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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
23/08/2017 |
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Data da última atualização: |
01/02/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. |
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Afiliação: |
MARCOS ELI BUZANSKAS, UFPB; DANIELA DO AMARAL GROSSI, Fast Genetics, Saskatoon; RICARDO VIEIRA VENTURA, Beef Improvement Opportunities, Guelph; FLAVIO SCHRAMM SCHENKEL, University of Guelph; TATIANE CRISTINA SELEGUIM CHUD, FCAV/Unesp; NEDENIA BONVINO STAFUZZA, FCAV/Unesp; LUCIANA DINIZ ROLA, FCAV/Unesp; SARAH LAGUNA CONCEIÇÃO MEIRELLES, Ufla; FABIANA BARICHELLO MOKRY, UFSCar; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; DANÍSIO PRADO MUNARI, FCAV/Unesp. |
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Título: |
Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, p. 1-10, 2017. |
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DOI: |
10.1186/s40104-017-0199-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Artigo 67. Na publicação: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva. |
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Conteúdo: |
Background: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals. Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age (435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age (12 SNPs), age at first calving (six SNPs), and age at second calving (four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding regions. Biological processes of genes were associated with immune system, multicellular organismal process, response to stimulus, apoptotic process, cellular component organization or biogenesis, biological adhesion, and reproduction. Conclusions: Few associations were observed for scrotal circumference at 210 d of age, age at first calving, and age at second calving, reinforcing their polygenic inheritance and the complexity of understanding the genetic architecture of reproductive traits. Finding many associations for scrotal circumference at 420 d of age in various regions of the Canchim genome also reveals the difficulty of targeting specific candidate genes that could act on fertility; nonetheless, the high linkage disequilibrium between loci herein estimated could aid to overcome this issue. Therefore, all relevant information about genomic regions influencing reproductive traits may contribute to target candidate genes for further investigation of causal mutations and aid in future genomic studies in Canchim cattle to improve the breeding program. MenosBackground: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals. Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age (435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age (12 SNPs), age at first calving (six SNPs), and age at second calving (four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding regions. Biological processes of genes were associated with immune system, multicellular organismal process, response to stimulus, apoptotic process, cellular component organization or biogenesis, biological adhesion, and reproduction. Conclusions: Few associations were observed for scrotal circumference at 210 d of age, age at first calving, and age at second calving, reinforcing their polygenic inheritance and the complexity of understanding the genetic architecture of reproductive traits. Finding many associations for scrotal circumference at 420 d of age in various regions of the Canchim genome also reveals the difficulty of targeting specific candidate genes that could act on fertility; nonetheless, the high linkage d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado Canchim; Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Genome-wide association study; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/162973/1/AP-Candidate-genes-Buzanskas-etal.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
01/02/2019 |
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Data da última atualização: |
01/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MINE, R. de O.; RAMOS FILHO, L. O.; NEVES, M. C.; MORICONI, W.; MALAGODI-BRAGA, K. S. |
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Afiliação: |
RAFAELA DE OLIVEIRA MINE, UNICAMP; LUIZ OCTAVIO RAMOS FILHO, CNPMA; MARCOS CORREA NEVES, CNPMA; WALDEMORE MORICONI, CNPMA; KATIA SAMPAIO MALAGOLI BRAGA, CNPMA. |
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Título: |
Uso de sistema de informação geográfica (SIG) para desenho e representação visual de sistemas agroflorestais. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO SOBRE REFORMA AGRÁRIA E QUESTÕES RURAIS. Terra, trabalho e lutas no século XXI: projetos em disputa, 2018, Araraquara: anais... Araraquara: UNIARA, 2018. |
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Páginas: |
10 p. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: Os projetos de inovação agroecológica em assentamentos agrários promovem estímulos econômicos e ecológicos por meio da implantação de sistemas agroflorestais (SAF). A complexidade desses sistemas, que em seu desenho podem reunir dezenas de espécies diferentes, demandam tecnologias e ferramentas informatizadas que facilitem sua representação gráfica em diferentes dimensões, o acompanhamento e análise do seu desenvolvimento. Os mapas são úteis para análise e compreensão do espaço geográfico e devem ser elaborados de forma a realmente comunicar e ser de fácil interpretação ao público em geral. Dentre as ferramentas disponíveis, os Sistemas de Informação Geográfica (SIG) podem representar uma interessante opção na criação de mapas, na medida em que permitem o tratamento de dados espaciais e a produção de saídas gráficas flexíveis e de fácil interpretação. O objetivo do presente trabalho é apresentar os primeiros resultados obtidos com o uso do software QGIS na representação gráfica do desenho, registro de dados e na visualização dos atributos de uma parcela experimental de SAF, localizada em área experimental da Embrapa Meio Ambiente, em Jaguariúna-SP. Foram produzidos, como protótipos, mapas produzidos pelo software, retratando a estrutura do SAF e alguns atributos das espécies implantadas. Conclui-se que o método adotado e o software utilizado permitem produzir registros de fácil interpretação, com relativa simplicidade operacional, representando grande potencial para auxiliar no desenho, na visualização de diferentes características e no monitoramento futuro de variáveis do sistema. MenosResumo: Os projetos de inovação agroecológica em assentamentos agrários promovem estímulos econômicos e ecológicos por meio da implantação de sistemas agroflorestais (SAF). A complexidade desses sistemas, que em seu desenho podem reunir dezenas de espécies diferentes, demandam tecnologias e ferramentas informatizadas que facilitem sua representação gráfica em diferentes dimensões, o acompanhamento e análise do seu desenvolvimento. Os mapas são úteis para análise e compreensão do espaço geográfico e devem ser elaborados de forma a realmente comunicar e ser de fácil interpretação ao público em geral. Dentre as ferramentas disponíveis, os Sistemas de Informação Geográfica (SIG) podem representar uma interessante opção na criação de mapas, na medida em que permitem o tratamento de dados espaciais e a produção de saídas gráficas flexíveis e de fácil interpretação. O objetivo do presente trabalho é apresentar os primeiros resultados obtidos com o uso do software QGIS na representação gráfica do desenho, registro de dados e na visualização dos atributos de uma parcela experimental de SAF, localizada em área experimental da Embrapa Meio Ambiente, em Jaguariúna-SP. Foram produzidos, como protótipos, mapas produzidos pelo software, retratando a estrutura do SAF e alguns atributos das espécies implantadas. Conclui-se que o método adotado e o software utilizado permitem produzir registros de fácil interpretação, com relativa simplicidade operacional, representando grande potencial para ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Agrofloresta; QGIS; SIG; Sistema de informações geográficas; Sistemas biodiversos. |
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Thesagro: |
Agrossilvicultura; Mapa. |
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Thesaurus NAL: |
Agroforestry; Geographic information systems. |
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Categoria do assunto: |
A Sistemas de Cultivo |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/191970/1/2018AA046.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: Os projetos de inovação agroecológica em assentamentos agrários promovem estímulos econômicos e ecológicos por meio da implantação de sistemas agroflorestais (SAF). A complexidade desses sistemas, que em seu desenho podem reunir dezenas de espécies diferentes, demandam tecnologias e ferramentas informatizadas que facilitem sua representação gráfica em diferentes dimensões, o acompanhamento e análise do seu desenvolvimento. Os mapas são úteis para análise e compreensão do espaço geográfico e devem ser elaborados de forma a realmente comunicar e ser de fácil interpretação ao público em geral. Dentre as ferramentas disponíveis, os Sistemas de Informação Geográfica (SIG) podem representar uma interessante opção na criação de mapas, na medida em que permitem o tratamento de dados espaciais e a produção de saídas gráficas flexíveis e de fácil interpretação. O objetivo do presente trabalho é apresentar os primeiros resultados obtidos com o uso do software QGIS na representação gráfica do desenho, registro de dados e na visualização dos atributos de uma parcela experimental de SAF, localizada em área experimental da Embrapa Meio Ambiente, em Jaguariúna-SP. Foram produzidos, como protótipos, mapas produzidos pelo software, retratando a estrutura do SAF e alguns atributos das espécies implantadas. Conclui-se que o método adotado e o software utilizado permitem produzir registros de fácil interpretação, com relativa simplicidade operacional, representando grande potencial para auxiliar no desenho, na visualização de diferentes características e no monitoramento futuro de variáveis do sistema.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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