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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
31/08/2015 |
Data da última atualização: |
25/05/2017 |
Autoria: |
PEREIRA, G. da S.; CAZÉ, A. L. R.; SILVA, M. G. da; ALMEIDA, V. C.; MAGALHAES, F. O. da C.; SILVA FILHO, J. L. da; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. |
Afiliação: |
GULHERME DA SILVA PEREIRA, Universidade Estadual da Paraíba; ANA LUÍZA RAMOS CAZÉ, Universidade Estadual da Paraíba; MICHELLE GARCIA DA SILVA, Universidade Estadual da Paraíba; VANESSA CAVALCANTE ALMEIDA, Universidade Estadual da Paraíba; FERNANDA OLIVEIRA DA C MAGALHAES, CNPA; JOAO LUIS DA SILVA FILHO, CNPA; PAULO AUGUSTO VIANNA BARROSO, CNPA; LUCIA VIEIRA HOFFMANN, CNPA. |
Título: |
Optimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Título em português: Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo. |
Conteúdo: |
The objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity. |
Palavras-Chave: |
Cultivar discrimination; Intraspecific polymorhism; Microsatellite; Microssatélite; Polimorfismo intraespecífico. |
Thesagro: |
Gossypium Hirsutum. |
Thesaurus Nal: |
Microsatellite repeats. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/128830/1/Optimal-use-of-SSR-markers.pdf
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Marc: |
LEADER 02344naa a2200301 a 4500 001 2022939 005 2017-05-25 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPEREIRA, G. da S. 245 $aOptimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton. 260 $c2015 500 $aTítulo em português: Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo. 520 $aThe objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity. 650 $aMicrosatellite repeats 650 $aGossypium Hirsutum 653 $aCultivar discrimination 653 $aIntraspecific polymorhism 653 $aMicrosatellite 653 $aMicrossatélite 653 $aPolimorfismo intraespecífico 700 1 $aCAZÉ, A. L. R. 700 1 $aSILVA, M. G. da 700 1 $aALMEIDA, V. C. 700 1 $aMAGALHAES, F. O. da C. 700 1 $aSILVA FILHO, J. L. da 700 1 $aBARROSO, P. A. V. 700 1 $aHOFFMANN, L. V. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
04/07/2003 |
Data da última atualização: |
26/02/2007 |
Autoria: |
COSTA, N. P. da; MESQUITA, C. M.; ANDRADE, J. G. M. PEREIRA, J. E. |
Título: |
Desenvolvimento de metodologias alternativas e redução dos desperdícios durante a colheita mecânica da soja (13.0.95.321-02). |
Ano de publicação: |
1998 |
Fonte/Imprenta: |
In: EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Soja (Londrina, PR). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja 1997. Londrina, 1998. |
Páginas: |
p. 230-232. |
Série: |
(EMBRAPA-CNPSo. Documentos, 118). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Avaliação das perdas durante a colheita mecânica da soja no Brasil; Avaliação da qualidade de sementes de soja, produzida no Brasil. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 00776naa a2200169 a 4500 001 1464023 005 2007-02-26 008 1998 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCOSTA, N. P. da 245 $aDesenvolvimento de metodologias alternativas e redução dos desperdícios durante a colheita mecânica da soja (13.0.95.321-02). 260 $c1998 300 $ap. 230-232. 490 $a(EMBRAPA-CNPSo. Documentos, 118). 520 $aAvaliação das perdas durante a colheita mecânica da soja no Brasil; Avaliação da qualidade de sementes de soja, produzida no Brasil. 700 1 $aMESQUITA, C. M. 700 1 $aANDRADE, J. G. M. PEREIRA, J. E. 773 $tIn: EMBRAPA. Centro Nacional de Pesquisa de Soja (Londrina, PR). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja 1997. Londrina, 1998.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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