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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
16/12/2009 |
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Data da última atualização: |
26/01/2010 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, P. H. da; VILARINHOS, A. D.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; SANTOS, V. J. dos. |
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Afiliação: |
Paulo Henrique da Silva, UFRB; Alberto Duarte Vilarinhos, CNPMF; Edson Perito Amorim, CNPMF; Cláudia Fortes Ferreira, CNPMF; Vânia Jesus dos Santos, UFRB. |
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Título: |
Validação e otimização de marcadores moleculares do tipo microssatélites em bananeira. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A cultura da bananeira tem grande importância social, pois além da geração de empregos e ser uma das culturas mais plantadas no país, é uma importante fonte de alimento, sendo o Brasil o segundo maior produtor mundial de banana, ficando atrás somente da Índia. Este fato é explicado principalmente pela baixa produtividade brasileira que está associada à falta de variedades comerciais que apresentem em especial, resistência às pragas. Uma das estratégias para a solução dos problemas mencionados, é a criação de novas variedades resistentes a pragas, mediante o melhoramento genético. O mapeamento genético, visando à identificação de alelos ligados a resistência ou suscetibilidade a fatores bióticos, é uma ferramenta acessória aos programas convencionais de melhoramento. Para isto, é necessário o desenvolvimento de marcadores moleculares, tais como os microssatélites (SSRs), para uso na construção de mapas genéticos. O objetivo deste trabalho é otimizar marcadores moleculares do tipo microssatélites. Um total de 110 primers derivados de ESTs e BACs foram otimizados no Laboratório de Virologia e Biologia Molecular da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Os primers foram submetidos a diversas temperaturas de anelamento e concentrações de reagentes, em especial MgCl2,e a detecção foi realizada em gel de agarose 3,5%. Todos os primers já foram otimizados e encontram-se em fase inicial de validação, com o uso de 20 acessos de bananeira. Esta segunda etapa encontra-se em andamento aplicando-se as reações de SSR em géis desnaturantes de poliacrilamida. MenosA cultura da bananeira tem grande importância social, pois além da geração de empregos e ser uma das culturas mais plantadas no país, é uma importante fonte de alimento, sendo o Brasil o segundo maior produtor mundial de banana, ficando atrás somente da Índia. Este fato é explicado principalmente pela baixa produtividade brasileira que está associada à falta de variedades comerciais que apresentem em especial, resistência às pragas. Uma das estratégias para a solução dos problemas mencionados, é a criação de novas variedades resistentes a pragas, mediante o melhoramento genético. O mapeamento genético, visando à identificação de alelos ligados a resistência ou suscetibilidade a fatores bióticos, é uma ferramenta acessória aos programas convencionais de melhoramento. Para isto, é necessário o desenvolvimento de marcadores moleculares, tais como os microssatélites (SSRs), para uso na construção de mapas genéticos. O objetivo deste trabalho é otimizar marcadores moleculares do tipo microssatélites. Um total de 110 primers derivados de ESTs e BACs foram otimizados no Laboratório de Virologia e Biologia Molecular da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Os primers foram submetidos a diversas temperaturas de anelamento e concentrações de reagentes, em especial MgCl2,e a detecção foi realizada em gel de agarose 3,5%. Todos os primers já foram otimizados e encontram-se em fase inicial de validação, com o uso de 20 acessos de bananeira. Esta segunda etapa encontra-se em andamento... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Musa spp. |
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Thesagro: |
Banana; Marcador Molecular; Melhoramento Genético Vegetal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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245 $aValidação e otimização de marcadores moleculares do tipo microssatélites em bananeira.
260 $c2009
520 $aA cultura da bananeira tem grande importância social, pois além da geração de empregos e ser uma das culturas mais plantadas no país, é uma importante fonte de alimento, sendo o Brasil o segundo maior produtor mundial de banana, ficando atrás somente da Índia. Este fato é explicado principalmente pela baixa produtividade brasileira que está associada à falta de variedades comerciais que apresentem em especial, resistência às pragas. Uma das estratégias para a solução dos problemas mencionados, é a criação de novas variedades resistentes a pragas, mediante o melhoramento genético. O mapeamento genético, visando à identificação de alelos ligados a resistência ou suscetibilidade a fatores bióticos, é uma ferramenta acessória aos programas convencionais de melhoramento. Para isto, é necessário o desenvolvimento de marcadores moleculares, tais como os microssatélites (SSRs), para uso na construção de mapas genéticos. O objetivo deste trabalho é otimizar marcadores moleculares do tipo microssatélites. Um total de 110 primers derivados de ESTs e BACs foram otimizados no Laboratório de Virologia e Biologia Molecular da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Os primers foram submetidos a diversas temperaturas de anelamento e concentrações de reagentes, em especial MgCl2,e a detecção foi realizada em gel de agarose 3,5%. Todos os primers já foram otimizados e encontram-se em fase inicial de validação, com o uso de 20 acessos de bananeira. Esta segunda etapa encontra-se em andamento aplicando-se as reações de SSR em géis desnaturantes de poliacrilamida.
650 $aBanana
650 $aMarcador Molecular
650 $aMelhoramento Genético Vegetal
653 $aMusa spp
700 1 $aVILARINHOS, A. D.
700 1 $aAMORIM, E. P.
700 1 $aFERREIRA, C. F.
700 1 $aSANTOS, V. J. dos
773 $tIn: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 3., 2009, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2009. 1 CD-ROM.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Instrumentação. Para informações adicionais entre em contato com cnpdia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Instrumentação. |
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Data corrente: |
24/03/2022 |
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Data da última atualização: |
24/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
NICOLODELLI, G.; HERCULANO, R. D.; MARANGONI, B. S.; RIBEIRO, M. C. S.; MILORI, D. M. B. P.; MENEGATTI, C. R. |
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Afiliação: |
DEBORA MARCONDES BASTOS PEREIRA, CNPDIA. |
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Título: |
Differentiation of latex biomembrane with collagen and non-collagen using laser induced breakdown spectroscopy. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Materials Today Communications, v. 30, 103099, 2022. |
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Páginas: |
1 - 7 |
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ISSN: |
2352-4928 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.mtcomm.2021.103099 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Studies on the interaction of a biomaterial with other components are important to enhance its positive effects and resolve its limitations. Therefore, the search for fast and low-cost techniques is essential for the analysis, characterization and differentiation of these biomaterials. Laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) is a multielemental, fast, with reduced analytical cost and environmentally clean technique that does not require the use of reagents for sample preparation. In this work, an elemental characterization of collagen and non-collagen latex samples was performed by LIBS technique. Multivariate analyzes, such as principal component analysis (PCA) and machine learning (ML) algorithms were applied on LIBS data in order to differentiate the classes. The main elements detected in the LIBS spectra examined were due to C, Fe, Mg, Ca, Na, H, N and K. The best results were achieved using LIBS spectral data from the specific range: 656.15–656.55 nm combined with 744.08–744.48 nm. The elements H and N were identified as the main discriminating factors between the samples studied. The leave one out cross-validation tests indicates that collagen latex biomembrane can be differentiated from non-collagen samples with 94.44% accuracy using the Weighted K-Nearest Neighbor algorithm. |
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Palavras-Chave: |
Chemometric analysis; LIBS; Machine learning algorithms; Natural latex. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02138naa a2200265 a 4500
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245 $aDifferentiation of latex biomembrane with collagen and non-collagen using laser induced breakdown spectroscopy.$h[electronic resource]
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520 $aStudies on the interaction of a biomaterial with other components are important to enhance its positive effects and resolve its limitations. Therefore, the search for fast and low-cost techniques is essential for the analysis, characterization and differentiation of these biomaterials. Laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) is a multielemental, fast, with reduced analytical cost and environmentally clean technique that does not require the use of reagents for sample preparation. In this work, an elemental characterization of collagen and non-collagen latex samples was performed by LIBS technique. Multivariate analyzes, such as principal component analysis (PCA) and machine learning (ML) algorithms were applied on LIBS data in order to differentiate the classes. The main elements detected in the LIBS spectra examined were due to C, Fe, Mg, Ca, Na, H, N and K. The best results were achieved using LIBS spectral data from the specific range: 656.15–656.55 nm combined with 744.08–744.48 nm. The elements H and N were identified as the main discriminating factors between the samples studied. The leave one out cross-validation tests indicates that collagen latex biomembrane can be differentiated from non-collagen samples with 94.44% accuracy using the Weighted K-Nearest Neighbor algorithm.
653 $aChemometric analysis
653 $aLIBS
653 $aMachine learning algorithms
653 $aNatural latex
700 1 $aHERCULANO, R. D.
700 1 $aMARANGONI, B. S.
700 1 $aRIBEIRO, M. C. S.
700 1 $aMILORI, D. M. B. P.
700 1 $aMENEGATTI, C. R.
773 $tMaterials Today Communications$gv. 30, 103099, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Instrumentação (CNPDIA) |
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