotide sequence, focus size/morphology and replication kinetics, respectively. Thus, IBDV reverse genetics by yeast-based homologous recombination provides tools to IBDV understanding and vaccines/viral vectors development. 650 $aAvibirnavirus 650 $aChickens 650 $aInfectious bursal disease virus 650 $aMolecular genetics 650 $aVertebrate viruses 650 $aDoença de Gumboro 650 $aFrango 650 $aGenética molecular 653 $aIBVD 653 $aVirologia molecular 700 1 $aARENHART, S. 700 1 $aSANTOS, H. F. dos 700 1 $aALMEIDA-QUEIROZ, S. R. 700 1 $aSILVA, A. N. M. R. 700 1 $aTREVISOL, I. M. 700 1 $aBERTANI, G. R. 700 1 $aGIL, L. H. V. G. 773 $tBrazilian Journal of Microbiology$gv. 45, n. 4, p. 1555-1563, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
22/12/2017 |
Data da última atualização: |
22/12/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
VICTORIA, D. de C.; NAKAI, A. M.; BETTIOL, G. M.; MONTEIRO, J. E. B. de A.; OLIVEIRA, A. F. de. |
Afiliação: |
DANIEL DE CASTRO VICTORIA, CNPTIA; ALAN MASSARU NAKAI, CNPTIA; GIOVANA MARANHAO BETTIOL, CPAC; JOSE EDUARDO B DE ALMEIDA MONTEIRO, CNPTIA; ARYEVERTON FORTES DE OLIVEIRA, CNPTIA. |
Título: |
Avaliação de métodos de interpolação do índice de satisfação das necessidades de água. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20., SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais. Juazeiro: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2017. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
CBAgro, SMUD 2017. |
Conteúdo: |
RESUMO: O Zoneamento Agrícola de Risco Climático (ZARC) é um instrumento da política agrícola brasileira, que indica as melhores épocas de plantio para diversas
culturas, reduzindo o risco climático de perdas quando observado. Uma das etapas consiste na interpolação do Índice de Satisfação das Necessidades de Água (ISNA). Devido ao grande número de combinações (diversas culturas, 3 solos, 3 ciclos, 2 fases de interesse e 36 períodos de plantio) essa etapa deve ser eficiente e com pequena intervenção humana, permitindo automatização e tratamento objetivo das informações. Foram avaliados dois métodos de interpolação, IDW e krigagem com ajuste automático de parâmetros. Através da validação cruzada, constatou-se a importância do fator de potência do IDW, com valores menores gerando maiores RMSE (raiz do erro quadrado médio). Ao limitar o raio de busca da interpolação, o IDW apresentou desempenho semelhante à krigagem quanto ao ajuste entre dados estimados e observados, porém, a superfície interpolada apresenta oscilações bruscas indesejadas. A interpolação por krigagem resultou em bom ajuste entre os dados observados e preditos e uma superfície interpolada mais suave, mostrando que o método pode ser utilizado com relativa segurança e vantagem para a automação da etapa de interpolação do ZARC. |
Palavras-Chave: |
Agroclimatic zonning; Climatic risk; Índice de satisfação das necessidades de água; Krigagem; Método IDW; Métodos de interpolação; Zarc; Zoneamento agroclimático. |
Thesagro: |
Risco Climático. |
Thesaurus NAL: |
Agricultural zoning. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 02520nam a2200301 a 4500 001 2083500 005 2017-12-22 008 2017 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aVICTORIA, D. de C. 245 $aAvaliação de métodos de interpolação do índice de satisfação das necessidades de água.$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20., SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais. Juazeiro: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia$c2017 300 $aNão paginado. 500 $aCBAgro, SMUD 2017. 520 $aRESUMO: O Zoneamento Agrícola de Risco Climático (ZARC) é um instrumento da política agrícola brasileira, que indica as melhores épocas de plantio para diversas culturas, reduzindo o risco climático de perdas quando observado. Uma das etapas consiste na interpolação do Índice de Satisfação das Necessidades de Água (ISNA). Devido ao grande número de combinações (diversas culturas, 3 solos, 3 ciclos, 2 fases de interesse e 36 períodos de plantio) essa etapa deve ser eficiente e com pequena intervenção humana, permitindo automatização e tratamento objetivo das informações. Foram avaliados dois métodos de interpolação, IDW e krigagem com ajuste automático de parâmetros. Através da validação cruzada, constatou-se a importância do fator de potência do IDW, com valores menores gerando maiores RMSE (raiz do erro quadrado médio). Ao limitar o raio de busca da interpolação, o IDW apresentou desempenho semelhante à krigagem quanto ao ajuste entre dados estimados e observados, porém, a superfície interpolada apresenta oscilações bruscas indesejadas. A interpolação por krigagem resultou em bom ajuste entre os dados observados e preditos e uma superfície interpolada mais suave, mostrando que o método pode ser utilizado com relativa segurança e vantagem para a automação da etapa de interpolação do ZARC. 650 $aAgricultural zoning 650 $aRisco Climático 653 $aAgroclimatic zonning 653 $aClimatic risk 653 $aÍndice de satisfação das necessidades de água 653 $aKrigagem 653 $aMétodo IDW 653 $aMétodos de interpolação 653 $aZarc 653 $aZoneamento agroclimático 700 1 $aNAKAI, A. M. 700 1 $aBETTIOL, G. M. 700 1 $aMONTEIRO, J. E. B. de A. 700 1 $aOLIVEIRA, A. F. de
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Embrapa Cerrados (CPAC) |
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